Protein–RNA interactions for Protein: O14975

SLC27A2, Very long-chain acyl-CoA synthetase, humanhuman

Predictions only

Length 620 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLC27A2O14975 ARRB2-216ENST00000574954 1348 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
SLC27A2O14975 ZNF281-202ENST00000367352 2933 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.29■■□□□ 1.32
SLC27A2O14975 ART5-203ENST00000397068 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
SLC27A2O14975 FHL1-219ENST00000618438 2178 ntTSL 3 BASIC23.28■■□□□ 1.32
SLC27A2O14975 PVRIG-201ENST00000317271 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
SLC27A2O14975 FAM83E-201ENST00000263266 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
SLC27A2O14975 DUT-202ENST00000455976 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
SLC27A2O14975 CEACAM3-201ENST00000344550 1022 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
SLC27A2O14975 TREX2-204ENST00000370212 861 ntTSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
SLC27A2O14975 TREX2-205ENST00000370231 1255 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
SLC27A2O14975 GDAP1L1-202ENST00000372952 722 ntTSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
SLC27A2O14975 UHRF2-202ENST00000381373 802 ntTSL 3 BASIC23.28■■□□□ 1.32
SLC27A2O14975 TREX2-207ENST00000393862 907 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
SLC27A2O14975 EP300-AS1-201ENST00000420537 457 ntTSL 3 BASIC23.28■■□□□ 1.32
SLC27A2O14975 LINC00708-201ENST00000428165 916 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
SLC27A2O14975 YBX1P10-201ENST00000444752 975 ntBASIC23.28■■□□□ 1.32
SLC27A2O14975 MMAB-206ENST00000540016 945 ntTSL 3 BASIC23.28■■□□□ 1.32
SLC27A2O14975 LINC00654-202ENST00000589201 579 ntTSL 3 BASIC23.28■■□□□ 1.32
SLC27A2O14975 Six3os1_6.1-201ENST00000620790 196 ntBASIC23.28■■□□□ 1.32
SLC27A2O14975 LGALS9C-212ENST00000583322 1602 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
SLC27A2O14975 DBNL-210ENST00000448521 1808 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
SLC27A2O14975 TSPAN15-201ENST00000373290 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
SLC27A2O14975 CDKN2B-AS1-217ENST00000585267 1337 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
SLC27A2O14975 GAS2L1-208ENST00000616432 2925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
SLC27A2O14975 HSPB2-C11orf52-202ENST00000534100 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
SLC27A2O14975 TRAPPC12-202ENST00000382110 2483 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.27■■□□□ 1.32
SLC27A2O14975 SGCE-207ENST00000447873 1597 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
SLC27A2O14975 CACNA2D1-203ENST00000423588 1429 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
SLC27A2O14975 MIXL1-201ENST00000366810 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
SLC27A2O14975 POLR1D-203ENST00000399697 2036 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
SLC27A2O14975 DISC1-202ENST00000317586 2636 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
SLC27A2O14975 POMC-201ENST00000264708 1074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.27■■□□□ 1.32
SLC27A2O14975 GUK1-209ENST00000366730 937 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC23.27■■□□□ 1.32
SLC27A2O14975 ZNF529-AS1-202ENST00000475219 1033 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
SLC27A2O14975 DENND3-207ENST00000518347 850 ntTSL 2 BASIC23.27■■□□□ 1.32
SLC27A2O14975 AC016065.1-203ENST00000523225 1017 ntTSL 3 BASIC23.27■■□□□ 1.32
SLC27A2O14975 GTF2IRD2B-206ENST00000614064 573 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
SLC27A2O14975 GMPPA-213ENST00000622191 1473 ntTSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
SLC27A2O14975 SYTL1-210ENST00000616558 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
SLC27A2O14975 MAPK8IP1-201ENST00000241014 3050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
SLC27A2O14975 FAM109B-201ENST00000321753 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
SLC27A2O14975 ETFA-202ENST00000433983 1346 ntTSL 2 BASIC23.27■■□□□ 1.32
SLC27A2O14975 PDLIM3-212ENST00000620787 2352 ntTSL 4 BASIC23.27■■□□□ 1.32
SLC27A2O14975 FOXD4-201ENST00000382500 1974 ntAPPRIS P1 BASIC23.27■■□□□ 1.32
SLC27A2O14975 SKP2-208ENST00000546211 1589 ntTSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
SLC27A2O14975 HIGD1A-201ENST00000321331 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.31
SLC27A2O14975 CHTOP-204ENST00000368694 2096 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
SLC27A2O14975 BID-202ENST00000342111 854 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
SLC27A2O14975 NRXN2-203ENST00000377551 6373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
SLC27A2O14975 MCHR1-202ENST00000381433 1219 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
SLC27A2O14975 NAA60-204ENST00000421765 1045 ntTSL 2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
SLC27A2O14975 LINC01881-205ENST00000456398 1235 ntTSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
SLC27A2O14975 EXOSC4-202ENST00000525936 606 ntTSL 3 BASIC23.26■■□□□ 1.31
SLC27A2O14975 AC022167.3-201ENST00000564485 427 ntTSL 2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
SLC27A2O14975 RELB-207ENST00000625761 2279 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
SLC27A2O14975 AC008060.1-201ENST00000401499 1551 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
SLC27A2O14975 TM7SF3-201ENST00000343028 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
SLC27A2O14975 GJB3-202ENST00000373366 2217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
SLC27A2O14975 BRSK1-201ENST00000309383 3079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
SLC27A2O14975 DMKN-207ENST00000419602 1496 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
SLC27A2O14975 CRMP1-201ENST00000324989 3146 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
SLC27A2O14975 LDHD-201ENST00000300051 2067 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
SLC27A2O14975 PRKAR2A-206ENST00000454963 1849 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
SLC27A2O14975 ABHD14A-201ENST00000273596 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
SLC27A2O14975 ESRRAP1-201ENST00000400596 1257 ntBASIC23.25■■□□□ 1.31
SLC27A2O14975 RPS23-206ENST00000510210 1058 ntTSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
SLC27A2O14975 KRT18P16-201ENST00000510337 1294 ntBASIC23.25■■□□□ 1.31
SLC27A2O14975 FXYD1-204ENST00000588081 645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
SLC27A2O14975 FAM32A-205ENST00000589852 1168 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
SLC27A2O14975 SMAGP-206ENST00000604188 433 ntTSL 3 BASIC23.25■■□□□ 1.31
SLC27A2O14975 AC069544.1-201ENST00000609399 999 ntBASIC23.25■■□□□ 1.31
SLC27A2O14975 SAAL1-202ENST00000524803 1582 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
SLC27A2O14975 PRR7-202ENST00000502922 1345 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
SLC27A2O14975 MAFF-202ENST00000407965 2325 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
SLC27A2O14975 PLD4-204ENST00000540372 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
SLC27A2O14975 KXD1-202ENST00000539106 1496 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.24■■□□□ 1.31
SLC27A2O14975 PYCR1-204ENST00000403172 1811 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
SLC27A2O14975 GPR62-201ENST00000322241 2191 ntAPPRIS P1 BASIC23.24■■□□□ 1.31
SLC27A2O14975 RASSF1-202ENST00000357043 1864 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
SLC27A2O14975 TNFAIP2-209ENST00000560869 4683 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
SLC27A2O14975 BEST2-201ENST00000042931 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
SLC27A2O14975 AC068831.2-201ENST00000448987 367 ntTSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
SLC27A2O14975 AC026427.1-201ENST00000508993 555 ntTSL 3 BASIC23.24■■□□□ 1.31
SLC27A2O14975 ZNF436-AS1-206ENST00000518821 461 ntTSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
SLC27A2O14975 SYNGR4-202ENST00000595322 533 ntTSL 3 BASIC23.24■■□□□ 1.31
SLC27A2O14975 MTDHP1-201ENST00000605323 784 ntBASIC23.24■■□□□ 1.31
SLC27A2O14975 LIMS2-204ENST00000409286 1678 ntTSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
SLC27A2O14975 CYGB-201ENST00000293230 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
SLC27A2O14975 HLA-G-201ENST00000360323 1427 ntAPPRIS P2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
SLC27A2O14975 ASB18-201ENST00000409749 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
SLC27A2O14975 ECE1-205ENST00000436918 2328 ntTSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
SLC27A2O14975 LRRC1-202ENST00000370888 3180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
SLC27A2O14975 TM9SF1-203ENST00000524835 1938 ntTSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
SLC27A2O14975 CSPG5-201ENST00000264723 4080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
SLC27A2O14975 SLC25A41-201ENST00000321510 1532 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
SLC27A2O14975 KDM3B-201ENST00000314358 6813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
SLC27A2O14975 ADAMTS10-205ENST00000595838 2458 ntTSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
SLC27A2O14975 FARSA-207ENST00000588025 2057 ntTSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
SLC27A2O14975 EZH2-201ENST00000320356 2639 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
SLC27A2O14975 AUP1-201ENST00000377526 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16.6 ms