Protein–RNA interactions for Protein: Q9BQ66

KRTAP4-12, Keratin-associated protein 4-12, humanhuman

Predictions only

Length 201 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KRTAP4-12Q9BQ66 VPS11-208ENST00000621676 3313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.73□□□□□ -1.97
KRTAP4-12Q9BQ66 FAM213A-205ENST00000606162 5859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.73□□□□□ -1.97
KRTAP4-12Q9BQ66 FXYD2-201ENST00000260287 513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.73□□□□□ -1.97
KRTAP4-12Q9BQ66 HIST1H1E-201ENST00000304218 754 ntAPPRIS P1 BASIC2.73□□□□□ -1.97
KRTAP4-12Q9BQ66 UCP2-201ENST00000310473 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.73□□□□□ -1.97
KRTAP4-12Q9BQ66 RNU6-1084P-201ENST00000362498 107 ntBASIC2.73□□□□□ -1.97
KRTAP4-12Q9BQ66 RNU6-1010P-201ENST00000362757 107 ntBASIC2.73□□□□□ -1.97
KRTAP4-12Q9BQ66 SNORD114-10-201ENST00000363409 72 ntBASIC2.73□□□□□ -1.97
KRTAP4-12Q9BQ66 RNA5SP333-201ENST00000363466 118 ntBASIC2.73□□□□□ -1.97
KRTAP4-12Q9BQ66 RNU1-33P-201ENST00000364249 162 ntBASIC2.73□□□□□ -1.97
KRTAP4-12Q9BQ66 RNA5SP334-201ENST00000364825 118 ntBASIC2.73□□□□□ -1.97
KRTAP4-12Q9BQ66 RNY4P3-201ENST00000365254 95 ntBASIC2.73□□□□□ -1.97
KRTAP4-12Q9BQ66 RNU6-1051P-201ENST00000365471 102 ntBASIC2.73□□□□□ -1.97
KRTAP4-12Q9BQ66 CREB3L4-203ENST00000368601 950 ntTSL 2 BASIC2.73□□□□□ -1.97
KRTAP4-12Q9BQ66 LY6G6F-201ENST00000375832 920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.73□□□□□ -1.97
KRTAP4-12Q9BQ66 TRBV20OR9-2-201ENST00000379435 416 ntAPPRIS P1 BASIC2.73□□□□□ -1.97
KRTAP4-12Q9BQ66 SNORA12-201ENST00000391162 147 ntBASIC2.73□□□□□ -1.97
KRTAP4-12Q9BQ66 RNA5SP299-201ENST00000391203 116 ntBASIC2.73□□□□□ -1.97
KRTAP4-12Q9BQ66 RNU11-5P-201ENST00000391216 129 ntBASIC2.73□□□□□ -1.97
KRTAP4-12Q9BQ66 UMODL1-203ENST00000400424 5516 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2.73□□□□□ -1.97
KRTAP4-12Q9BQ66 SNU13-204ENST00000402458 462 ntTSL 3 BASIC2.73□□□□□ -1.97
KRTAP4-12Q9BQ66 SLC25A20P1-201ENST00000408043 903 ntBASIC2.73□□□□□ -1.97
KRTAP4-12Q9BQ66 SNORD88B-201ENST00000408454 91 ntBASIC2.73□□□□□ -1.97
KRTAP4-12Q9BQ66 AQP7P1-201ENST00000412626 1045 ntBASIC2.73□□□□□ -1.97
KRTAP4-12Q9BQ66 LINC00265-2P-201ENST00000413372 782 ntBASIC2.73□□□□□ -1.97
KRTAP4-12Q9BQ66 AC244452.1-201ENST00000413798 141 ntBASIC2.73□□□□□ -1.97
KRTAP4-12Q9BQ66 AC009237.9-201ENST00000414800 347 ntBASIC2.73□□□□□ -1.97
KRTAP4-12Q9BQ66 SLC25A6P3-201ENST00000424829 879 ntBASIC2.73□□□□□ -1.97
KRTAP4-12Q9BQ66 AC009238.2-201ENST00000431026 355 ntBASIC2.73□□□□□ -1.97
KRTAP4-12Q9BQ66 EEF1DP2-201ENST00000433698 843 ntBASIC2.73□□□□□ -1.97
KRTAP4-12Q9BQ66 MED15P7-201ENST00000435410 822 ntBASIC2.73□□□□□ -1.97
KRTAP4-12Q9BQ66 HLA-W-207ENST00000439514 771 ntBASIC2.73□□□□□ -1.97
KRTAP4-12Q9BQ66 AC083855.1-201ENST00000440041 258 ntBASIC2.73□□□□□ -1.97
KRTAP4-12Q9BQ66 LINC02521-201ENST00000440848 834 ntTSL 2 BASIC2.73□□□□□ -1.97
KRTAP4-12Q9BQ66 IP6K2-218ENST00000443964 973 ntTSL 4 BASIC2.73□□□□□ -1.97
KRTAP4-12Q9BQ66 PLA2G4B-201ENST00000452633 2985 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.73□□□□□ -1.97
KRTAP4-12Q9BQ66 AC079250.1-201ENST00000456046 531 ntBASIC2.73□□□□□ -1.97
KRTAP4-12Q9BQ66 AC005908.1-201ENST00000468701 347 ntBASIC2.73□□□□□ -1.97
KRTAP4-12Q9BQ66 UBL5P3-201ENST00000475112 231 ntBASIC2.73□□□□□ -1.97
KRTAP4-12Q9BQ66 SLIT2-204ENST00000504154 6390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.73□□□□□ -1.97
KRTAP4-12Q9BQ66 AC253536.5-201ENST00000506097 347 ntBASIC2.73□□□□□ -1.97
KRTAP4-12Q9BQ66 RNU4ATAC9P-201ENST00000517146 126 ntBASIC2.73□□□□□ -1.97
KRTAP4-12Q9BQ66 IGHV3-25-201ENST00000518224 351 ntBASIC2.73□□□□□ -1.97
KRTAP4-12Q9BQ66 IGKV2-18-201ENST00000522607 343 ntBASIC2.73□□□□□ -1.97
KRTAP4-12Q9BQ66 AP001922.6-201ENST00000532553 546 ntTSL 5 BASIC2.73□□□□□ -1.97
KRTAP4-12Q9BQ66 SAA1-203ENST00000532858 583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.73□□□□□ -1.97
KRTAP4-12Q9BQ66 DDX11L8-201ENST00000535849 366 ntBASIC2.73□□□□□ -1.97
KRTAP4-12Q9BQ66 AP001880.1-201ENST00000538772 421 ntBASIC2.73□□□□□ -1.97
KRTAP4-12Q9BQ66 AC100827.1-201ENST00000569853 382 ntBASIC2.73□□□□□ -1.97
KRTAP4-12Q9BQ66 MIR4526-201ENST00000583168 87 ntBASIC2.73□□□□□ -1.97
KRTAP4-12Q9BQ66 RN7SL52P-201ENST00000584271 284 ntBASIC2.73□□□□□ -1.97
KRTAP4-12Q9BQ66 ZNF223-202ENST00000585552 541 ntTSL 4 BASIC2.73□□□□□ -1.97
KRTAP4-12Q9BQ66 APOC4-APOC2-202ENST00000589057 680 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.73□□□□□ -1.97
KRTAP4-12Q9BQ66 RPSAP66-201ENST00000592196 606 ntBASIC2.73□□□□□ -1.97
KRTAP4-12Q9BQ66 AC093458.1-201ENST00000608912 222 ntBASIC2.73□□□□□ -1.97
KRTAP4-12Q9BQ66 UBE2Q2P6-201ENST00000612666 153 ntBASIC2.73□□□□□ -1.97
KRTAP4-12Q9BQ66 TP53TG1_1.1-201ENST00000612852 152 ntBASIC2.73□□□□□ -1.97
KRTAP4-12Q9BQ66 TLR10-207ENST00000613579 3801 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC2.73□□□□□ -1.97
KRTAP4-12Q9BQ66 ARHGEF25-208ENST00000616622 2103 ntTSL 2 BASIC2.73□□□□□ -1.97
KRTAP4-12Q9BQ66 C2orf27AP1-201ENST00000618128 586 ntBASIC2.73□□□□□ -1.97
KRTAP4-12Q9BQ66 BIN3-212ENST00000640731 450 ntTSL 5 BASIC2.73□□□□□ -1.97
KRTAP4-12Q9BQ66 AC078776.2-201ENST00000641021 285 ntBASIC2.73□□□□□ -1.97
KRTAP4-12Q9BQ66 MIER2-201ENST00000264819 6884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.73□□□□□ -1.97
KRTAP4-12Q9BQ66 RP1-207ENST00000637698 6177 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.73□□□□□ -1.97
KRTAP4-12Q9BQ66 SYNJ2-208ENST00000640338 3959 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2.73□□□□□ -1.97
KRTAP4-12Q9BQ66 CDK18-201ENST00000360066 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.73□□□□□ -1.97
KRTAP4-12Q9BQ66 TCF3-201ENST00000262965 4451 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC2.73□□□□□ -1.97
KRTAP4-12Q9BQ66 VWCE-202ENST00000335613 3640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.73□□□□□ -1.97
KRTAP4-12Q9BQ66 CELSR1-201ENST00000262738 11389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.73□□□□□ -1.97
KRTAP4-12Q9BQ66 PTPN5-202ENST00000396166 2299 ntTSL 2 BASIC2.73□□□□□ -1.97
KRTAP4-12Q9BQ66 RXRG-204ENST00000619224 2252 ntTSL 1 (best) BASIC2.73□□□□□ -1.97
KRTAP4-12Q9BQ66 CNDP1-203ENST00000582365 4111 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC2.73□□□□□ -1.97
KRTAP4-12Q9BQ66 ANKRD36B-201ENST00000258459 5986 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.73□□□□□ -1.97
KRTAP4-12Q9BQ66 ZFAND5-205ENST00000376962 2785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.73□□□□□ -1.97
KRTAP4-12Q9BQ66 AC073869.1-201ENST00000415574 2762 ntBASIC2.73□□□□□ -1.97
KRTAP4-12Q9BQ66 SON-201ENST00000300278 7477 ntTSL 1 (best) BASIC2.73□□□□□ -1.97
KRTAP4-12Q9BQ66 SMG8-201ENST00000300917 3263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.73□□□□□ -1.97
KRTAP4-12Q9BQ66 TWSG1-201ENST00000262120 3756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.73□□□□□ -1.97
KRTAP4-12Q9BQ66 Z97653.2-201ENST00000623057 1418 ntBASIC2.73□□□□□ -1.97
KRTAP4-12Q9BQ66 AC245140.2-201ENST00000624054 1939 ntBASIC2.73□□□□□ -1.97
KRTAP4-12Q9BQ66 IKBKB-218ENST00000520835 2403 ntTSL 2 BASIC2.73□□□□□ -1.97
KRTAP4-12Q9BQ66 TNIP1-202ENST00000389378 2935 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC2.73□□□□□ -1.97
KRTAP4-12Q9BQ66 B3GNT4-202ENST00000535274 2938 ntAPPRIS P1 BASIC2.73□□□□□ -1.97
KRTAP4-12Q9BQ66 ATXN2-215ENST00000542287 3443 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2.73□□□□□ -1.97
KRTAP4-12Q9BQ66 ATE1-201ENST00000224652 4930 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC2.73□□□□□ -1.97
KRTAP4-12Q9BQ66 MYH7-201ENST00000355349 6087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.73□□□□□ -1.97
KRTAP4-12Q9BQ66 RAPGEF1-201ENST00000372189 6085 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2.73□□□□□ -1.97
KRTAP4-12Q9BQ66 NBPF3-202ENST00000318249 3591 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC2.73□□□□□ -1.97
KRTAP4-12Q9BQ66 ARHGAP9-203ENST00000424809 2569 ntTSL 2 BASIC2.73□□□□□ -1.97
KRTAP4-12Q9BQ66 RPH3AL-222ENST00000618002 2578 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC2.73□□□□□ -1.97
KRTAP4-12Q9BQ66 PRC1-204ENST00000442656 2060 ntTSL 2 BASIC2.73□□□□□ -1.97
KRTAP4-12Q9BQ66 CDK3-201ENST00000425876 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.73□□□□□ -1.97
KRTAP4-12Q9BQ66 MROH4P-201ENST00000431302 1578 ntBASIC2.73□□□□□ -1.97
KRTAP4-12Q9BQ66 KIFC3-204ENST00000465878 3225 ntTSL 1 (best) BASIC2.73□□□□□ -1.97
KRTAP4-12Q9BQ66 PXN-221ENST00000637617 3246 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC2.73□□□□□ -1.97
KRTAP4-12Q9BQ66 ACSM2B-202ENST00000414188 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.73□□□□□ -1.97
KRTAP4-12Q9BQ66 ANKAR-201ENST00000313581 4391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.73□□□□□ -1.97
KRTAP4-12Q9BQ66 ANO6-202ENST00000423947 5504 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2.73□□□□□ -1.97
KRTAP4-12Q9BQ66 TUBGCP3-201ENST00000261965 3899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.73□□□□□ -1.97
KRTAP4-12Q9BQ66 CNTNAP3P2-201ENST00000617175 3861 ntBASIC2.73□□□□□ -1.97
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 162.9 ms