Protein–RNA interactions for Protein: Q9NSA3

CTNNBIP1, Beta-catenin-interacting protein 1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 81 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CTNNBIP1Q9NSA3 GOLGA4-212ENST00000617480 1545 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
CTNNBIP1Q9NSA3 CDK13-201ENST00000181839 7298 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
CTNNBIP1Q9NSA3 SMARCD1-201ENST00000381513 3237 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
CTNNBIP1Q9NSA3 FBXL7-202ENST00000504595 4562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
CTNNBIP1Q9NSA3 RBFOX1-215ENST00000553186 2196 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
CTNNBIP1Q9NSA3 ACSS3-201ENST00000261206 2666 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
CTNNBIP1Q9NSA3 KIAA1549-201ENST00000422774 6283 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
CTNNBIP1Q9NSA3 NRM-203ENST00000376421 1734 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
CTNNBIP1Q9NSA3 SNX27-203ENST00000368843 7197 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
CTNNBIP1Q9NSA3 OPRD1-201ENST00000234961 9345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
CTNNBIP1Q9NSA3 C11orf49-201ENST00000278460 1645 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
CTNNBIP1Q9NSA3 PITX2-203ENST00000355080 2100 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
CTNNBIP1Q9NSA3 CCM2-202ENST00000381112 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
CTNNBIP1Q9NSA3 FAM198A-202ENST00000430121 3121 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
CTNNBIP1Q9NSA3 SAC3D1-205ENST00000531072 1362 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
CTNNBIP1Q9NSA3 TMEM179-201ENST00000341595 2513 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
CTNNBIP1Q9NSA3 PLD4-204ENST00000540372 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
CTNNBIP1Q9NSA3 KLHL35-201ENST00000376292 1500 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
CTNNBIP1Q9NSA3 SYN2-206ENST00000621198 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
CTNNBIP1Q9NSA3 NEBL-AS1-202ENST00000439097 661 ntTSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
CTNNBIP1Q9NSA3 HIGD1A-204ENST00000452906 585 ntTSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
CTNNBIP1Q9NSA3 ATP6V0B-205ENST00000472174 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
CTNNBIP1Q9NSA3 BRD2-214ENST00000496118 735 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
CTNNBIP1Q9NSA3 AC007322.4-201ENST00000509611 723 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
CTNNBIP1Q9NSA3 AL583722.4-201ENST00000555524 716 ntTSL 3 BASIC15.91■□□□□ 0.14
CTNNBIP1Q9NSA3 AC013268.1-206ENST00000638368 961 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
CTNNBIP1Q9NSA3 AC112229.1-201ENST00000639295 961 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
CTNNBIP1Q9NSA3 AGPAT3-201ENST00000291572 5546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
CTNNBIP1Q9NSA3 TMEM8A-201ENST00000250930 2346 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
CTNNBIP1Q9NSA3 FBXL20-202ENST00000394294 2309 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
CTNNBIP1Q9NSA3 NTRK1-201ENST00000358660 2492 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
CTNNBIP1Q9NSA3 PTH2R-204ENST00000617735 2472 ntTSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
CTNNBIP1Q9NSA3 PVRIG-201ENST00000317271 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
CTNNBIP1Q9NSA3 TCERG1L-201ENST00000368642 2618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
CTNNBIP1Q9NSA3 PSMG4-209ENST00000473000 4603 ntTSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
CTNNBIP1Q9NSA3 FGF17-202ENST00000518533 1706 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
CTNNBIP1Q9NSA3 SIM2-201ENST00000290399 4442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
CTNNBIP1Q9NSA3 GAREM2-201ENST00000401533 4161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
CTNNBIP1Q9NSA3 PHGDH-210ENST00000641115 1638 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
CTNNBIP1Q9NSA3 ADAM33-202ENST00000356518 3677 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
CTNNBIP1Q9NSA3 C2CD2L-201ENST00000336702 4771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
CTNNBIP1Q9NSA3 NOMO3-202ENST00000399336 4356 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
CTNNBIP1Q9NSA3 TYRO3-201ENST00000263798 8207 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
CTNNBIP1Q9NSA3 ISOC1-201ENST00000173527 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
CTNNBIP1Q9NSA3 SOWAHC-201ENST00000356454 4657 ntAPPRIS P1 BASIC15.9■□□□□ 0.14
CTNNBIP1Q9NSA3 LRWD1-201ENST00000292616 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
CTNNBIP1Q9NSA3 FLCN-203ENST00000389169 1692 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
CTNNBIP1Q9NSA3 ABCB9-202ENST00000344275 2394 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
CTNNBIP1Q9NSA3 ST3GAL3-206ENST00000351035 2377 ntTSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
CTNNBIP1Q9NSA3 WIPF2-202ENST00000394103 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
CTNNBIP1Q9NSA3 TRPC1-203ENST00000476941 3061 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
CTNNBIP1Q9NSA3 DBNL-210ENST00000448521 1808 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
CTNNBIP1Q9NSA3 PPM1N-207ENST00000451287 1293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
CTNNBIP1Q9NSA3 BRI3-207ENST00000539286 699 ntTSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
CTNNBIP1Q9NSA3 MFSD11-216ENST00000590393 1141 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
CTNNBIP1Q9NSA3 AC016405.3-201ENST00000607710 860 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
CTNNBIP1Q9NSA3 AC093762.2-201ENST00000641700 291 ntAPPRIS P1 BASIC15.9■□□□□ 0.14
CTNNBIP1Q9NSA3 PCCA-201ENST00000376279 2418 ntTSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
CTNNBIP1Q9NSA3 CLN3-240ENST00000631023 1586 ntTSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
CTNNBIP1Q9NSA3 SYT7-208ENST00000542670 1887 ntTSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
CTNNBIP1Q9NSA3 POFUT2-201ENST00000331343 4825 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
CTNNBIP1Q9NSA3 NAT16-201ENST00000300303 2935 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
CTNNBIP1Q9NSA3 LRPPRC-202ENST00000409659 1610 ntTSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
CTNNBIP1Q9NSA3 RAB7A-201ENST00000265062 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
CTNNBIP1Q9NSA3 KBTBD2-201ENST00000304056 3745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
CTNNBIP1Q9NSA3 RAX2-201ENST00000555633 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
CTNNBIP1Q9NSA3 CCDC34-201ENST00000317945 2109 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
CTNNBIP1Q9NSA3 FXYD6-211ENST00000539526 2132 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
CTNNBIP1Q9NSA3 LAG3-201ENST00000203629 1974 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
CTNNBIP1Q9NSA3 C5orf17-202ENST00000512559 1984 ntTSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
CTNNBIP1Q9NSA3 GCOM1-202ENST00000380569 1846 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
CTNNBIP1Q9NSA3 PHC1-212ENST00000543824 4292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
CTNNBIP1Q9NSA3 DCHS2-201ENST00000339452 5064 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
CTNNBIP1Q9NSA3 LTBP3-202ENST00000322147 4046 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
CTNNBIP1Q9NSA3 SORCS3-202ENST00000369701 5757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
CTNNBIP1Q9NSA3 NLGN2-204ENST00000575301 4374 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
CTNNBIP1Q9NSA3 FAM187A-202ENST00000412523 1748 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
CTNNBIP1Q9NSA3 ZNF707-202ENST00000418203 2661 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
CTNNBIP1Q9NSA3 EDN3-204ENST00000371028 2397 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
CTNNBIP1Q9NSA3 CASP16P-201ENST00000428155 1433 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
CTNNBIP1Q9NSA3 SPRED3-201ENST00000338502 4778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
CTNNBIP1Q9NSA3 RPLP0-201ENST00000228306 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
CTNNBIP1Q9NSA3 TMEM218-201ENST00000279968 1034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
CTNNBIP1Q9NSA3 RTCA-202ENST00000370126 538 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
CTNNBIP1Q9NSA3 RBP4-201ENST00000371464 1068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
CTNNBIP1Q9NSA3 POLE4-205ENST00000483063 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
CTNNBIP1Q9NSA3 AC037459.4-201ENST00000517384 585 ntTSL 4 BASIC15.89■□□□□ 0.13
CTNNBIP1Q9NSA3 AC084032.1-201ENST00000552324 578 ntTSL 4 BASIC15.89■□□□□ 0.13
CTNNBIP1Q9NSA3 AC140479.5-201ENST00000568189 735 ntTSL 3 BASIC15.89■□□□□ 0.13
CTNNBIP1Q9NSA3 ATP10A-207ENST00000619904 988 ntTSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
CTNNBIP1Q9NSA3 GJB6-204ENST00000400066 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
CTNNBIP1Q9NSA3 RHBDD3-201ENST00000216085 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
CTNNBIP1Q9NSA3 KRT78-201ENST00000304620 1778 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
CTNNBIP1Q9NSA3 MORC4-201ENST00000255495 2940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
CTNNBIP1Q9NSA3 RHOT1-202ENST00000354266 2919 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
CTNNBIP1Q9NSA3 B4GALNT1-213ENST00000552350 1649 ntTSL 4 BASIC15.89■□□□□ 0.13
CTNNBIP1Q9NSA3 ELL2-201ENST00000237853 6046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
CTNNBIP1Q9NSA3 ALDOA-212ENST00000564546 2104 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
CTNNBIP1Q9NSA3 ARHGAP22-210ENST00000477708 1951 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
CTNNBIP1Q9NSA3 LARGE2-206ENST00000529052 2459 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.1 ms