Protein–RNA interactions for Protein: A0A0J9YYF1

TRBV7-4, T-cell receptor beta variable 7-4 (gene/pseudogene) (Fragment), humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
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TRBV7-4A0A0J9YYF1 PRKCD-201ENST00000330452 2680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
TRBV7-4A0A0J9YYF1 ASPM-201ENST00000294732 6132 ntTSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
TRBV7-4A0A0J9YYF1 CPZ-202ENST00000360986 2267 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
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TRBV7-4A0A0J9YYF1 STK10-201ENST00000176763 6060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.5
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TRBV7-4A0A0J9YYF1 CTSD-212ENST00000637815 2003 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.96□□□□□ -0.5
TRBV7-4A0A0J9YYF1 MMD2-202ENST00000404774 2415 ntTSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.5
TRBV7-4A0A0J9YYF1 CCNI2-201ENST00000378731 2355 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.5
TRBV7-4A0A0J9YYF1 SPR-201ENST00000234454 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
TRBV7-4A0A0J9YYF1 BRSK2-215ENST00000544817 1842 ntTSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
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