Protein–RNA interactions for Protein: Q9NRS6

SNX15, Sorting nexin-15, humanhuman

Predictions only

Length 342 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SNX15Q9NRS6 TOR2A-203ENST00000373284 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
SNX15Q9NRS6 SRRM3-204ENST00000611745 3612 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.51■□□□□ 0.71
SNX15Q9NRS6 SPTBN4-207ENST00000595535 6105 ntTSL 5 BASIC19.51■□□□□ 0.71
SNX15Q9NRS6 MARK1-203ENST00000402574 5273 ntTSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
SNX15Q9NRS6 MB21D1-202ENST00000370318 1917 ntTSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
SNX15Q9NRS6 ZDHHC18-202ENST00000374142 5020 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
SNX15Q9NRS6 KCNQ5-201ENST00000342056 6688 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.51■□□□□ 0.71
SNX15Q9NRS6 LINC00315-201ENST00000441947 2323 ntTSL 5 BASIC19.51■□□□□ 0.71
SNX15Q9NRS6 NTRK1-206ENST00000524377 2432 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
SNX15Q9NRS6 FAM72A-203ENST00000367129 676 ntTSL 3 BASIC19.51■□□□□ 0.71
SNX15Q9NRS6 VSX1-201ENST00000376707 943 ntTSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
SNX15Q9NRS6 METTL26-203ENST00000397664 604 ntTSL 2 BASIC19.51■□□□□ 0.71
SNX15Q9NRS6 CCDC103-202ENST00000410006 921 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.51■□□□□ 0.71
SNX15Q9NRS6 ZNF148-203ENST00000468369 1025 ntTSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
SNX15Q9NRS6 FAM72A-205ENST00000468509 629 ntTSL 5 BASIC19.51■□□□□ 0.71
SNX15Q9NRS6 ZNF467-202ENST00000484747 913 ntTSL 2 BASIC19.51■□□□□ 0.71
SNX15Q9NRS6 WWTR1-AS1-203ENST00000495094 975 ntTSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
SNX15Q9NRS6 AC022517.1-201ENST00000592429 346 ntBASIC19.51■□□□□ 0.71
SNX15Q9NRS6 EPN2-212ENST00000575595 1491 ntTSL 2 BASIC19.51■□□□□ 0.71
SNX15Q9NRS6 FAM131C-201ENST00000375662 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
SNX15Q9NRS6 SYTL1-210ENST00000616558 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
SNX15Q9NRS6 KMT5B-201ENST00000304363 5837 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.51■□□□□ 0.71
SNX15Q9NRS6 FBXO24-202ENST00000427939 2087 ntTSL 2 BASIC19.51■□□□□ 0.71
SNX15Q9NRS6 AHRR-204ENST00000506456 2350 ntTSL 2 BASIC19.51■□□□□ 0.71
SNX15Q9NRS6 TEAD2-202ENST00000377214 2440 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC19.51■□□□□ 0.71
SNX15Q9NRS6 ASMTL-201ENST00000381317 2027 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
SNX15Q9NRS6 ASMTL-202ENST00000381333 2035 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.51■□□□□ 0.71
SNX15Q9NRS6 LINC01465-201ENST00000408887 1940 ntBASIC19.51■□□□□ 0.71
SNX15Q9NRS6 FAM187A-202ENST00000412523 1748 ntTSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
SNX15Q9NRS6 RAB11FIP4-211ENST00000621161 8628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
SNX15Q9NRS6 AHCYL1-203ENST00000393614 4313 ntTSL 2 BASIC19.5■□□□□ 0.71
SNX15Q9NRS6 CPAMD8-202ENST00000388925 5355 ntTSL 5 BASIC19.5■□□□□ 0.71
SNX15Q9NRS6 STMN4-202ENST00000350889 2288 ntTSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
SNX15Q9NRS6 DBN1-210ENST00000512501 1878 ntTSL 3 BASIC19.5■□□□□ 0.71
SNX15Q9NRS6 YBX3-201ENST00000228251 1796 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
SNX15Q9NRS6 RBM26-207ENST00000622611 5230 ntTSL 2 BASIC19.5■□□□□ 0.71
SNX15Q9NRS6 MEF2B-201ENST00000409224 1683 ntTSL 2 BASIC19.5■□□□□ 0.71
SNX15Q9NRS6 SENP6-201ENST00000327284 2700 ntTSL 2 BASIC19.5■□□□□ 0.71
SNX15Q9NRS6 TBXA2R-201ENST00000375190 2608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
SNX15Q9NRS6 PGAP1-204ENST00000409475 2443 ntTSL 2 BASIC19.5■□□□□ 0.71
SNX15Q9NRS6 LSM12P1-201ENST00000411836 588 ntBASIC19.5■□□□□ 0.71
SNX15Q9NRS6 AC004911.1-201ENST00000416316 871 ntBASIC19.5■□□□□ 0.71
SNX15Q9NRS6 SERP1-205ENST00000487153 657 ntTSL 4 BASIC19.5■□□□□ 0.71
SNX15Q9NRS6 DIMT1-202ENST00000506390 1208 ntTSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
SNX15Q9NRS6 SUZ12P1-202ENST00000578070 929 ntTSL 5 BASIC19.5■□□□□ 0.71
SNX15Q9NRS6 ATRAID-208ENST00000611786 1256 ntTSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
SNX15Q9NRS6 DIP2A-203ENST00000435722 2760 ntTSL 2 BASIC19.5■□□□□ 0.71
SNX15Q9NRS6 INSR-201ENST00000302850 4721 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
SNX15Q9NRS6 CASTOR1-202ENST00000407689 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
SNX15Q9NRS6 BSCL2-207ENST00000407022 1516 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
SNX15Q9NRS6 NUTM2D-201ENST00000381697 3290 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
SNX15Q9NRS6 AC138356.1-201ENST00000330539 2086 ntTSL 2 BASIC19.5■□□□□ 0.71
SNX15Q9NRS6 TCERG1L-201ENST00000368642 2618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
SNX15Q9NRS6 CD58-203ENST00000457047 1328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
SNX15Q9NRS6 EEF1D-225ENST00000529272 1311 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.5■□□□□ 0.71
SNX15Q9NRS6 TOM1L2-210ENST00000542206 1320 ntTSL 2 BASIC19.5■□□□□ 0.71
SNX15Q9NRS6 MMD2-201ENST00000401401 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
SNX15Q9NRS6 ISLR2-202ENST00000419208 2306 ntTSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
SNX15Q9NRS6 RIMBP3B-201ENST00000620804 6105 ntAPPRIS P1 BASIC19.49■□□□□ 0.71
SNX15Q9NRS6 PITX2-203ENST00000355080 2100 ntTSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
SNX15Q9NRS6 RPP25-201ENST00000322177 3049 ntAPPRIS P1 BASIC19.49■□□□□ 0.71
SNX15Q9NRS6 TRMT2A-203ENST00000404751 2498 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.49■□□□□ 0.71
SNX15Q9NRS6 AC116351.2-201ENST00000606540 1585 ntBASIC19.49■□□□□ 0.71
SNX15Q9NRS6 PTH2R-204ENST00000617735 2472 ntTSL 2 BASIC19.49■□□□□ 0.71
SNX15Q9NRS6 TNFRSF8-202ENST00000413146 2363 ntTSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
SNX15Q9NRS6 LIN54-209ENST00000510557 2257 ntTSL 2 BASIC19.49■□□□□ 0.71
SNX15Q9NRS6 LARGE2-202ENST00000401752 2516 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
SNX15Q9NRS6 PCCA-201ENST00000376279 2418 ntTSL 2 BASIC19.49■□□□□ 0.71
SNX15Q9NRS6 GPX1P1-201ENST00000388829 606 ntBASIC19.49■□□□□ 0.71
SNX15Q9NRS6 ELOVL2-AS1-201ENST00000456190 737 ntTSL 3 BASIC19.49■□□□□ 0.71
SNX15Q9NRS6 KCNA3-201ENST00000369769 2569 ntAPPRIS P1 BASIC19.49■□□□□ 0.71
SNX15Q9NRS6 PRDM11-201ENST00000424263 1858 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.49■□□□□ 0.71
SNX15Q9NRS6 LINC01505-207ENST00000637185 1540 ntTSL 5 BASIC19.49■□□□□ 0.71
SNX15Q9NRS6 KIF22-201ENST00000160827 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
SNX15Q9NRS6 RAB11B-201ENST00000328024 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
SNX15Q9NRS6 FAM66E-201ENST00000529252 1433 ntTSL 2 BASIC19.49■□□□□ 0.71
SNX15Q9NRS6 FAM66B-201ENST00000529456 1432 ntTSL 2 BASIC19.49■□□□□ 0.71
SNX15Q9NRS6 SYN2-206ENST00000621198 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
SNX15Q9NRS6 GCOM1-202ENST00000380569 1846 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.48■□□□□ 0.71
SNX15Q9NRS6 MORC4-201ENST00000255495 2940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
SNX15Q9NRS6 PDCD10-201ENST00000392750 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
SNX15Q9NRS6 DSCC1-201ENST00000313655 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
SNX15Q9NRS6 HOXB9-201ENST00000311177 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
SNX15Q9NRS6 SMTN-204ENST00000404574 1735 ntTSL 2 BASIC19.48■□□□□ 0.71
SNX15Q9NRS6 STX6-204ENST00000542060 4809 ntTSL 2 BASIC19.48■□□□□ 0.71
SNX15Q9NRS6 ARHGAP27-201ENST00000290470 1376 ntTSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
SNX15Q9NRS6 TRAM1L1-201ENST00000310754 2023 ntAPPRIS P1 BASIC19.48■□□□□ 0.71
SNX15Q9NRS6 C17orf58-201ENST00000334461 1535 ntTSL 2 BASIC19.48■□□□□ 0.71
SNX15Q9NRS6 ALKBH6-213ENST00000486389 1525 ntTSL 3 BASIC19.48■□□□□ 0.71
SNX15Q9NRS6 RHOT1-202ENST00000354266 2919 ntTSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
SNX15Q9NRS6 PGPEP1L-201ENST00000378919 995 ntTSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
SNX15Q9NRS6 VSX1-206ENST00000444511 1197 ntTSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
SNX15Q9NRS6 YIF1A-205ENST00000471387 854 ntTSL 5 BASIC19.48■□□□□ 0.71
SNX15Q9NRS6 MCRIP1-203ENST00000538396 925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
SNX15Q9NRS6 IL34-204ENST00000566361 1001 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
SNX15Q9NRS6 INAVA-202ENST00000413687 2197 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC19.48■□□□□ 0.71
SNX15Q9NRS6 MICU2-201ENST00000382374 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
SNX15Q9NRS6 FAM217A-208ENST00000639338 1929 ntTSL 5 BASIC19.48■□□□□ 0.71
SNX15Q9NRS6 DHRSX-201ENST00000334651 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
SNX15Q9NRS6 ANKRD53-202ENST00000360589 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.48■□□□□ 0.71
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34.3 ms