Protein–RNA interactions for Protein: H3BQV1

Uncharacterized protein (Fragment), humanhuman

Predictions only

Length 296 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
H3BQV1 AGO4-201ENST00000373210 7116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
H3BQV1 MYO9A-214ENST00000566885 5111 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
H3BQV1 ZNF771-202ENST00000434417 1454 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
H3BQV1 TMSB4X-203ENST00000380636 1702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
H3BQV1 LDHAL6A-202ENST00000396213 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
H3BQV1 FBLN7-202ENST00000331203 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
H3BQV1 AC098818.2-201ENST00000564925 2320 ntBASIC22.8■■□□□ 1.24
H3BQV1 SMAD7-201ENST00000262158 3087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
H3BQV1 Z82202.1-201ENST00000623446 1880 ntBASIC22.8■■□□□ 1.24
H3BQV1 CSF1-205ENST00000420111 1083 ntTSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
H3BQV1 DNAJA4-210ENST00000489435 947 ntTSL 3 BASIC22.8■■□□□ 1.24
H3BQV1 WWTR1-AS1-203ENST00000495094 975 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
H3BQV1 AC083906.2-201ENST00000511578 360 ntBASIC22.8■■□□□ 1.24
H3BQV1 SNAP23-210ENST00000564153 775 ntTSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
H3BQV1 AL121832.2-201ENST00000610979 668 ntBASIC22.8■■□□□ 1.24
H3BQV1 UMOD-203ENST00000396138 2399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
H3BQV1 C17orf58-201ENST00000334461 1535 ntTSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
H3BQV1 PCMT1-203ENST00000367384 1938 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
H3BQV1 SLC35E1-208ENST00000595753 5099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
H3BQV1 ECE1-205ENST00000436918 2328 ntTSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
H3BQV1 SMTN-204ENST00000404574 1735 ntTSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
H3BQV1 GLRB-207ENST00000541722 2765 ntTSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
H3BQV1 RASSF1-202ENST00000357043 1864 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
H3BQV1 PRKCI-201ENST00000295797 4950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
H3BQV1 C16orf74-201ENST00000284245 906 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
H3BQV1 PPP1CA-202ENST00000358239 1054 ntTSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
H3BQV1 CALM3-202ENST00000391918 702 ntTSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
H3BQV1 NME6-213ENST00000451657 871 ntTSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
H3BQV1 LINC01962-201ENST00000513771 411 ntTSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
H3BQV1 PLEKHJ1-205ENST00000587394 937 ntTSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
H3BQV1 AP000974.1-201ENST00000623909 2387 ntBASIC22.79■■□□□ 1.24
H3BQV1 AC116351.2-201ENST00000606540 1585 ntBASIC22.79■■□□□ 1.24
H3BQV1 HCN2-201ENST00000251287 3408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
H3BQV1 DBNDD2-206ENST00000372720 1481 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
H3BQV1 PRR14-203ENST00000542965 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
H3BQV1 ARNT-202ENST00000358595 4887 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
H3BQV1 BX323043.1-201ENST00000641006 1765 ntBASIC22.78■■□□□ 1.24
H3BQV1 KAT5-203ENST00000377046 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
H3BQV1 SHANK1-202ENST00000359082 6459 ntTSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
H3BQV1 SHANK3-203ENST00000445220 5175 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
H3BQV1 AKNA-205ENST00000374079 2138 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
H3BQV1 TJP1-208ENST00000495972 2890 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
H3BQV1 AC008878.3-201ENST00000617428 4964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
H3BQV1 HRASLS-201ENST00000264735 1066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
H3BQV1 PITPNC1-201ENST00000299954 6359 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
H3BQV1 DUSP5P2-201ENST00000426873 1033 ntBASIC22.78■■□□□ 1.24
H3BQV1 ENTPD8-204ENST00000472938 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
H3BQV1 NCAPD3-204ENST00000526422 1060 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
H3BQV1 SNX7-205ENST00000529992 1589 ntTSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
H3BQV1 IQSEC1-201ENST00000273221 5279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
H3BQV1 CREG2-201ENST00000324768 6383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
H3BQV1 C11orf49-201ENST00000278460 1645 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
H3BQV1 BZW1-209ENST00000452790 1473 ntTSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
H3BQV1 RELB-207ENST00000625761 2279 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
H3BQV1 PRSS12-201ENST00000296498 4809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
H3BQV1 AL032819.2-201ENST00000624543 2162 ntBASIC22.77■■□□□ 1.24
H3BQV1 ISLR2-208ENST00000565159 2824 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.77■■□□□ 1.24
H3BQV1 CENPN-201ENST00000299572 1398 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
H3BQV1 LRP8-204ENST00000371454 3322 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
H3BQV1 FAM83E-201ENST00000263266 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
H3BQV1 DUT-202ENST00000455976 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
H3BQV1 PPP1R36-201ENST00000298705 1405 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
H3BQV1 UNC119-202ENST00000335765 1424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
H3BQV1 TRPV3-209ENST00000576742 2766 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
H3BQV1 ZNF582-207ENST00000619584 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
H3BQV1 SLC52A2-209ENST00000530047 1757 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
H3BQV1 VAV1-210ENST00000602142 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
H3BQV1 BHLHA15-201ENST00000314018 706 ntAPPRIS P1 BASIC22.77■■□□□ 1.24
H3BQV1 ALKBH6-212ENST00000485128 959 ntTSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
H3BQV1 ZNF436-AS1-206ENST00000518821 461 ntTSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
H3BQV1 BHLHA15-202ENST00000609256 796 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.77■■□□□ 1.24
H3BQV1 MUTYH-203ENST00000372098 1839 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
H3BQV1 MUTYH-204ENST00000372104 1823 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
H3BQV1 MUTYH-205ENST00000372110 1809 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
H3BQV1 ZNF821-221ENST00000611294 1833 ntTSL 3 BASIC22.77■■□□□ 1.24
H3BQV1 REEP2-202ENST00000378339 2170 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
H3BQV1 NHLH2-201ENST00000320238 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
H3BQV1 FAM131C-201ENST00000375662 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
H3BQV1 PDZD3-203ENST00000525131 1882 ntTSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
H3BQV1 MAGED2-203ENST00000375053 2066 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.23
H3BQV1 MEN1-206ENST00000377321 2614 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.23
H3BQV1 SEPT7-206ENST00000435235 1584 ntTSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
H3BQV1 THTPA-202ENST00000404535 1779 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
H3BQV1 FAM91A1-201ENST00000334705 5511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
H3BQV1 FAM239A-202ENST00000438107 2155 ntTSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
H3BQV1 NFATC1-217ENST00000591814 4819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
H3BQV1 AC093627.4-201ENST00000484550 5008 ntTSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
H3BQV1 LAPTM4B-204ENST00000619747 2758 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
H3BQV1 NUDT22-201ENST00000279206 1094 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
H3BQV1 NUDT22-204ENST00000441250 986 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
H3BQV1 HIGD1A-204ENST00000452906 585 ntTSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
H3BQV1 CAMLG-202ENST00000514518 895 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
H3BQV1 CKLF-CMTM1-204ENST00000532838 587 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC22.76■■□□□ 1.23
H3BQV1 Z97986.1-201ENST00000565879 476 ntTSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
H3BQV1 AC005829.2-201ENST00000571422 1056 ntBASIC22.76■■□□□ 1.23
H3BQV1 KCNE5-201ENST00000372101 1473 ntAPPRIS P1 BASIC22.76■■□□□ 1.23
H3BQV1 LIMS2-204ENST00000409286 1678 ntTSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
H3BQV1 AC245041.2-204ENST00000610809 1962 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
H3BQV1 C1orf198-201ENST00000366663 3858 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
H3BQV1 CEP55-201ENST00000371485 2638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.9 ms