Protein–RNA interactions for Protein: A6NDU8

C5orf51, UPF0600 protein C5orf51, humanhuman

Predictions only

Length 294 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C5orf51A6NDU8 ZFAND6-224ENST00000618205 1659 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
C5orf51A6NDU8 ERCC2-203ENST00000391944 2334 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
C5orf51A6NDU8 PCSK1N-201ENST00000218230 1050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
C5orf51A6NDU8 SRM-201ENST00000376957 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
C5orf51A6NDU8 IGHV3-20-201ENST00000390606 415 ntAPPRIS P1 BASIC16.38■□□□□ 0.21
C5orf51A6NDU8 IGHV3-33-201ENST00000390615 431 ntAPPRIS P1 BASIC16.38■□□□□ 0.21
C5orf51A6NDU8 ORMDL1-202ENST00000392349 1137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
C5orf51A6NDU8 AC009299.2-201ENST00000482477 511 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
C5orf51A6NDU8 IGHV3-30-201ENST00000603660 431 ntAPPRIS P1 BASIC16.38■□□□□ 0.21
C5orf51A6NDU8 ZEB1-AS1-205ENST00000605946 382 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
C5orf51A6NDU8 SHISA9-205ENST00000639941 1135 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
C5orf51A6NDU8 ARHGAP6-202ENST00000337414 5117 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
C5orf51A6NDU8 CROCCP3-202ENST00000420820 1947 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
C5orf51A6NDU8 ZFP91-201ENST00000316059 5220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
C5orf51A6NDU8 RETREG1-201ENST00000306320 3268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
C5orf51A6NDU8 FDXR-219ENST00000583917 1762 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
C5orf51A6NDU8 B4GALT4-202ENST00000393765 2459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
C5orf51A6NDU8 RBM14-RBM4-201ENST00000412278 1566 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
C5orf51A6NDU8 GCH1-207ENST00000622544 2923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
C5orf51A6NDU8 COMP-202ENST00000425807 2292 ntTSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
C5orf51A6NDU8 FICD-201ENST00000361549 1816 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
C5orf51A6NDU8 SUGCT-202ENST00000401647 1369 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
C5orf51A6NDU8 SLC5A10-203ENST00000395645 2069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
C5orf51A6NDU8 TMEM132A-201ENST00000005286 3480 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
C5orf51A6NDU8 ANKRD53-202ENST00000360589 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
C5orf51A6NDU8 PPP1R3F-202ENST00000376188 2443 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
C5orf51A6NDU8 SPSB4-201ENST00000310546 2908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
C5orf51A6NDU8 RNF217-211ENST00000560949 5145 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
C5orf51A6NDU8 COQ10B-201ENST00000263960 2239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
C5orf51A6NDU8 PTEN-201ENST00000371953 9027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
C5orf51A6NDU8 EPHX3-202ENST00000435261 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
C5orf51A6NDU8 ZEB1-AS1-201ENST00000423714 456 ntTSL 3 BASIC16.37■□□□□ 0.21
C5orf51A6NDU8 CDKN2A-205ENST00000479692 544 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
C5orf51A6NDU8 AC011448.1-201ENST00000555938 1100 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
C5orf51A6NDU8 KCTD5-202ENST00000564195 774 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
C5orf51A6NDU8 HOMER3-206ENST00000594439 982 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
C5orf51A6NDU8 MCCC1-215ENST00000629669 2316 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
C5orf51A6NDU8 AC009237.14-201ENST00000609975 1594 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
C5orf51A6NDU8 CRMP1-202ENST00000397890 2911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
C5orf51A6NDU8 AC009113.1-201ENST00000570267 2443 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
C5orf51A6NDU8 TRABD-203ENST00000395827 2172 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
C5orf51A6NDU8 ANKRD10-201ENST00000267339 2495 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
C5orf51A6NDU8 SLCO4A1-201ENST00000217159 2776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
C5orf51A6NDU8 EWSR1-207ENST00000406548 2207 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
C5orf51A6NDU8 NR1H2-201ENST00000253727 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
C5orf51A6NDU8 ST6GALNAC6-215ENST00000542456 2018 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
C5orf51A6NDU8 SMARCC2-201ENST00000267064 4076 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
C5orf51A6NDU8 NTRK2-206ENST00000376213 5560 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
C5orf51A6NDU8 ABHD12B-202ENST00000353130 1477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
C5orf51A6NDU8 CDHR1-201ENST00000332904 2694 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
C5orf51A6NDU8 PTPA-206ENST00000358994 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
C5orf51A6NDU8 CROCCP1-201ENST00000426910 5675 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
C5orf51A6NDU8 GABRB3-202ENST00000311550 5781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
C5orf51A6NDU8 PHF20L1-214ENST00000485595 1810 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
C5orf51A6NDU8 SLC35F3-201ENST00000366617 2762 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
C5orf51A6NDU8 ACBD4-207ENST00000586346 1579 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
C5orf51A6NDU8 TMEM54-201ENST00000329151 871 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
C5orf51A6NDU8 AGAP1-IT1-201ENST00000440498 664 ntTSL 3 BASIC16.36■□□□□ 0.21
C5orf51A6NDU8 RNF225-201ENST00000601382 990 ntAPPRIS P1 BASIC16.36■□□□□ 0.21
C5orf51A6NDU8 HOXA11-AS1_1.1-201ENST00000613939 98 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
C5orf51A6NDU8 PDP1-208ENST00000520728 2554 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
C5orf51A6NDU8 CAMK2D-201ENST00000296402 5820 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
C5orf51A6NDU8 RTEL1-204ENST00000370003 2273 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
C5orf51A6NDU8 SERPINF2-202ENST00000382061 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
C5orf51A6NDU8 INTS12-206ENST00000451321 1975 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
C5orf51A6NDU8 ATP2C1-218ENST00000510168 5067 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
C5orf51A6NDU8 AC011416.4-201ENST00000639283 2195 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
C5orf51A6NDU8 MFF-207ENST00000409565 1548 ntTSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
C5orf51A6NDU8 IFFO1-204ENST00000396840 2677 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
C5orf51A6NDU8 AGAP4-201ENST00000311652 2715 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
C5orf51A6NDU8 ORAI2-205ENST00000478730 5531 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
C5orf51A6NDU8 PLCD3-212ENST00000619929 6107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
C5orf51A6NDU8 CCDC50-202ENST00000392456 2454 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
C5orf51A6NDU8 SYBU-232ENST00000533171 2498 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
C5orf51A6NDU8 CHD1L-204ENST00000431239 2907 ntTSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
C5orf51A6NDU8 GATA2-202ENST00000430265 2525 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
C5orf51A6NDU8 URAD-201ENST00000332715 931 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
C5orf51A6NDU8 CTAG1B-202ENST00000359887 998 ntTSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
C5orf51A6NDU8 PTPA-214ENST00000423100 988 ntTSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
C5orf51A6NDU8 AC126544.1-201ENST00000580842 1059 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
C5orf51A6NDU8 SF1-220ENST00000626028 704 ntTSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
C5orf51A6NDU8 C1orf232-201ENST00000634842 643 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
C5orf51A6NDU8 AC105233.4-201ENST00000642045 216 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
C5orf51A6NDU8 L2HGDH-202ENST00000267436 6414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
C5orf51A6NDU8 PAGR1-201ENST00000320330 1702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
C5orf51A6NDU8 EARS2-206ENST00000563232 1709 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
C5orf51A6NDU8 MAP3K6-202ENST00000374040 4309 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
C5orf51A6NDU8 TFEB-203ENST00000358871 2188 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
C5orf51A6NDU8 DTX2-211ENST00000446600 2281 ntTSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
C5orf51A6NDU8 GIT1-203ENST00000394869 3711 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
C5orf51A6NDU8 APLP2-204ENST00000345598 1862 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
C5orf51A6NDU8 FAM83E-201ENST00000263266 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
C5orf51A6NDU8 GTF3C5-203ENST00000372099 1999 ntTSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
C5orf51A6NDU8 EIF2B1-201ENST00000424014 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
C5orf51A6NDU8 ARHGAP26-202ENST00000378004 9200 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
C5orf51A6NDU8 IGLON5-201ENST00000270642 2606 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
C5orf51A6NDU8 FAM167A-207ENST00000534308 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
C5orf51A6NDU8 FER1L4-210ENST00000615531 5998 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
C5orf51A6NDU8 MOXD1-203ENST00000392401 2191 ntTSL 4 BASIC16.34■□□□□ 0.21
C5orf51A6NDU8 RELB-201ENST00000221452 2294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.9 ms