Protein–RNA interactions for Protein: O75386

TULP3, Tubby-related protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 442 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TULP3O75386 ABBA01031674.1-201ENST00000635145 728 ntBASIC20.1■□□□□ 0.81
TULP3O75386 AC097662.2-201ENST00000641359 267 ntAPPRIS P1 BASIC20.1■□□□□ 0.81
TULP3O75386 AC092667.1-201ENST00000434301 2586 ntBASIC20.1■□□□□ 0.81
TULP3O75386 GAS2-202ENST00000454584 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
TULP3O75386 PCGF3-208ENST00000470161 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
TULP3O75386 KLHL31-202ENST00000407079 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
TULP3O75386 ZNF668-207ENST00000535577 2396 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
TULP3O75386 GSTM4-201ENST00000326729 1321 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
TULP3O75386 RPS6KA2-201ENST00000265678 5824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
TULP3O75386 HEY2-201ENST00000368364 2678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
TULP3O75386 GUCY1A3-210ENST00000513574 2656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
TULP3O75386 BCKDK-203ENST00000394950 1997 ntTSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
TULP3O75386 PAQR6-215ENST00000623241 1961 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
TULP3O75386 HES2-203ENST00000377837 1222 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
TULP3O75386 NEURL1B-202ENST00000520919 1089 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
TULP3O75386 AC026271.3-201ENST00000571884 352 ntBASIC20.09■□□□□ 0.81
TULP3O75386 ZNF599-203ENST00000588760 948 ntTSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
TULP3O75386 SMN1-211ENST00000625245 885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
TULP3O75386 SMN2-215ENST00000628696 885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
TULP3O75386 CROCCP4-202ENST00000633627 573 ntTSL 3 BASIC20.09■□□□□ 0.81
TULP3O75386 IL11RA-201ENST00000318041 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
TULP3O75386 DUSP7-202ENST00000495880 3340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
TULP3O75386 ACHE-207ENST00000428317 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
TULP3O75386 GNA15-201ENST00000262958 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
TULP3O75386 TAF6L-201ENST00000294168 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
TULP3O75386 SMYD2-201ENST00000366957 1671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
TULP3O75386 FAM131C-201ENST00000375662 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
TULP3O75386 ZNF48-201ENST00000320159 3234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
TULP3O75386 TMEM234-203ENST00000373593 1411 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
TULP3O75386 MED26-207ENST00000611692 1444 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
TULP3O75386 LGALS12-203ENST00000394618 1618 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
TULP3O75386 TRABD2A-201ENST00000335459 1844 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
TULP3O75386 IGFBP7-AS1-201ENST00000499667 1389 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
TULP3O75386 SLC35A3-208ENST00000638336 2438 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
TULP3O75386 BX119927.1-201ENST00000636596 1552 ntBASIC20.08■□□□□ 0.81
TULP3O75386 B4GALNT1-208ENST00000550764 1967 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
TULP3O75386 GABRA2-214ENST00000515082 2366 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
TULP3O75386 GLIPR2-203ENST00000396613 1917 ntTSL 4 BASIC20.08■□□□□ 0.81
TULP3O75386 FSCN1P1-201ENST00000568912 1481 ntBASIC20.08■□□□□ 0.81
TULP3O75386 MESTP1-201ENST00000404287 994 ntBASIC20.08■□□□□ 0.81
TULP3O75386 AL954642.1-201ENST00000428088 538 ntTSL 3 BASIC20.08■□□□□ 0.81
TULP3O75386 USP46-AS1-201ENST00000503051 1048 ntTSL 3 BASIC20.08■□□□□ 0.81
TULP3O75386 NCAM1-AS1-201ENST00000526229 1081 ntTSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.81
TULP3O75386 SIVA1-207ENST00000556195 674 ntTSL 3 BASIC20.08■□□□□ 0.81
TULP3O75386 GCHFR-205ENST00000559932 695 ntTSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.81
TULP3O75386 TK2-213ENST00000563369 882 ntTSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.81
TULP3O75386 SLC39A11-207ENST00000579732 1004 ntTSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.81
TULP3O75386 AC027682.4-201ENST00000605277 798 ntTSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.81
TULP3O75386 CEBPA-201ENST00000498907 2631 ntAPPRIS P1 BASIC20.08■□□□□ 0.8
TULP3O75386 EFHD2-201ENST00000375980 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
TULP3O75386 ME3-202ENST00000393324 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
TULP3O75386 ARFRP1-214ENST00000622789 2559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
TULP3O75386 ZNF664-207ENST00000539644 5108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
TULP3O75386 IFNAR2-204ENST00000382264 1389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
TULP3O75386 TNFAIP2-209ENST00000560869 4683 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.8
TULP3O75386 ALKBH6-213ENST00000486389 1525 ntTSL 3 BASIC20.07■□□□□ 0.8
TULP3O75386 PACSIN3-211ENST00000539589 2009 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.07■□□□□ 0.8
TULP3O75386 INTS11-202ENST00000411962 1832 ntTSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
TULP3O75386 BTBD1-202ENST00000379403 1467 ntTSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
TULP3O75386 CYP2D8P-201ENST00000433633 1490 ntBASIC20.07■□□□□ 0.8
TULP3O75386 C1orf50-201ENST00000372525 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
TULP3O75386 ID1-202ENST00000376112 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
TULP3O75386 UBB-203ENST00000395839 1012 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.07■□□□□ 0.8
TULP3O75386 JAKMIP1-201ENST00000282924 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
TULP3O75386 GYG1-202ENST00000345003 2052 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
TULP3O75386 RASGRP1-201ENST00000310803 5023 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
TULP3O75386 RASGRP1-204ENST00000539159 5021 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
TULP3O75386 SMTN-204ENST00000404574 1735 ntTSL 2 BASIC20.07■□□□□ 0.8
TULP3O75386 HOXA11-AS-205ENST00000522863 1723 ntTSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
TULP3O75386 CHRNB2-205ENST00000637900 2390 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
TULP3O75386 FEZF1-202ENST00000427185 1368 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
TULP3O75386 LRRC23-207ENST00000433346 1387 ntTSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
TULP3O75386 PHOSPHO1-202ENST00000413580 2173 ntTSL 2 BASIC20.07■□□□□ 0.8
TULP3O75386 TMEM8A-201ENST00000250930 2346 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.07■□□□□ 0.8
TULP3O75386 SPRN-201ENST00000414069 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
TULP3O75386 ME2-202ENST00000382927 2492 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
TULP3O75386 INTS11-208ENST00000435064 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
TULP3O75386 TTC39C-202ENST00000317571 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
TULP3O75386 AVPR2-202ENST00000358927 1763 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.06■□□□□ 0.8
TULP3O75386 PSMD6-201ENST00000295901 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
TULP3O75386 HBA1-201ENST00000320868 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
TULP3O75386 COX5A-201ENST00000322347 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
TULP3O75386 AC004980.1-204ENST00000429707 299 ntBASIC20.06■□□□□ 0.8
TULP3O75386 UNC5B-AS1-201ENST00000447119 647 ntTSL 2 BASIC20.06■□□□□ 0.8
TULP3O75386 STAC3-202ENST00000546246 1014 ntTSL 2 BASIC20.06■□□□□ 0.8
TULP3O75386 TMEM235-204ENST00000551068 1187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.06■□□□□ 0.8
TULP3O75386 NAPSB-206ENST00000562112 1266 ntBASIC20.06■□□□□ 0.8
TULP3O75386 AL031600.3-201ENST00000566287 1124 ntTSL 5 BASIC20.06■□□□□ 0.8
TULP3O75386 MAP3K14-AS1-202ENST00000585351 893 ntTSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
TULP3O75386 HLX-201ENST00000366903 2280 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
TULP3O75386 BRSK2-215ENST00000544817 1842 ntTSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
TULP3O75386 PPM1D-204ENST00000629650 1525 ntTSL 5 BASIC20.06■□□□□ 0.8
TULP3O75386 MYL5-206ENST00000506838 2956 ntTSL 2 BASIC20.06■□□□□ 0.8
TULP3O75386 LINC01568-207ENST00000641790 1380 ntBASIC20.06■□□□□ 0.8
TULP3O75386 SPOCK3-217ENST00000511269 1768 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.06■□□□□ 0.8
TULP3O75386 IRX3-201ENST00000329734 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
TULP3O75386 EEF1D-246ENST00000532741 2387 ntTSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
TULP3O75386 SHOX2-203ENST00000441443 3038 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.05■□□□□ 0.8
TULP3O75386 SMURF1-202ENST00000361368 5581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
TULP3O75386 BEX3-204ENST00000372645 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 75.4 ms