Protein–RNA interactions for Protein: Q9NYA1

SPHK1, Sphingosine kinase 1, humanhuman

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Length 384 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SPHK1Q9NYA1 ME2-218ENST00000640965 2476 ntTSL 5 BASIC18.94■□□□□ 0.62
SPHK1Q9NYA1 DACH1-201ENST00000611519 4789 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
SPHK1Q9NYA1 MTX1-201ENST00000316721 1441 ntTSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
SPHK1Q9NYA1 FAM212B-203ENST00000444059 1423 ntTSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
SPHK1Q9NYA1 RAB11FIP4-201ENST00000394744 1968 ntTSL 2 BASIC18.94■□□□□ 0.62
SPHK1Q9NYA1 HAS3-201ENST00000219322 1163 ntTSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
SPHK1Q9NYA1 NKAIN4-201ENST00000370307 793 ntTSL 5 BASIC18.94■□□□□ 0.62
SPHK1Q9NYA1 PDCD2-202ENST00000392090 936 ntTSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
SPHK1Q9NYA1 MRPL2-207ENST00000487429 905 ntTSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
SPHK1Q9NYA1 ADAMTS19-AS1-201ENST00000502827 786 ntTSL 4 BASIC18.94■□□□□ 0.62
SPHK1Q9NYA1 NDUFA13-203ENST00000503283 825 ntTSL 2 BASIC18.94■□□□□ 0.62
SPHK1Q9NYA1 KRT18P16-201ENST00000510337 1294 ntBASIC18.94■□□□□ 0.62
SPHK1Q9NYA1 REXO2-216ENST00000544196 452 ntTSL 3 BASIC18.94■□□□□ 0.62
SPHK1Q9NYA1 RARRES2P10-201ENST00000564312 460 ntBASIC18.94■□□□□ 0.62
SPHK1Q9NYA1 AC091551.1-201ENST00000590722 1228 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.94■□□□□ 0.62
SPHK1Q9NYA1 SMC5-AS1-201ENST00000594708 1818 ntTSL 2 BASIC18.94■□□□□ 0.62
SPHK1Q9NYA1 RNF165-205ENST00000588679 2904 ntBASIC18.94■□□□□ 0.62
SPHK1Q9NYA1 KLF2-201ENST00000248071 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
SPHK1Q9NYA1 MRFAP1-201ENST00000320912 2049 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.94■□□□□ 0.62
SPHK1Q9NYA1 C19orf66-209ENST00000591813 1481 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
SPHK1Q9NYA1 ASAP2-202ENST00000315273 5582 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
SPHK1Q9NYA1 KCNH2-201ENST00000262186 4286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
SPHK1Q9NYA1 TRIM46-204ENST00000368385 1864 ntTSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
SPHK1Q9NYA1 NGEF-202ENST00000373552 2286 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.94■□□□□ 0.62
SPHK1Q9NYA1 GPR20-201ENST00000377741 1515 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.94■□□□□ 0.62
SPHK1Q9NYA1 JDP2-201ENST00000267569 1700 ntTSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
SPHK1Q9NYA1 LSM4-203ENST00000593829 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
SPHK1Q9NYA1 PRMT2-206ENST00000397638 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
SPHK1Q9NYA1 GCSH-201ENST00000315467 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
SPHK1Q9NYA1 RPUSD2-202ENST00000559271 1558 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.93■□□□□ 0.62
SPHK1Q9NYA1 SSH1-209ENST00000551165 2354 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
SPHK1Q9NYA1 TEX22-201ENST00000451127 2571 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.93■□□□□ 0.62
SPHK1Q9NYA1 PGAM5-203ENST00000498926 2834 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.93■□□□□ 0.62
SPHK1Q9NYA1 GLB1-201ENST00000307363 2616 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
SPHK1Q9NYA1 ACHE-204ENST00000412389 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
SPHK1Q9NYA1 IRGQ-205ENST00000602269 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
SPHK1Q9NYA1 SOCS2-207ENST00000549206 2072 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.93■□□□□ 0.62
SPHK1Q9NYA1 LINC02361-201ENST00000538731 1484 ntTSL 2 BASIC18.93■□□□□ 0.62
SPHK1Q9NYA1 PTPRCAP-201ENST00000326294 1292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
SPHK1Q9NYA1 RPS2P55-201ENST00000397318 883 ntBASIC18.93■□□□□ 0.62
SPHK1Q9NYA1 DMRT2-206ENST00000412350 1244 ntTSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
SPHK1Q9NYA1 C16orf90-202ENST00000437192 907 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.93■□□□□ 0.62
SPHK1Q9NYA1 RBCK1-213ENST00000475269 1200 ntTSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
SPHK1Q9NYA1 SNX5-213ENST00000486039 602 ntTSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
SPHK1Q9NYA1 AC107956.1-201ENST00000494359 873 ntBASIC18.93■□□□□ 0.62
SPHK1Q9NYA1 SBF2-AS1-202ENST00000499953 854 ntTSL 5 BASIC18.93■□□□□ 0.62
SPHK1Q9NYA1 AC027682.2-201ENST00000563083 336 ntTSL 5 BASIC18.93■□□□□ 0.62
SPHK1Q9NYA1 RPL23AP53-202ENST00000606507 370 ntTSL 3 BASIC18.93■□□□□ 0.62
SPHK1Q9NYA1 PMPCB-202ENST00000428154 1714 ntTSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
SPHK1Q9NYA1 PRELID3B-201ENST00000355937 2626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
SPHK1Q9NYA1 PLBD1-201ENST00000240617 2426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
SPHK1Q9NYA1 ZBED3-201ENST00000255198 6172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
SPHK1Q9NYA1 NPAS1-201ENST00000439365 1341 ntTSL 2 BASIC18.93■□□□□ 0.62
SPHK1Q9NYA1 AATK-AS1-203ENST00000637878 1306 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.93■□□□□ 0.62
SPHK1Q9NYA1 GALNT10-202ENST00000377661 3778 ntTSL 5 BASIC18.93■□□□□ 0.62
SPHK1Q9NYA1 PAQR9-201ENST00000340634 2452 ntAPPRIS P1 BASIC18.93■□□□□ 0.62
SPHK1Q9NYA1 PCBP4-212ENST00000484633 2009 ntTSL 5 BASIC18.93■□□□□ 0.62
SPHK1Q9NYA1 GRIK4-205ENST00000527524 5861 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.93■□□□□ 0.62
SPHK1Q9NYA1 FAM3A-203ENST00000369641 1359 ntTSL 5 BASIC18.93■□□□□ 0.62
SPHK1Q9NYA1 EDC4-201ENST00000358933 4800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
SPHK1Q9NYA1 YIPF2-201ENST00000253031 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
SPHK1Q9NYA1 ZGPAT-203ENST00000357119 1896 ntTSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
SPHK1Q9NYA1 CHST8-203ENST00000438847 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
SPHK1Q9NYA1 PSMD6-201ENST00000295901 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
SPHK1Q9NYA1 ADAD1-202ENST00000388724 1912 ntTSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
SPHK1Q9NYA1 CFP-201ENST00000247153 1713 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.92■□□□□ 0.62
SPHK1Q9NYA1 RBM45-207ENST00000616198 1788 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
SPHK1Q9NYA1 NCF1B-202ENST00000432102 930 ntTSL 2 BASIC18.92■□□□□ 0.62
SPHK1Q9NYA1 AC019257.1-201ENST00000517676 557 ntTSL 5 BASIC18.92■□□□□ 0.62
SPHK1Q9NYA1 MOK-228ENST00000523231 1114 ntTSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
SPHK1Q9NYA1 ISG20-210ENST00000560741 800 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.92■□□□□ 0.62
SPHK1Q9NYA1 AL354712.1-201ENST00000563570 477 ntTSL 3 BASIC18.92■□□□□ 0.62
SPHK1Q9NYA1 SLC6A6-208ENST00000621751 1252 ntTSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
SPHK1Q9NYA1 DGKZ-214ENST00000527911 3337 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
SPHK1Q9NYA1 EBF1-202ENST00000380654 2345 ntTSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
SPHK1Q9NYA1 PYCR1-204ENST00000403172 1811 ntTSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
SPHK1Q9NYA1 NOL3-204ENST00000564053 1592 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.92■□□□□ 0.62
SPHK1Q9NYA1 CENPH-206ENST00000515001 1305 ntTSL 2 BASIC18.92■□□□□ 0.62
SPHK1Q9NYA1 BICRA-204ENST00000614245 5697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.92■□□□□ 0.62
SPHK1Q9NYA1 RAB5C-202ENST00000393860 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
SPHK1Q9NYA1 OGG1-217ENST00000449570 1948 ntTSL 5 BASIC18.92■□□□□ 0.62
SPHK1Q9NYA1 HMOX2-218ENST00000619913 1908 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.92■□□□□ 0.62
SPHK1Q9NYA1 CXCL16-201ENST00000293778 2222 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
SPHK1Q9NYA1 PFKFB3-217ENST00000626882 1965 ntTSL 5 BASIC18.92■□□□□ 0.62
SPHK1Q9NYA1 FAM129C-205ENST00000595684 2265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
SPHK1Q9NYA1 GIPR-202ENST00000304207 1432 ntTSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
SPHK1Q9NYA1 PML-204ENST00000359928 1726 ntTSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
SPHK1Q9NYA1 WBP2-213ENST00000590221 1745 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC18.91■□□□□ 0.62
SPHK1Q9NYA1 MRPS2-201ENST00000241600 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
SPHK1Q9NYA1 LRIG1-201ENST00000273261 5273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
SPHK1Q9NYA1 RBM14-RBM4-201ENST00000412278 1566 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.91■□□□□ 0.62
SPHK1Q9NYA1 ZNF316-201ENST00000382252 5392 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.91■□□□□ 0.62
SPHK1Q9NYA1 C1QBP-201ENST00000225698 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
SPHK1Q9NYA1 TSPY8-201ENST00000287721 1161 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
SPHK1Q9NYA1 CMTM8-201ENST00000307526 1174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
SPHK1Q9NYA1 UPK3B-203ENST00000394849 1041 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.91■□□□□ 0.62
SPHK1Q9NYA1 TSPY10-201ENST00000428845 1161 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
SPHK1Q9NYA1 TUBB8P6-201ENST00000436895 1288 ntBASIC18.91■□□□□ 0.62
SPHK1Q9NYA1 LINC01786-202ENST00000453732 389 ntTSL 2 BASIC18.91■□□□□ 0.62
SPHK1Q9NYA1 TSPY3-203ENST00000457222 1161 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
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