Protein–RNA interactions for Protein: Q96QD8

SLC38A2, Sodium-coupled neutral amino acid transporter 2, humanhuman

Predictions only

Length 506 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLC38A2Q96QD8 METTL15-202ENST00000403099 795 ntTSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
SLC38A2Q96QD8 AC105036.2-201ENST00000569468 176 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
SLC38A2Q96QD8 LITAF-205ENST00000570904 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
SLC38A2Q96QD8 GDF6-203ENST00000621429 1179 ntTSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
SLC38A2Q96QD8 OR10C1-204ENST00000622521 1039 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
SLC38A2Q96QD8 AC093762.2-201ENST00000641700 291 ntAPPRIS P1 BASIC18.03■□□□□ 0.48
SLC38A2Q96QD8 PRDM5-201ENST00000264808 5330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
SLC38A2Q96QD8 EHMT1-203ENST00000460843 5137 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
SLC38A2Q96QD8 SPAG9-202ENST00000357122 4761 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
SLC38A2Q96QD8 SLC22A17-211ENST00000637426 1563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
SLC38A2Q96QD8 EIF4G3-214ENST00000634879 5325 ntTSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
SLC38A2Q96QD8 KCNC3-203ENST00000477616 3176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
SLC38A2Q96QD8 MYC-201ENST00000259523 2042 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
SLC38A2Q96QD8 GRTP1-203ENST00000375431 1384 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
SLC38A2Q96QD8 GPC5-201ENST00000377067 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
SLC38A2Q96QD8 TUSC2-201ENST00000232496 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
SLC38A2Q96QD8 FAM110A-204ENST00000381941 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
SLC38A2Q96QD8 THOP1-201ENST00000307741 4804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
SLC38A2Q96QD8 ADAP2-201ENST00000330889 2934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
SLC38A2Q96QD8 EPB41L4B-201ENST00000374557 4006 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
SLC38A2Q96QD8 CDK17-203ENST00000543119 2442 ntTSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
SLC38A2Q96QD8 EIF2B4-201ENST00000347454 1792 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
SLC38A2Q96QD8 PAQR6-205ENST00000368270 1765 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
SLC38A2Q96QD8 FBXO24-202ENST00000427939 2087 ntTSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
SLC38A2Q96QD8 PSMD8-201ENST00000215071 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
SLC38A2Q96QD8 CDKN2C-201ENST00000262662 2904 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
SLC38A2Q96QD8 FBLN7-202ENST00000331203 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
SLC38A2Q96QD8 APLP2-204ENST00000345598 1862 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
SLC38A2Q96QD8 ASIP-201ENST00000374954 586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
SLC38A2Q96QD8 HAGH-201ENST00000397353 1257 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
SLC38A2Q96QD8 C2orf50-202ENST00000405022 980 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
SLC38A2Q96QD8 AC092171.1-201ENST00000455866 753 ntTSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
SLC38A2Q96QD8 SNAP23-210ENST00000564153 775 ntTSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
SLC38A2Q96QD8 AC027307.1-201ENST00000590252 457 ntTSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
SLC38A2Q96QD8 CIRBP-246ENST00000628979 1043 ntTSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
SLC38A2Q96QD8 TLNRD1-201ENST00000267984 4845 ntAPPRIS P1 BASIC18.02■□□□□ 0.48
SLC38A2Q96QD8 ZNF554-201ENST00000317243 2736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
SLC38A2Q96QD8 EGFL7-203ENST00000371699 2125 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.47
SLC38A2Q96QD8 ELMOD1-206ENST00000531234 1832 ntTSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.47
SLC38A2Q96QD8 SMYD2-201ENST00000366957 1671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
SLC38A2Q96QD8 SLC9A6-201ENST00000370695 4725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
SLC38A2Q96QD8 HOXC4-201ENST00000303406 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
SLC38A2Q96QD8 RWDD4-206ENST00000512740 1393 ntTSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.47
SLC38A2Q96QD8 FAR2P2-204ENST00000424873 2070 ntTSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.47
SLC38A2Q96QD8 NAT16-201ENST00000300303 2935 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.47
SLC38A2Q96QD8 MSANTD2-202ENST00000374979 2349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
SLC38A2Q96QD8 MREG-201ENST00000263268 1314 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
SLC38A2Q96QD8 INTS11-250ENST00000620829 1862 ntTSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
SLC38A2Q96QD8 KRT9-201ENST00000246662 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
SLC38A2Q96QD8 STMN4-202ENST00000350889 2288 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
SLC38A2Q96QD8 MARK2-211ENST00000513765 2671 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
SLC38A2Q96QD8 MADCAM1-201ENST00000215637 1572 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
SLC38A2Q96QD8 SNX24-211ENST00000513881 1563 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
SLC38A2Q96QD8 STK10-201ENST00000176763 6060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
SLC38A2Q96QD8 AC245041.2-204ENST00000610809 1962 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
SLC38A2Q96QD8 NFIB-208ENST00000397581 3318 ntTSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
SLC38A2Q96QD8 RAPSN-205ENST00000529341 1408 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
SLC38A2Q96QD8 METRN-204ENST00000568223 3325 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
SLC38A2Q96QD8 TP53BP2-201ENST00000343537 4651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
SLC38A2Q96QD8 P3H4-201ENST00000355468 2791 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
SLC38A2Q96QD8 IP6K1-204ENST00000468463 1815 ntTSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
SLC38A2Q96QD8 ADCY6-206ENST00000550422 5877 ntTSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
SLC38A2Q96QD8 OIP5-201ENST00000220514 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
SLC38A2Q96QD8 RNPS1-201ENST00000301730 1276 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
SLC38A2Q96QD8 TPSAB1-201ENST00000338844 1175 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
SLC38A2Q96QD8 SLC29A4P1-201ENST00000398760 971 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
SLC38A2Q96QD8 ZNF148-203ENST00000468369 1025 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
SLC38A2Q96QD8 CIRBP-211ENST00000586773 942 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
SLC38A2Q96QD8 AC007993.2-201ENST00000592842 521 ntTSL 4 BASIC18.01■□□□□ 0.47
SLC38A2Q96QD8 TMEM191B-201ENST00000612978 1220 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
SLC38A2Q96QD8 SENP6-202ENST00000370010 4644 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
SLC38A2Q96QD8 TYRO3-201ENST00000263798 8207 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
SLC38A2Q96QD8 ANKDD1B-204ENST00000601380 2569 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
SLC38A2Q96QD8 NOMO1-201ENST00000287667 4355 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
SLC38A2Q96QD8 ZNF582-207ENST00000619584 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
SLC38A2Q96QD8 SLC35B1-201ENST00000240333 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
SLC38A2Q96QD8 AC004408.2-201ENST00000623613 2777 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
SLC38A2Q96QD8 ITGB5-201ENST00000296181 4372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
SLC38A2Q96QD8 AUH-202ENST00000375731 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
SLC38A2Q96QD8 RBM14-RBM4-201ENST00000412278 1566 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
SLC38A2Q96QD8 FOXN3-209ENST00000555353 1595 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
SLC38A2Q96QD8 TMEM218-213ENST00000531909 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
SLC38A2Q96QD8 ZBTB33-202ENST00000557385 2346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
SLC38A2Q96QD8 REEP2-202ENST00000378339 2170 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
SLC38A2Q96QD8 STK25-205ENST00000405883 1904 ntTSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
SLC38A2Q96QD8 EML3-217ENST00000531557 2509 ntTSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
SLC38A2Q96QD8 HEBP2-204ENST00000607197 10014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
SLC38A2Q96QD8 KLHL2-201ENST00000226725 3134 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
SLC38A2Q96QD8 TMPO-201ENST00000261210 820 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
SLC38A2Q96QD8 MPV17L-202ENST00000396385 1037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
SLC38A2Q96QD8 TRIM35-203ENST00000521253 1215 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
SLC38A2Q96QD8 CAMTA1-216ENST00000557126 486 ntTSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
SLC38A2Q96QD8 ULK4P1-204ENST00000565949 721 ntTSL 4 BASIC18■□□□□ 0.47
SLC38A2Q96QD8 DGKI-202ENST00000424189 4163 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
SLC38A2Q96QD8 RDH13-203ENST00000415061 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
SLC38A2Q96QD8 SNX27-203ENST00000368843 7197 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
SLC38A2Q96QD8 ANKRD65-204ENST00000520296 1632 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
SLC38A2Q96QD8 ADORA2A-201ENST00000337539 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
SLC38A2Q96QD8 CELF6-202ENST00000395258 1741 ntTSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
SLC38A2Q96QD8 ACD-214ENST00000620338 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.8 ms