Protein–RNA interactions for Protein: A0A0U1RRI6

CENPVL3, Centromere protein V-like 3, humanhuman

Predictions only

Length 287 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CENPVL3A0A0U1RRI6 ZNF497-202ENST00000425453 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
CENPVL3A0A0U1RRI6 DUSP7-202ENST00000495880 3340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
CENPVL3A0A0U1RRI6 KLHDC1-201ENST00000359332 2691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
CENPVL3A0A0U1RRI6 ZNF48-201ENST00000320159 3234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
CENPVL3A0A0U1RRI6 BRD4-202ENST00000360016 3240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
CENPVL3A0A0U1RRI6 PCMT1-205ENST00000464889 1984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
CENPVL3A0A0U1RRI6 ACP1-205ENST00000407983 703 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
CENPVL3A0A0U1RRI6 AC108025.1-201ENST00000453678 1058 ntTSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
CENPVL3A0A0U1RRI6 KCNIP3-205ENST00000468529 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
CENPVL3A0A0U1RRI6 ANK1-211ENST00000522231 1060 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
CENPVL3A0A0U1RRI6 ANK1-212ENST00000522543 1160 ntTSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
CENPVL3A0A0U1RRI6 DEUP1-206ENST00000530273 410 ntTSL 3 BASIC15.88■□□□□ 0.13
CENPVL3A0A0U1RRI6 TMEM235-204ENST00000551068 1187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
CENPVL3A0A0U1RRI6 KANK3-205ENST00000610351 1191 ntTSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
CENPVL3A0A0U1RRI6 AC131212.4-201ENST00000623606 975 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
CENPVL3A0A0U1RRI6 ATG4B-226ENST00000625810 370 ntTSL 4 BASIC15.88■□□□□ 0.13
CENPVL3A0A0U1RRI6 ABBA01031674.1-201ENST00000635145 728 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
CENPVL3A0A0U1RRI6 WAS-201ENST00000376701 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
CENPVL3A0A0U1RRI6 DNAJA4-202ENST00000394852 3116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
CENPVL3A0A0U1RRI6 BCL7A-201ENST00000261822 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
CENPVL3A0A0U1RRI6 DMKN-207ENST00000419602 1496 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
CENPVL3A0A0U1RRI6 AC079598.2-202ENST00000546624 1451 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
CENPVL3A0A0U1RRI6 CPNE7-202ENST00000319518 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
CENPVL3A0A0U1RRI6 KCNIP2-207ENST00000358038 2489 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
CENPVL3A0A0U1RRI6 HOXD11-201ENST00000249504 1533 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.88■□□□□ 0.13
CENPVL3A0A0U1RRI6 ZNF326-202ENST00000361911 1538 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
CENPVL3A0A0U1RRI6 HDHD5-201ENST00000155674 1735 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
CENPVL3A0A0U1RRI6 RASD1-201ENST00000225688 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
CENPVL3A0A0U1RRI6 DISC1-212ENST00000535983 2505 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
CENPVL3A0A0U1RRI6 AC011511.1-201ENST00000452032 1956 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
CENPVL3A0A0U1RRI6 C19orf35-201ENST00000342063 2574 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
CENPVL3A0A0U1RRI6 ATAD3A-202ENST00000378755 2612 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
CENPVL3A0A0U1RRI6 KRT8P8-201ENST00000434750 1448 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
CENPVL3A0A0U1RRI6 CDK5R2-201ENST00000302625 2508 ntAPPRIS P1 BASIC15.87■□□□□ 0.13
CENPVL3A0A0U1RRI6 FSCN1P1-201ENST00000568912 1481 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
CENPVL3A0A0U1RRI6 PILRB-207ENST00000448382 2314 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
CENPVL3A0A0U1RRI6 KRAS-201ENST00000256078 1119 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
CENPVL3A0A0U1RRI6 IZUMO2-201ENST00000293405 728 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
CENPVL3A0A0U1RRI6 AC004980.1-204ENST00000429707 299 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
CENPVL3A0A0U1RRI6 MUC1-211ENST00000438413 927 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
CENPVL3A0A0U1RRI6 AC004803.1-203ENST00000539259 501 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
CENPVL3A0A0U1RRI6 AC026271.3-201ENST00000571884 352 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
CENPVL3A0A0U1RRI6 AP005263.1-201ENST00000579126 914 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
CENPVL3A0A0U1RRI6 PDCD5-207ENST00000590247 699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
CENPVL3A0A0U1RRI6 KLHL26-205ENST00000599006 989 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
CENPVL3A0A0U1RRI6 AP000525.1-201ENST00000608286 694 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
CENPVL3A0A0U1RRI6 HLA-A-209ENST00000638375 975 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
CENPVL3A0A0U1RRI6 AC099778.1-201ENST00000568593 1911 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
CENPVL3A0A0U1RRI6 ABLIM2-205ENST00000428004 2573 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
CENPVL3A0A0U1RRI6 ICAM5-201ENST00000221980 3000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
CENPVL3A0A0U1RRI6 OGG1-202ENST00000302008 2191 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
CENPVL3A0A0U1RRI6 SNX18-203ENST00000381410 5218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
CENPVL3A0A0U1RRI6 FUT5-202ENST00000588525 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
CENPVL3A0A0U1RRI6 NDOR1-201ENST00000344894 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
CENPVL3A0A0U1RRI6 NPIPA8-201ENST00000525596 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
CENPVL3A0A0U1RRI6 GNS-207ENST00000542058 2020 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
CENPVL3A0A0U1RRI6 AC009237.14-201ENST00000609975 1594 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
CENPVL3A0A0U1RRI6 KLHDC4-203ENST00000347925 1821 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
CENPVL3A0A0U1RRI6 TXNDC5-201ENST00000379757 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
CENPVL3A0A0U1RRI6 DMPK-205ENST00000458663 2548 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
CENPVL3A0A0U1RRI6 CPLX3-201ENST00000395018 2082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
CENPVL3A0A0U1RRI6 ISLR2-202ENST00000419208 2306 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
CENPVL3A0A0U1RRI6 MED17-221ENST00000639724 2317 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
CENPVL3A0A0U1RRI6 SLC35E2-201ENST00000246421 1430 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
CENPVL3A0A0U1RRI6 EPHX1-201ENST00000272167 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
CENPVL3A0A0U1RRI6 MICU2-201ENST00000382374 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
CENPVL3A0A0U1RRI6 GLIPR2-203ENST00000396613 1917 ntTSL 4 BASIC15.86■□□□□ 0.13
CENPVL3A0A0U1RRI6 HMBS-214ENST00000542729 1469 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
CENPVL3A0A0U1RRI6 SNAP23-202ENST00000349777 2480 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
CENPVL3A0A0U1RRI6 FAM129C-203ENST00000449408 2004 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
CENPVL3A0A0U1RRI6 MAP1LC3A-203ENST00000397709 698 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.86■□□□□ 0.13
CENPVL3A0A0U1RRI6 LRRC75A-AS1-205ENST00000475953 1201 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
CENPVL3A0A0U1RRI6 AC100839.1-201ENST00000559589 577 ntTSL 4 BASIC15.86■□□□□ 0.13
CENPVL3A0A0U1RRI6 TGIF1-222ENST00000577543 729 ntTSL 3 BASIC15.86■□□□□ 0.13
CENPVL3A0A0U1RRI6 CYB561-214ENST00000582034 1193 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
CENPVL3A0A0U1RRI6 ZNF561-AS1-202ENST00000586614 568 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
CENPVL3A0A0U1RRI6 ANKRD54-211ENST00000609454 825 ntTSL 3 BASIC15.86■□□□□ 0.13
CENPVL3A0A0U1RRI6 AC097662.2-201ENST00000641359 267 ntAPPRIS P1 BASIC15.86■□□□□ 0.13
CENPVL3A0A0U1RRI6 SSR1-204ENST00000474597 1808 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
CENPVL3A0A0U1RRI6 TMEFF1-201ENST00000374879 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
CENPVL3A0A0U1RRI6 SGCE-207ENST00000447873 1597 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
CENPVL3A0A0U1RRI6 KXD1-203ENST00000540691 1592 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.86■□□□□ 0.13
CENPVL3A0A0U1RRI6 RPUSD2-202ENST00000559271 1558 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
CENPVL3A0A0U1RRI6 MAG-202ENST00000392213 2390 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
CENPVL3A0A0U1RRI6 HEY2-201ENST00000368364 2678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
CENPVL3A0A0U1RRI6 ZFYVE9-201ENST00000287727 5194 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
CENPVL3A0A0U1RRI6 ULK2-202ENST00000395544 6010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
CENPVL3A0A0U1RRI6 SUMO3-204ENST00000411651 1921 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
CENPVL3A0A0U1RRI6 TMEM234-203ENST00000373593 1411 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
CENPVL3A0A0U1RRI6 DNAJB5-203ENST00000453597 2589 ntTSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
CENPVL3A0A0U1RRI6 KIRREL2-202ENST00000347900 2015 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
CENPVL3A0A0U1RRI6 FBXW8-201ENST00000309909 2343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
CENPVL3A0A0U1RRI6 TAF7-201ENST00000313368 2334 ntAPPRIS P1 BASIC15.85■□□□□ 0.13
CENPVL3A0A0U1RRI6 C17orf58-204ENST00000580729 2065 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
CENPVL3A0A0U1RRI6 RARA-201ENST00000254066 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
CENPVL3A0A0U1RRI6 CERKL-205ENST00000409440 2425 ntTSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
CENPVL3A0A0U1RRI6 DBNL-210ENST00000448521 1808 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
CENPVL3A0A0U1RRI6 NYAP1-202ENST00000454988 2777 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
CENPVL3A0A0U1RRI6 PTPN11-202ENST00000392597 1876 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
CENPVL3A0A0U1RRI6 AQP12B-201ENST00000407834 1094 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 56.6 ms