Protein–RNA interactions for Protein: Q96MK3

FAM20A, Pseudokinase FAM20A, humanhuman

Predictions only

Length 541 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FAM20AQ96MK3 SGO1-AS1-202ENST00000448208 819 ntTSL 3 BASIC22.08■■□□□ 1.13
FAM20AQ96MK3 Z98884.1-201ENST00000451646 830 ntTSL 3 BASIC22.08■■□□□ 1.13
FAM20AQ96MK3 TSPY3-203ENST00000457222 1161 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
FAM20AQ96MK3 NDUFB2-203ENST00000461457 559 ntTSL 3 BASIC22.08■■□□□ 1.13
FAM20AQ96MK3 ANKRD13D-216ENST00000514166 2138 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
FAM20AQ96MK3 TMEM72-203ENST00000544540 1018 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
FAM20AQ96MK3 C1QL1P1-201ENST00000568105 661 ntBASIC22.08■■□□□ 1.13
FAM20AQ96MK3 USP36-216ENST00000589424 970 ntTSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
FAM20AQ96MK3 MRM1-204ENST00000614766 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
FAM20AQ96MK3 DPH1-201ENST00000263083 2221 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
FAM20AQ96MK3 EARS2-206ENST00000563232 1709 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
FAM20AQ96MK3 LINC02361-201ENST00000538731 1484 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.12
FAM20AQ96MK3 TMEM44-203ENST00000381975 2197 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
FAM20AQ96MK3 SGCE-207ENST00000447873 1597 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
FAM20AQ96MK3 LHX3-202ENST00000371748 2365 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
FAM20AQ96MK3 AUP1-201ENST00000377526 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
FAM20AQ96MK3 HTR7P1-201ENST00000538670 1336 ntBASIC22.07■■□□□ 1.12
FAM20AQ96MK3 KRT78-201ENST00000304620 1778 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
FAM20AQ96MK3 UPF1-207ENST00000599848 5311 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
FAM20AQ96MK3 PBX1-222ENST00000627490 1769 ntTSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
FAM20AQ96MK3 ZIM2-206ENST00000599935 2226 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
FAM20AQ96MK3 GSN-204ENST00000373818 2657 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
FAM20AQ96MK3 ST3GAL4-209ENST00000526727 1967 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
FAM20AQ96MK3 DCAKD-208ENST00000614054 2054 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
FAM20AQ96MK3 CELF6-202ENST00000395258 1741 ntTSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
FAM20AQ96MK3 RNF38-204ENST00000357058 5254 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
FAM20AQ96MK3 BSX-201ENST00000343035 830 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
FAM20AQ96MK3 PDCD2-202ENST00000392090 936 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
FAM20AQ96MK3 COQ10B-203ENST00000409398 879 ntTSL 3 BASIC22.07■■□□□ 1.12
FAM20AQ96MK3 SMIM19-201ENST00000414154 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
FAM20AQ96MK3 AC110769.1-201ENST00000420161 815 ntTSL 3 BASIC22.07■■□□□ 1.12
FAM20AQ96MK3 TNFRSF1B-204ENST00000536782 557 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
FAM20AQ96MK3 AC090877.2-202ENST00000560363 574 ntTSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
FAM20AQ96MK3 AC027682.2-201ENST00000563083 336 ntTSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
FAM20AQ96MK3 AC091551.1-201ENST00000590722 1228 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
FAM20AQ96MK3 SLC6A6-208ENST00000621751 1252 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
FAM20AQ96MK3 ADM-207ENST00000530439 1839 ntTSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
FAM20AQ96MK3 RAB5C-202ENST00000393860 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
FAM20AQ96MK3 ROPN1-209ENST00000495093 1376 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
FAM20AQ96MK3 CTDSP2-204ENST00000548823 1368 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
FAM20AQ96MK3 MED17-221ENST00000639724 2317 ntTSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
FAM20AQ96MK3 TTC12-202ENST00000393020 2541 ntTSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
FAM20AQ96MK3 NRXN2-203ENST00000377551 6373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
FAM20AQ96MK3 GABRD-201ENST00000378585 1961 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
FAM20AQ96MK3 FAM58A-204ENST00000576892 1306 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
FAM20AQ96MK3 GIPR-202ENST00000304207 1432 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
FAM20AQ96MK3 DPF1-217ENST00000614244 2356 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
FAM20AQ96MK3 NDOR1-204ENST00000458322 1829 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
FAM20AQ96MK3 CMTM8-201ENST00000307526 1174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
FAM20AQ96MK3 AL353807.1-201ENST00000427475 662 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
FAM20AQ96MK3 C16orf90-202ENST00000437192 907 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
FAM20AQ96MK3 HIGD1A-204ENST00000452906 585 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
FAM20AQ96MK3 UBE2K-204ENST00000503368 891 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
FAM20AQ96MK3 HGNC:18790-208ENST00000506380 798 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.06■■□□□ 1.12
FAM20AQ96MK3 MOK-228ENST00000523231 1114 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
FAM20AQ96MK3 CNOT8-224ENST00000523698 862 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
FAM20AQ96MK3 AL049780.2-201ENST00000556236 367 ntTSL 3 BASIC22.06■■□□□ 1.12
FAM20AQ96MK3 MRPL4-204ENST00000588502 827 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
FAM20AQ96MK3 FLT3LG-211ENST00000600429 984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
FAM20AQ96MK3 AL353708.3-201ENST00000610272 989 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
FAM20AQ96MK3 FMR1-201ENST00000218200 4333 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
FAM20AQ96MK3 DMKN-207ENST00000419602 1496 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
FAM20AQ96MK3 TEX22-201ENST00000451127 2571 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
FAM20AQ96MK3 RPS6KA2-201ENST00000265678 5824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
FAM20AQ96MK3 LINC01011-201ENST00000445000 2811 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
FAM20AQ96MK3 GLB1-201ENST00000307363 2616 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
FAM20AQ96MK3 SYT5-202ENST00000537500 2612 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
FAM20AQ96MK3 EBF1-202ENST00000380654 2345 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
FAM20AQ96MK3 TMED4-201ENST00000289577 2203 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
FAM20AQ96MK3 RTN4RL2-201ENST00000335099 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
FAM20AQ96MK3 CBR1-205ENST00000530908 1924 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
FAM20AQ96MK3 KLHL21-206ENST00000610898 1945 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
FAM20AQ96MK3 PYCR1-204ENST00000403172 1811 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
FAM20AQ96MK3 DBNL-210ENST00000448521 1808 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
FAM20AQ96MK3 ITPKC-201ENST00000263370 3385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
FAM20AQ96MK3 CNNM4-201ENST00000377075 4800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
FAM20AQ96MK3 HDAC2-201ENST00000368632 2084 ntTSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
FAM20AQ96MK3 SLC1A6-202ENST00000430939 1794 ntTSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
FAM20AQ96MK3 OLFM1-204ENST00000371793 2444 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.05■■□□□ 1.12
FAM20AQ96MK3 FAM3A-203ENST00000369641 1359 ntTSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
FAM20AQ96MK3 PTPRCAP-201ENST00000326294 1292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
FAM20AQ96MK3 LYPD1-201ENST00000345008 1033 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
FAM20AQ96MK3 S100A14-203ENST00000368701 1080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
FAM20AQ96MK3 AP000697.1-201ENST00000430607 339 ntTSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
FAM20AQ96MK3 LINC00636-201ENST00000494231 1264 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
FAM20AQ96MK3 AC008550.1-201ENST00000511500 884 ntBASIC22.05■■□□□ 1.12
FAM20AQ96MK3 AC019257.1-201ENST00000517676 557 ntTSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
FAM20AQ96MK3 AC015712.2-203ENST00000560461 688 ntTSL 3 BASIC22.05■■□□□ 1.12
FAM20AQ96MK3 AC010336.4-201ENST00000595655 438 ntTSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
FAM20AQ96MK3 ZNF692-202ENST00000366471 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
FAM20AQ96MK3 WBP2-213ENST00000590221 1745 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC22.05■■□□□ 1.12
FAM20AQ96MK3 PCDHAC2-203ENST00000615316 3011 ntBASIC22.05■■□□□ 1.12
FAM20AQ96MK3 ST3GAL3-219ENST00000372374 2170 ntTSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
FAM20AQ96MK3 KCNC2-204ENST00000540018 2168 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
FAM20AQ96MK3 MRPS2-201ENST00000241600 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
FAM20AQ96MK3 KCNN2-207ENST00000610748 2091 ntTSL 3 BASIC22.05■■□□□ 1.12
FAM20AQ96MK3 DBN1-210ENST00000512501 1878 ntTSL 3 BASIC22.05■■□□□ 1.12
FAM20AQ96MK3 EPHX1-201ENST00000272167 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
FAM20AQ96MK3 MOK-201ENST00000361847 1940 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
FAM20AQ96MK3 KRTAP5-AS1-201ENST00000424148 2265 ntTSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 48.2 ms