Protein–RNA interactions for Protein: O94985

CLSTN1, Calsyntenin-1, humanhuman

Predictions only

Length 981 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CLSTN1O94985 HLA-G-202ENST00000376815 851 ntBASIC21.64■■□□□ 1.05
CLSTN1O94985 HLA-G-203ENST00000376818 1127 ntBASIC21.64■■□□□ 1.05
CLSTN1O94985 SBK2-202ENST00000413299 1085 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.64■■□□□ 1.05
CLSTN1O94985 MMP25-204ENST00000612971 1017 ntTSL 5 BASIC21.64■■□□□ 1.05
CLSTN1O94985 PYCR3-207ENST00000495276 2332 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
CLSTN1O94985 INTS11-202ENST00000411962 1832 ntTSL 5 BASIC21.64■■□□□ 1.05
CLSTN1O94985 WDR25-201ENST00000335290 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
CLSTN1O94985 NOP56-201ENST00000329276 2400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
CLSTN1O94985 AC112907.3-201ENST00000577781 2400 ntBASIC21.64■■□□□ 1.05
CLSTN1O94985 WIPF1-205ENST00000409415 1772 ntTSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
CLSTN1O94985 H19-201ENST00000411754 1788 ntTSL 5 BASIC21.64■■□□□ 1.05
CLSTN1O94985 MFSD10-211ENST00000514800 1776 ntTSL 5 BASIC21.64■■□□□ 1.05
CLSTN1O94985 MAP3K6-207ENST00000493901 4309 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.64■■□□□ 1.05
CLSTN1O94985 FAM170B-201ENST00000311787 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
CLSTN1O94985 PDLIM3-212ENST00000620787 2352 ntTSL 4 BASIC21.63■■□□□ 1.05
CLSTN1O94985 EYA2-210ENST00000611592 2612 ntTSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
CLSTN1O94985 DDX51-202ENST00000397333 4718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
CLSTN1O94985 HMOX2-218ENST00000619913 1908 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
CLSTN1O94985 SNRPA-201ENST00000243563 1621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
CLSTN1O94985 ATF5-202ENST00000595125 1637 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.63■■□□□ 1.05
CLSTN1O94985 GOSR1-201ENST00000225724 6039 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
CLSTN1O94985 NETO2-202ENST00000562435 7481 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
CLSTN1O94985 ZGPAT-203ENST00000357119 1896 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
CLSTN1O94985 BID-202ENST00000342111 854 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
CLSTN1O94985 N4BP2L1-203ENST00000380133 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
CLSTN1O94985 ZNF295-AS1-201ENST00000412906 952 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
CLSTN1O94985 LACTB-202ENST00000413507 2978 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
CLSTN1O94985 ZNF467-202ENST00000484747 913 ntTSL 2 BASIC21.63■■□□□ 1.05
CLSTN1O94985 CD99-210ENST00000611428 1243 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
CLSTN1O94985 PITX2-201ENST00000306732 2320 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
CLSTN1O94985 AL162377.1-201ENST00000618844 1793 ntBASIC21.63■■□□□ 1.05
CLSTN1O94985 SPG7-202ENST00000341316 2288 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
CLSTN1O94985 ENOSF1-201ENST00000251101 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
CLSTN1O94985 SUN1-220ENST00000457378 1309 ntTSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
CLSTN1O94985 PTPA-204ENST00000355007 2515 ntTSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
CLSTN1O94985 TMEM189-201ENST00000371650 2222 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
CLSTN1O94985 C2CD2L-201ENST00000336702 4771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
CLSTN1O94985 LIPT2-201ENST00000310109 1018 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.62■■□□□ 1.05
CLSTN1O94985 MDK-204ENST00000395569 686 ntTSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
CLSTN1O94985 LY6E-202ENST00000429120 1173 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
CLSTN1O94985 AL161908.1-201ENST00000451449 449 ntTSL 2 BASIC21.62■■□□□ 1.05
CLSTN1O94985 SERP1-205ENST00000487153 657 ntTSL 4 BASIC21.62■■□□□ 1.05
CLSTN1O94985 C17orf107-202ENST00000521575 1275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
CLSTN1O94985 FAM219B-212ENST00000565772 1249 ntTSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
CLSTN1O94985 INO80E-214ENST00000620599 515 ntTSL 2 BASIC21.62■■□□□ 1.05
CLSTN1O94985 MYC-209ENST00000641252 345 ntBASIC21.62■■□□□ 1.05
CLSTN1O94985 NFIX-205ENST00000585575 1485 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
CLSTN1O94985 C3orf33-201ENST00000340171 1884 ntTSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
CLSTN1O94985 FAM208A-209ENST00000493960 5600 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
CLSTN1O94985 GYG1-202ENST00000345003 2052 ntTSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
CLSTN1O94985 NGEF-202ENST00000373552 2286 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.62■■□□□ 1.05
CLSTN1O94985 C16orf70-201ENST00000219139 2865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
CLSTN1O94985 AVPR2-202ENST00000358927 1763 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
CLSTN1O94985 SREBF2-201ENST00000361204 5240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
CLSTN1O94985 MOK-233ENST00000524214 1539 ntTSL 2 BASIC21.61■■□□□ 1.05
CLSTN1O94985 FAM213A-202ENST00000372185 1723 ntTSL 2 BASIC21.61■■□□□ 1.05
CLSTN1O94985 IKZF1-209ENST00000438033 1748 ntTSL 2 BASIC21.61■■□□□ 1.05
CLSTN1O94985 AC008073.3-201ENST00000610442 2281 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.61■■□□□ 1.05
CLSTN1O94985 AC073210.2-201ENST00000430369 194 ntBASIC21.61■■□□□ 1.05
CLSTN1O94985 TPD52L1-207ENST00000527711 999 ntTSL 2 BASIC21.61■■□□□ 1.05
CLSTN1O94985 AL049874.3-201ENST00000557618 868 ntTSL 3 BASIC21.61■■□□□ 1.05
CLSTN1O94985 AF274858.3-202ENST00000569906 755 ntTSL 3 BASIC21.61■■□□□ 1.05
CLSTN1O94985 AC006557.6-201ENST00000623071 864 ntBASIC21.61■■□□□ 1.05
CLSTN1O94985 PACSIN3-211ENST00000539589 2009 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.61■■□□□ 1.05
CLSTN1O94985 FICD-201ENST00000361549 1816 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
CLSTN1O94985 NSMF-201ENST00000265663 2981 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
CLSTN1O94985 NSMF-206ENST00000371475 2987 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
CLSTN1O94985 KRT8P20-201ENST00000423953 1409 ntBASIC21.61■■□□□ 1.05
CLSTN1O94985 BRD4-202ENST00000360016 3240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
CLSTN1O94985 CACNB2-203ENST00000352115 1911 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
CLSTN1O94985 STMN3-201ENST00000370053 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
CLSTN1O94985 PSMG4-209ENST00000473000 4603 ntTSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
CLSTN1O94985 NCLN-205ENST00000590671 2070 ntTSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
CLSTN1O94985 EIF2AK3-201ENST00000303236 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
CLSTN1O94985 TSSK6-201ENST00000585580 1467 ntAPPRIS P1 BASIC21.6■■□□□ 1.05
CLSTN1O94985 SLC39A5-209ENST00000454355 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
CLSTN1O94985 REXO2-201ENST00000265881 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
CLSTN1O94985 LCE2A-201ENST00000368779 592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
CLSTN1O94985 OTUB1-203ENST00000428192 1296 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
CLSTN1O94985 ABCC3-217ENST00000515707 656 ntTSL 3 BASIC21.6■■□□□ 1.05
CLSTN1O94985 REXO2-208ENST00000539754 791 ntTSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
CLSTN1O94985 RPL17-204ENST00000579248 790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
CLSTN1O94985 PSME3-210ENST00000590720 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
CLSTN1O94985 TRAPPC5-203ENST00000595985 411 ntTSL 3 BASIC21.6■■□□□ 1.05
CLSTN1O94985 CCT5-205ENST00000506600 1939 ntTSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
CLSTN1O94985 AFG3L1P-217ENST00000557444 2447 ntBASIC21.6■■□□□ 1.05
CLSTN1O94985 PCDHB12-202ENST00000622978 2093 ntTSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
CLSTN1O94985 WT1-212ENST00000640146 1554 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
CLSTN1O94985 TAL1-201ENST00000294339 5001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
CLSTN1O94985 HDHD5-201ENST00000155674 1735 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
CLSTN1O94985 TSEN15-203ENST00000423085 1743 ntTSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
CLSTN1O94985 KDM5C-204ENST00000375401 6031 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
CLSTN1O94985 CROCCP1-201ENST00000426910 5675 ntBASIC21.6■■□□□ 1.05
CLSTN1O94985 KCNK4-201ENST00000394525 1673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
CLSTN1O94985 AC013269.1-201ENST00000409259 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
CLSTN1O94985 TISP43-206ENST00000623376 1653 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
CLSTN1O94985 XBP1-203ENST00000403532 1824 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC21.59■■□□□ 1.05
CLSTN1O94985 SPOCK3-215ENST00000510741 1963 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
CLSTN1O94985 BID-204ENST00000399767 2129 ntTSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
CLSTN1O94985 IDH1-205ENST00000446179 2298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.9 ms