Protein–RNA interactions for Protein: P31277

HOXD11, Homeobox protein Hox-D11, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 338 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HOXD11P31277 FOXO3-203ENST00000540898 2553 ntTSL 1 (best) BASIC9.96□□□□□ -0.82
HOXD11P31277 MAGEB16-205ENST00000399992 1734 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.96□□□□□ -0.82
HOXD11P31277 DPY19L2-202ENST00000324472 4060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.96□□□□□ -0.82
HOXD11P31277 DLC1-202ENST00000316609 1837 ntTSL 2 BASIC9.96□□□□□ -0.82
HOXD11P31277 DTNA-227ENST00000597599 1869 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC9.96□□□□□ -0.82
HOXD11P31277 RMDN2-203ENST00000402091 1973 ntTSL 2 BASIC9.95□□□□□ -0.82
HOXD11P31277 ZNF814-213ENST00000597832 2090 ntTSL 2 BASIC9.95□□□□□ -0.82
HOXD11P31277 AL121950.1-201ENST00000624993 2077 ntBASIC9.95□□□□□ -0.82
HOXD11P31277 DCN-202ENST00000393155 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.95□□□□□ -0.82
HOXD11P31277 PXN-202ENST00000267257 3835 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.95□□□□□ -0.82
HOXD11P31277 PXN-206ENST00000458477 3807 ntTSL 1 (best) BASIC9.95□□□□□ -0.82
HOXD11P31277 ZNF433-203ENST00000419886 2322 ntTSL 1 (best) BASIC9.95□□□□□ -0.82
HOXD11P31277 TSPAN14-206ENST00000372164 5476 ntTSL 1 (best) BASIC9.95□□□□□ -0.82
HOXD11P31277 RCBTB1-202ENST00000378302 4033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.95□□□□□ -0.82
HOXD11P31277 NLRP1-215ENST00000613500 4494 ntTSL 5 BASIC9.95□□□□□ -0.82
HOXD11P31277 DCTN1-226ENST00000628224 4485 ntTSL 5 BASIC9.95□□□□□ -0.82
HOXD11P31277 KLHL18-201ENST00000232766 4620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.95□□□□□ -0.82
HOXD11P31277 THADA-202ENST00000402360 2974 ntTSL 5 BASIC9.95□□□□□ -0.82
HOXD11P31277 TCAF1-201ENST00000355951 3343 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC9.95□□□□□ -0.82
HOXD11P31277 RNU6-653P-201ENST00000363074 106 ntBASIC9.95□□□□□ -0.82
HOXD11P31277 TRAV19-201ENST00000390447 467 ntAPPRIS P1 BASIC9.95□□□□□ -0.82
HOXD11P31277 RNU6-1275P-201ENST00000391087 107 ntBASIC9.95□□□□□ -0.82
HOXD11P31277 RNU5A-5P-201ENST00000411054 116 ntBASIC9.95□□□□□ -0.82
HOXD11P31277 LYPLA2P3-201ENST00000417429 576 ntBASIC9.95□□□□□ -0.82
HOXD11P31277 AL358453.1-201ENST00000422522 250 ntBASIC9.95□□□□□ -0.82
HOXD11P31277 AC104698.1-201ENST00000435671 276 ntBASIC9.95□□□□□ -0.82
HOXD11P31277 AL132875.2-201ENST00000436418 325 ntTSL 5 BASIC9.95□□□□□ -0.82
HOXD11P31277 CYCSP43-201ENST00000438233 310 ntBASIC9.95□□□□□ -0.82
HOXD11P31277 RBMY2TP-201ENST00000451162 947 ntBASIC9.95□□□□□ -0.82
HOXD11P31277 AC239859.3-201ENST00000456469 408 ntTSL 5 BASIC9.95□□□□□ -0.82
HOXD11P31277 OR2A1-AS1-202ENST00000467944 422 ntBASIC9.95□□□□□ -0.82
HOXD11P31277 Y_RNA.706-201ENST00000516933 99 ntBASIC9.95□□□□□ -0.82
HOXD11P31277 FBXO16-208ENST00000519471 398 ntTSL 2 BASIC9.95□□□□□ -0.82
HOXD11P31277 AL359792.1-201ENST00000554046 385 ntTSL 3 BASIC9.95□□□□□ -0.82
HOXD11P31277 RPL21P9-201ENST00000556149 474 ntBASIC9.95□□□□□ -0.82
HOXD11P31277 AC010536.2-201ENST00000563036 338 ntTSL 3 BASIC9.95□□□□□ -0.82
HOXD11P31277 GLYATL1P2-202ENST00000588046 902 ntBASIC9.95□□□□□ -0.82
HOXD11P31277 AC008474.1-201ENST00000589127 573 ntTSL 4 BASIC9.95□□□□□ -0.82
HOXD11P31277 AC099849.1-201ENST00000603437 466 ntBASIC9.95□□□□□ -0.82
HOXD11P31277 AC135050.6-201ENST00000610813 528 ntTSL 3 BASIC9.95□□□□□ -0.82
HOXD11P31277 AC010223.1-201ENST00000625092 279 ntBASIC9.95□□□□□ -0.82
HOXD11P31277 MLC1-201ENST00000311597 3933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.95□□□□□ -0.82
HOXD11P31277 ZFYVE1-208ENST00000556143 4485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.95□□□□□ -0.82
HOXD11P31277 PMEPA1-201ENST00000265626 4627 ntTSL 3 BASIC9.95□□□□□ -0.82
HOXD11P31277 USP17L10-202ENST00000421288 1677 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.95□□□□□ -0.82
HOXD11P31277 PGA3-201ENST00000325558 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.95□□□□□ -0.82
HOXD11P31277 ARNTL2-207ENST00000542388 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.95□□□□□ -0.82
HOXD11P31277 DACH2-208ENST00000613770 1731 ntTSL 5 BASIC9.95□□□□□ -0.82
HOXD11P31277 RNASEH2B-AS1-209ENST00000631080 1707 ntTSL 5 BASIC9.95□□□□□ -0.82
HOXD11P31277 PPM1K-210ENST00000608933 6484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.95□□□□□ -0.82
HOXD11P31277 AC097662.1-204ENST00000396588 2214 ntTSL 2 BASIC9.95□□□□□ -0.82
HOXD11P31277 ST3GAL5-257ENST00000640418 2467 ntTSL 5 BASIC9.95□□□□□ -0.82
HOXD11P31277 SLC10A5-201ENST00000518568 2568 ntAPPRIS P1 BASIC9.95□□□□□ -0.82
HOXD11P31277 CAVIN4-201ENST00000307584 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.95□□□□□ -0.82
HOXD11P31277 TNPO1-213ENST00000523768 2632 ntTSL 2 BASIC9.95□□□□□ -0.82
HOXD11P31277 CUX1-221ENST00000622516 2990 ntTSL 1 (best) BASIC9.95□□□□□ -0.82
HOXD11P31277 RFX2-202ENST00000359161 3595 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC9.95□□□□□ -0.82
HOXD11P31277 ANO1-209ENST00000531349 3552 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.95□□□□□ -0.82
HOXD11P31277 DCTN1-205ENST00000409567 4024 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.95□□□□□ -0.82
HOXD11P31277 RPGR-203ENST00000378505 4767 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.95□□□□□ -0.82
HOXD11P31277 MYH2-202ENST00000397183 6078 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.94□□□□□ -0.82
HOXD11P31277 TJAP1-215ENST00000612912 4312 ntTSL 2 BASIC9.94□□□□□ -0.82
HOXD11P31277 DNASE1-201ENST00000246949 4200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.94□□□□□ -0.82
HOXD11P31277 SEC31A-228ENST00000509142 3861 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.94□□□□□ -0.82
HOXD11P31277 CALD1-201ENST00000361675 3612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.94□□□□□ -0.82
HOXD11P31277 OPTN-205ENST00000378757 3321 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.94□□□□□ -0.82
HOXD11P31277 BPNT1-205ENST00000469520 2737 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.94□□□□□ -0.82
HOXD11P31277 ECM2-204ENST00000444490 2648 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.94□□□□□ -0.82
HOXD11P31277 SUPT20H-224ENST00000542180 2478 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.94□□□□□ -0.82
HOXD11P31277 GGCX-205ENST00000430215 2314 ntTSL 2 BASIC9.94□□□□□ -0.82
HOXD11P31277 SETD5-203ENST00000402198 6827 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.94□□□□□ -0.82
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HOXD11P31277 PSAT1-202ENST00000376588 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.94□□□□□ -0.82
HOXD11P31277 BTD-206ENST00000437172 2097 ntTSL 2 BASIC9.94□□□□□ -0.82
HOXD11P31277 ERCC8-201ENST00000265038 2017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.94□□□□□ -0.82
HOXD11P31277 NRXN3-218ENST00000635466 5254 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC9.94□□□□□ -0.82
HOXD11P31277 TNC-211ENST00000537320 4946 ntTSL 5 BASIC9.94□□□□□ -0.82
HOXD11P31277 DGCR2-205ENST00000537045 4361 ntTSL 2 BASIC9.94□□□□□ -0.82
HOXD11P31277 RPL9P7-201ENST00000330965 580 ntBASIC9.94□□□□□ -0.82
HOXD11P31277 SPP1-202ENST00000360804 1196 ntTSL 1 (best) BASIC9.94□□□□□ -0.82
HOXD11P31277 RNU6-199P-201ENST00000362954 107 ntBASIC9.94□□□□□ -0.82
HOXD11P31277 GSTM1-203ENST00000369819 790 ntTSL 1 (best) BASIC9.94□□□□□ -0.82
HOXD11P31277 SNORA48.6-201ENST00000391156 130 ntBASIC9.94□□□□□ -0.82
HOXD11P31277 C14orf2-202ENST00000414262 842 ntTSL 1 (best) BASIC9.94□□□□□ -0.82
HOXD11P31277 AC104794.1-201ENST00000425235 312 ntTSL 3 BASIC9.94□□□□□ -0.82
HOXD11P31277 IFNWP18-201ENST00000437472 591 ntBASIC9.94□□□□□ -0.82
HOXD11P31277 AL513043.1-201ENST00000439124 535 ntBASIC9.94□□□□□ -0.82
HOXD11P31277 CICP10-201ENST00000439497 198 ntBASIC9.94□□□□□ -0.82
HOXD11P31277 AC011193.1-202ENST00000441287 323 ntTSL 3 BASIC9.94□□□□□ -0.82
HOXD11P31277 CDCA4P1-201ENST00000442667 624 ntBASIC9.94□□□□□ -0.82
HOXD11P31277 AL136376.1-201ENST00000449303 515 ntTSL 3 BASIC9.94□□□□□ -0.82
HOXD11P31277 AC107613.1-201ENST00000450488 1018 ntBASIC9.94□□□□□ -0.82
HOXD11P31277 AC104451.1-201ENST00000458010 176 ntBASIC9.94□□□□□ -0.82
HOXD11P31277 MBNL1-213ENST00000465907 945 ntTSL 1 (best) BASIC9.94□□□□□ -0.82
HOXD11P31277 AL355032.1-201ENST00000472981 438 ntBASIC9.94□□□□□ -0.82
HOXD11P31277 RN7SL259P-201ENST00000478499 253 ntBASIC9.94□□□□□ -0.82
HOXD11P31277 AC025271.1-201ENST00000485045 429 ntBASIC9.94□□□□□ -0.82
HOXD11P31277 OR7E94P-201ENST00000502331 374 ntBASIC9.94□□□□□ -0.82
HOXD11P31277 RNU7-121P-201ENST00000516604 62 ntBASIC9.94□□□□□ -0.82
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