Protein–RNA interactions for Protein: Q96RF0

SNX18, Sorting nexin-18, humanhuman

Predictions only

Length 628 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SNX18Q96RF0 ZNF419-201ENST00000221735 2309 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
SNX18Q96RF0 SUN1-220ENST00000457378 1309 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
SNX18Q96RF0 ZNF419-204ENST00000415379 2186 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
SNX18Q96RF0 AL032819.2-201ENST00000624543 2162 ntBASIC17.82■□□□□ 0.44
SNX18Q96RF0 MOB2-201ENST00000329957 1207 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
SNX18Q96RF0 DNAJC1-202ENST00000376980 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
SNX18Q96RF0 AC007322.1-201ENST00000426983 750 ntBASIC17.82■□□□□ 0.44
SNX18Q96RF0 CYP2T1P-201ENST00000432607 1285 ntBASIC17.82■□□□□ 0.44
SNX18Q96RF0 HMX1-202ENST00000506970 651 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
SNX18Q96RF0 AC080023.1-201ENST00000526906 803 ntTSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
SNX18Q96RF0 NDUFS3-207ENST00000529276 558 ntTSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
SNX18Q96RF0 AC008694.1-202ENST00000636953 945 ntBASIC17.82■□□□□ 0.44
SNX18Q96RF0 UBXN2B-206ENST00000638450 591 ntTSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
SNX18Q96RF0 TMEM250-201ENST00000418388 2823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
SNX18Q96RF0 GABRD-201ENST00000378585 1961 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
SNX18Q96RF0 OGG1-217ENST00000449570 1948 ntTSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
SNX18Q96RF0 BMP1-202ENST00000306385 4229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
SNX18Q96RF0 DMAP1-202ENST00000361745 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
SNX18Q96RF0 OSR2-210ENST00000523368 1519 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
SNX18Q96RF0 RGMA-208ENST00000556658 1889 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
SNX18Q96RF0 DOK4-218ENST00000569548 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
SNX18Q96RF0 INAVA-202ENST00000413687 2197 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
SNX18Q96RF0 ZFP92-201ENST00000338647 6105 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
SNX18Q96RF0 KRT8P20-201ENST00000423953 1409 ntBASIC17.81■□□□□ 0.44
SNX18Q96RF0 KRT16P6-202ENST00000425692 1426 ntBASIC17.81■□□□□ 0.44
SNX18Q96RF0 STX18-201ENST00000306200 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
SNX18Q96RF0 TMSB4X-203ENST00000380636 1702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
SNX18Q96RF0 TINCR-201ENST00000448587 3733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
SNX18Q96RF0 CPNE7-201ENST00000268720 2657 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
SNX18Q96RF0 NLRP6-201ENST00000312165 2679 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
SNX18Q96RF0 UPF1-201ENST00000262803 5348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
SNX18Q96RF0 CCDC63-201ENST00000308208 1993 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
SNX18Q96RF0 PCDHB11-202ENST00000624887 1973 ntTSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
SNX18Q96RF0 STAG3L3-201ENST00000423834 1262 ntTSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
SNX18Q96RF0 PDXDC2P-202ENST00000527016 543 ntTSL 3 BASIC17.81■□□□□ 0.44
SNX18Q96RF0 RPS15-206ENST00000589656 473 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
SNX18Q96RF0 OR10C1-204ENST00000622521 1039 ntBASIC17.81■□□□□ 0.44
SNX18Q96RF0 TRAPPC2L-201ENST00000301021 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
SNX18Q96RF0 EPB41L3-207ENST00000545076 3190 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
SNX18Q96RF0 NUTM2F-202ENST00000341207 2516 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
SNX18Q96RF0 NUTM2G-202ENST00000372322 2516 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
SNX18Q96RF0 FAM216A-201ENST00000377673 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
SNX18Q96RF0 MOK-225ENST00000522867 1883 ntTSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
SNX18Q96RF0 AC125437.2-201ENST00000625180 2167 ntBASIC17.81■□□□□ 0.44
SNX18Q96RF0 KCNC4-204ENST00000438661 2953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
SNX18Q96RF0 RNF135-205ENST00000535306 2098 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
SNX18Q96RF0 RAB34-204ENST00000395245 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
SNX18Q96RF0 BST1-201ENST00000265016 1480 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
SNX18Q96RF0 TSEN15-203ENST00000423085 1743 ntTSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
SNX18Q96RF0 VMAC-201ENST00000339485 2254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
SNX18Q96RF0 TMEM129-202ENST00000382936 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
SNX18Q96RF0 DYNLT3-201ENST00000378578 2217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
SNX18Q96RF0 WNT7B-204ENST00000410089 2202 ntTSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
SNX18Q96RF0 ARHGAP27-201ENST00000290470 1376 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
SNX18Q96RF0 KRT16P3-203ENST00000580621 1939 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
SNX18Q96RF0 SHANK3-203ENST00000445220 5175 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
SNX18Q96RF0 IGFALS-201ENST00000215539 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
SNX18Q96RF0 BANP-223ENST00000538234 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
SNX18Q96RF0 KLF13-201ENST00000307145 6825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
SNX18Q96RF0 TMEM218-213ENST00000531909 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
SNX18Q96RF0 CAPZB-202ENST00000264203 2068 ntTSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
SNX18Q96RF0 CLIP3-206ENST00000593074 2080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
SNX18Q96RF0 DNTTIP1-201ENST00000372622 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
SNX18Q96RF0 APTR-203ENST00000430801 583 ntTSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
SNX18Q96RF0 JOSD2-205ENST00000601423 802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
SNX18Q96RF0 AC005181.1-201ENST00000604782 1256 ntBASIC17.8■□□□□ 0.44
SNX18Q96RF0 AL161421.1-201ENST00000619666 1101 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
SNX18Q96RF0 RHBDD3-201ENST00000216085 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
SNX18Q96RF0 WFIKKN1-201ENST00000319070 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
SNX18Q96RF0 OGG1-203ENST00000302036 2220 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
SNX18Q96RF0 AKR7A3-201ENST00000361640 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
SNX18Q96RF0 RBM26-202ENST00000438724 5152 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
SNX18Q96RF0 DSCAM-201ENST00000400454 8552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
SNX18Q96RF0 HAPLN4-201ENST00000291481 3449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
SNX18Q96RF0 TRMU-201ENST00000290846 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
SNX18Q96RF0 KLHL31-202ENST00000407079 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
SNX18Q96RF0 SMYD2-201ENST00000366957 1671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
SNX18Q96RF0 MORF4L1-201ENST00000331268 2359 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
SNX18Q96RF0 SNAP47-202ENST00000366759 2362 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
SNX18Q96RF0 GLIS1-201ENST00000312233 2812 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
SNX18Q96RF0 GLIS1-202ENST00000628545 2807 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
SNX18Q96RF0 ADORA2A-201ENST00000337539 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
SNX18Q96RF0 RAI14-201ENST00000265109 5092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
SNX18Q96RF0 DVL3-203ENST00000431765 2294 ntTSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
SNX18Q96RF0 PSMD8-201ENST00000215071 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
SNX18Q96RF0 KRT1-201ENST00000252244 2451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
SNX18Q96RF0 C2orf54-201ENST00000307486 2017 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
SNX18Q96RF0 SYN2-206ENST00000621198 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
SNX18Q96RF0 ADK-206ENST00000541550 2222 ntTSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
SNX18Q96RF0 CBX1-202ENST00000393408 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
SNX18Q96RF0 C19orf25-202ENST00000436106 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
SNX18Q96RF0 FBXL3-201ENST00000355619 3503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
SNX18Q96RF0 MARCH8-201ENST00000319836 5272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
SNX18Q96RF0 CPQ-201ENST00000220763 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
SNX18Q96RF0 MGST3-205ENST00000367889 1015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
SNX18Q96RF0 AL512625.2-201ENST00000417533 625 ntBASIC17.79■□□□□ 0.44
SNX18Q96RF0 CD99P1-203ENST00000431582 602 ntTSL 4 BASIC17.79■□□□□ 0.44
SNX18Q96RF0 AC027307.1-201ENST00000590252 457 ntTSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
SNX18Q96RF0 PARD6A-203ENST00000602551 1171 ntTSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
SNX18Q96RF0 BRWD1-AS2-201ENST00000603064 1028 ntBASIC17.79■□□□□ 0.44
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.6 ms