Protein–RNA interactions for Protein: Q96K76

USP47, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 47, humanhuman

Predictions only

Length 1,375 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
USP47Q96K76 ALDOA-221ENST00000566897 2448 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC27.56■■■□□ 2
USP47Q96K76 RNASEH2C-203ENST00000528220 1337 ntTSL 2 BASIC27.55■■■□□ 2
USP47Q96K76 AGTR1-209ENST00000497524 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
USP47Q96K76 SNAPC2-201ENST00000221573 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
USP47Q96K76 PMS1-222ENST00000639501 2506 ntTSL 5 BASIC27.55■■■□□ 2
USP47Q96K76 MDFI-202ENST00000373050 809 ntTSL 2 BASIC27.55■■■□□ 2
USP47Q96K76 ADAMTS19-AS1-201ENST00000502827 786 ntTSL 4 BASIC27.55■■■□□ 2
USP47Q96K76 Z99916.2-201ENST00000604037 246 ntBASIC27.55■■■□□ 2
USP47Q96K76 SLC52A2-209ENST00000530047 1757 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.55■■■□□ 2
USP47Q96K76 TREX1-205ENST00000625293 1783 ntBASIC27.55■■■□□ 2
USP47Q96K76 EPS8L1-203ENST00000540810 2360 ntTSL 2 BASIC27.55■■■□□ 2
USP47Q96K76 WFIKKN1-201ENST00000319070 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
USP47Q96K76 GFI1-202ENST00000370332 2855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
USP47Q96K76 VGF-201ENST00000249330 2575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
USP47Q96K76 RBFOX1-215ENST00000553186 2196 ntTSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
USP47Q96K76 LHX8-202ENST00000356261 1764 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
USP47Q96K76 PBX1-222ENST00000627490 1769 ntTSL 2 BASIC27.54■■■□□ 2
USP47Q96K76 PDLIM2-205ENST00000397761 1491 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.54■■■□□ 2
USP47Q96K76 CHAC1-205ENST00000617961 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
USP47Q96K76 EPOR-201ENST00000222139 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
USP47Q96K76 SSBP3-216ENST00000610401 3168 ntTSL 5 BASIC27.54■■■□□ 2
USP47Q96K76 VAV3-202ENST00000370056 4990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
USP47Q96K76 FDX2-207ENST00000494368 584 ntTSL 4 BASIC27.54■■■□□ 2
USP47Q96K76 TMEM9B-203ENST00000528117 949 ntTSL 2 BASIC27.54■■■□□ 2
USP47Q96K76 AC233702.5-201ENST00000584107 538 ntBASIC27.54■■■□□ 2
USP47Q96K76 FYN-204ENST00000368678 2573 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.54■■■□□ 2
USP47Q96K76 SLC11A2-208ENST00000546743 1740 ntTSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
USP47Q96K76 KRT8P8-201ENST00000434750 1448 ntBASIC27.54■■■□□ 2
USP47Q96K76 AC148477.3-202ENST00000376617 1766 ntTSL 2 BASIC27.54■■■□□ 2
USP47Q96K76 FMR1-204ENST00000370471 4125 ntTSL 5 BASIC27.53■■■□□ 2
USP47Q96K76 PDCD2-202ENST00000392090 936 ntTSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
USP47Q96K76 ANKRD54-204ENST00000411961 946 ntTSL 5 BASIC27.53■■■□□ 2
USP47Q96K76 C16orf90-202ENST00000437192 907 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.53■■■□□ 2
USP47Q96K76 LINC01786-202ENST00000453732 389 ntTSL 2 BASIC27.53■■■□□ 2
USP47Q96K76 SBF2-AS1-202ENST00000499953 854 ntTSL 5 BASIC27.53■■■□□ 2
USP47Q96K76 RNASEK-202ENST00000548577 810 ntTSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
USP47Q96K76 ADARB1-205ENST00000437626 5032 ntTSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
USP47Q96K76 THTPA-202ENST00000404535 1779 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.53■■■□□ 2
USP47Q96K76 TWF2-203ENST00000499914 1440 ntTSL 5 BASIC27.53■■■□□ 2
USP47Q96K76 CAMKV-205ENST00000467248 1688 ntTSL 2 BASIC27.53■■■□□ 2
USP47Q96K76 PIGQ-204ENST00000409527 1915 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.53■■■□□ 2
USP47Q96K76 EARS2-206ENST00000563232 1709 ntTSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
USP47Q96K76 RAP2A-201ENST00000245304 5487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
USP47Q96K76 C16orf72-201ENST00000327827 5953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
USP47Q96K76 ZBTB7B-201ENST00000292176 2129 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
USP47Q96K76 MRPS2-201ENST00000241600 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
USP47Q96K76 C1QBP-201ENST00000225698 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
USP47Q96K76 CXCL3-201ENST00000296026 1075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
USP47Q96K76 IMMP2L-201ENST00000331762 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
USP47Q96K76 RPS2P55-201ENST00000397318 883 ntBASIC27.52■■■□□ 2
USP47Q96K76 AC107956.1-201ENST00000494359 873 ntBASIC27.52■■■□□ 2
USP47Q96K76 TESC-AS1-201ENST00000547006 1053 ntTSL 2 BASIC27.52■■■□□ 2
USP47Q96K76 AL354712.1-201ENST00000563570 477 ntTSL 3 BASIC27.52■■■□□ 2
USP47Q96K76 AF186192.3-201ENST00000583427 947 ntBASIC27.52■■■□□ 2
USP47Q96K76 AL353708.3-201ENST00000610272 989 ntBASIC27.52■■■□□ 2
USP47Q96K76 SLC7A10-201ENST00000253188 1946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
USP47Q96K76 EPHX1-201ENST00000272167 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
USP47Q96K76 KXD1-203ENST00000540691 1592 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.52■■■□□ 2
USP47Q96K76 POC1A-202ENST00000394970 1999 ntTSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
USP47Q96K76 C20orf27-201ENST00000217195 1302 ntTSL 2 BASIC27.52■■■□□ 2
USP47Q96K76 MMP11-201ENST00000215743 2291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
USP47Q96K76 MAP2K2-202ENST00000394867 1471 ntTSL 5 BASIC27.52■■■□□ 2
USP47Q96K76 ASMTL-206ENST00000534940 2048 ntTSL 2 BASIC27.52■■■□□ 2
USP47Q96K76 RBPJL-203ENST00000372743 1623 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
USP47Q96K76 SLC1A6-202ENST00000430939 1794 ntTSL 2 BASIC27.52■■■□□ 2
USP47Q96K76 TRMU-201ENST00000290846 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.51■■■□□ 2
USP47Q96K76 CTDSP2-204ENST00000548823 1368 ntTSL 1 (best) BASIC27.51■■■□□ 2
USP47Q96K76 KLHL21-206ENST00000610898 1945 ntTSL 1 (best) BASIC27.51■■■□□ 2
USP47Q96K76 WDR74-201ENST00000278856 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
USP47Q96K76 RALGPS1-206ENST00000394011 819 ntTSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
USP47Q96K76 CCT7-202ENST00000398422 1234 ntTSL 2 BASIC27.51■■□□□ 1.99
USP47Q96K76 NIFKP9-201ENST00000419265 221 ntBASIC27.51■■□□□ 1.99
USP47Q96K76 AC020922.2-201ENST00000596786 359 ntTSL 4 BASIC27.51■■□□□ 1.99
USP47Q96K76 SETD7-202ENST00000404104 1590 ntTSL 2 BASIC27.51■■□□□ 1.99
USP47Q96K76 EFCAB11-202ENST00000538485 1870 ntTSL 2 BASIC27.51■■□□□ 1.99
USP47Q96K76 FENDRR-203ENST00000595886 3095 ntTSL 2 BASIC27.51■■□□□ 1.99
USP47Q96K76 HSDL1-202ENST00000434463 1493 ntTSL 2 BASIC27.51■■□□□ 1.99
USP47Q96K76 KRT16-201ENST00000301653 1644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
USP47Q96K76 NRXN1-226ENST00000626899 2543 ntTSL 2 BASIC27.51■■□□□ 1.99
USP47Q96K76 CARD9-201ENST00000371732 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
USP47Q96K76 UBE2F-205ENST00000414443 2100 ntTSL 2 BASIC27.51■■□□□ 1.99
USP47Q96K76 HPS6-201ENST00000299238 2649 ntAPPRIS P1 BASIC27.51■■□□□ 1.99
USP47Q96K76 MARK3-206ENST00000440884 2643 ntTSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
USP47Q96K76 PTPRM-201ENST00000332175 6095 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
USP47Q96K76 CTAG2-201ENST00000247306 993 ntTSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
USP47Q96K76 CALML5-201ENST00000380332 859 ntAPPRIS P1 BASIC27.5■■□□□ 1.99
USP47Q96K76 DYNLT3-203ENST00000432389 719 ntTSL 5 BASIC27.5■■□□□ 1.99
USP47Q96K76 DEUP1-206ENST00000530273 410 ntTSL 3 BASIC27.5■■□□□ 1.99
USP47Q96K76 MRPL4-204ENST00000588502 827 ntTSL 2 BASIC27.5■■□□□ 1.99
USP47Q96K76 MAGED2-203ENST00000375053 2066 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
USP47Q96K76 MOK-201ENST00000361847 1940 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
USP47Q96K76 SHB-201ENST00000377707 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
USP47Q96K76 L2HGDH-203ENST00000421284 1958 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.5■■□□□ 1.99
USP47Q96K76 PARP2-202ENST00000429687 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
USP47Q96K76 ZNF346-209ENST00000512315 1575 ntTSL 2 BASIC27.5■■□□□ 1.99
USP47Q96K76 HLA-G-201ENST00000360323 1427 ntAPPRIS P2 BASIC27.5■■□□□ 1.99
USP47Q96K76 HAS3-201ENST00000219322 1163 ntTSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
USP47Q96K76 CMTM8-201ENST00000307526 1174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
USP47Q96K76 AL590666.2-201ENST00000448869 758 ntTSL 2 BASIC27.49■■□□□ 1.99
USP47Q96K76 AC113410.3-201ENST00000623366 203 ntBASIC27.49■■□□□ 1.99
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.4 ms