Protein–RNA interactions for Protein: O15553

MEFV, Pyrin, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 781 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MEFVO15553 AC069185.1-201ENST00000531395 811 ntTSL 3 BASIC21.43■■□□□ 1.02
MEFVO15553 AC140479.4-201ENST00000561715 463 ntTSL 4 BASIC21.43■■□□□ 1.02
MEFVO15553 FP475955.1-201ENST00000624937 553 ntTSL 4 BASIC21.43■■□□□ 1.02
MEFVO15553 LRCH4-201ENST00000310300 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
MEFVO15553 TMEM91-203ENST00000392002 1389 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
MEFVO15553 PRDM8-202ENST00000415738 3124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
MEFVO15553 GALNT16-204ENST00000553669 1629 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
MEFVO15553 PNKP-214ENST00000600573 1602 ntTSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
MEFVO15553 PHGDH-210ENST00000641115 1638 ntBASIC21.43■■□□□ 1.02
MEFVO15553 RTN1-202ENST00000342503 1703 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
MEFVO15553 ASPG-201ENST00000546892 1791 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
MEFVO15553 AL445183.2-201ENST00000439621 1871 ntTSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
MEFVO15553 MAPK15-201ENST00000338033 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
MEFVO15553 RGMB-207ENST00000513185 2052 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
MEFVO15553 SPHK1-203ENST00000545180 2238 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
MEFVO15553 TMEM8A-201ENST00000250930 2346 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
MEFVO15553 FLVCR1-201ENST00000366971 5939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
MEFVO15553 ATP5D-201ENST00000215375 997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
MEFVO15553 WDR74-201ENST00000278856 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
MEFVO15553 CCNO-201ENST00000282572 1433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
MEFVO15553 VEGFB-201ENST00000309422 1380 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
MEFVO15553 C17orf58-201ENST00000334461 1535 ntTSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
MEFVO15553 CCDC151-201ENST00000356392 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
MEFVO15553 CCDC107-202ENST00000378406 1016 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
MEFVO15553 UPK3B-203ENST00000394849 1041 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
MEFVO15553 SAE1-203ENST00000413379 2313 ntTSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
MEFVO15553 AC110769.1-201ENST00000420161 815 ntTSL 3 BASIC21.42■■□□□ 1.02
MEFVO15553 HSPA8-202ENST00000453788 2004 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
MEFVO15553 CENPS-CORT-202ENST00000465026 494 ntTSL 3 BASIC21.42■■□□□ 1.02
MEFVO15553 CENPS-CORT-203ENST00000470413 626 ntTSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
MEFVO15553 ROPN1-209ENST00000495093 1376 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
MEFVO15553 AC035140.1-201ENST00000507957 493 ntTSL 3 BASIC21.42■■□□□ 1.02
MEFVO15553 CRACR2B-207ENST00000528542 1792 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
MEFVO15553 PRKY-204ENST00000533551 1019 ntBASIC21.42■■□□□ 1.02
MEFVO15553 CD37-204ENST00000535669 1674 ntTSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
MEFVO15553 AL049780.2-201ENST00000556236 367 ntTSL 3 BASIC21.42■■□□□ 1.02
MEFVO15553 ISG20-210ENST00000560741 800 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
MEFVO15553 FAM58A-204ENST00000576892 1306 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
MEFVO15553 SYNGR4-202ENST00000595322 533 ntTSL 3 BASIC21.42■■□□□ 1.02
MEFVO15553 FGF14-IT1-202ENST00000607251 2123 ntTSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
MEFVO15553 AC013268.1-201ENST00000639717 1208 ntTSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
MEFVO15553 EBF1-202ENST00000380654 2345 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
MEFVO15553 UBAP1-204ENST00000625521 2029 ntTSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
MEFVO15553 COQ10A-201ENST00000308197 1652 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
MEFVO15553 ZNF561-AS1-201ENST00000585797 1593 ntTSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
MEFVO15553 PLCD1-201ENST00000334661 2769 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
MEFVO15553 PLEKHG4-201ENST00000360461 6782 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
MEFVO15553 PSKH2-201ENST00000276616 1322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
MEFVO15553 FAM98C-201ENST00000252530 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
MEFVO15553 PTPRCAP-201ENST00000326294 1292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
MEFVO15553 RPS2P55-201ENST00000397318 883 ntBASIC21.41■■□□□ 1.02
MEFVO15553 YBEY-205ENST00000397694 534 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
MEFVO15553 MDK-205ENST00000405308 1166 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
MEFVO15553 SNX5-213ENST00000486039 602 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
MEFVO15553 AC107956.1-201ENST00000494359 873 ntBASIC21.41■■□□□ 1.02
MEFVO15553 ADAMTS19-AS1-201ENST00000502827 786 ntTSL 4 BASIC21.41■■□□□ 1.02
MEFVO15553 AC233702.5-201ENST00000584107 538 ntBASIC21.41■■□□□ 1.02
MEFVO15553 FAM98C-205ENST00000588262 826 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
MEFVO15553 DCAKD-208ENST00000614054 2054 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
MEFVO15553 USP39-204ENST00000409766 2033 ntTSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
MEFVO15553 CYP21A1P-201ENST00000342991 1971 ntTSL 3 BASIC21.41■■□□□ 1.02
MEFVO15553 SYT7-208ENST00000542670 1887 ntTSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
MEFVO15553 INTS11-209ENST00000450926 1839 ntTSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
MEFVO15553 TNKS2-201ENST00000371627 6157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
MEFVO15553 SHANK1-203ENST00000391813 4785 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
MEFVO15553 WWOX-202ENST00000402655 1594 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
MEFVO15553 TNFSF11-203ENST00000398795 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
MEFVO15553 ZSCAN1-201ENST00000282326 2054 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
MEFVO15553 ZNF554-201ENST00000317243 2736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
MEFVO15553 MGARP-201ENST00000398955 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
MEFVO15553 ZNF664-207ENST00000539644 5108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
MEFVO15553 RPP25L-201ENST00000297613 1092 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
MEFVO15553 LYPD1-201ENST00000345008 1033 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
MEFVO15553 MDFI-202ENST00000373050 809 ntTSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
MEFVO15553 RAB29-203ENST00000414729 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
MEFVO15553 MOK-228ENST00000523231 1114 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
MEFVO15553 CAVIN3-203ENST00000530979 957 ntTSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
MEFVO15553 DHRS4-206ENST00000558581 1143 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
MEFVO15553 AC027682.2-201ENST00000563083 336 ntTSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
MEFVO15553 AC097641.1-201ENST00000580671 588 ntTSL 4 BASIC21.4■■□□□ 1.02
MEFVO15553 SMAGP-206ENST00000604188 433 ntTSL 3 BASIC21.4■■□□□ 1.02
MEFVO15553 CDC42BPB-201ENST00000361246 6758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
MEFVO15553 BRSK1-201ENST00000309383 3079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
MEFVO15553 TRABD2A-201ENST00000335459 1844 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
MEFVO15553 TAF7-201ENST00000313368 2334 ntAPPRIS P1 BASIC21.4■■□□□ 1.02
MEFVO15553 ESYT2-201ENST00000251527 5960 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
MEFVO15553 MARK2-211ENST00000513765 2671 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
MEFVO15553 MSLN-205ENST00000563941 2109 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
MEFVO15553 MARK2-204ENST00000402010 4728 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
MEFVO15553 PNCK-201ENST00000340888 1508 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.02
MEFVO15553 STXBP6-203ENST00000419632 1970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
MEFVO15553 DOK2-201ENST00000276420 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
MEFVO15553 FAM3A-203ENST00000369641 1359 ntTSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.02
MEFVO15553 ODF3L2-202ENST00000382696 1393 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
MEFVO15553 AL035252.2-201ENST00000454676 3168 ntTSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.02
MEFVO15553 AC007249.2-201ENST00000553181 1737 ntTSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
MEFVO15553 POMC-202ENST00000380794 1295 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.01
MEFVO15553 TGIF1-219ENST00000551541 990 ntTSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.01
MEFVO15553 AL354712.1-201ENST00000563570 477 ntTSL 3 BASIC21.39■■□□□ 1.01
MEFVO15553 TNNT1-208ENST00000587465 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 52.1 ms