Protein–RNA interactions for Protein: Q9NSP4

CENPM, Centromere protein M, humanhuman

Predictions only

Length 180 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CENPMQ9NSP4 SPAG9-202ENST00000357122 4761 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
CENPMQ9NSP4 DTD1-201ENST00000377452 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
CENPMQ9NSP4 ZNF470-201ENST00000330619 7151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
CENPMQ9NSP4 INSM2-201ENST00000307169 3013 ntAPPRIS P1 BASIC17.39■□□□□ 0.38
CENPMQ9NSP4 MSL1-202ENST00000398532 4707 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.38
CENPMQ9NSP4 LRP8-204ENST00000371454 3322 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.38
CENPMQ9NSP4 SOCS2-210ENST00000551556 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
CENPMQ9NSP4 CSNK1D-203ENST00000392334 2047 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
CENPMQ9NSP4 KCNA2-206ENST00000638477 1524 ntTSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
CENPMQ9NSP4 MAP3K6-207ENST00000493901 4309 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
CENPMQ9NSP4 CDCA4P2-201ENST00000441182 718 ntBASIC17.39■□□□□ 0.37
CENPMQ9NSP4 AC026185.1-201ENST00000445748 174 ntBASIC17.39■□□□□ 0.37
CENPMQ9NSP4 TPT1-AS1-210ENST00000520590 873 ntTSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
CENPMQ9NSP4 CAMKK2-206ENST00000402834 2051 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
CENPMQ9NSP4 SYNC-201ENST00000373484 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.39■□□□□ 0.37
CENPMQ9NSP4 PSMD8-201ENST00000215071 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
CENPMQ9NSP4 DUT-201ENST00000331200 2147 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
CENPMQ9NSP4 CXXC5-201ENST00000302517 2658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
CENPMQ9NSP4 SLC35B1-201ENST00000240333 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
CENPMQ9NSP4 PHGDH-210ENST00000641115 1638 ntBASIC17.39■□□□□ 0.37
CENPMQ9NSP4 GPR62-201ENST00000322241 2191 ntAPPRIS P1 BASIC17.39■□□□□ 0.37
CENPMQ9NSP4 FAM129C-201ENST00000332386 2222 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
CENPMQ9NSP4 SPTBN4-202ENST00000352632 8676 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
CENPMQ9NSP4 PFKFB3-217ENST00000626882 1965 ntTSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
CENPMQ9NSP4 TSSC4-207ENST00000451491 1423 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
CENPMQ9NSP4 CCS-208ENST00000533244 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
CENPMQ9NSP4 AP3S1-201ENST00000316788 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
CENPMQ9NSP4 RNH1-203ENST00000397604 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
CENPMQ9NSP4 KCNC3-203ENST00000477616 3176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
CENPMQ9NSP4 PPM1H-201ENST00000228705 6353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
CENPMQ9NSP4 EXTL3-201ENST00000220562 6483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
CENPMQ9NSP4 HTR1E-201ENST00000305344 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
CENPMQ9NSP4 AC005906.2-203ENST00000640962 2091 ntTSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
CENPMQ9NSP4 RAB28-201ENST00000288723 1810 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
CENPMQ9NSP4 TOR2A-203ENST00000373284 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
CENPMQ9NSP4 TRAPPC12-202ENST00000382110 2483 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
CENPMQ9NSP4 EVPL-202ENST00000586740 6223 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
CENPMQ9NSP4 LRR1-202ENST00000318317 957 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
CENPMQ9NSP4 GCC2-AS1-201ENST00000322353 558 ntTSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
CENPMQ9NSP4 MIR663A-201ENST00000385250 93 ntBASIC17.38■□□□□ 0.37
CENPMQ9NSP4 BX276092.2-201ENST00000417668 665 ntBASIC17.38■□□□□ 0.37
CENPMQ9NSP4 FAM229A-204ENST00000432622 699 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
CENPMQ9NSP4 ANAPC11-212ENST00000577425 603 ntTSL 3 BASIC17.38■□□□□ 0.37
CENPMQ9NSP4 AC005410.1-201ENST00000579522 462 ntTSL 3 BASIC17.38■□□□□ 0.37
CENPMQ9NSP4 PADI2-201ENST00000375481 1607 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
CENPMQ9NSP4 NPAS1-207ENST00000602189 1643 ntTSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
CENPMQ9NSP4 LMTK2-201ENST00000297293 8946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
CENPMQ9NSP4 CLINT1-207ENST00000523908 2346 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
CENPMQ9NSP4 APTR-204ENST00000440088 2029 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
CENPMQ9NSP4 WIPF2-202ENST00000394103 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
CENPMQ9NSP4 PML-204ENST00000359928 1726 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
CENPMQ9NSP4 NRM-203ENST00000376421 1734 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
CENPMQ9NSP4 ACD-214ENST00000620338 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
CENPMQ9NSP4 TXNRD2-203ENST00000400519 3155 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
CENPMQ9NSP4 POLE2-202ENST00000539565 1792 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
CENPMQ9NSP4 FAM212B-203ENST00000444059 1423 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
CENPMQ9NSP4 AC093484.2-201ENST00000580996 2166 ntBASIC17.38■□□□□ 0.37
CENPMQ9NSP4 FAM3A-215ENST00000447601 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
CENPMQ9NSP4 BRSK2-215ENST00000544817 1842 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
CENPMQ9NSP4 UNKL-204ENST00000389221 5116 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
CENPMQ9NSP4 ANTXR1-203ENST00000409829 2221 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
CENPMQ9NSP4 DISC1-204ENST00000366633 2676 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
CENPMQ9NSP4 DISC1-214ENST00000539444 2658 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
CENPMQ9NSP4 CDH5-204ENST00000563425 1932 ntTSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
CENPMQ9NSP4 PRKAG2-203ENST00000418337 2318 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
CENPMQ9NSP4 TXNRD2-202ENST00000400518 2025 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
CENPMQ9NSP4 DND1-201ENST00000542735 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
CENPMQ9NSP4 TFRC-202ENST00000392396 5032 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
CENPMQ9NSP4 C20orf196-202ENST00000378979 585 ntTSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
CENPMQ9NSP4 SERPINH1P1-201ENST00000419794 1249 ntBASIC17.37■□□□□ 0.37
CENPMQ9NSP4 ZNF467-202ENST00000484747 913 ntTSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
CENPMQ9NSP4 DIMT1-202ENST00000506390 1208 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
CENPMQ9NSP4 HCK-207ENST00000520553 2101 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
CENPMQ9NSP4 PLK5-204ENST00000588430 900 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
CENPMQ9NSP4 ATRAID-208ENST00000611786 1256 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
CENPMQ9NSP4 AL161421.1-201ENST00000619666 1101 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
CENPMQ9NSP4 MRC2-201ENST00000303375 5988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
CENPMQ9NSP4 UBE2E3-201ENST00000392415 1347 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.37■□□□□ 0.37
CENPMQ9NSP4 TOM1L2-210ENST00000542206 1320 ntTSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
CENPMQ9NSP4 WIPF1-205ENST00000409415 1772 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
CENPMQ9NSP4 TNFRSF1A-201ENST00000162749 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
CENPMQ9NSP4 HOXA11-201ENST00000006015 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
CENPMQ9NSP4 TMEM8A-201ENST00000250930 2346 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
CENPMQ9NSP4 RDH13-203ENST00000415061 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
CENPMQ9NSP4 DBNDD2-203ENST00000372710 1417 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
CENPMQ9NSP4 RAPSN-205ENST00000529341 1408 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
CENPMQ9NSP4 HCN2-201ENST00000251287 3408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
CENPMQ9NSP4 ADNP2-201ENST00000262198 5393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
CENPMQ9NSP4 FUZ-201ENST00000313777 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
CENPMQ9NSP4 CAMKV-205ENST00000467248 1688 ntTSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
CENPMQ9NSP4 STMN3-201ENST00000370053 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
CENPMQ9NSP4 EARS2-206ENST00000563232 1709 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
CENPMQ9NSP4 ARFRP1-208ENST00000612256 2974 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
CENPMQ9NSP4 DLX3-202ENST00000512495 834 ntTSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
CENPMQ9NSP4 AC084032.1-201ENST00000552324 578 ntTSL 4 BASIC17.36■□□□□ 0.37
CENPMQ9NSP4 VPS53-216ENST00000574029 585 ntTSL 4 BASIC17.36■□□□□ 0.37
CENPMQ9NSP4 AL050303.2-201ENST00000619798 666 ntBASIC17.36■□□□□ 0.37
CENPMQ9NSP4 ALDH3A2-224ENST00000626500 995 ntTSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
CENPMQ9NSP4 KLHL21-206ENST00000610898 1945 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
CENPMQ9NSP4 UCHL5-204ENST00000367451 1346 ntTSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.8 ms