Protein–RNA interactions for Protein: Q95604

HLA-C, HLA class I histocompatibility antigen, Cw-17 alpha chain, humanhuman

Predictions only

Length 372 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HLA-CQ95604 PKM-201ENST00000319622 2717 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC20.39■□□□□ 0.85
HLA-CQ95604 PFN1-201ENST00000225655 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
HLA-CQ95604 UPK3B-201ENST00000257632 1296 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC20.39■□□□□ 0.85
HLA-CQ95604 STRA8-201ENST00000275764 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
HLA-CQ95604 TSPAN14-202ENST00000341863 1037 ntTSL 5 BASIC20.39■□□□□ 0.85
HLA-CQ95604 AL645929.1-201ENST00000420084 975 ntBASIC20.39■□□□□ 0.85
HLA-CQ95604 SPDYE13P-201ENST00000445314 798 ntBASIC20.39■□□□□ 0.85
HLA-CQ95604 MVB12A-204ENST00000528515 686 ntTSL 5 BASIC20.39■□□□□ 0.85
HLA-CQ95604 NT5C-210ENST00000582160 860 ntTSL 2 BASIC20.39■□□□□ 0.85
HLA-CQ95604 TBX6-201ENST00000279386 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
HLA-CQ95604 TBX6-205ENST00000627355 1796 ntTSL 5 BASIC20.39■□□□□ 0.85
HLA-CQ95604 TMEM230-206ENST00000379283 1660 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.38■□□□□ 0.85
HLA-CQ95604 KXD1-203ENST00000540691 1592 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.38■□□□□ 0.85
HLA-CQ95604 HORMAD2-201ENST00000336726 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
HLA-CQ95604 ANKRD2-202ENST00000307518 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
HLA-CQ95604 RAP2A-201ENST00000245304 5487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
HLA-CQ95604 EFCC1-201ENST00000436022 2691 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.38■□□□□ 0.85
HLA-CQ95604 LINC01578-209ENST00000557682 2683 ntTSL 2 BASIC20.38■□□□□ 0.85
HLA-CQ95604 ZACN-201ENST00000334586 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
HLA-CQ95604 ATP5J-203ENST00000400090 647 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.38■□□□□ 0.85
HLA-CQ95604 ZFAND2B-207ENST00000409412 569 ntTSL 2 BASIC20.38■□□□□ 0.85
HLA-CQ95604 SPDYE15P-201ENST00000424157 909 ntBASIC20.38■□□□□ 0.85
HLA-CQ95604 DYDC2-206ENST00000444807 1173 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC20.38■□□□□ 0.85
HLA-CQ95604 NUS1P1-201ENST00000446295 882 ntBASIC20.38■□□□□ 0.85
HLA-CQ95604 AC137630.1-201ENST00000452042 782 ntTSL 4 BASIC20.38■□□□□ 0.85
HLA-CQ95604 AC007161.3-201ENST00000469183 637 ntTSL 5 BASIC20.38■□□□□ 0.85
HLA-CQ95604 CNTD2-203ENST00000513948 787 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.38■□□□□ 0.85
HLA-CQ95604 NAPSB-203ENST00000531692 561 ntTSL 2 BASIC20.38■□□□□ 0.85
HLA-CQ95604 AC243965.1-201ENST00000557595 781 ntTSL 3 BASIC20.38■□□□□ 0.85
HLA-CQ95604 CARHSP1-205ENST00000562843 843 ntTSL 2 BASIC20.38■□□□□ 0.85
HLA-CQ95604 TBCB-205ENST00000585746 875 ntTSL 3 BASIC20.38■□□□□ 0.85
HLA-CQ95604 IFNL4P1-201ENST00000607083 540 ntBASIC20.38■□□□□ 0.85
HLA-CQ95604 DEF8-228ENST00000610455 816 ntTSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
HLA-CQ95604 AC008567.3-202ENST00000619671 859 ntTSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
HLA-CQ95604 SMIM29-209ENST00000636500 1186 ntTSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
HLA-CQ95604 JUNB-201ENST00000302754 1820 ntAPPRIS P1 BASIC20.38■□□□□ 0.85
HLA-CQ95604 HTRA2-201ENST00000258080 2370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
HLA-CQ95604 ZSCAN18-217ENST00000601144 2190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
HLA-CQ95604 KRT16P6-202ENST00000425692 1426 ntBASIC20.37■□□□□ 0.85
HLA-CQ95604 TTYH1-202ENST00000376530 1885 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
HLA-CQ95604 ZDHHC20-201ENST00000320220 1351 ntTSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
HLA-CQ95604 MAGED2-213ENST00000627068 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
HLA-CQ95604 SNX3-201ENST00000230085 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
HLA-CQ95604 ERLEC1-203ENST00000405123 1756 ntTSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
HLA-CQ95604 CIRBP-201ENST00000320936 1328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
HLA-CQ95604 NTMT1-203ENST00000372483 1315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
HLA-CQ95604 CIRBP-207ENST00000586472 1303 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC20.37■□□□□ 0.85
HLA-CQ95604 SKOR2-203ENST00000620245 3048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
HLA-CQ95604 COPE-201ENST00000262812 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
HLA-CQ95604 FCN3-201ENST00000270879 1030 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
HLA-CQ95604 TMEM150B-201ENST00000326652 943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
HLA-CQ95604 FCN3-202ENST00000354982 997 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
HLA-CQ95604 FAM19A3-201ENST00000361886 1056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
HLA-CQ95604 HEBP2-201ENST00000367697 844 ntTSL 2 BASIC20.37■□□□□ 0.85
HLA-CQ95604 LINC01315-202ENST00000424852 1142 ntTSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
HLA-CQ95604 LINC01237-203ENST00000430555 843 ntTSL 4 BASIC20.37■□□□□ 0.85
HLA-CQ95604 AL591212.1-201ENST00000433646 615 ntTSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
HLA-CQ95604 BX276092.5-203ENST00000456199 560 ntBASIC20.37■□□□□ 0.85
HLA-CQ95604 EMBP1-201ENST00000458200 901 ntBASIC20.37■□□□□ 0.85
HLA-CQ95604 GRK4-204ENST00000503518 2136 ntTSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
HLA-CQ95604 SELENOH-204ENST00000534355 818 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
HLA-CQ95604 AC021739.3-201ENST00000557908 855 ntTSL 2 BASIC20.37■□□□□ 0.85
HLA-CQ95604 RNPS1-224ENST00000569598 918 ntTSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
HLA-CQ95604 AL121672.3-201ENST00000608644 468 ntBASIC20.37■□□□□ 0.85
HLA-CQ95604 AL031008.1-201ENST00000619963 541 ntBASIC20.37■□□□□ 0.85
HLA-CQ95604 DEAF1-201ENST00000382409 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
HLA-CQ95604 FAM118A-202ENST00000405673 1612 ntTSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
HLA-CQ95604 DDX42-201ENST00000359353 2783 ntTSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
HLA-CQ95604 PARD3-209ENST00000374790 5825 ntTSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
HLA-CQ95604 CRACR2B-207ENST00000528542 1792 ntTSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
HLA-CQ95604 ZSWIM7-201ENST00000399277 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
HLA-CQ95604 TACC3-213ENST00000617535 1693 ntTSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
HLA-CQ95604 FBXW7-202ENST00000281708 4976 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
HLA-CQ95604 NEK7-207ENST00000538004 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
HLA-CQ95604 AC079385.1-202ENST00000549203 569 ntTSL 4 BASIC20.36■□□□□ 0.85
HLA-CQ95604 AL160237.2-201ENST00000556165 472 ntBASIC20.36■□□□□ 0.85
HLA-CQ95604 MIR3180-1-201ENST00000580374 94 ntBASIC20.36■□□□□ 0.85
HLA-CQ95604 LINC00092-202ENST00000580908 580 ntTSL 2 BASIC20.36■□□□□ 0.85
HLA-CQ95604 MIR3180-3-201ENST00000584616 94 ntBASIC20.36■□□□□ 0.85
HLA-CQ95604 IGFLR1-209ENST00000592537 1195 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
HLA-CQ95604 DHRS4L2-211ENST00000621761 1049 ntTSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
HLA-CQ95604 USF2-202ENST00000343550 1523 ntTSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
HLA-CQ95604 C16orf58-209ENST00000567994 1845 ntTSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
HLA-CQ95604 CBLN2-209ENST00000585159 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
HLA-CQ95604 CCDC9-201ENST00000221922 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
HLA-CQ95604 FAM3A-202ENST00000359889 1712 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.36■□□□□ 0.85
HLA-CQ95604 NSUN5-204ENST00000438747 1663 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
HLA-CQ95604 PRELID3A-203ENST00000587735 1694 ntTSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
HLA-CQ95604 TRIM4-202ENST00000354241 1942 ntTSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
HLA-CQ95604 TEX13A-201ENST00000600991 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
HLA-CQ95604 KCNH1-214ENST00000640566 1365 ntTSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
HLA-CQ95604 SLC25A46-202ENST00000447245 1575 ntTSL 2 BASIC20.35■□□□□ 0.85
HLA-CQ95604 HBZP1-201ENST00000354915 429 ntBASIC20.35■□□□□ 0.85
HLA-CQ95604 AC104692.2-201ENST00000603054 253 ntBASIC20.35■□□□□ 0.85
HLA-CQ95604 AC064834.1-201ENST00000606986 503 ntTSL 3 BASIC20.35■□□□□ 0.85
HLA-CQ95604 AC139530.3-201ENST00000620344 690 ntBASIC20.35■□□□□ 0.85
HLA-CQ95604 BSCL2-207ENST00000407022 1516 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
HLA-CQ95604 CYP2A6-201ENST00000301141 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
HLA-CQ95604 PSIP1-201ENST00000380715 1966 ntTSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
HLA-CQ95604 MAP2K2-202ENST00000394867 1471 ntTSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.3 ms