Protein–RNA interactions for Protein: P16410

CTLA4, Cytotoxic T-lymphocyte protein 4, humanhuman

Predictions only

Length 223 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CTLA4P16410 UBE2Z-201ENST00000360943 3122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
CTLA4P16410 PVRIG-201ENST00000317271 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
CTLA4P16410 AC092171.1-201ENST00000455866 753 ntTSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
CTLA4P16410 EGFEM1P-209ENST00000502332 728 ntTSL 3 BASIC17.38■□□□□ 0.37
CTLA4P16410 SLC29A4P2-201ENST00000504749 1089 ntBASIC17.38■□□□□ 0.37
CTLA4P16410 ZNF436-AS1-206ENST00000518821 461 ntTSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
CTLA4P16410 PIGQ-204ENST00000409527 1915 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
CTLA4P16410 BIRC2-206ENST00000530675 1927 ntTSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
CTLA4P16410 MTX1-202ENST00000368376 1632 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
CTLA4P16410 VAV1-210ENST00000602142 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
CTLA4P16410 ILDR2-203ENST00000469934 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
CTLA4P16410 AC098818.2-201ENST00000564925 2320 ntBASIC17.38■□□□□ 0.37
CTLA4P16410 LDHAL6A-202ENST00000396213 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
CTLA4P16410 FAM187A-202ENST00000412523 1748 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
CTLA4P16410 LAPTM4B-204ENST00000619747 2758 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
CTLA4P16410 KCNC3-203ENST00000477616 3176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
CTLA4P16410 BACE1-204ENST00000445823 1408 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
CTLA4P16410 ARRDC2-201ENST00000222250 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
CTLA4P16410 R3HCC1-210ENST00000625275 1489 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
CTLA4P16410 SETD7-202ENST00000404104 1590 ntTSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
CTLA4P16410 GLRB-207ENST00000541722 2765 ntTSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
CTLA4P16410 TRPV3-209ENST00000576742 2766 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
CTLA4P16410 SHISA7-201ENST00000376325 6033 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
CTLA4P16410 BRAF-201ENST00000288602 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
CTLA4P16410 REXO2-201ENST00000265881 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
CTLA4P16410 COPS9-201ENST00000307266 759 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
CTLA4P16410 DDR1-228ENST00000376575 732 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
CTLA4P16410 AKAIN1-201ENST00000434239 575 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
CTLA4P16410 ABCC3-217ENST00000515707 656 ntTSL 3 BASIC17.37■□□□□ 0.37
CTLA4P16410 PNMA6B-201ENST00000538162 1200 ntBASIC17.37■□□□□ 0.37
CTLA4P16410 REXO2-208ENST00000539754 791 ntTSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
CTLA4P16410 AC105020.4-201ENST00000569467 563 ntTSL 4 BASIC17.37■□□□□ 0.37
CTLA4P16410 AC060766.5-201ENST00000590539 871 ntBASIC17.37■□□□□ 0.37
CTLA4P16410 NDUFA6-AS1-207ENST00000595777 833 ntTSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
CTLA4P16410 CRB2-202ENST00000373631 5550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
CTLA4P16410 REEP2-202ENST00000378339 2170 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
CTLA4P16410 CENPH-206ENST00000515001 1305 ntTSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
CTLA4P16410 IP6K1-204ENST00000468463 1815 ntTSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
CTLA4P16410 EFCAB11-202ENST00000538485 1870 ntTSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
CTLA4P16410 SYTL1-210ENST00000616558 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
CTLA4P16410 FOXP4-205ENST00000409208 3341 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
CTLA4P16410 PCDHGB3-202ENST00000618934 2445 ntAPPRIS P1 BASIC17.37■□□□□ 0.37
CTLA4P16410 BCS1L-201ENST00000359273 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
CTLA4P16410 CHAC1-205ENST00000617961 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
CTLA4P16410 TMEM235-202ENST00000421688 2490 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
CTLA4P16410 PROB1-201ENST00000434752 5122 ntAPPRIS P1 BASIC17.36■□□□□ 0.37
CTLA4P16410 ALDOA-212ENST00000564546 2104 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
CTLA4P16410 SPHK2-211ENST00000600537 2136 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
CTLA4P16410 LMF1-212ENST00000568897 1603 ntTSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
CTLA4P16410 FGFR1-238ENST00000532791 5590 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
CTLA4P16410 ISLR2-208ENST00000565159 2824 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.36■□□□□ 0.37
CTLA4P16410 FBXO24-201ENST00000241071 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
CTLA4P16410 GFER-201ENST00000248114 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
CTLA4P16410 AP000974.1-201ENST00000623909 2387 ntBASIC17.36■□□□□ 0.37
CTLA4P16410 MED15P9-202ENST00000427638 1841 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
CTLA4P16410 TMEM91-209ENST00000539627 1843 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
CTLA4P16410 PDZD3-203ENST00000525131 1882 ntTSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
CTLA4P16410 NHLH2-201ENST00000320238 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
CTLA4P16410 MON1A-202ENST00000417270 2527 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
CTLA4P16410 CDK13-202ENST00000340829 5066 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
CTLA4P16410 IFI27L2-201ENST00000238609 511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
CTLA4P16410 CUEDC2-201ENST00000369937 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
CTLA4P16410 ANKRD39-201ENST00000393537 976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
CTLA4P16410 HAGH-201ENST00000397353 1257 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
CTLA4P16410 EIF4E3-203ENST00000421769 777 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
CTLA4P16410 AL807752.2-201ENST00000435463 301 ntTSL 3 BASIC17.36■□□□□ 0.37
CTLA4P16410 AL161908.1-201ENST00000451449 449 ntTSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
CTLA4P16410 AC090192.1-201ENST00000517740 490 ntBASIC17.36■□□□□ 0.37
CTLA4P16410 GOSR2-208ENST00000573224 1115 ntTSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
CTLA4P16410 PAQR4-205ENST00000576565 842 ntTSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
CTLA4P16410 AC104771.1-201ENST00000603335 964 ntBASIC17.36■□□□□ 0.37
CTLA4P16410 Z83844.2-201ENST00000456099 1945 ntTSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
CTLA4P16410 TM9SF1-203ENST00000524835 1938 ntTSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
CTLA4P16410 ARHGAP22-210ENST00000477708 1951 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
CTLA4P16410 NAAA-206ENST00000507956 1300 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
CTLA4P16410 ASCC1-205ENST00000394919 2683 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
CTLA4P16410 PLD4-204ENST00000540372 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
CTLA4P16410 CTBP2-202ENST00000334808 2130 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
CTLA4P16410 PTGES2-AS1-201ENST00000443493 2100 ntBASIC17.36■□□□□ 0.37
CTLA4P16410 CAMKK1-202ENST00000348335 3563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
CTLA4P16410 MORF4L1-215ENST00000559345 1468 ntTSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
CTLA4P16410 ZNF346-201ENST00000358149 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
CTLA4P16410 PRSS36-202ENST00000418068 2446 ntTSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
CTLA4P16410 MCEMP1-201ENST00000333598 1730 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
CTLA4P16410 OSR2-202ENST00000435298 1736 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
CTLA4P16410 FAR2P2-204ENST00000424873 2070 ntTSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
CTLA4P16410 STX18-201ENST00000306200 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
CTLA4P16410 SLC34A3-202ENST00000538474 2162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
CTLA4P16410 ANXA8L1-201ENST00000584982 2174 ntTSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
CTLA4P16410 LPCAT3-201ENST00000261407 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
CTLA4P16410 NDUFB1-201ENST00000329559 528 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
CTLA4P16410 ZPBP-203ENST00000419417 1095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
CTLA4P16410 AC069152.1-201ENST00000438030 544 ntBASIC17.35■□□□□ 0.37
CTLA4P16410 AC009065.4-203ENST00000562838 535 ntTSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
CTLA4P16410 SNCA-203ENST00000394986 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
CTLA4P16410 AC007383.3-201ENST00000453039 1411 ntTSL 3 BASIC17.35■□□□□ 0.37
CTLA4P16410 VSTM2B-201ENST00000335523 1488 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
CTLA4P16410 SLC25A41-201ENST00000321510 1532 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
CTLA4P16410 FDFT1-209ENST00000525900 1596 ntTSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
CTLA4P16410 LRPPRC-202ENST00000409659 1610 ntTSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 38 ms