Protein–RNA interactions for Protein: Q9NPC4

A4GALT, Lactosylceramide 4-alpha-galactosyltransferase, humanhuman

Predictions only

Length 353 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
A4GALTQ9NPC4 P2RX5-202ENST00000345901 2031 ntTSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
A4GALTQ9NPC4 ASMTL-201ENST00000381317 2027 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
A4GALTQ9NPC4 ASMTL-202ENST00000381333 2035 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
A4GALTQ9NPC4 LSM12-201ENST00000293406 2308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
A4GALTQ9NPC4 GAS2L1-208ENST00000616432 2925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
A4GALTQ9NPC4 ECEL1-201ENST00000304546 2865 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
A4GALTQ9NPC4 AGAP5-203ENST00000581191 2779 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
A4GALTQ9NPC4 PTRH1-204ENST00000419060 2692 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
A4GALTQ9NPC4 DMRT2-204ENST00000382251 2292 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
A4GALTQ9NPC4 SLC5A10-205ENST00000417251 1984 ntTSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
A4GALTQ9NPC4 SYTL1-210ENST00000616558 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
A4GALTQ9NPC4 MEF2B-201ENST00000409224 1683 ntTSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
A4GALTQ9NPC4 AP2M1-203ENST00000411763 1577 ntTSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
A4GALTQ9NPC4 PDLIM2-205ENST00000397761 1491 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
A4GALTQ9NPC4 AUNIP-203ENST00000538789 1392 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
A4GALTQ9NPC4 FAM160B1-201ENST00000369246 666 ntTSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
A4GALTQ9NPC4 NME6-213ENST00000451657 871 ntTSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
A4GALTQ9NPC4 LINC02091-201ENST00000576171 1185 ntTSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
A4GALTQ9NPC4 CIRBP-214ENST00000587896 1081 ntTSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
A4GALTQ9NPC4 PTCRA-204ENST00000616441 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
A4GALTQ9NPC4 ZNRF1-202ENST00000335325 4620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
A4GALTQ9NPC4 CAPN1-226ENST00000533820 3083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
A4GALTQ9NPC4 GALNT16-204ENST00000553669 1629 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
A4GALTQ9NPC4 SUPT4H1-202ENST00000577396 1643 ntTSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
A4GALTQ9NPC4 DMWD-201ENST00000270223 3305 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
A4GALTQ9NPC4 BTD-202ENST00000383778 2261 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
A4GALTQ9NPC4 UBE2Q2-204ENST00000561851 1582 ntTSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
A4GALTQ9NPC4 BCS1L-201ENST00000359273 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
A4GALTQ9NPC4 GMPPA-213ENST00000622191 1473 ntTSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
A4GALTQ9NPC4 GAS6-201ENST00000327773 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
A4GALTQ9NPC4 CAMKK1-202ENST00000348335 3563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
A4GALTQ9NPC4 NECAB3-202ENST00000375238 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
A4GALTQ9NPC4 VAV1-201ENST00000304076 2825 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
A4GALTQ9NPC4 PPP1CA-202ENST00000358239 1054 ntTSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
A4GALTQ9NPC4 FNDC11-201ENST00000370097 1119 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
A4GALTQ9NPC4 METTL15-202ENST00000403099 795 ntTSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
A4GALTQ9NPC4 GGT1-206ENST00000404223 952 ntTSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
A4GALTQ9NPC4 MIPEPP3-201ENST00000412105 444 ntBASIC18.22■□□□□ 0.51
A4GALTQ9NPC4 PARL-206ENST00000435888 1098 ntTSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
A4GALTQ9NPC4 CROCCP5-201ENST00000436658 830 ntBASIC18.22■□□□□ 0.51
A4GALTQ9NPC4 AL645608.9-201ENST00000442292 829 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
A4GALTQ9NPC4 OR2A1-AS1-201ENST00000462305 773 ntBASIC18.22■□□□□ 0.51
A4GALTQ9NPC4 AC004889.1-204ENST00000474656 773 ntTSL 3 BASIC18.22■□□□□ 0.51
A4GALTQ9NPC4 ALKBH6-212ENST00000485128 959 ntTSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
A4GALTQ9NPC4 VPS53-216ENST00000574029 585 ntTSL 4 BASIC18.22■□□□□ 0.51
A4GALTQ9NPC4 AL137784.2-201ENST00000607332 1000 ntBASIC18.22■□□□□ 0.51
A4GALTQ9NPC4 GGTLC2-204ENST00000613850 973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
A4GALTQ9NPC4 GGTLC2-205ENST00000618722 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
A4GALTQ9NPC4 FPGS-203ENST00000373247 2279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
A4GALTQ9NPC4 SLC38A11-203ENST00000409149 1621 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
A4GALTQ9NPC4 PLCL1-201ENST00000428675 5125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
A4GALTQ9NPC4 PCDHA4-201ENST00000378125 2328 ntTSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
A4GALTQ9NPC4 ISLR2-202ENST00000419208 2306 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
A4GALTQ9NPC4 EFCAB11-202ENST00000538485 1870 ntTSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
A4GALTQ9NPC4 FOXN3-214ENST00000557258 2692 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
A4GALTQ9NPC4 HLA-G-201ENST00000360323 1427 ntAPPRIS P2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
A4GALTQ9NPC4 TMEM41B-207ENST00000611268 1440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
A4GALTQ9NPC4 RAI14-201ENST00000265109 5092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
A4GALTQ9NPC4 EPHA10-202ENST00000373048 5425 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
A4GALTQ9NPC4 KCNE5-201ENST00000372101 1473 ntAPPRIS P1 BASIC18.21■□□□□ 0.51
A4GALTQ9NPC4 GTF3C5-202ENST00000372097 2406 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
A4GALTQ9NPC4 SLC27A3-214ENST00000624995 2413 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
A4GALTQ9NPC4 CHTOP-204ENST00000368694 2096 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
A4GALTQ9NPC4 IKBKG-214ENST00000618670 2069 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
A4GALTQ9NPC4 LIPG-203ENST00000577628 2323 ntTSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
A4GALTQ9NPC4 SERPINB6-204ENST00000380529 1370 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
A4GALTQ9NPC4 NR1H2-201ENST00000253727 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
A4GALTQ9NPC4 PON1-201ENST00000222381 2568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
A4GALTQ9NPC4 NUDT22-201ENST00000279206 1094 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
A4GALTQ9NPC4 NAA20-202ENST00000334982 1260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
A4GALTQ9NPC4 SLC22A15-201ENST00000369502 1230 ntTSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
A4GALTQ9NPC4 RER1-204ENST00000378518 522 ntTSL 3 BASIC18.21■□□□□ 0.51
A4GALTQ9NPC4 CSF1-205ENST00000420111 1083 ntTSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
A4GALTQ9NPC4 NUDT22-204ENST00000441250 986 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
A4GALTQ9NPC4 PLEKHJ1-205ENST00000587394 937 ntTSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
A4GALTQ9NPC4 WT1-211ENST00000639907 1545 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
A4GALTQ9NPC4 YBX3-201ENST00000228251 1796 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
A4GALTQ9NPC4 MB21D1-202ENST00000370318 1917 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
A4GALTQ9NPC4 PIGQ-204ENST00000409527 1915 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
A4GALTQ9NPC4 DSCC1-201ENST00000313655 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
A4GALTQ9NPC4 CDHR5-201ENST00000349570 2318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
A4GALTQ9NPC4 NDUFA10-203ENST00000404554 1557 ntTSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
A4GALTQ9NPC4 P3H4-201ENST00000355468 2791 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
A4GALTQ9NPC4 NHLH2-201ENST00000320238 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
A4GALTQ9NPC4 CASKIN1-201ENST00000343516 5759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
A4GALTQ9NPC4 GNA12-201ENST00000275364 4378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
A4GALTQ9NPC4 HIC1-201ENST00000322941 3053 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
A4GALTQ9NPC4 STX17-212ENST00000534052 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
A4GALTQ9NPC4 RMND5A-201ENST00000283632 6301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
A4GALTQ9NPC4 WIPF1-207ENST00000410117 777 ntTSL 3 BASIC18.2■□□□□ 0.5
A4GALTQ9NPC4 GLI3-203ENST00000437480 451 ntTSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
A4GALTQ9NPC4 DNAJA4-210ENST00000489435 947 ntTSL 3 BASIC18.2■□□□□ 0.5
A4GALTQ9NPC4 C5orf38-206ENST00000505778 509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
A4GALTQ9NPC4 DLX3-202ENST00000512495 834 ntTSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
A4GALTQ9NPC4 LINC01962-201ENST00000513771 411 ntTSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
A4GALTQ9NPC4 C11orf24-209ENST00000533310 980 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
A4GALTQ9NPC4 AC022509.3-202ENST00000545819 566 ntTSL 3 BASIC18.2■□□□□ 0.5
A4GALTQ9NPC4 C12orf75-205ENST00000549893 719 ntTSL 3 BASIC18.2■□□□□ 0.5
A4GALTQ9NPC4 AC092118.2-201ENST00000613495 667 ntBASIC18.2■□□□□ 0.5
A4GALTQ9NPC4 AL772284.2-201ENST00000620151 1147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 40.7 ms