Protein–RNA interactions for Protein: Q96S38

RPS6KC1, Ribosomal protein S6 kinase delta-1, humanhuman

Predictions only

Length 1,066 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RPS6KC1Q96S38 CHD1L-201ENST00000361293 2484 ntTSL 2 BASIC21.52■■□□□ 1.04
RPS6KC1Q96S38 IMPDH1-208ENST00000470772 1888 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.04
RPS6KC1Q96S38 FAM83A-205ENST00000522648 1604 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
RPS6KC1Q96S38 B4GALNT1-213ENST00000552350 1649 ntTSL 4 BASIC21.52■■□□□ 1.04
RPS6KC1Q96S38 NGEF-202ENST00000373552 2286 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.52■■□□□ 1.04
RPS6KC1Q96S38 CTAG2-201ENST00000247306 993 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
RPS6KC1Q96S38 GPSM1-203ENST00000392944 1111 ntTSL 3 BASIC21.52■■□□□ 1.04
RPS6KC1Q96S38 ZFYVE1-202ENST00000394207 1183 ntTSL 2 BASIC21.52■■□□□ 1.04
RPS6KC1Q96S38 AQP12B-201ENST00000407834 1094 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
RPS6KC1Q96S38 HGNC:18790-208ENST00000506380 798 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.52■■□□□ 1.04
RPS6KC1Q96S38 GNB5-211ENST00000560116 918 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
RPS6KC1Q96S38 HMOX2-218ENST00000619913 1908 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.04
RPS6KC1Q96S38 TAF4-201ENST00000252996 4628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
RPS6KC1Q96S38 KLC1-208ENST00000452929 2453 ntTSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.04
RPS6KC1Q96S38 FICD-201ENST00000361549 1816 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
RPS6KC1Q96S38 GPT-205ENST00000528431 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
RPS6KC1Q96S38 INSR-201ENST00000302850 4721 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
RPS6KC1Q96S38 PCID2-203ENST00000375457 2372 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
RPS6KC1Q96S38 KCNH2-201ENST00000262186 4286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.03
RPS6KC1Q96S38 CACTIN-202ENST00000248420 2671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.03
RPS6KC1Q96S38 PRKCD-202ENST00000394729 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
RPS6KC1Q96S38 KCNMB4-201ENST00000258111 4731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
RPS6KC1Q96S38 SAAL1-204ENST00000529318 1503 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
RPS6KC1Q96S38 AGAP4-207ENST00000616763 2784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
RPS6KC1Q96S38 SOBP-201ENST00000317357 5245 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
RPS6KC1Q96S38 PRSS3-201ENST00000342836 1144 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
RPS6KC1Q96S38 TSPAN14-205ENST00000372158 1095 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
RPS6KC1Q96S38 AL390728.5-201ENST00000428687 706 ntTSL 3 BASIC21.51■■□□□ 1.03
RPS6KC1Q96S38 F2R-202ENST00000505600 442 ntTSL 2 BASIC21.51■■□□□ 1.03
RPS6KC1Q96S38 CXCL2-202ENST00000508487 1218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
RPS6KC1Q96S38 MOK-228ENST00000523231 1114 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
RPS6KC1Q96S38 C17orf62-238ENST00000585064 1074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.51■■□□□ 1.03
RPS6KC1Q96S38 PHOSPHO2-206ENST00000616481 1252 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.51■■□□□ 1.03
RPS6KC1Q96S38 PHOSPHO2-208ENST00000617738 1053 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.51■■□□□ 1.03
RPS6KC1Q96S38 AC004706.3-201ENST00000634558 1009 ntTSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
RPS6KC1Q96S38 KRT18-202ENST00000388837 1420 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
RPS6KC1Q96S38 CCDC91-207ENST00000539107 2440 ntTSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
RPS6KC1Q96S38 POLD2-201ENST00000223361 1597 ntTSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
RPS6KC1Q96S38 MCEMP1-201ENST00000333598 1730 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
RPS6KC1Q96S38 PTPN11-202ENST00000392597 1876 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
RPS6KC1Q96S38 RAI14-201ENST00000265109 5092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
RPS6KC1Q96S38 ARID1B-220ENST00000636930 8246 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.51■■□□□ 1.03
RPS6KC1Q96S38 HTR7P1-201ENST00000538670 1336 ntBASIC21.51■■□□□ 1.03
RPS6KC1Q96S38 ETV7-206ENST00000615781 1776 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
RPS6KC1Q96S38 ZBTB7A-201ENST00000322357 5422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
RPS6KC1Q96S38 FLCN-203ENST00000389169 1692 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
RPS6KC1Q96S38 SEMA6B-202ENST00000586965 2034 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
RPS6KC1Q96S38 PARP2-202ENST00000429687 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
RPS6KC1Q96S38 MYL5-206ENST00000506838 2956 ntTSL 2 BASIC21.5■■□□□ 1.03
RPS6KC1Q96S38 CBLC-201ENST00000270279 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
RPS6KC1Q96S38 ANKRD2-202ENST00000307518 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
RPS6KC1Q96S38 DLEU2-203ENST00000425586 1267 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
RPS6KC1Q96S38 BX088651.1-201ENST00000540551 451 ntBASIC21.5■■□□□ 1.03
RPS6KC1Q96S38 AC015712.2-203ENST00000560461 688 ntTSL 3 BASIC21.5■■□□□ 1.03
RPS6KC1Q96S38 AC113410.3-201ENST00000623366 203 ntBASIC21.5■■□□□ 1.03
RPS6KC1Q96S38 PCDHB12-202ENST00000622978 2093 ntTSL 2 BASIC21.5■■□□□ 1.03
RPS6KC1Q96S38 ILKAP-201ENST00000254654 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
RPS6KC1Q96S38 BACE1-203ENST00000428381 1333 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
RPS6KC1Q96S38 NARS2-201ENST00000281038 2519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
RPS6KC1Q96S38 DMAP1-202ENST00000361745 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
RPS6KC1Q96S38 NTMT1-210ENST00000613644 1501 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.5■■□□□ 1.03
RPS6KC1Q96S38 GRB14-201ENST00000263915 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
RPS6KC1Q96S38 CXCL16-201ENST00000293778 2222 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
RPS6KC1Q96S38 ROPN1-209ENST00000495093 1376 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
RPS6KC1Q96S38 SHB-201ENST00000377707 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
RPS6KC1Q96S38 HPS6-201ENST00000299238 2649 ntAPPRIS P1 BASIC21.49■■□□□ 1.03
RPS6KC1Q96S38 WT1-212ENST00000640146 1554 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
RPS6KC1Q96S38 RASGRP1-201ENST00000310803 5023 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
RPS6KC1Q96S38 RASGRP1-204ENST00000539159 5021 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
RPS6KC1Q96S38 NEURL4-203ENST00000570460 4890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
RPS6KC1Q96S38 FAM53A-202ENST00000461064 2159 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.49■■□□□ 1.03
RPS6KC1Q96S38 ATP5D-201ENST00000215375 997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
RPS6KC1Q96S38 CMTM8-201ENST00000307526 1174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
RPS6KC1Q96S38 TCTEX1D2-201ENST00000325318 673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
RPS6KC1Q96S38 BSX-201ENST00000343035 830 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
RPS6KC1Q96S38 AKR1A1-201ENST00000351829 1166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
RPS6KC1Q96S38 USF2-203ENST00000379134 648 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
RPS6KC1Q96S38 POMC-202ENST00000380794 1295 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.49■■□□□ 1.03
RPS6KC1Q96S38 AL353807.1-201ENST00000427475 662 ntBASIC21.49■■□□□ 1.03
RPS6KC1Q96S38 SNX5-213ENST00000486039 602 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
RPS6KC1Q96S38 DHDH-203ENST00000522614 776 ntTSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
RPS6KC1Q96S38 RPS20-210ENST00000523936 899 ntTSL 2 BASIC21.49■■□□□ 1.03
RPS6KC1Q96S38 C17orf62-230ENST00000583617 866 ntTSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
RPS6KC1Q96S38 MIR4785-201ENST00000585005 73 ntBASIC21.49■■□□□ 1.03
RPS6KC1Q96S38 PRKACA-209ENST00000590853 1101 ntTSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
RPS6KC1Q96S38 TP53RK-201ENST00000372102 2012 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
RPS6KC1Q96S38 TTLL7-214ENST00000610996 2028 ntTSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
RPS6KC1Q96S38 INPP4A-201ENST00000074304 6752 ntTSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
RPS6KC1Q96S38 DDRGK1-201ENST00000354488 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
RPS6KC1Q96S38 MAP3K14-AS1-203ENST00000585780 2475 ntTSL 2 BASIC21.49■■□□□ 1.03
RPS6KC1Q96S38 LACTB-202ENST00000413507 2978 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
RPS6KC1Q96S38 ISYNA1-201ENST00000338128 2420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
RPS6KC1Q96S38 CD8B-203ENST00000390655 1417 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
RPS6KC1Q96S38 ESR2-212ENST00000556275 2695 ntTSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
RPS6KC1Q96S38 PDLIM2-221ENST00000622702 1490 ntTSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
RPS6KC1Q96S38 LZTS3-201ENST00000329152 5257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
RPS6KC1Q96S38 NFKBIE-204ENST00000619360 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
RPS6KC1Q96S38 PTPRCAP-201ENST00000326294 1292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
RPS6KC1Q96S38 VMO1-201ENST00000328739 766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
RPS6KC1Q96S38 TMSB4X-201ENST00000380633 495 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.48■■□□□ 1.03
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.2 ms