Protein–RNA interactions for Protein: Q96EX1

SMIM12, Small integral membrane protein 12, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SMIM12Q96EX1 LINC01881-206ENST00000614114 957 ntTSL 2 BASIC14.94□□□□□ -0.02
SMIM12Q96EX1 KIAA1522-202ENST00000373480 5294 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
SMIM12Q96EX1 KIAA1522-203ENST00000373481 5293 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.94□□□□□ -0.02
SMIM12Q96EX1 CDK11A-205ENST00000378633 2458 ntTSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
SMIM12Q96EX1 SYBU-232ENST00000533171 2498 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.94□□□□□ -0.02
SMIM12Q96EX1 CDH6-205ENST00000514738 2569 ntTSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
SMIM12Q96EX1 DPYSL5-202ENST00000401478 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
SMIM12Q96EX1 SNX11-201ENST00000359238 2315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
SMIM12Q96EX1 PHKA1-201ENST00000339490 6121 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
SMIM12Q96EX1 SLCO4A1-201ENST00000217159 2776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
SMIM12Q96EX1 RTCA-203ENST00000370128 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
SMIM12Q96EX1 ALDH5A1-202ENST00000357578 5248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
SMIM12Q96EX1 CNTNAP3-204ENST00000377656 4986 ntTSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
SMIM12Q96EX1 TBP-202ENST00000392092 1903 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
SMIM12Q96EX1 UBE2Q2-204ENST00000561851 1582 ntTSL 2 BASIC14.94□□□□□ -0.02
SMIM12Q96EX1 FER1L4-210ENST00000615531 5998 ntBASIC14.94□□□□□ -0.02
SMIM12Q96EX1 SLC25A46-201ENST00000355943 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
SMIM12Q96EX1 LRRC42-203ENST00000371370 2037 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.93□□□□□ -0.02
SMIM12Q96EX1 CARMIL2-201ENST00000334583 4687 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
SMIM12Q96EX1 ACY1-207ENST00000476854 1319 ntTSL 3 BASIC14.93□□□□□ -0.02
SMIM12Q96EX1 UMOD-201ENST00000302509 2477 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
SMIM12Q96EX1 CTBP2-202ENST00000334808 2130 ntTSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
SMIM12Q96EX1 ASPHD2-201ENST00000215906 3357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
SMIM12Q96EX1 FAM213A-206ENST00000615554 2213 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
SMIM12Q96EX1 LAMP1-201ENST00000332556 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
SMIM12Q96EX1 FAM198A-202ENST00000430121 3121 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
SMIM12Q96EX1 SEMA6D-205ENST00000389425 2318 ntTSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
SMIM12Q96EX1 ADA-201ENST00000372874 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
SMIM12Q96EX1 REEP2-201ENST00000254901 2099 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
SMIM12Q96EX1 C11orf49-201ENST00000278460 1645 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
SMIM12Q96EX1 COX20-203ENST00000411948 2631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
SMIM12Q96EX1 SENP6-201ENST00000327284 2700 ntTSL 2 BASIC14.93□□□□□ -0.02
SMIM12Q96EX1 AK3-202ENST00000381809 2736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
SMIM12Q96EX1 C1QL1-201ENST00000253407 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
SMIM12Q96EX1 MFSD14C-201ENST00000375223 619 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
SMIM12Q96EX1 IGFBP3-202ENST00000381083 1050 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
SMIM12Q96EX1 IL15RA-209ENST00000397255 759 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
SMIM12Q96EX1 HDHD5-203ENST00000399852 1118 ntTSL 3 BASIC14.93□□□□□ -0.02
SMIM12Q96EX1 AC092675.2-201ENST00000413274 541 ntTSL 4 BASIC14.93□□□□□ -0.02
SMIM12Q96EX1 AC093817.1-201ENST00000507296 812 ntTSL 3 BASIC14.93□□□□□ -0.02
SMIM12Q96EX1 SFTPC-205ENST00000521315 1046 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
SMIM12Q96EX1 IL15RA-216ENST00000530685 660 ntTSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
SMIM12Q96EX1 AC243732.1-201ENST00000612648 864 ntBASIC14.93□□□□□ -0.02
SMIM12Q96EX1 ABHD1-207ENST00000621324 1078 ntTSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
SMIM12Q96EX1 YAP1-209ENST00000537274 5350 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
SMIM12Q96EX1 UXS1-203ENST00000409501 1839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
SMIM12Q96EX1 RAB5C-202ENST00000393860 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
SMIM12Q96EX1 TRMT2A-203ENST00000404751 2498 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.93□□□□□ -0.02
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SMIM12Q96EX1 LRCH3-207ENST00000441090 2034 ntTSL 2 BASIC14.93□□□□□ -0.02
SMIM12Q96EX1 PGPEP1L-202ENST00000535714 1483 ntTSL 2 BASIC14.93□□□□□ -0.02
SMIM12Q96EX1 BACE2-203ENST00000347667 8764 ntTSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
SMIM12Q96EX1 ZBTB7B-201ENST00000292176 2129 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
SMIM12Q96EX1 NTSR2-201ENST00000306928 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
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SMIM12Q96EX1 EIF3B-202ENST00000397011 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
SMIM12Q96EX1 PPM1G-201ENST00000344034 2311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
SMIM12Q96EX1 PRODH-215ENST00000610940 2405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
SMIM12Q96EX1 SMIM4-203ENST00000477703 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
SMIM12Q96EX1 PKDREJ-201ENST00000253255 7693 ntAPPRIS P1 BASIC14.93□□□□□ -0.02
SMIM12Q96EX1 C3orf58-201ENST00000315691 4346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
SMIM12Q96EX1 PCSK7-201ENST00000320934 4649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
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SMIM12Q96EX1 FAM90A1-201ENST00000307435 2342 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.92□□□□□ -0.02
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SMIM12Q96EX1 HIGD1A-204ENST00000452906 585 ntTSL 2 BASIC14.92□□□□□ -0.02
SMIM12Q96EX1 ZFYVE28-207ENST00000509171 1135 ntTSL 2 BASIC14.92□□□□□ -0.02
SMIM12Q96EX1 HRH3-203ENST00000611492 900 ntTSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
SMIM12Q96EX1 NOL4L-211ENST00000621426 6577 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.92□□□□□ -0.02
SMIM12Q96EX1 MAPK8IP1P2-201ENST00000580257 1472 ntBASIC14.92□□□□□ -0.02
SMIM12Q96EX1 CRAMP1-201ENST00000293925 7671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.92□□□□□ -0.02
SMIM12Q96EX1 KLF1-201ENST00000264834 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
SMIM12Q96EX1 JADE3-204ENST00000614628 4934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
SMIM12Q96EX1 CASKIN2-201ENST00000321617 5015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
SMIM12Q96EX1 KRT78-201ENST00000304620 1778 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
SMIM12Q96EX1 SSBP2-218ENST00000514493 1790 ntTSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
SMIM12Q96EX1 ZNF385A-212ENST00000551109 2369 ntTSL 5 BASIC14.92□□□□□ -0.02
SMIM12Q96EX1 AC011270.2-201ENST00000624293 2550 ntBASIC14.92□□□□□ -0.02
SMIM12Q96EX1 MEN1-201ENST00000312049 2761 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
SMIM12Q96EX1 SH3BP1-201ENST00000357436 2852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
SMIM12Q96EX1 ZNF598-204ENST00000563630 3371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
SMIM12Q96EX1 FARP1-242ENST00000627049 5103 ntTSL 5 BASIC14.92□□□□□ -0.02
SMIM12Q96EX1 AP1AR-202ENST00000309703 2337 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
SMIM12Q96EX1 LINC00461-203ENST00000504246 2300 ntTSL 2 BASIC14.92□□□□□ -0.02
SMIM12Q96EX1 CDC42SE2-206ENST00000503291 2025 ntTSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
SMIM12Q96EX1 CCND3-204ENST00000414200 1724 ntTSL 2 BASIC14.92□□□□□ -0.02
SMIM12Q96EX1 TMEM121-201ENST00000392519 1532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
SMIM12Q96EX1 GRK2-201ENST00000308595 3466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
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