Protein–RNA interactions for Protein: K7ER74

APOC4-APOC2, APOC4-APOC2 readthrough (NMD candidate), humanhuman

Predictions only

Length 178 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
APOC4-APOC2K7ER74 REXO2-201ENST00000265881 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
APOC4-APOC2K7ER74 ZNF302-209ENST00000507959 854 ntTSL 2 BASIC20.17■□□□□ 0.82
APOC4-APOC2K7ER74 H1FX-AS1-204ENST00000511998 917 ntTSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
APOC4-APOC2K7ER74 REXO2-208ENST00000539754 791 ntTSL 2 BASIC20.17■□□□□ 0.82
APOC4-APOC2K7ER74 AC098934.4-201ENST00000564127 592 ntBASIC20.17■□□□□ 0.82
APOC4-APOC2K7ER74 AL138781.1-201ENST00000566567 1274 ntBASIC20.17■□□□□ 0.82
APOC4-APOC2K7ER74 AC007216.1-201ENST00000570197 601 ntTSL 4 BASIC20.17■□□□□ 0.82
APOC4-APOC2K7ER74 AC083880.1-201ENST00000608266 535 ntBASIC20.17■□□□□ 0.82
APOC4-APOC2K7ER74 NRXN1-202ENST00000342183 3315 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
APOC4-APOC2K7ER74 ARMC6-220ENST00000546344 1814 ntTSL 2 BASIC20.17■□□□□ 0.82
APOC4-APOC2K7ER74 ZNF398-202ENST00000475153 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
APOC4-APOC2K7ER74 UMOD-203ENST00000396138 2399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
APOC4-APOC2K7ER74 SEPT6-202ENST00000354228 1576 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
APOC4-APOC2K7ER74 AC138696.1-201ENST00000522452 2897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
APOC4-APOC2K7ER74 GFER-201ENST00000248114 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
APOC4-APOC2K7ER74 BRAF-201ENST00000288602 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
APOC4-APOC2K7ER74 SMIM4-203ENST00000477703 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
APOC4-APOC2K7ER74 DBNL-210ENST00000448521 1808 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
APOC4-APOC2K7ER74 DLGAP4-201ENST00000339266 5016 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
APOC4-APOC2K7ER74 MLF2-201ENST00000203630 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
APOC4-APOC2K7ER74 HAGH-201ENST00000397353 1257 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
APOC4-APOC2K7ER74 AKAIN1-201ENST00000434239 575 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.16■□□□□ 0.82
APOC4-APOC2K7ER74 AL807752.2-201ENST00000435463 301 ntTSL 3 BASIC20.16■□□□□ 0.82
APOC4-APOC2K7ER74 AL161908.1-201ENST00000451449 449 ntTSL 2 BASIC20.16■□□□□ 0.82
APOC4-APOC2K7ER74 SLC29A4P2-201ENST00000504749 1089 ntBASIC20.16■□□□□ 0.82
APOC4-APOC2K7ER74 ABCC3-217ENST00000515707 656 ntTSL 3 BASIC20.16■□□□□ 0.82
APOC4-APOC2K7ER74 PNMA6B-201ENST00000538162 1200 ntBASIC20.16■□□□□ 0.82
APOC4-APOC2K7ER74 AL929601.1-201ENST00000551565 573 ntTSL 4 BASIC20.16■□□□□ 0.82
APOC4-APOC2K7ER74 HSD17B12-213ENST00000637401 866 ntTSL 4 BASIC20.16■□□□□ 0.82
APOC4-APOC2K7ER74 MARK2-202ENST00000361128 3004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
APOC4-APOC2K7ER74 TRMU-202ENST00000381019 1381 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
APOC4-APOC2K7ER74 AC007383.3-201ENST00000453039 1411 ntTSL 3 BASIC20.16■□□□□ 0.82
APOC4-APOC2K7ER74 GMPPA-213ENST00000622191 1473 ntTSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
APOC4-APOC2K7ER74 GLS-201ENST00000320717 4834 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
APOC4-APOC2K7ER74 AC148477.3-202ENST00000376617 1766 ntTSL 2 BASIC20.16■□□□□ 0.82
APOC4-APOC2K7ER74 PLCB2-204ENST00000557821 4517 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
APOC4-APOC2K7ER74 ZNRF1-202ENST00000335325 4620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
APOC4-APOC2K7ER74 IRF7-203ENST00000397566 2051 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
APOC4-APOC2K7ER74 USP21-201ENST00000289865 2195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
APOC4-APOC2K7ER74 TRIM58-201ENST00000366481 3225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
APOC4-APOC2K7ER74 NDUFB1-201ENST00000329559 528 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
APOC4-APOC2K7ER74 OTUB1-203ENST00000428192 1296 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
APOC4-APOC2K7ER74 AC022509.3-202ENST00000545819 566 ntTSL 3 BASIC20.15■□□□□ 0.82
APOC4-APOC2K7ER74 AL109923.1-201ENST00000618799 583 ntBASIC20.15■□□□□ 0.82
APOC4-APOC2K7ER74 AL121906.2-201ENST00000621597 723 ntBASIC20.15■□□□□ 0.82
APOC4-APOC2K7ER74 PITX3-201ENST00000370002 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
APOC4-APOC2K7ER74 GNA12-201ENST00000275364 4378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
APOC4-APOC2K7ER74 CASTOR1-202ENST00000407689 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
APOC4-APOC2K7ER74 MELTF-202ENST00000296351 1650 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
APOC4-APOC2K7ER74 ST3GAL4-205ENST00000449406 1669 ntTSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
APOC4-APOC2K7ER74 MCEMP1-201ENST00000333598 1730 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
APOC4-APOC2K7ER74 OSR2-202ENST00000435298 1736 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
APOC4-APOC2K7ER74 EWSR1-208ENST00000414183 2189 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
APOC4-APOC2K7ER74 DSCC1-201ENST00000313655 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
APOC4-APOC2K7ER74 EVL-202ENST00000402714 2353 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
APOC4-APOC2K7ER74 PCDHGB3-202ENST00000618934 2445 ntAPPRIS P1 BASIC20.15■□□□□ 0.82
APOC4-APOC2K7ER74 RHOT2-201ENST00000315082 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
APOC4-APOC2K7ER74 SHANK1-203ENST00000391813 4785 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.82
APOC4-APOC2K7ER74 FOXN3-214ENST00000557258 2692 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.82
APOC4-APOC2K7ER74 AOC3-204ENST00000591562 2522 ntTSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.82
APOC4-APOC2K7ER74 PRSS36-202ENST00000418068 2446 ntTSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.82
APOC4-APOC2K7ER74 SLC39A4-201ENST00000276833 2297 ntTSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
APOC4-APOC2K7ER74 DPF1-209ENST00000456296 1562 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
APOC4-APOC2K7ER74 RHBDL1-202ENST00000352681 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
APOC4-APOC2K7ER74 CAV3-201ENST00000343849 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
APOC4-APOC2K7ER74 CCAR2-214ENST00000613179 1421 ntTSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
APOC4-APOC2K7ER74 PSKH2-201ENST00000276616 1322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
APOC4-APOC2K7ER74 NAAA-206ENST00000507956 1300 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
APOC4-APOC2K7ER74 CUEDC2-201ENST00000369937 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
APOC4-APOC2K7ER74 GATA3-AS1-204ENST00000438755 675 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
APOC4-APOC2K7ER74 ABHD17AP6-201ENST00000458502 1044 ntBASIC20.14■□□□□ 0.81
APOC4-APOC2K7ER74 GNB5-211ENST00000560116 918 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
APOC4-APOC2K7ER74 PAQR4-205ENST00000576565 842 ntTSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
APOC4-APOC2K7ER74 VIM-AS1-202ENST00000605833 918 ntTSL 3 BASIC20.14■□□□□ 0.81
APOC4-APOC2K7ER74 AC092666.2-201ENST00000613287 246 ntBASIC20.14■□□□□ 0.81
APOC4-APOC2K7ER74 LMO4-202ENST00000370544 5405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
APOC4-APOC2K7ER74 ITGBL1-202ENST00000376180 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
APOC4-APOC2K7ER74 SOCS2-206ENST00000549122 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
APOC4-APOC2K7ER74 ATPIF1-202ENST00000465645 1855 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
APOC4-APOC2K7ER74 SPHK1-207ENST00000590959 1851 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
APOC4-APOC2K7ER74 TMEM218-213ENST00000531909 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
APOC4-APOC2K7ER74 MEN1-209ENST00000394376 3034 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
APOC4-APOC2K7ER74 DISC1-204ENST00000366633 2676 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
APOC4-APOC2K7ER74 DISC1-214ENST00000539444 2658 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
APOC4-APOC2K7ER74 ARRDC2-201ENST00000222250 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
APOC4-APOC2K7ER74 PAFAH1B2-202ENST00000419197 2517 ntTSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
APOC4-APOC2K7ER74 HEMK1-206ENST00000455834 1499 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
APOC4-APOC2K7ER74 CECR2-202ENST00000342247 6178 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
APOC4-APOC2K7ER74 SLC1A7-201ENST00000371491 1306 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
APOC4-APOC2K7ER74 NSMF-201ENST00000265663 2981 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
APOC4-APOC2K7ER74 CAVIN3-201ENST00000303927 1174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
APOC4-APOC2K7ER74 ANKRD39-201ENST00000393537 976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
APOC4-APOC2K7ER74 EIF4E3-203ENST00000421769 777 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
APOC4-APOC2K7ER74 AC009065.4-203ENST00000562838 535 ntTSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
APOC4-APOC2K7ER74 AC133041.1-202ENST00000642053 222 ntBASIC20.13■□□□□ 0.81
APOC4-APOC2K7ER74 FARSA-207ENST00000588025 2057 ntTSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
APOC4-APOC2K7ER74 P2RX5-202ENST00000345901 2031 ntTSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
APOC4-APOC2K7ER74 TRPV3-209ENST00000576742 2766 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
APOC4-APOC2K7ER74 LAPTM4B-204ENST00000619747 2758 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
APOC4-APOC2K7ER74 LAG3-201ENST00000203629 1974 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.8 ms