Protein–RNA interactions for Protein: Q9BXY4

RSPO3, R-spondin-3, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 272 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RSPO3Q9BXY4 TPCN2-201ENST00000294309 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
RSPO3Q9BXY4 B3GALNT2-201ENST00000313984 1874 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
RSPO3Q9BXY4 TMEM91-203ENST00000392002 1389 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
RSPO3Q9BXY4 ETV4-204ENST00000545089 1628 ntTSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
RSPO3Q9BXY4 ERCC2-203ENST00000391944 2334 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
RSPO3Q9BXY4 SETD7-202ENST00000404104 1590 ntTSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
RSPO3Q9BXY4 NAAA-206ENST00000507956 1300 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
RSPO3Q9BXY4 MLF2-201ENST00000203630 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
RSPO3Q9BXY4 NR1H2-201ENST00000253727 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
RSPO3Q9BXY4 C16orf74-201ENST00000284245 906 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
RSPO3Q9BXY4 PPP1CA-202ENST00000358239 1054 ntTSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
RSPO3Q9BXY4 CNIH4-203ENST00000366858 702 ntTSL 3 BASIC18.05■□□□□ 0.48
RSPO3Q9BXY4 ZNF467-202ENST00000484747 913 ntTSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
RSPO3Q9BXY4 C5orf38-206ENST00000505778 509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
RSPO3Q9BXY4 ZNF696-204ENST00000520333 605 ntTSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
RSPO3Q9BXY4 MORF4L1-215ENST00000559345 1468 ntTSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
RSPO3Q9BXY4 RFTN1-201ENST00000334133 2982 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
RSPO3Q9BXY4 OTUD1-201ENST00000376495 2933 ntAPPRIS P1 BASIC18.05■□□□□ 0.48
RSPO3Q9BXY4 MIB2-231ENST00000518681 3116 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
RSPO3Q9BXY4 ARHGAP11A-208ENST00000567348 2422 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
RSPO3Q9BXY4 PPP1R12C-202ENST00000435544 2363 ntTSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
RSPO3Q9BXY4 SLC25A3-201ENST00000188376 1909 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
RSPO3Q9BXY4 LARGE2-202ENST00000401752 2516 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
RSPO3Q9BXY4 CPXM2-204ENST00000615851 2512 ntTSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
RSPO3Q9BXY4 MARK2-201ENST00000350490 2903 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
RSPO3Q9BXY4 TM7SF2-202ENST00000345348 1490 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
RSPO3Q9BXY4 GMPPA-213ENST00000622191 1473 ntTSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
RSPO3Q9BXY4 IFI27L2-201ENST00000238609 511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
RSPO3Q9BXY4 C11orf86-201ENST00000308963 1187 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
RSPO3Q9BXY4 XBP1-202ENST00000344347 1131 ntTSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
RSPO3Q9BXY4 XXYLT1-202ENST00000356740 564 ntTSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
RSPO3Q9BXY4 PYCR3-202ENST00000377579 985 ntTSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
RSPO3Q9BXY4 DNAJA4-210ENST00000489435 947 ntTSL 3 BASIC18.04■□□□□ 0.48
RSPO3Q9BXY4 SLC29A4P2-201ENST00000504749 1089 ntBASIC18.04■□□□□ 0.48
RSPO3Q9BXY4 C11orf24-209ENST00000533310 980 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
RSPO3Q9BXY4 AC073896.1-201ENST00000549318 937 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
RSPO3Q9BXY4 PGAP3-206ENST00000579146 2220 ntTSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
RSPO3Q9BXY4 TMEM70-201ENST00000312184 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
RSPO3Q9BXY4 SKP2-208ENST00000546211 1589 ntTSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
RSPO3Q9BXY4 ASGR1-208ENST00000574388 1552 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
RSPO3Q9BXY4 TWF1-201ENST00000395510 3045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
RSPO3Q9BXY4 MCIDAS-201ENST00000513312 1736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
RSPO3Q9BXY4 FAM189B-204ENST00000368368 2609 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
RSPO3Q9BXY4 KLHL23-201ENST00000272797 2087 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
RSPO3Q9BXY4 SLC27A3-204ENST00000368661 2410 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
RSPO3Q9BXY4 LINC01505-207ENST00000637185 1540 ntTSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
RSPO3Q9BXY4 CD55-201ENST00000314754 2220 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
RSPO3Q9BXY4 MVB12A-201ENST00000317040 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
RSPO3Q9BXY4 UVSSA-207ENST00000511216 2927 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
RSPO3Q9BXY4 MAPK9-203ENST00000393360 4326 ntTSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
RSPO3Q9BXY4 CHMP6-201ENST00000325167 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
RSPO3Q9BXY4 TEX21P-204ENST00000641479 1693 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
RSPO3Q9BXY4 TRAM1L1-201ENST00000310754 2023 ntAPPRIS P1 BASIC18.03■□□□□ 0.48
RSPO3Q9BXY4 PPA1-202ENST00000373232 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
RSPO3Q9BXY4 CBY3-201ENST00000376974 785 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
RSPO3Q9BXY4 CALM3-202ENST00000391918 702 ntTSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
RSPO3Q9BXY4 EMC6-202ENST00000397133 762 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
RSPO3Q9BXY4 PPP1R14BP2-201ENST00000426284 444 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
RSPO3Q9BXY4 ANKRD65-202ENST00000442470 876 ntTSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
RSPO3Q9BXY4 AC092143.2-201ENST00000554623 985 ntTSL 3 BASIC18.03■□□□□ 0.48
RSPO3Q9BXY4 AL138781.1-201ENST00000566567 1274 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
RSPO3Q9BXY4 KLF2-202ENST00000592003 564 ntTSL 3 BASIC18.03■□□□□ 0.48
RSPO3Q9BXY4 TIMM50-213ENST00000599794 786 ntTSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
RSPO3Q9BXY4 TRAPPC3-208ENST00000616074 1114 ntTSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
RSPO3Q9BXY4 FMR1-201ENST00000218200 4333 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
RSPO3Q9BXY4 CADPS-219ENST00000612439 5455 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
RSPO3Q9BXY4 ADORA2A-214ENST00000611543 2412 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
RSPO3Q9BXY4 FDFT1-209ENST00000525900 1596 ntTSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
RSPO3Q9BXY4 C2orf81-201ENST00000290390 2227 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
RSPO3Q9BXY4 DNAJC11-201ENST00000294401 2210 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
RSPO3Q9BXY4 TMEM198-202ENST00000373883 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
RSPO3Q9BXY4 SPHK1-207ENST00000590959 1851 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
RSPO3Q9BXY4 CMTM7-201ENST00000334983 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
RSPO3Q9BXY4 AL161938.1-201ENST00000569833 2180 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
RSPO3Q9BXY4 UBE2E1-201ENST00000306627 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
RSPO3Q9BXY4 FBXL20-202ENST00000394294 2309 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
RSPO3Q9BXY4 UMOD-201ENST00000302509 2477 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
RSPO3Q9BXY4 AKT2-210ENST00000424901 5170 ntTSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
RSPO3Q9BXY4 SYNDIG1L-201ENST00000331628 2607 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
RSPO3Q9BXY4 PABPC1L-204ENST00000255136 2129 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
RSPO3Q9BXY4 TNFRSF8-202ENST00000413146 2363 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
RSPO3Q9BXY4 ZNF211-204ENST00000347302 2472 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
RSPO3Q9BXY4 PIGP-203ENST00000399098 972 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
RSPO3Q9BXY4 AC006970.2-201ENST00000450065 779 ntBASIC18.02■□□□□ 0.48
RSPO3Q9BXY4 GATS-209ENST00000454084 1030 ntTSL 3 BASIC18.02■□□□□ 0.48
RSPO3Q9BXY4 AC083880.1-201ENST00000608266 535 ntBASIC18.02■□□□□ 0.48
RSPO3Q9BXY4 CCAR2-214ENST00000613179 1421 ntTSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
RSPO3Q9BXY4 PTMS-207ENST00000619580 1150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
RSPO3Q9BXY4 FAM72C-202ENST00000584486 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
RSPO3Q9BXY4 TMEM250-201ENST00000418388 2823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
RSPO3Q9BXY4 SERPINB6-204ENST00000380529 1370 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.47
RSPO3Q9BXY4 TMEM179-201ENST00000341595 2513 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
RSPO3Q9BXY4 MTFR1L-202ENST00000374301 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
RSPO3Q9BXY4 OGFOD2-201ENST00000228922 1780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
RSPO3Q9BXY4 SLC38A11-203ENST00000409149 1621 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
RSPO3Q9BXY4 CORO1B-201ENST00000341356 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
RSPO3Q9BXY4 ELOA-201ENST00000418390 5154 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
RSPO3Q9BXY4 ST3GAL3-206ENST00000351035 2377 ntTSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
RSPO3Q9BXY4 ARL2-201ENST00000246747 979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
RSPO3Q9BXY4 COA6-202ENST00000366613 641 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.7 ms