Protein–RNA interactions for Protein: P23469

PTPRE, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase epsilon, humanhuman

Predictions only

Length 700 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPREP23469 H19-201ENST00000411754 1788 ntTSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
PTPREP23469 KDELR3-201ENST00000216014 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
PTPREP23469 P2RX3-204ENST00000616487 1346 ntTSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
PTPREP23469 LAYN-203ENST00000436913 2590 ntTSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
PTPREP23469 ILDR2-207ENST00000529071 2566 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
PTPREP23469 ICAM4-201ENST00000340992 1176 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
PTPREP23469 AP002982.1-201ENST00000492365 877 ntBASIC22.91■■□□□ 1.26
PTPREP23469 DMPK-205ENST00000458663 2548 ntTSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
PTPREP23469 PARP2-202ENST00000429687 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
PTPREP23469 SUMO3-201ENST00000332859 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
PTPREP23469 BID-204ENST00000399767 2129 ntTSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
PTPREP23469 EFHD2-201ENST00000375980 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
PTPREP23469 MYO1C-203ENST00000438665 4898 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
PTPREP23469 CCSAP-201ENST00000284617 5121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
PTPREP23469 FAM19A4-201ENST00000295569 2292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
PTPREP23469 AGAP4-207ENST00000616763 2784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
PTPREP23469 FAM53A-202ENST00000461064 2159 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
PTPREP23469 AC091230.1-202ENST00000564823 5356 ntTSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
PTPREP23469 WASH6P-203ENST00000460206 1826 ntTSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
PTPREP23469 DAB1-202ENST00000371230 1150 ntTSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
PTPREP23469 AL162231.1-203ENST00000416454 465 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
PTPREP23469 AC110769.1-201ENST00000420161 815 ntTSL 3 BASIC22.9■■□□□ 1.26
PTPREP23469 KRT18P35-201ENST00000510488 1269 ntBASIC22.9■■□□□ 1.26
PTPREP23469 AC092865.7-201ENST00000641832 219 ntBASIC22.9■■□□□ 1.26
PTPREP23469 KRT18-202ENST00000388837 1420 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
PTPREP23469 PRDM11-201ENST00000424263 1858 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
PTPREP23469 AC092835.1-201ENST00000425953 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
PTPREP23469 PYCR3-207ENST00000495276 2332 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
PTPREP23469 PNKP-214ENST00000600573 1602 ntTSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
PTPREP23469 DLEU7-201ENST00000400393 2092 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
PTPREP23469 PHF20L1-214ENST00000485595 1810 ntTSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.26
PTPREP23469 MGARP-201ENST00000398955 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
PTPREP23469 LINC00511-201ENST00000453722 1716 ntTSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.26
PTPREP23469 BIK-201ENST00000216115 953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
PTPREP23469 UNC93B2-201ENST00000285383 730 ntBASIC22.89■■□□□ 1.25
PTPREP23469 MSLN-201ENST00000382862 2116 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.25
PTPREP23469 ZNF337-AS1-204ENST00000428254 817 ntTSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.25
PTPREP23469 NDUFA13-201ENST00000428459 576 ntTSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.25
PTPREP23469 AC009487.1-202ENST00000437683 402 ntTSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.25
PTPREP23469 DEDD2-209ENST00000598727 1037 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
PTPREP23469 AP000525.1-201ENST00000608286 694 ntBASIC22.89■■□□□ 1.25
PTPREP23469 GLDC-219ENST00000640208 420 ntTSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.25
PTPREP23469 BTBD1-202ENST00000379403 1467 ntTSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.25
PTPREP23469 UBC-201ENST00000339647 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
PTPREP23469 FAM99A-201ENST00000382167 1432 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
PTPREP23469 ASPHD1-201ENST00000308748 1584 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
PTPREP23469 ETV2-202ENST00000379026 1571 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.25
PTPREP23469 GNB1-209ENST00000610897 3145 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
PTPREP23469 PPP5C-202ENST00000391919 1929 ntTSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
PTPREP23469 CNTNAP3B-202ENST00000341990 2666 ntTSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
PTPREP23469 SAAL1-204ENST00000529318 1503 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
PTPREP23469 ABHD5-205ENST00000458276 1690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
PTPREP23469 GOLGA4-208ENST00000444882 1451 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
PTPREP23469 LETM1-201ENST00000302787 5462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
PTPREP23469 PTCRA-201ENST00000304672 1080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
PTPREP23469 PTCRA-202ENST00000441198 1005 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
PTPREP23469 PTCRA-203ENST00000446507 759 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
PTPREP23469 MCRIP1-201ENST00000455127 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
PTPREP23469 AC005363.2-201ENST00000618631 242 ntBASIC22.88■■□□□ 1.25
PTPREP23469 SPINK2-206ENST00000618802 608 ntTSL 3 BASIC22.88■■□□□ 1.25
PTPREP23469 AC007743.1-203ENST00000447423 1623 ntTSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
PTPREP23469 DND1-201ENST00000542735 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
PTPREP23469 CD8B-203ENST00000390655 1417 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
PTPREP23469 MTUS2-202ENST00000380808 1793 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
PTPREP23469 HPS6-201ENST00000299238 2649 ntAPPRIS P1 BASIC22.88■■□□□ 1.25
PTPREP23469 ST7-OT4-201ENST00000397750 1576 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
PTPREP23469 MORF4L2-AS1-201ENST00000435306 2086 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
PTPREP23469 PGAM5-203ENST00000498926 2834 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
PTPREP23469 VMO1-201ENST00000328739 766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
PTPREP23469 CACYBP-202ENST00000405362 1059 ntTSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
PTPREP23469 AC099329.3-201ENST00000431549 602 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC22.87■■□□□ 1.25
PTPREP23469 AC117500.4-201ENST00000542797 617 ntTSL 3 BASIC22.87■■□□□ 1.25
PTPREP23469 P4HB-223ENST00000576390 439 ntTSL 4 BASIC22.87■■□□□ 1.25
PTPREP23469 PCSK6-217ENST00000618548 4269 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
PTPREP23469 BX119927.1-201ENST00000636596 1552 ntBASIC22.87■■□□□ 1.25
PTPREP23469 MCEMP1-201ENST00000333598 1730 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
PTPREP23469 KIRREL2-202ENST00000347900 2015 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
PTPREP23469 TMEM44-203ENST00000381975 2197 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
PTPREP23469 NTN1-201ENST00000173229 5954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
PTPREP23469 PAXIP1-202ENST00000404141 3827 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
PTPREP23469 MRPS2-201ENST00000241600 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
PTPREP23469 HYLS1-203ENST00000526028 1803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
PTPREP23469 TINAGL1-211ENST00000537531 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
PTPREP23469 WIPI2-203ENST00000401525 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
PTPREP23469 ENGASE-205ENST00000579016 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
PTPREP23469 TXNDC5-201ENST00000379757 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
PTPREP23469 ZFP64-206ENST00000371523 2234 ntTSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
PTPREP23469 METRNL-203ENST00000571814 1900 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
PTPREP23469 KRT78-201ENST00000304620 1778 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
PTPREP23469 CDX1-202ENST00000616154 1343 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
PTPREP23469 KCNQ5-205ENST00000370398 6345 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
PTPREP23469 GPR35-202ENST00000403859 2032 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
PTPREP23469 NFKBIL1-201ENST00000376145 1401 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
PTPREP23469 ENTPD8-201ENST00000344119 2111 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
PTPREP23469 RHOC-204ENST00000369633 1295 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.86■■□□□ 1.25
PTPREP23469 DNAL4-201ENST00000216068 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
PTPREP23469 LENG9-203ENST00000611161 1916 ntAPPRIS P1 BASIC22.86■■□□□ 1.25
PTPREP23469 TBL1Y-201ENST00000346432 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
PTPREP23469 MGAT5B-209ENST00000569840 4492 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
PTPREP23469 PCDHA13-203ENST00000617769 2427 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31 ms