Protein–RNA interactions for Protein: P0C7W6

CCDC172, Coiled-coil domain-containing protein 172, humanhuman

Predictions only

Length 258 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC172P0C7W6 RBM42-204ENST00000589559 1328 ntTSL 5 BASIC21.14■□□□□ 0.97
CCDC172P0C7W6 DCXR-201ENST00000306869 887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
CCDC172P0C7W6 LINC00471-201ENST00000313064 1282 ntTSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
CCDC172P0C7W6 MIR663A-201ENST00000385250 93 ntBASIC21.14■□□□□ 0.97
CCDC172P0C7W6 CSF1-205ENST00000420111 1083 ntTSL 5 BASIC21.14■□□□□ 0.97
CCDC172P0C7W6 LINC02091-201ENST00000576171 1185 ntTSL 5 BASIC21.14■□□□□ 0.97
CCDC172P0C7W6 IKBKGP1-201ENST00000612193 1073 ntBASIC21.14■□□□□ 0.97
CCDC172P0C7W6 AL772284.2-201ENST00000620151 1147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.14■□□□□ 0.97
CCDC172P0C7W6 OGFR-204ENST00000621591 1194 ntTSL 5 BASIC21.14■□□□□ 0.97
CCDC172P0C7W6 MARS-234ENST00000630571 216 ntTSL 5 BASIC21.14■□□□□ 0.97
CCDC172P0C7W6 MARS-235ENST00000630803 183 ntTSL 3 BASIC21.14■□□□□ 0.97
CCDC172P0C7W6 STK16-201ENST00000396738 1673 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.14■□□□□ 0.97
CCDC172P0C7W6 AC138430.1-201ENST00000586064 5409 ntTSL 2 BASIC21.14■□□□□ 0.97
CCDC172P0C7W6 PCDH1-201ENST00000287008 4793 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.14■□□□□ 0.97
CCDC172P0C7W6 HERPUD2-201ENST00000311350 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
CCDC172P0C7W6 KLC2-204ENST00000394067 2898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
CCDC172P0C7W6 TBC1D10A-204ENST00000403477 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.14■□□□□ 0.97
CCDC172P0C7W6 CASP6-201ENST00000265164 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
CCDC172P0C7W6 TOR2A-203ENST00000373284 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
CCDC172P0C7W6 EPN3-216ENST00000537145 2223 ntTSL 5 BASIC21.13■□□□□ 0.97
CCDC172P0C7W6 PTPN12-201ENST00000248594 3406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
CCDC172P0C7W6 AL138752.2-201ENST00000540557 2591 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.13■□□□□ 0.97
CCDC172P0C7W6 CRK-204ENST00000574295 1391 ntTSL 5 BASIC21.13■□□□□ 0.97
CCDC172P0C7W6 ZNF281-202ENST00000367352 2933 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.13■□□□□ 0.97
CCDC172P0C7W6 TMSB4X-203ENST00000380636 1702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
CCDC172P0C7W6 LDHAL6A-202ENST00000396213 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
CCDC172P0C7W6 ACD-214ENST00000620338 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
CCDC172P0C7W6 PPP1CA-202ENST00000358239 1054 ntTSL 2 BASIC21.13■□□□□ 0.97
CCDC172P0C7W6 AL645608.9-201ENST00000442292 829 ntTSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
CCDC172P0C7W6 YIF1B-213ENST00000591755 1077 ntTSL 2 BASIC21.13■□□□□ 0.97
CCDC172P0C7W6 AL050303.2-201ENST00000619798 666 ntBASIC21.13■□□□□ 0.97
CCDC172P0C7W6 SHANK3-203ENST00000445220 5175 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.13■□□□□ 0.97
CCDC172P0C7W6 ACSS3-201ENST00000261206 2666 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
CCDC172P0C7W6 ARHGDIA-202ENST00000400721 1568 ntTSL 2 BASIC21.13■□□□□ 0.97
CCDC172P0C7W6 DUT-202ENST00000455976 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
CCDC172P0C7W6 ANTXR1-203ENST00000409829 2221 ntTSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
CCDC172P0C7W6 IRF3-221ENST00000598808 1468 ntTSL 5 BASIC21.13■□□□□ 0.97
CCDC172P0C7W6 WIPF1-205ENST00000409415 1772 ntTSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
CCDC172P0C7W6 RBL2-201ENST00000262133 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
CCDC172P0C7W6 HLX-201ENST00000366903 2280 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
CCDC172P0C7W6 SLC36A1-209ENST00000521925 1621 ntTSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
CCDC172P0C7W6 DND1-201ENST00000542735 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
CCDC172P0C7W6 AC116351.2-201ENST00000606540 1585 ntBASIC21.12■□□□□ 0.97
CCDC172P0C7W6 GTF3C5-202ENST00000372097 2406 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
CCDC172P0C7W6 CNIH4-203ENST00000366858 702 ntTSL 3 BASIC21.12■□□□□ 0.97
CCDC172P0C7W6 CALM3-202ENST00000391918 702 ntTSL 2 BASIC21.12■□□□□ 0.97
CCDC172P0C7W6 AC073210.2-201ENST00000430369 194 ntBASIC21.12■□□□□ 0.97
CCDC172P0C7W6 PIGQ-209ENST00000470411 2112 ntTSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
CCDC172P0C7W6 HCK-207ENST00000520553 2101 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
CCDC172P0C7W6 NLRP6-201ENST00000312165 2679 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
CCDC172P0C7W6 UHRF1-203ENST00000615884 2651 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.12■□□□□ 0.97
CCDC172P0C7W6 PPM1D-204ENST00000629650 1525 ntTSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
CCDC172P0C7W6 CGRRF1-201ENST00000216420 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
CCDC172P0C7W6 SYBU-201ENST00000276646 2870 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
CCDC172P0C7W6 EFS-201ENST00000216733 3118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
CCDC172P0C7W6 AC018553.1-201ENST00000616682 1458 ntBASIC21.12■□□□□ 0.97
CCDC172P0C7W6 SMTN-204ENST00000404574 1735 ntTSL 2 BASIC21.12■□□□□ 0.97
CCDC172P0C7W6 SLC35F3-201ENST00000366617 2762 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
CCDC172P0C7W6 WAC-205ENST00000375664 5924 ntTSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
CCDC172P0C7W6 MYEOV-202ENST00000441339 1996 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.12■□□□□ 0.97
CCDC172P0C7W6 NPLOC4-201ENST00000331134 4415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
CCDC172P0C7W6 RASSF1-202ENST00000357043 1864 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
CCDC172P0C7W6 CEP78-202ENST00000376597 2618 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
CCDC172P0C7W6 PRMT2-206ENST00000397638 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
CCDC172P0C7W6 MFSD1-219ENST00000622669 2361 ntTSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
CCDC172P0C7W6 ZNF821-221ENST00000611294 1833 ntTSL 3 BASIC21.11■□□□□ 0.97
CCDC172P0C7W6 ZBTB46-203ENST00000395104 5198 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.11■□□□□ 0.97
CCDC172P0C7W6 RAB11B-201ENST00000328024 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
CCDC172P0C7W6 NGLY1-202ENST00000280700 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
CCDC172P0C7W6 CHST2-201ENST00000309575 4582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
CCDC172P0C7W6 C17orf58-201ENST00000334461 1535 ntTSL 2 BASIC21.11■□□□□ 0.97
CCDC172P0C7W6 CKLF-CMTM1-204ENST00000532838 587 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC21.11■□□□□ 0.97
CCDC172P0C7W6 MCRIP1-203ENST00000538396 925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
CCDC172P0C7W6 ULK4P1-204ENST00000565949 721 ntTSL 4 BASIC21.11■□□□□ 0.97
CCDC172P0C7W6 AL121832.2-201ENST00000610979 668 ntBASIC21.11■□□□□ 0.97
CCDC172P0C7W6 PGAP1-204ENST00000409475 2443 ntTSL 2 BASIC21.11■□□□□ 0.97
CCDC172P0C7W6 KDELR3-201ENST00000216014 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
CCDC172P0C7W6 ZNF771-202ENST00000434417 1454 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.11■□□□□ 0.97
CCDC172P0C7W6 SHROOM1-202ENST00000378676 2352 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.11■□□□□ 0.97
CCDC172P0C7W6 TTC34-201ENST00000401095 8814 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.11■□□□□ 0.97
CCDC172P0C7W6 MSANTD2-202ENST00000374979 2349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
CCDC172P0C7W6 PRDM11-201ENST00000424263 1858 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.11■□□□□ 0.97
CCDC172P0C7W6 MUTYH-203ENST00000372098 1839 ntTSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
CCDC172P0C7W6 MUTYH-204ENST00000372104 1823 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
CCDC172P0C7W6 MUTYH-205ENST00000372110 1809 ntTSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
CCDC172P0C7W6 PVRIG-201ENST00000317271 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
CCDC172P0C7W6 PHB2-201ENST00000399433 1308 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.1■□□□□ 0.97
CCDC172P0C7W6 FAM187A-202ENST00000412523 1748 ntTSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
CCDC172P0C7W6 AC018445.3-201ENST00000624177 1945 ntBASIC21.1■□□□□ 0.97
CCDC172P0C7W6 ZBTB7B-201ENST00000292176 2129 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
CCDC172P0C7W6 CAMKK2-206ENST00000402834 2051 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
CCDC172P0C7W6 PDZD3-203ENST00000525131 1882 ntTSL 2 BASIC21.1■□□□□ 0.97
CCDC172P0C7W6 Z82202.1-201ENST00000623446 1880 ntBASIC21.1■□□□□ 0.97
CCDC172P0C7W6 UBE3C-201ENST00000348165 5229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
CCDC172P0C7W6 NME6-213ENST00000451657 871 ntTSL 2 BASIC21.1■□□□□ 0.97
CCDC172P0C7W6 DNAJA4-210ENST00000489435 947 ntTSL 3 BASIC21.1■□□□□ 0.97
CCDC172P0C7W6 WWTR1-AS1-203ENST00000495094 975 ntTSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
CCDC172P0C7W6 DLX3-202ENST00000512495 834 ntTSL 2 BASIC21.1■□□□□ 0.97
CCDC172P0C7W6 ZNF324-202ENST00000535298 1006 ntTSL 5 BASIC21.1■□□□□ 0.97
CCDC172P0C7W6 RAP2CP1-201ENST00000605103 478 ntBASIC21.1■□□□□ 0.97
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.3 ms