Protein–RNA interactions for Protein: Q9BQ66

KRTAP4-12, Keratin-associated protein 4-12, humanhuman

Predictions only

Length 201 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KRTAP4-12Q9BQ66 CACNA1C-208ENST00000399601 6511 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2.75□□□□□ -1.97
KRTAP4-12Q9BQ66 CACNA1C-217ENST00000399641 6511 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2.75□□□□□ -1.97
KRTAP4-12Q9BQ66 CACNA1C-218ENST00000399644 6511 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2.75□□□□□ -1.97
KRTAP4-12Q9BQ66 CES1-203ENST00000422046 2178 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC2.75□□□□□ -1.97
KRTAP4-12Q9BQ66 GRB7-205ENST00000445327 2197 ntTSL 2 BASIC2.75□□□□□ -1.97
KRTAP4-12Q9BQ66 SOGA3-201ENST00000465909 3756 ntTSL 5 BASIC2.75□□□□□ -1.97
KRTAP4-12Q9BQ66 MPHOSPH8-201ENST00000361479 4235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.75□□□□□ -1.97
KRTAP4-12Q9BQ66 ADH5-201ENST00000296412 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.75□□□□□ -1.97
KRTAP4-12Q9BQ66 ATP6V0E2-201ENST00000421974 2605 ntTSL 1 (best) BASIC2.75□□□□□ -1.97
KRTAP4-12Q9BQ66 PPM1F-201ENST00000263212 5143 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC2.75□□□□□ -1.97
KRTAP4-12Q9BQ66 G3BP2-202ENST00000359707 4883 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC2.75□□□□□ -1.97
KRTAP4-12Q9BQ66 BRF1-205ENST00000440513 2368 ntTSL 2 BASIC2.75□□□□□ -1.97
KRTAP4-12Q9BQ66 MAPK1IP1L-205ENST00000622254 2836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.75□□□□□ -1.97
KRTAP4-12Q9BQ66 GLIS1-202ENST00000628545 2807 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC2.75□□□□□ -1.97
KRTAP4-12Q9BQ66 FAM177A1-203ENST00000396472 3254 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC2.75□□□□□ -1.97
KRTAP4-12Q9BQ66 CACNB1-202ENST00000394303 3742 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC2.75□□□□□ -1.97
KRTAP4-12Q9BQ66 C11orf57-209ENST00000532163 3739 ntTSL 2 BASIC2.75□□□□□ -1.97
KRTAP4-12Q9BQ66 KIAA1217-209ENST00000430453 5962 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC2.75□□□□□ -1.97
KRTAP4-12Q9BQ66 KIAA1217-211ENST00000458595 5977 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2.75□□□□□ -1.97
KRTAP4-12Q9BQ66 GSE1-203ENST00000405402 4366 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2.75□□□□□ -1.97
KRTAP4-12Q9BQ66 GFRA2-202ENST00000517328 2104 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.75□□□□□ -1.97
KRTAP4-12Q9BQ66 CD22-209ENST00000594250 2107 ntTSL 1 (best) BASIC2.75□□□□□ -1.97
KRTAP4-12Q9BQ66 PDE4C-204ENST00000539010 1699 ntTSL 1 (best) BASIC2.75□□□□□ -1.97
KRTAP4-12Q9BQ66 CCDC88C-204ENST00000389857 7474 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.75□□□□□ -1.97
KRTAP4-12Q9BQ66 HIVEP1-201ENST00000379388 9027 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC2.75□□□□□ -1.97
KRTAP4-12Q9BQ66 HIVEP1-208ENST00000541134 9023 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC2.75□□□□□ -1.97
KRTAP4-12Q9BQ66 RPGR-202ENST00000339363 3686 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC2.75□□□□□ -1.97
KRTAP4-12Q9BQ66 TLK1-205ENST00000431350 5663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.75□□□□□ -1.97
KRTAP4-12Q9BQ66 THOC2-220ENST00000618150 3211 ntTSL 1 (best) BASIC2.75□□□□□ -1.97
KRTAP4-12Q9BQ66 AC091980.2-201ENST00000619056 2775 ntAPPRIS P1 BASIC2.75□□□□□ -1.97
KRTAP4-12Q9BQ66 ERCC6-208ENST00000515869 3439 ntTSL 2 BASIC2.75□□□□□ -1.97
KRTAP4-12Q9BQ66 CPD-201ENST00000225719 9394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.75□□□□□ -1.97
KRTAP4-12Q9BQ66 SLC8B1-201ENST00000202831 2975 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.75□□□□□ -1.97
KRTAP4-12Q9BQ66 C10orf90-202ENST00000356858 2995 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC2.75□□□□□ -1.97
KRTAP4-12Q9BQ66 ZNF75D-201ENST00000370764 2977 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC2.75□□□□□ -1.97
KRTAP4-12Q9BQ66 AC005014.1-201ENST00000432006 2976 ntBASIC2.75□□□□□ -1.97
KRTAP4-12Q9BQ66 SSTR1-201ENST00000267377 4295 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC2.75□□□□□ -1.97
KRTAP4-12Q9BQ66 AC005261.2-201ENST00000593427 4258 ntBASIC2.75□□□□□ -1.97
KRTAP4-12Q9BQ66 KCNE1B-202ENST00000618699 3154 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC2.75□□□□□ -1.97
KRTAP4-12Q9BQ66 PLA2G4F-202ENST00000397272 5587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.75□□□□□ -1.97
KRTAP4-12Q9BQ66 CAMKK2-205ENST00000392474 4453 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2.75□□□□□ -1.97
KRTAP4-12Q9BQ66 GCK-204ENST00000403799 2729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.75□□□□□ -1.97
KRTAP4-12Q9BQ66 SOX6-210ENST00000528252 2707 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC2.75□□□□□ -1.97
KRTAP4-12Q9BQ66 SLCO1C1-201ENST00000266509 3365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.75□□□□□ -1.97
KRTAP4-12Q9BQ66 RIPK4-202ENST00000352483 4016 ntTSL 5 BASIC2.75□□□□□ -1.97
KRTAP4-12Q9BQ66 VPS54-202ENST00000354504 3594 ntTSL 1 (best) BASIC2.75□□□□□ -1.97
KRTAP4-12Q9BQ66 PIAS3-203ENST00000393045 2901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.75□□□□□ -1.97
KRTAP4-12Q9BQ66 DDR1-232ENST00000418800 3588 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC2.75□□□□□ -1.97
KRTAP4-12Q9BQ66 AC025171.1-202ENST00000499871 2271 ntTSL 1 (best) BASIC2.75□□□□□ -1.97
KRTAP4-12Q9BQ66 IQCC-202ENST00000537469 2252 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2.75□□□□□ -1.97
KRTAP4-12Q9BQ66 YLPM1-207ENST00000552421 4899 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC2.75□□□□□ -1.97
KRTAP4-12Q9BQ66 ARHGAP21-217ENST00000612832 5514 ntTSL 5 BASIC2.75□□□□□ -1.97
KRTAP4-12Q9BQ66 TRABD2B-202ENST00000606738 7034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.75□□□□□ -1.97
KRTAP4-12Q9BQ66 TLK1-202ENST00000360843 5726 ntTSL 1 (best) BASIC2.75□□□□□ -1.97
KRTAP4-12Q9BQ66 KIAA2012-204ENST00000498697 3772 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC2.75□□□□□ -1.97
KRTAP4-12Q9BQ66 EIF3C-202ENST00000395587 3137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.75□□□□□ -1.97
KRTAP4-12Q9BQ66 ZNF345-213ENST00000589046 3120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.75□□□□□ -1.97
KRTAP4-12Q9BQ66 ZNF345-215ENST00000614069 3103 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC2.75□□□□□ -1.97
KRTAP4-12Q9BQ66 RCAN2-204ENST00000405162 2457 ntTSL 5 BASIC2.75□□□□□ -1.97
KRTAP4-12Q9BQ66 AC091951.1-201ENST00000512854 2465 ntBASIC2.75□□□□□ -1.97
KRTAP4-12Q9BQ66 PCDHGA11-201ENST00000398587 4647 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC2.75□□□□□ -1.97
KRTAP4-12Q9BQ66 CES1-202ENST00000361503 1835 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC2.75□□□□□ -1.97
KRTAP4-12Q9BQ66 PEX1-204ENST00000438045 3329 ntTSL 2 BASIC2.75□□□□□ -1.97
KRTAP4-12Q9BQ66 HOTTIP-203ENST00000521028 3345 ntTSL 5 BASIC2.75□□□□□ -1.97
KRTAP4-12Q9BQ66 AC012313.3-202ENST00000599109 3322 ntTSL 5 BASIC2.75□□□□□ -1.97
KRTAP4-12Q9BQ66 ENOX2-204ENST00000394363 4174 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC2.75□□□□□ -1.97
KRTAP4-12Q9BQ66 KRT82-201ENST00000257974 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.75□□□□□ -1.97
KRTAP4-12Q9BQ66 URM1-203ENST00000372853 2650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.75□□□□□ -1.97
KRTAP4-12Q9BQ66 ASH2L-202ENST00000428278 2678 ntTSL 1 (best) BASIC2.75□□□□□ -1.97
KRTAP4-12Q9BQ66 DDX27-207ENST00000622530 2693 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC2.75□□□□□ -1.97
KRTAP4-12Q9BQ66 CORO7-201ENST00000251166 3540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.75□□□□□ -1.97
KRTAP4-12Q9BQ66 CACNB2-201ENST00000282343 3524 ntTSL 1 (best) BASIC2.75□□□□□ -1.97
KRTAP4-12Q9BQ66 DDX54-202ENST00000314045 4380 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2.75□□□□□ -1.97
KRTAP4-12Q9BQ66 PTGDR2-201ENST00000332539 2895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.75□□□□□ -1.97
KRTAP4-12Q9BQ66 PTPN20-201ENST00000374218 2872 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC2.75□□□□□ -1.97
KRTAP4-12Q9BQ66 RNFT2-203ENST00000392549 2896 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.75□□□□□ -1.97
KRTAP4-12Q9BQ66 SRPK1-204ENST00000373825 4592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.75□□□□□ -1.97
KRTAP4-12Q9BQ66 CEP164-201ENST00000278935 5630 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC2.74□□□□□ -1.97
KRTAP4-12Q9BQ66 MTA2-201ENST00000278823 3058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.74□□□□□ -1.97
KRTAP4-12Q9BQ66 PLK4-210ENST00000514379 3060 ntTSL 2 BASIC2.74□□□□□ -1.97
KRTAP4-12Q9BQ66 PLEKHA7-202ENST00000355661 4980 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC2.74□□□□□ -1.97
KRTAP4-12Q9BQ66 ANKRD20A4-201ENST00000357336 4137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.74□□□□□ -1.97
KRTAP4-12Q9BQ66 ZMYND11-207ENST00000397959 4138 ntTSL 2 BASIC2.74□□□□□ -1.97
KRTAP4-12Q9BQ66 SCAF4-202ENST00000399804 4127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2.74□□□□□ -1.97
KRTAP4-12Q9BQ66 SENP7-202ENST00000348610 3272 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2.74□□□□□ -1.97
KRTAP4-12Q9BQ66 PODN-202ENST00000371500 3287 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2.74□□□□□ -1.97
KRTAP4-12Q9BQ66 FAM47DP-201ENST00000402340 3290 ntBASIC2.74□□□□□ -1.97
KRTAP4-12Q9BQ66 CEP192-202ENST00000430049 3286 ntTSL 1 (best) BASIC2.74□□□□□ -1.97
KRTAP4-12Q9BQ66 TM2D2-202ENST00000456397 3263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.74□□□□□ -1.97
KRTAP4-12Q9BQ66 AP2B1-215ENST00000616681 3267 ntTSL 2 BASIC2.74□□□□□ -1.97
KRTAP4-12Q9BQ66 GTF2H3-214ENST00000618160 3252 ntTSL 5 BASIC2.74□□□□□ -1.97
KRTAP4-12Q9BQ66 ST6GALNAC6-202ENST00000373141 2424 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC2.74□□□□□ -1.97
KRTAP4-12Q9BQ66 FAM107A-202ENST00000394481 3465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.74□□□□□ -1.97
KRTAP4-12Q9BQ66 ABCG1-204ENST00000398437 3475 ntTSL 1 (best) BASIC2.74□□□□□ -1.97
KRTAP4-12Q9BQ66 SHC1-210ENST00000448116 3481 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC2.74□□□□□ -1.97
KRTAP4-12Q9BQ66 TMEM120B-204ENST00000449592 7461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.74□□□□□ -1.97
KRTAP4-12Q9BQ66 CAST-206ENST00000395812 4506 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC2.74□□□□□ -1.97
KRTAP4-12Q9BQ66 KRT31-201ENST00000251645 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.74□□□□□ -1.97
KRTAP4-12Q9BQ66 LINC00174-204ENST00000421767 4702 ntTSL 5 BASIC2.74□□□□□ -1.97
KRTAP4-12Q9BQ66 ACTN4-203ENST00000424234 1566 ntTSL 1 (best) BASIC2.74□□□□□ -1.97
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 116.9 ms