Protein–RNA interactions for Protein: Q9NYR9

NKIRAS2, NF-kappa-B inhibitor-interacting Ras-like protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 191 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NKIRAS2Q9NYR9 TMEM218-201ENST00000279968 1034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
NKIRAS2Q9NYR9 UNC50-201ENST00000357765 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
NKIRAS2Q9NYR9 PPP1CA-202ENST00000358239 1054 ntTSL 2 BASIC17.53■□□□□ 0.4
NKIRAS2Q9NYR9 AC093787.1-201ENST00000450396 207 ntBASIC17.53■□□□□ 0.4
NKIRAS2Q9NYR9 PTGER2-202ENST00000557436 643 ntTSL 3 BASIC17.53■□□□□ 0.4
NKIRAS2Q9NYR9 ZNF263-205ENST00000574253 1139 ntTSL 2 BASIC17.53■□□□□ 0.4
NKIRAS2Q9NYR9 OGFR-204ENST00000621591 1194 ntTSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
NKIRAS2Q9NYR9 AC133041.1-202ENST00000642053 222 ntBASIC17.53■□□□□ 0.4
NKIRAS2Q9NYR9 MAPT-209ENST00000446361 5345 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
NKIRAS2Q9NYR9 MB21D2-201ENST00000392452 3368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
NKIRAS2Q9NYR9 ADORA2A-201ENST00000337539 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
NKIRAS2Q9NYR9 NKX2-1-203ENST00000518149 2583 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
NKIRAS2Q9NYR9 PRR36-202ENST00000618550 4456 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
NKIRAS2Q9NYR9 ACOT4-201ENST00000326303 2362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
NKIRAS2Q9NYR9 HACE1-202ENST00000369125 3102 ntTSL 2 BASIC17.53■□□□□ 0.4
NKIRAS2Q9NYR9 FDXR-219ENST00000583917 1762 ntTSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
NKIRAS2Q9NYR9 AUH-202ENST00000375731 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
NKIRAS2Q9NYR9 SDCBP-204ENST00000447182 2103 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
NKIRAS2Q9NYR9 ATP2A3-201ENST00000309890 4826 ntTSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
NKIRAS2Q9NYR9 CLYBL-203ENST00000376355 6771 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.52■□□□□ 0.4
NKIRAS2Q9NYR9 SLC2A7-201ENST00000400906 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
NKIRAS2Q9NYR9 RPS6KA1-203ENST00000374166 3131 ntTSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.4
NKIRAS2Q9NYR9 MLX-201ENST00000246912 2586 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
NKIRAS2Q9NYR9 ANKDD1B-204ENST00000601380 2569 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.4
NKIRAS2Q9NYR9 FBXW11-202ENST00000296933 4539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
NKIRAS2Q9NYR9 EEF1DP3-201ENST00000428783 1309 ntTSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
NKIRAS2Q9NYR9 CASKIN2-201ENST00000321617 5015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
NKIRAS2Q9NYR9 TBX18-202ENST00000369663 6245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
NKIRAS2Q9NYR9 SUMO3-201ENST00000332859 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
NKIRAS2Q9NYR9 TSC22D3-205ENST00000372390 1812 ntTSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
NKIRAS2Q9NYR9 TMEM53-202ENST00000372237 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
NKIRAS2Q9NYR9 SMPD4-202ENST00000409031 4896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
NKIRAS2Q9NYR9 AGAP2-201ENST00000257897 5388 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
NKIRAS2Q9NYR9 NOXO1-203ENST00000397280 1147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
NKIRAS2Q9NYR9 MIPEPP3-201ENST00000412105 444 ntBASIC17.52■□□□□ 0.4
NKIRAS2Q9NYR9 ALKBH6-212ENST00000485128 959 ntTSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.4
NKIRAS2Q9NYR9 TPT1-AS1-210ENST00000520590 873 ntTSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.4
NKIRAS2Q9NYR9 RGMA-211ENST00000557420 989 ntTSL 3 BASIC17.52■□□□□ 0.4
NKIRAS2Q9NYR9 LYRM1-205ENST00000562740 931 ntTSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
NKIRAS2Q9NYR9 TCF3P1-201ENST00000423021 1937 ntBASIC17.52■□□□□ 0.4
NKIRAS2Q9NYR9 AC138356.1-201ENST00000330539 2086 ntTSL 2 BASIC17.52■□□□□ 0.39
NKIRAS2Q9NYR9 KCNN2-207ENST00000610748 2091 ntTSL 3 BASIC17.52■□□□□ 0.39
NKIRAS2Q9NYR9 HOXA4-202ENST00000428284 1595 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.52■□□□□ 0.39
NKIRAS2Q9NYR9 SMG1P5-201ENST00000411546 2362 ntTSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
NKIRAS2Q9NYR9 TYRO3-201ENST00000263798 8207 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
NKIRAS2Q9NYR9 AL645608.1-202ENST00000417705 1389 ntTSL 3 BASIC17.52■□□□□ 0.39
NKIRAS2Q9NYR9 EWSR1-208ENST00000414183 2189 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC17.52■□□□□ 0.39
NKIRAS2Q9NYR9 NIPAL2-202ENST00000430223 4496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
NKIRAS2Q9NYR9 ZNF710-201ENST00000268154 4617 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.51■□□□□ 0.39
NKIRAS2Q9NYR9 ADGRG2-209ENST00000379876 4779 ntTSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
NKIRAS2Q9NYR9 TBX21-201ENST00000177694 2572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
NKIRAS2Q9NYR9 TBCB-201ENST00000221855 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
NKIRAS2Q9NYR9 CDK6-202ENST00000424848 1465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
NKIRAS2Q9NYR9 MON1A-203ENST00000455683 1617 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
NKIRAS2Q9NYR9 TINAGL1-201ENST00000271064 2187 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
NKIRAS2Q9NYR9 TPSAB1-201ENST00000338844 1175 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
NKIRAS2Q9NYR9 RAB11FIP2-201ENST00000355624 6061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
NKIRAS2Q9NYR9 XXYLT1-202ENST00000356740 564 ntTSL 2 BASIC17.51■□□□□ 0.39
NKIRAS2Q9NYR9 ACHE-207ENST00000428317 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
NKIRAS2Q9NYR9 ALG5-202ENST00000443765 1119 ntTSL 2 BASIC17.51■□□□□ 0.39
NKIRAS2Q9NYR9 AP001972.3-201ENST00000530792 495 ntTSL 3 BASIC17.51■□□□□ 0.39
NKIRAS2Q9NYR9 ISCU-212ENST00000547005 795 ntTSL 3 BASIC17.51■□□□□ 0.39
NKIRAS2Q9NYR9 SLC38A7-205ENST00000564010 1437 ntTSL 2 BASIC17.51■□□□□ 0.39
NKIRAS2Q9NYR9 MAGIX-202ENST00000595224 1238 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
NKIRAS2Q9NYR9 AC092118.2-201ENST00000613495 667 ntBASIC17.51■□□□□ 0.39
NKIRAS2Q9NYR9 AL772284.2-201ENST00000620151 1147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
NKIRAS2Q9NYR9 ZIC1-201ENST00000282928 5241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
NKIRAS2Q9NYR9 CLN8-208ENST00000635751 1807 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
NKIRAS2Q9NYR9 SLC25A39-212ENST00000590194 1542 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
NKIRAS2Q9NYR9 MRPL40-201ENST00000333130 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
NKIRAS2Q9NYR9 IKBIP-203ENST00000393042 1368 ntTSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
NKIRAS2Q9NYR9 ESR1-210ENST00000456483 1368 ntTSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
NKIRAS2Q9NYR9 NLRP6-201ENST00000312165 2679 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
NKIRAS2Q9NYR9 SNX4-201ENST00000251775 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
NKIRAS2Q9NYR9 RTKN-201ENST00000233330 2220 ntTSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
NKIRAS2Q9NYR9 SLC25A10-201ENST00000331531 1946 ntTSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
NKIRAS2Q9NYR9 SKOR1-203ENST00000554054 3620 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
NKIRAS2Q9NYR9 AVPR2-202ENST00000358927 1763 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
NKIRAS2Q9NYR9 SEMA3C-201ENST00000265361 5174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
NKIRAS2Q9NYR9 PGR-201ENST00000263463 2496 ntTSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
NKIRAS2Q9NYR9 STX6-201ENST00000258301 4851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
NKIRAS2Q9NYR9 PRR14-202ENST00000300835 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
NKIRAS2Q9NYR9 PFKFB3-204ENST00000379785 2181 ntTSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
NKIRAS2Q9NYR9 PLCL2-204ENST00000615277 4147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
NKIRAS2Q9NYR9 SENP6-201ENST00000327284 2700 ntTSL 2 BASIC17.5■□□□□ 0.39
NKIRAS2Q9NYR9 MMP23B-202ENST00000378675 1309 ntTSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
NKIRAS2Q9NYR9 NELFE-202ENST00000375429 1584 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
NKIRAS2Q9NYR9 FST-201ENST00000256759 2519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
NKIRAS2Q9NYR9 OTUD1-201ENST00000376495 2933 ntAPPRIS P1 BASIC17.5■□□□□ 0.39
NKIRAS2Q9NYR9 MAN2A1-201ENST00000261483 4667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
NKIRAS2Q9NYR9 COA6-202ENST00000366613 641 ntTSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
NKIRAS2Q9NYR9 AC069152.1-201ENST00000438030 544 ntBASIC17.5■□□□□ 0.39
NKIRAS2Q9NYR9 VMO1-204ENST00000441199 741 ntTSL 2 BASIC17.5■□□□□ 0.39
NKIRAS2Q9NYR9 HTT-AS-201ENST00000503893 515 ntTSL 4 BASIC17.5■□□□□ 0.39
NKIRAS2Q9NYR9 ZNF324-202ENST00000535298 1006 ntTSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
NKIRAS2Q9NYR9 AL138781.1-201ENST00000566567 1274 ntBASIC17.5■□□□□ 0.39
NKIRAS2Q9NYR9 ATG4B-204ENST00000402096 1685 ntTSL 2 BASIC17.5■□□□□ 0.39
NKIRAS2Q9NYR9 TRIM4-202ENST00000354241 1942 ntTSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
NKIRAS2Q9NYR9 SAMD14-203ENST00000503131 1938 ntTSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
NKIRAS2Q9NYR9 PLBD2-201ENST00000280800 4800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.2 ms