Protein–RNA interactions for Protein: Q9H4Q4

PRDM12, PR domain zinc finger protein 12, humanhuman

Predictions only

Length 367 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRDM12Q9H4Q4 AC103746.1-201ENST00000617440 1133 ntTSL 3 BASIC21.31■■□□□ 1
PRDM12Q9H4Q4 AL138966.2-201ENST00000621997 464 ntBASIC21.31■■□□□ 1
PRDM12Q9H4Q4 AL121956.5-201ENST00000625261 221 ntBASIC21.31■■□□□ 1
PRDM12Q9H4Q4 ABBA01031674.1-201ENST00000635145 728 ntBASIC21.31■■□□□ 1
PRDM12Q9H4Q4 SLAIN1-206ENST00000418532 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
PRDM12Q9H4Q4 AC121338.2-201ENST00000622535 1744 ntBASIC21.31■■□□□ 1
PRDM12Q9H4Q4 PACSIN3-201ENST00000298838 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
PRDM12Q9H4Q4 NNT-AS1-206ENST00000606697 1945 ntTSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
PRDM12Q9H4Q4 HTRA3-202ENST00000382512 2023 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
PRDM12Q9H4Q4 DLEU2-208ENST00000621282 3068 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
PRDM12Q9H4Q4 GPR108-201ENST00000264080 2057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
PRDM12Q9H4Q4 ZNF48-201ENST00000320159 3234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
PRDM12Q9H4Q4 LPAR1-201ENST00000358883 2687 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
PRDM12Q9H4Q4 GGCT-202ENST00000275428 1173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
PRDM12Q9H4Q4 BAD-201ENST00000309032 929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
PRDM12Q9H4Q4 PPP1R14BP5-201ENST00000440334 435 ntBASIC21.3■■□□□ 1
PRDM12Q9H4Q4 AC027682.5-201ENST00000567122 530 ntTSL 3 BASIC21.3■■□□□ 1
PRDM12Q9H4Q4 RNF165-206ENST00000590330 1049 ntTSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
PRDM12Q9H4Q4 TXNL4A-211ENST00000592837 611 ntTSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
PRDM12Q9H4Q4 AL691432.3-201ENST00000621860 400 ntBASIC21.3■■□□□ 1
PRDM12Q9H4Q4 AGER-207ENST00000375076 1492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
PRDM12Q9H4Q4 SPEG-203ENST00000396688 1457 ntTSL 3 BASIC21.3■■□□□ 1
PRDM12Q9H4Q4 CAMK2B-216ENST00000440254 2097 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
PRDM12Q9H4Q4 RFXANK-205ENST00000456252 1325 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
PRDM12Q9H4Q4 AATK-AS1-203ENST00000637878 1306 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
PRDM12Q9H4Q4 ST8SIA1-204ENST00000404299 1920 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
PRDM12Q9H4Q4 DTX3-201ENST00000337737 2029 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
PRDM12Q9H4Q4 DLK2-201ENST00000357338 2038 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
PRDM12Q9H4Q4 MAFF-204ENST00000426621 2216 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC21.29■■□□□ 1
PRDM12Q9H4Q4 GPSM1-206ENST00000616132 2270 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
PRDM12Q9H4Q4 KCNQ5-205ENST00000370398 6345 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
PRDM12Q9H4Q4 SLC43A3-225ENST00000533524 1879 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
PRDM12Q9H4Q4 RTN4-207ENST00000402434 1456 ntTSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
PRDM12Q9H4Q4 ISCU-201ENST00000311893 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
PRDM12Q9H4Q4 SYNE4-202ENST00000340477 1004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
PRDM12Q9H4Q4 UBE2J2-205ENST00000400930 1021 ntTSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
PRDM12Q9H4Q4 AC004540.1-201ENST00000439120 891 ntTSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
PRDM12Q9H4Q4 AC011506.1-201ENST00000474329 610 ntBASIC21.29■■□□□ 1
PRDM12Q9H4Q4 PSMD9-208ENST00000542602 516 ntTSL 3 BASIC21.29■■□□□ 1
PRDM12Q9H4Q4 MED9-202ENST00000580462 565 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
PRDM12Q9H4Q4 ABHD17A-204ENST00000590661 1079 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
PRDM12Q9H4Q4 NDUFV2-AS1-203ENST00000608008 779 ntBASIC21.29■■□□□ 1
PRDM12Q9H4Q4 AL606970.3-201ENST00000446811 2246 ntTSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
PRDM12Q9H4Q4 CD7-207ENST00000584284 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
PRDM12Q9H4Q4 SCOC-207ENST00000506597 1838 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
PRDM12Q9H4Q4 NAGK-229ENST00000613852 1801 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
PRDM12Q9H4Q4 SOCS2-210ENST00000551556 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
PRDM12Q9H4Q4 PLLP-201ENST00000219207 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
PRDM12Q9H4Q4 TNFRSF25-203ENST00000351959 1441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
PRDM12Q9H4Q4 DNAJA4-202ENST00000394852 3116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
PRDM12Q9H4Q4 DNASE1L2-201ENST00000320700 1326 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
PRDM12Q9H4Q4 MFSD10-201ENST00000329687 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
PRDM12Q9H4Q4 SLC9A3R1-201ENST00000262613 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
PRDM12Q9H4Q4 DPYSL5-202ENST00000401478 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
PRDM12Q9H4Q4 MAF-202ENST00000393350 6384 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.28■■□□□ 1
PRDM12Q9H4Q4 AMER2-202ENST00000515384 3197 ntAPPRIS P1 BASIC21.28■■□□□ 1
PRDM12Q9H4Q4 AC006128.1-201ENST00000624704 1661 ntBASIC21.28■■□□□ 1
PRDM12Q9H4Q4 ODC1-201ENST00000234111 2653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
PRDM12Q9H4Q4 ERF-202ENST00000440177 2032 ntTSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
PRDM12Q9H4Q4 DUSP5-201ENST00000369583 2557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
PRDM12Q9H4Q4 CEMP1-202ENST00000567119 1374 ntAPPRIS P2 BASIC21.28■■□□□ 1
PRDM12Q9H4Q4 CREB3-201ENST00000353704 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
PRDM12Q9H4Q4 PKIB-206ENST00000392490 1811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
PRDM12Q9H4Q4 PIEZO1-202ENST00000327397 1246 ntTSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
PRDM12Q9H4Q4 GPX4-201ENST00000354171 919 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
PRDM12Q9H4Q4 CD70-202ENST00000423145 881 ntTSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
PRDM12Q9H4Q4 CATIP-AS1-202ENST00000441749 480 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
PRDM12Q9H4Q4 MRPL2-208ENST00000489623 570 ntTSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
PRDM12Q9H4Q4 FDX2-206ENST00000492239 773 ntTSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
PRDM12Q9H4Q4 SNCB-205ENST00000510387 730 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
PRDM12Q9H4Q4 EEF1D-243ENST00000532400 419 ntTSL 3 BASIC21.28■■□□□ 1
PRDM12Q9H4Q4 AC026271.3-201ENST00000571884 352 ntBASIC21.28■■□□□ 1
PRDM12Q9H4Q4 KDELR3-201ENST00000216014 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
PRDM12Q9H4Q4 METTL1-202ENST00000324871 2066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
PRDM12Q9H4Q4 ALG9-215ENST00000616540 2069 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
PRDM12Q9H4Q4 BBC3-201ENST00000300880 1347 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
PRDM12Q9H4Q4 ZNF668-207ENST00000535577 2396 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
PRDM12Q9H4Q4 DCK-201ENST00000286648 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
PRDM12Q9H4Q4 STIM2-204ENST00000467087 5154 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
PRDM12Q9H4Q4 AC004890.2-202ENST00000463462 1494 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
PRDM12Q9H4Q4 TRIM3-202ENST00000359518 3042 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
PRDM12Q9H4Q4 WBP2-213ENST00000590221 1745 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC21.27■■□□□ 1
PRDM12Q9H4Q4 NECAB3-201ENST00000246190 1989 ntTSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
PRDM12Q9H4Q4 DND1-201ENST00000542735 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
PRDM12Q9H4Q4 LGALS1-201ENST00000215909 560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
PRDM12Q9H4Q4 TMIGD2-201ENST00000301272 1262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
PRDM12Q9H4Q4 DNTTIP1-201ENST00000372622 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
PRDM12Q9H4Q4 SMIM19-202ENST00000416469 691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
PRDM12Q9H4Q4 COX11P1-201ENST00000489116 835 ntBASIC21.27■■□□□ 1
PRDM12Q9H4Q4 AC098864.1-204ENST00000513752 805 ntTSL 4 BASIC21.27■■□□□ 1
PRDM12Q9H4Q4 SMPDL3A-203ENST00000539041 1755 ntTSL 2 BASIC21.27■■□□□ 1
PRDM12Q9H4Q4 REPS2-202ENST00000357277 7953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
PRDM12Q9H4Q4 UXS1-203ENST00000409501 1839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.27■□□□□ 0.99
PRDM12Q9H4Q4 PHF2-201ENST00000359246 5569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
PRDM12Q9H4Q4 MAG-202ENST00000392213 2390 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
PRDM12Q9H4Q4 PRDM11-201ENST00000424263 1858 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
PRDM12Q9H4Q4 LAYN-204ENST00000525126 1763 ntTSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
PRDM12Q9H4Q4 DMRTB1-201ENST00000371445 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
PRDM12Q9H4Q4 TXNRD3-204ENST00000640433 1932 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
PRDM12Q9H4Q4 GPR32-201ENST00000270590 1269 ntAPPRIS P1 BASIC21.26■□□□□ 0.99
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 38.3 ms