Protein–RNA interactions for Protein: P0DN79

CBSL, Cystathionine beta-synthase-like protein, humanhuman

Predictions only

Length 551 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CBSLP0DN79 S1PR5-201ENST00000333430 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
CBSLP0DN79 MRPL2-202ENST00000388752 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
CBSLP0DN79 HSPD1-202ENST00000388968 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
CBSLP0DN79 SPNS1-201ENST00000311008 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
CBSLP0DN79 SARDH-201ENST00000298628 1484 ntTSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
CBSLP0DN79 RGS11-204ENST00000397770 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
CBSLP0DN79 PPTC7-201ENST00000354300 4996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
CBSLP0DN79 FAM129C-208ENST00000599164 2073 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.22■□□□□ 0.67
CBSLP0DN79 GCSHP5-201ENST00000443090 522 ntBASIC19.22■□□□□ 0.67
CBSLP0DN79 DET1-205ENST00000558413 583 ntTSL 4 BASIC19.22■□□□□ 0.67
CBSLP0DN79 PSMD6-201ENST00000295901 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
CBSLP0DN79 MPV17L2-204ENST00000599612 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
CBSLP0DN79 ARRB2-216ENST00000574954 1348 ntTSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
CBSLP0DN79 KLHDC2-201ENST00000298307 5514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
CBSLP0DN79 TINAGL1-201ENST00000271064 2187 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
CBSLP0DN79 RABEPK-204ENST00000394125 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
CBSLP0DN79 ART5-203ENST00000397068 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
CBSLP0DN79 NTMT1-210ENST00000613644 1501 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.21■□□□□ 0.67
CBSLP0DN79 GOLGA6L3-201ENST00000507199 1679 ntBASIC19.21■□□□□ 0.67
CBSLP0DN79 EMILIN2-201ENST00000254528 5910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
CBSLP0DN79 FGF14-IT1-202ENST00000607251 2123 ntTSL 2 BASIC19.21■□□□□ 0.67
CBSLP0DN79 PLCL1-201ENST00000428675 5125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
CBSLP0DN79 ZDHHC12-202ENST00000372667 1187 ntTSL 5 BASIC19.21■□□□□ 0.67
CBSLP0DN79 TMEM35B-201ENST00000373337 922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
CBSLP0DN79 FAM167B-201ENST00000373582 936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
CBSLP0DN79 CCDC47-202ENST00000403162 2195 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.21■□□□□ 0.67
CBSLP0DN79 RDH13-203ENST00000415061 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
CBSLP0DN79 AL158047.1-201ENST00000445918 881 ntBASIC19.21■□□□□ 0.67
CBSLP0DN79 TTTY14-205ENST00000454875 544 ntTSL 2 BASIC19.21■□□□□ 0.67
CBSLP0DN79 LINC01881-205ENST00000456398 1235 ntTSL 5 BASIC19.21■□□□□ 0.67
CBSLP0DN79 AC026362.1-201ENST00000540866 5618 ntTSL 2 BASIC19.21■□□□□ 0.67
CBSLP0DN79 AC142381.4-202ENST00000563973 229 ntBASIC19.21■□□□□ 0.67
CBSLP0DN79 AC127496.6-201ENST00000576215 338 ntTSL 3 BASIC19.21■□□□□ 0.67
CBSLP0DN79 GTF2IRD2B-206ENST00000614064 573 ntTSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
CBSLP0DN79 FGF13-208ENST00000626909 1039 ntTSL 2 BASIC19.21■□□□□ 0.67
CBSLP0DN79 MICU2-201ENST00000382374 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
CBSLP0DN79 BCS1L-201ENST00000359273 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
CBSLP0DN79 MAP2K2-202ENST00000394867 1471 ntTSL 5 BASIC19.21■□□□□ 0.67
CBSLP0DN79 ETFA-202ENST00000433983 1346 ntTSL 2 BASIC19.21■□□□□ 0.67
CBSLP0DN79 NEIL3-201ENST00000264596 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
CBSLP0DN79 HAND2-AS1-237ENST00000616485 2420 ntTSL 2 BASIC19.21■□□□□ 0.67
CBSLP0DN79 NYX-202ENST00000378220 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
CBSLP0DN79 ZNF331-214ENST00000511154 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
CBSLP0DN79 ILF3-217ENST00000589998 2622 ntTSL 2 BASIC19.21■□□□□ 0.66
CBSLP0DN79 EYA2-210ENST00000611592 2612 ntTSL 5 BASIC19.21■□□□□ 0.66
CBSLP0DN79 BCR-202ENST00000359540 4708 ntTSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
CBSLP0DN79 UBC-201ENST00000339647 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
CBSLP0DN79 BIN2-210ENST00000615107 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
CBSLP0DN79 THTPA-202ENST00000404535 1779 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.2■□□□□ 0.66
CBSLP0DN79 LGALS7-201ENST00000378626 466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
CBSLP0DN79 POLR2J-202ENST00000393794 784 ntTSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
CBSLP0DN79 LEF1-AS1-203ENST00000507799 459 ntTSL 3 BASIC19.2■□□□□ 0.66
CBSLP0DN79 AC022509.3-202ENST00000545819 566 ntTSL 3 BASIC19.2■□□□□ 0.66
CBSLP0DN79 AC100835.1-201ENST00000565737 498 ntTSL 5 BASIC19.2■□□□□ 0.66
CBSLP0DN79 MAZ-215ENST00000569978 567 ntTSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
CBSLP0DN79 AC005786.3-201ENST00000589360 565 ntTSL 3 BASIC19.2■□□□□ 0.66
CBSLP0DN79 SLC38A11-203ENST00000409149 1621 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC19.2■□□□□ 0.66
CBSLP0DN79 MORF4L1-215ENST00000559345 1468 ntTSL 2 BASIC19.2■□□□□ 0.66
CBSLP0DN79 HOXC4-201ENST00000303406 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
CBSLP0DN79 ZNF302-215ENST00000627982 1723 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.2■□□□□ 0.66
CBSLP0DN79 HIGD1A-201ENST00000321331 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
CBSLP0DN79 CYP21A2-222ENST00000435122 1914 ntTSL 2 BASIC19.19■□□□□ 0.66
CBSLP0DN79 TNFSF11-203ENST00000398795 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
CBSLP0DN79 TGFBR1-201ENST00000374990 5720 ntTSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
CBSLP0DN79 OLFM1-202ENST00000277415 1014 ntTSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
CBSLP0DN79 SPDYE2-201ENST00000341656 1219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
CBSLP0DN79 NMRK1-201ENST00000361092 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
CBSLP0DN79 H3F3A-204ENST00000366816 799 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.19■□□□□ 0.66
CBSLP0DN79 FKBP2-202ENST00000394540 1002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
CBSLP0DN79 KRT17P3-201ENST00000420566 1262 ntBASIC19.19■□□□□ 0.66
CBSLP0DN79 AC073316.3-201ENST00000437354 982 ntTSL 3 BASIC19.19■□□□□ 0.66
CBSLP0DN79 SPDYE2B-202ENST00000455020 1219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
CBSLP0DN79 NME1-207ENST00000480143 964 ntTSL 2 BASIC19.19■□□□□ 0.66
CBSLP0DN79 AC069185.1-201ENST00000531395 811 ntTSL 3 BASIC19.19■□□□□ 0.66
CBSLP0DN79 PRKY-204ENST00000533551 1019 ntBASIC19.19■□□□□ 0.66
CBSLP0DN79 PDLIM2-205ENST00000397761 1491 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.19■□□□□ 0.66
CBSLP0DN79 ACD-214ENST00000620338 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
CBSLP0DN79 KCNMA1-293ENST00000640969 5789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.19■□□□□ 0.66
CBSLP0DN79 AP3S1-201ENST00000316788 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
CBSLP0DN79 KLHL11-201ENST00000319121 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
CBSLP0DN79 TBC1D9-201ENST00000442267 5306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
CBSLP0DN79 EFHD2-201ENST00000375980 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
CBSLP0DN79 CBLN2-201ENST00000269503 2945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
CBSLP0DN79 ACD-201ENST00000219251 2052 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.18■□□□□ 0.66
CBSLP0DN79 CCNO-201ENST00000282572 1433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
CBSLP0DN79 LIMS2-207ENST00000409808 2315 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.18■□□□□ 0.66
CBSLP0DN79 NETO1-207ENST00000583169 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
CBSLP0DN79 DUT-202ENST00000455976 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
CBSLP0DN79 CDH5-204ENST00000563425 1932 ntTSL 5 BASIC19.18■□□□□ 0.66
CBSLP0DN79 SEC61A2-206ENST00000379051 707 ntTSL 3 BASIC19.18■□□□□ 0.66
CBSLP0DN79 ZNF529-AS1-202ENST00000475219 1033 ntTSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
CBSLP0DN79 RPL29-204ENST00000479017 670 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.18■□□□□ 0.66
CBSLP0DN79 EPHA5-AS1-202ENST00000509473 1177 ntTSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
CBSLP0DN79 AC093827.2-201ENST00000512654 315 ntBASIC19.18■□□□□ 0.66
CBSLP0DN79 AC068987.1-201ENST00000562996 427 ntTSL 3 BASIC19.18■□□□□ 0.66
CBSLP0DN79 AC233263.1-201ENST00000578059 224 ntBASIC19.18■□□□□ 0.66
CBSLP0DN79 PSKH2-201ENST00000276616 1322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
CBSLP0DN79 SGCE-207ENST00000447873 1597 ntTSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
CBSLP0DN79 NFIX-202ENST00000360105 5459 ntTSL 5 BASIC19.18■□□□□ 0.66
CBSLP0DN79 ELMOD1-206ENST00000531234 1832 ntTSL 2 BASIC19.18■□□□□ 0.66
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 56.4 ms