Protein–RNA interactions for Protein: Q96MD7

C9orf85, Uncharacterized protein C9orf85, humanhuman

Predictions only

Length 179 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C9orf85Q96MD7 RPH3AL-203ENST00000536489 1235 ntTSL 2 BASIC14.22□□□□□ -0.13
C9orf85Q96MD7 BEAN1-AS1-201ENST00000564618 533 ntTSL 4 BASIC14.22□□□□□ -0.13
C9orf85Q96MD7 PCDHA4-201ENST00000378125 2328 ntTSL 5 BASIC14.22□□□□□ -0.13
C9orf85Q96MD7 EPN2-212ENST00000575595 1491 ntTSL 2 BASIC14.22□□□□□ -0.13
C9orf85Q96MD7 NHLH2-201ENST00000320238 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
C9orf85Q96MD7 EIF2B1-201ENST00000424014 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
C9orf85Q96MD7 MTX1-201ENST00000316721 1441 ntTSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
C9orf85Q96MD7 DBNL-210ENST00000448521 1808 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
C9orf85Q96MD7 MIXL1-201ENST00000366810 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
C9orf85Q96MD7 STX17-212ENST00000534052 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
C9orf85Q96MD7 SLC27A3-214ENST00000624995 2413 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
C9orf85Q96MD7 NECTIN1-201ENST00000264025 5840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
C9orf85Q96MD7 IDUA-201ENST00000247933 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
C9orf85Q96MD7 UBE2Q2-204ENST00000561851 1582 ntTSL 2 BASIC14.22□□□□□ -0.13
C9orf85Q96MD7 ALDOA-212ENST00000564546 2104 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.13
C9orf85Q96MD7 KRT87P-201ENST00000529785 1700 ntTSL 2 BASIC14.21□□□□□ -0.13
C9orf85Q96MD7 FOXN3-214ENST00000557258 2692 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.13
C9orf85Q96MD7 SLC27A1-204ENST00000598424 2681 ntTSL 2 BASIC14.21□□□□□ -0.13
C9orf85Q96MD7 BSCL2-207ENST00000407022 1516 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.13
C9orf85Q96MD7 KCNA2-206ENST00000638477 1524 ntTSL 5 BASIC14.21□□□□□ -0.13
C9orf85Q96MD7 TMEM235-201ENST00000374946 2409 ntTSL 5 BASIC14.21□□□□□ -0.13
C9orf85Q96MD7 FAM72A-203ENST00000367129 676 ntTSL 3 BASIC14.21□□□□□ -0.13
C9orf85Q96MD7 FAM72A-205ENST00000468509 629 ntTSL 5 BASIC14.21□□□□□ -0.13
C9orf85Q96MD7 MCRIP1-203ENST00000538396 925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.13
C9orf85Q96MD7 IL34-204ENST00000566361 1001 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.13
C9orf85Q96MD7 AC133552.2-202ENST00000575694 574 ntBASIC14.21□□□□□ -0.13
C9orf85Q96MD7 POU5F1-209ENST00000638788 369 ntTSL 5 BASIC14.21□□□□□ -0.13
C9orf85Q96MD7 FNDC5-207ENST00000640867 639 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC14.21□□□□□ -0.13
C9orf85Q96MD7 ENTPD6-201ENST00000354989 2708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.13
C9orf85Q96MD7 FAM66E-201ENST00000529252 1433 ntTSL 2 BASIC14.21□□□□□ -0.13
C9orf85Q96MD7 FAM66B-201ENST00000529456 1432 ntTSL 2 BASIC14.21□□□□□ -0.13
C9orf85Q96MD7 YBX3-201ENST00000228251 1796 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.13
C9orf85Q96MD7 WIPF1-205ENST00000409415 1772 ntTSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.13
C9orf85Q96MD7 KIF22-201ENST00000160827 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.13
C9orf85Q96MD7 PITX2-203ENST00000355080 2100 ntTSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.13
C9orf85Q96MD7 STMN4-202ENST00000350889 2288 ntTSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.14
C9orf85Q96MD7 CLDN5-204ENST00000618236 1374 ntAPPRIS P1 BASIC14.21□□□□□ -0.14
C9orf85Q96MD7 LRCH4-201ENST00000310300 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.14
C9orf85Q96MD7 KLHDC4-201ENST00000270583 1886 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.14
C9orf85Q96MD7 TOR2A-203ENST00000373284 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
C9orf85Q96MD7 MELTF-202ENST00000296351 1650 ntTSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
C9orf85Q96MD7 MEN1-208ENST00000394374 3155 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.2□□□□□ -0.14
C9orf85Q96MD7 NR1H2-201ENST00000253727 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
C9orf85Q96MD7 BZW1-209ENST00000452790 1473 ntTSL 2 BASIC14.2□□□□□ -0.14
C9orf85Q96MD7 CHAC1-205ENST00000617961 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
C9orf85Q96MD7 PDLIM2-221ENST00000622702 1490 ntTSL 5 BASIC14.2□□□□□ -0.14
C9orf85Q96MD7 LIN54-209ENST00000510557 2257 ntTSL 2 BASIC14.2□□□□□ -0.14
C9orf85Q96MD7 KSR1-205ENST00000509603 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.2□□□□□ -0.14
C9orf85Q96MD7 RNF5-203ENST00000375094 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
C9orf85Q96MD7 ELOVL2-AS1-201ENST00000456190 737 ntTSL 3 BASIC14.2□□□□□ -0.14
C9orf85Q96MD7 AC007161.3-201ENST00000469183 637 ntTSL 5 BASIC14.2□□□□□ -0.14
C9orf85Q96MD7 AL162430.1-201ENST00000480705 870 ntBASIC14.2□□□□□ -0.14
C9orf85Q96MD7 LIMD2-202ENST00000578061 756 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.2□□□□□ -0.14
C9orf85Q96MD7 AL032819.3-201ENST00000640283 925 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.2□□□□□ -0.14
C9orf85Q96MD7 NDUFA10-203ENST00000404554 1557 ntTSL 5 BASIC14.2□□□□□ -0.14
C9orf85Q96MD7 SKP2-208ENST00000546211 1589 ntTSL 5 BASIC14.2□□□□□ -0.14
C9orf85Q96MD7 GCGR-202ENST00000570996 1872 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.2□□□□□ -0.14
C9orf85Q96MD7 CMTM7-201ENST00000334983 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
C9orf85Q96MD7 ORAI2-204ENST00000473939 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
C9orf85Q96MD7 PRRC2A-201ENST00000376007 6861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
C9orf85Q96MD7 BTD-202ENST00000383778 2261 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.2□□□□□ -0.14
C9orf85Q96MD7 NOP14-202ENST00000398071 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
C9orf85Q96MD7 TMEM198-202ENST00000373883 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
C9orf85Q96MD7 TBX6-201ENST00000279386 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
C9orf85Q96MD7 RAB11B-201ENST00000328024 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
C9orf85Q96MD7 TBX6-205ENST00000627355 1796 ntTSL 5 BASIC14.19□□□□□ -0.14
C9orf85Q96MD7 MORF4L1-215ENST00000559345 1468 ntTSL 2 BASIC14.19□□□□□ -0.14
C9orf85Q96MD7 CD58-203ENST00000457047 1328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
C9orf85Q96MD7 GIT1-201ENST00000225394 3768 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
C9orf85Q96MD7 TULP1-201ENST00000229771 2162 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
C9orf85Q96MD7 STRBP-201ENST00000348403 3337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
C9orf85Q96MD7 KCNC3-203ENST00000477616 3176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
C9orf85Q96MD7 SYTL1-210ENST00000616558 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
C9orf85Q96MD7 MEN1-209ENST00000394376 3034 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.19□□□□□ -0.14
C9orf85Q96MD7 PGPEP1L-201ENST00000378919 995 ntTSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
C9orf85Q96MD7 C20orf196-202ENST00000378979 585 ntTSL 2 BASIC14.19□□□□□ -0.14
C9orf85Q96MD7 CALM3-202ENST00000391918 702 ntTSL 2 BASIC14.19□□□□□ -0.14
C9orf85Q96MD7 AC073896.1-201ENST00000549318 937 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.19□□□□□ -0.14
C9orf85Q96MD7 ANKRD20A6P-201ENST00000618763 204 ntBASIC14.19□□□□□ -0.14
C9orf85Q96MD7 GCOM1-202ENST00000380569 1846 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC14.19□□□□□ -0.14
C9orf85Q96MD7 TMEM91-209ENST00000539627 1843 ntTSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
C9orf85Q96MD7 PCDHB14-202ENST00000624896 2367 ntTSL 2 BASIC14.19□□□□□ -0.14
C9orf85Q96MD7 AC013269.1-201ENST00000409259 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
C9orf85Q96MD7 TISP43-206ENST00000623376 1653 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
C9orf85Q96MD7 LAPTM4B-204ENST00000619747 2758 ntTSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
C9orf85Q96MD7 ALKBH6-213ENST00000486389 1525 ntTSL 3 BASIC14.19□□□□□ -0.14
C9orf85Q96MD7 NFIB-208ENST00000397581 3318 ntTSL 5 BASIC14.19□□□□□ -0.14
C9orf85Q96MD7 ADORA2A-215ENST00000618076 2630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
C9orf85Q96MD7 SLC7A10-201ENST00000253188 1946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
C9orf85Q96MD7 ARHGAP27-201ENST00000290470 1376 ntTSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
C9orf85Q96MD7 ZFP69-202ENST00000372706 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
C9orf85Q96MD7 TJP1-208ENST00000495972 2890 ntTSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
C9orf85Q96MD7 MMD2-201ENST00000401401 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
C9orf85Q96MD7 DLGAP4-206ENST00000475894 3110 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.19□□□□□ -0.14
C9orf85Q96MD7 PLPBP-201ENST00000328195 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
C9orf85Q96MD7 KLHL29-203ENST00000486442 5287 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.19□□□□□ -0.14
C9orf85Q96MD7 TRAM1L1-201ENST00000310754 2023 ntAPPRIS P1 BASIC14.19□□□□□ -0.14
C9orf85Q96MD7 P2RY6-212ENST00000618468 2431 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.19□□□□□ -0.14
C9orf85Q96MD7 PDLIM2-205ENST00000397761 1491 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.18□□□□□ -0.14
C9orf85Q96MD7 FAM160A2-201ENST00000265978 3481 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.5 ms