Protein–RNA interactions for Protein: Q969E8

TSR2, Pre-rRNA-processing protein TSR2 homolog, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 191 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TSR2Q969E8 ASMTL-206ENST00000534940 2048 ntTSL 2 BASIC25.47■■□□□ 1.67
TSR2Q969E8 AC107959.1-202ENST00000502083 1945 ntTSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
TSR2Q969E8 LSR-214ENST00000621372 2274 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
TSR2Q969E8 FAM102B-201ENST00000370035 5600 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
TSR2Q969E8 LTBP3-201ENST00000301873 4443 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.47■■□□□ 1.67
TSR2Q969E8 BCS1L-201ENST00000359273 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
TSR2Q969E8 PAIP1-203ENST00000436644 1734 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
TSR2Q969E8 ODF3L2-202ENST00000382696 1393 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
TSR2Q969E8 FAM131C-201ENST00000375662 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
TSR2Q969E8 P2RY6-210ENST00000542092 1674 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.46■■□□□ 1.67
TSR2Q969E8 UTP4-201ENST00000314423 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
TSR2Q969E8 MRPL15-201ENST00000260102 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
TSR2Q969E8 MTFP1-202ENST00000355143 891 ntTSL 2 BASIC25.46■■□□□ 1.67
TSR2Q969E8 C6orf132-202ENST00000356542 894 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.46■■□□□ 1.67
TSR2Q969E8 LGALS7-201ENST00000378626 466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
TSR2Q969E8 AC091564.2-201ENST00000527191 399 ntTSL 3 BASIC25.46■■□□□ 1.67
TSR2Q969E8 ARF3-208ENST00000541959 807 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.46■■□□□ 1.67
TSR2Q969E8 RBM6-204ENST00000422955 2324 ntTSL 2 BASIC25.46■■□□□ 1.67
TSR2Q969E8 LETM1-201ENST00000302787 5462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
TSR2Q969E8 PCDHB11-202ENST00000624887 1973 ntTSL 2 BASIC25.45■■□□□ 1.67
TSR2Q969E8 PIGQ-204ENST00000409527 1915 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.45■■□□□ 1.67
TSR2Q969E8 SAAL1-202ENST00000524803 1582 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
TSR2Q969E8 NISCH-201ENST00000345716 5238 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
TSR2Q969E8 DBNL-210ENST00000448521 1808 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
TSR2Q969E8 RAC1-201ENST00000348035 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
TSR2Q969E8 ANKS6-201ENST00000353234 7164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
TSR2Q969E8 TNFRSF18-204ENST00000486728 727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
TSR2Q969E8 AC140479.4-201ENST00000561715 463 ntTSL 4 BASIC25.45■■□□□ 1.66
TSR2Q969E8 AC013268.1-201ENST00000639717 1208 ntTSL 5 BASIC25.45■■□□□ 1.66
TSR2Q969E8 REST-211ENST00000640168 1268 ntTSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
TSR2Q969E8 ART5-203ENST00000397068 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
TSR2Q969E8 TREX1-205ENST00000625293 1783 ntBASIC25.45■■□□□ 1.66
TSR2Q969E8 ARHGAP11A-205ENST00000563864 2279 ntTSL 5 BASIC25.45■■□□□ 1.66
TSR2Q969E8 RTKN-201ENST00000233330 2220 ntTSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
TSR2Q969E8 CPEB1-214ENST00000617522 2220 ntTSL 5 BASIC25.45■■□□□ 1.66
TSR2Q969E8 CYB561-204ENST00000448884 1496 ntTSL 2 BASIC25.45■■□□□ 1.66
TSR2Q969E8 AUP1-201ENST00000377526 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
TSR2Q969E8 PSMD6-201ENST00000295901 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
TSR2Q969E8 MEF2B-204ENST00000424583 1405 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.45■■□□□ 1.66
TSR2Q969E8 ACADVL-203ENST00000356839 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
TSR2Q969E8 TSNAXIP1-202ENST00000415766 2338 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.45■■□□□ 1.66
TSR2Q969E8 DCAKD-208ENST00000614054 2054 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.44■■□□□ 1.66
TSR2Q969E8 THOC6-209ENST00000575576 1360 ntTSL 5 BASIC25.44■■□□□ 1.66
TSR2Q969E8 WFIKKN1-201ENST00000319070 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
TSR2Q969E8 TGFBR1-202ENST00000374994 6516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
TSR2Q969E8 MGARP-201ENST00000398955 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
TSR2Q969E8 NBL1-209ENST00000548815 1953 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC25.44■■□□□ 1.66
TSR2Q969E8 SHOX2-203ENST00000441443 3038 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.44■■□□□ 1.66
TSR2Q969E8 STK24-AS1-201ENST00000434547 1278 ntTSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
TSR2Q969E8 KHDRBS1-204ENST00000492989 1215 ntTSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
TSR2Q969E8 KRT18P16-201ENST00000510337 1294 ntBASIC25.44■■□□□ 1.66
TSR2Q969E8 AC016065.1-203ENST00000523225 1017 ntTSL 3 BASIC25.44■■□□□ 1.66
TSR2Q969E8 CNOT8-224ENST00000523698 862 ntTSL 2 BASIC25.44■■□□□ 1.66
TSR2Q969E8 ARMC4P1-202ENST00000576034 643 ntTSL 2 BASIC25.44■■□□□ 1.66
TSR2Q969E8 AC011446.2-202ENST00000592882 756 ntTSL 3 BASIC25.44■■□□□ 1.66
TSR2Q969E8 MRGPRF-201ENST00000309099 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
TSR2Q969E8 GIPR-202ENST00000304207 1432 ntTSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
TSR2Q969E8 TMEM151B-202ENST00000451188 4895 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.44■■□□□ 1.66
TSR2Q969E8 EPOR-201ENST00000222139 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
TSR2Q969E8 FAM46B-201ENST00000289166 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
TSR2Q969E8 RBFOX1-215ENST00000553186 2196 ntTSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
TSR2Q969E8 AC148477.3-202ENST00000376617 1766 ntTSL 2 BASIC25.44■■□□□ 1.66
TSR2Q969E8 ACOT2-204ENST00000613168 1553 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
TSR2Q969E8 AC104581.1-201ENST00000324348 2852 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.43■■□□□ 1.66
TSR2Q969E8 PARP2-202ENST00000429687 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
TSR2Q969E8 FBXW7-202ENST00000281708 4976 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
TSR2Q969E8 AKR1A1-201ENST00000351829 1166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
TSR2Q969E8 GDAP1L1-202ENST00000372952 722 ntTSL 5 BASIC25.43■■□□□ 1.66
TSR2Q969E8 SFXN1-203ENST00000502393 637 ntTSL 2 BASIC25.43■■□□□ 1.66
TSR2Q969E8 TMEM72-203ENST00000544540 1018 ntTSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
TSR2Q969E8 ELAC1-203ENST00000588577 694 ntTSL 2 BASIC25.43■■□□□ 1.66
TSR2Q969E8 ZBTB7B-201ENST00000292176 2129 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
TSR2Q969E8 FAM3A-203ENST00000369641 1359 ntTSL 5 BASIC25.43■■□□□ 1.66
TSR2Q969E8 FEZF1-202ENST00000427185 1368 ntTSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
TSR2Q969E8 DEDD2-204ENST00000595337 1894 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC25.43■■□□□ 1.66
TSR2Q969E8 C2orf54-201ENST00000307486 2017 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
TSR2Q969E8 TRABD2A-201ENST00000335459 1844 ntTSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
TSR2Q969E8 POC1A-202ENST00000394970 1999 ntTSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
TSR2Q969E8 LINC02361-201ENST00000538731 1484 ntTSL 2 BASIC25.42■■□□□ 1.66
TSR2Q969E8 HOMER1-202ENST00000334082 5881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
TSR2Q969E8 KRT78-201ENST00000304620 1778 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
TSR2Q969E8 RPP25L-201ENST00000297613 1092 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.42■■□□□ 1.66
TSR2Q969E8 PTTG1-205ENST00000520452 895 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.42■■□□□ 1.66
TSR2Q969E8 SLC6A6-208ENST00000621751 1252 ntTSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
TSR2Q969E8 ROPN1-209ENST00000495093 1376 ntTSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
TSR2Q969E8 TSPAN15-201ENST00000373290 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
TSR2Q969E8 WAS-201ENST00000376701 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
TSR2Q969E8 TPCN2-208ENST00000637342 2856 ntTSL 5 BASIC25.42■■□□□ 1.66
TSR2Q969E8 KCNMA1-209ENST00000372443 5059 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.41■■□□□ 1.66
TSR2Q969E8 PTPRJ-208ENST00000615445 4773 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.41■■□□□ 1.66
TSR2Q969E8 BACE1-203ENST00000428381 1333 ntTSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
TSR2Q969E8 COMMD7-202ENST00000446419 1343 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC25.41■■□□□ 1.66
TSR2Q969E8 CENPH-206ENST00000515001 1305 ntTSL 2 BASIC25.41■■□□□ 1.66
TSR2Q969E8 SAE1-201ENST00000270225 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
TSR2Q969E8 ARHGEF4-202ENST00000355771 1872 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
TSR2Q969E8 KLC2-204ENST00000394067 2898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
TSR2Q969E8 WBP2-213ENST00000590221 1745 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC25.41■■□□□ 1.66
TSR2Q969E8 CARD9-201ENST00000371732 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
TSR2Q969E8 AC092718.1-201ENST00000501068 1088 ntTSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
TSR2Q969E8 UBE2K-204ENST00000503368 891 ntTSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.6 ms