Protein–RNA interactions for Protein: Q8WW22

DNAJA4, DnaJ homolog subfamily A member 4, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 397 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DNAJA4Q8WW22 RBM14-RBM4-201ENST00000412278 1566 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
DNAJA4Q8WW22 MOK-233ENST00000524214 1539 ntTSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
DNAJA4Q8WW22 BRSK2-215ENST00000544817 1842 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
DNAJA4Q8WW22 KRT1-201ENST00000252244 2451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
DNAJA4Q8WW22 MFSD1-219ENST00000622669 2361 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
DNAJA4Q8WW22 PIK3R1-201ENST00000320694 2625 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
DNAJA4Q8WW22 NOTCH2NL-204ENST00000579793 1954 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
DNAJA4Q8WW22 DLGAP4-206ENST00000475894 3110 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
DNAJA4Q8WW22 KCNQ5-203ENST00000355635 6623 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
DNAJA4Q8WW22 PPARG-202ENST00000309576 1870 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
DNAJA4Q8WW22 SLC22A17-211ENST00000637426 1563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
DNAJA4Q8WW22 MBD3-201ENST00000156825 5518 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
DNAJA4Q8WW22 BACE2-202ENST00000330333 2993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
DNAJA4Q8WW22 MIPEPP3-201ENST00000412105 444 ntBASIC18.06■□□□□ 0.48
DNAJA4Q8WW22 SERP1-205ENST00000487153 657 ntTSL 4 BASIC18.06■□□□□ 0.48
DNAJA4Q8WW22 AC006001.3-204ENST00000638711 2103 ntTSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
DNAJA4Q8WW22 ZSCAN1-201ENST00000282326 2054 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
DNAJA4Q8WW22 USP25-204ENST00000400183 5341 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
DNAJA4Q8WW22 FGFR1-203ENST00000341462 6054 ntTSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
DNAJA4Q8WW22 OBSL1-203ENST00000373876 5503 ntTSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
DNAJA4Q8WW22 BABAM1-208ENST00000598188 1470 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
DNAJA4Q8WW22 TMEM259-209ENST00000592590 2509 ntTSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
DNAJA4Q8WW22 TSHZ3-201ENST00000240587 5176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
DNAJA4Q8WW22 UNC119-202ENST00000335765 1424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
DNAJA4Q8WW22 P2RY6-210ENST00000542092 1674 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
DNAJA4Q8WW22 GLB1-201ENST00000307363 2616 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
DNAJA4Q8WW22 ATPIF1-202ENST00000465645 1855 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
DNAJA4Q8WW22 TJP1-208ENST00000495972 2890 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
DNAJA4Q8WW22 CLN8-208ENST00000635751 1807 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
DNAJA4Q8WW22 AL158211.5-201ENST00000623583 2518 ntBASIC18.05■□□□□ 0.48
DNAJA4Q8WW22 FPGS-203ENST00000373247 2279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
DNAJA4Q8WW22 LINC01505-207ENST00000637185 1540 ntTSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
DNAJA4Q8WW22 CSF1-205ENST00000420111 1083 ntTSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
DNAJA4Q8WW22 AC080013.1-202ENST00000465477 674 ntTSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
DNAJA4Q8WW22 ALKBH6-212ENST00000485128 959 ntTSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
DNAJA4Q8WW22 DNAJA4-210ENST00000489435 947 ntTSL 3 BASIC18.05■□□□□ 0.48
DNAJA4Q8WW22 RPH3AL-203ENST00000536489 1235 ntTSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
DNAJA4Q8WW22 AC084032.1-201ENST00000552324 578 ntTSL 4 BASIC18.05■□□□□ 0.48
DNAJA4Q8WW22 SNAP23-210ENST00000564153 775 ntTSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
DNAJA4Q8WW22 SOCS2-210ENST00000551556 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
DNAJA4Q8WW22 CEP55-201ENST00000371485 2638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
DNAJA4Q8WW22 LMTK2-201ENST00000297293 8946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
DNAJA4Q8WW22 FUZ-201ENST00000313777 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
DNAJA4Q8WW22 KCNK17-201ENST00000373231 1658 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
DNAJA4Q8WW22 NEURL3-202ENST00000435380 1675 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
DNAJA4Q8WW22 FGF16-201ENST00000439435 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
DNAJA4Q8WW22 TRPV3-209ENST00000576742 2766 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
DNAJA4Q8WW22 KAZN-203ENST00000376030 6030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
DNAJA4Q8WW22 PIGQ-206ENST00000422307 2052 ntTSL 3 BASIC18.05■□□□□ 0.48
DNAJA4Q8WW22 UNC5B-201ENST00000335350 6841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
DNAJA4Q8WW22 SCO1-203ENST00000577427 1601 ntTSL 3 BASIC18.05■□□□□ 0.48
DNAJA4Q8WW22 OGG1-204ENST00000339511 1815 ntTSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
DNAJA4Q8WW22 NFATC1-217ENST00000591814 4819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
DNAJA4Q8WW22 EPN3-216ENST00000537145 2223 ntTSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
DNAJA4Q8WW22 CTDSP2-204ENST00000548823 1368 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
DNAJA4Q8WW22 CRK-204ENST00000574295 1391 ntTSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
DNAJA4Q8WW22 ASGR1-208ENST00000574388 1552 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
DNAJA4Q8WW22 VAV1-201ENST00000304076 2825 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
DNAJA4Q8WW22 MOB3C-202ENST00000319928 2822 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
DNAJA4Q8WW22 C5orf17-202ENST00000512559 1984 ntTSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
DNAJA4Q8WW22 TMEM8A-201ENST00000250930 2346 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
DNAJA4Q8WW22 ARHGAP22-204ENST00000417247 2340 ntTSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
DNAJA4Q8WW22 PPFIA1-202ENST00000389547 4133 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
DNAJA4Q8WW22 HRASLS-201ENST00000264735 1066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
DNAJA4Q8WW22 C11orf86-201ENST00000308963 1187 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
DNAJA4Q8WW22 BHLHA15-201ENST00000314018 706 ntAPPRIS P1 BASIC18.04■□□□□ 0.48
DNAJA4Q8WW22 CNIH4-203ENST00000366858 702 ntTSL 3 BASIC18.04■□□□□ 0.48
DNAJA4Q8WW22 RNF5-203ENST00000375094 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
DNAJA4Q8WW22 SLC29A4P1-201ENST00000398760 971 ntBASIC18.04■□□□□ 0.48
DNAJA4Q8WW22 AL390719.1-204ENST00000412397 1219 ntBASIC18.04■□□□□ 0.48
DNAJA4Q8WW22 SCO2-203ENST00000535425 1002 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
DNAJA4Q8WW22 ZNF688-205ENST00000563707 244 ntTSL 3 BASIC18.04■□□□□ 0.48
DNAJA4Q8WW22 BHLHA15-202ENST00000609256 796 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.04■□□□□ 0.48
DNAJA4Q8WW22 AC092118.2-201ENST00000613495 667 ntBASIC18.04■□□□□ 0.48
DNAJA4Q8WW22 PUF60-202ENST00000349157 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
DNAJA4Q8WW22 FAM110A-204ENST00000381941 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
DNAJA4Q8WW22 PCDHA2-203ENST00000526136 5254 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
DNAJA4Q8WW22 WDR45-207ENST00000376372 1639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
DNAJA4Q8WW22 PPP1R36-201ENST00000298705 1405 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
DNAJA4Q8WW22 KLRG2-201ENST00000340940 2197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
DNAJA4Q8WW22 SLC29A4-202ENST00000396872 5685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
DNAJA4Q8WW22 UBE2F-205ENST00000414443 2100 ntTSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
DNAJA4Q8WW22 PLEKHG5-206ENST00000377748 5221 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
DNAJA4Q8WW22 KLHL31-202ENST00000407079 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
DNAJA4Q8WW22 CELF6-202ENST00000395258 1741 ntTSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
DNAJA4Q8WW22 RNH1-203ENST00000397604 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
DNAJA4Q8WW22 RNF146-213ENST00000610153 2070 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
DNAJA4Q8WW22 TOR2A-203ENST00000373284 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
DNAJA4Q8WW22 ARHGAP9-202ENST00000393797 2912 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
DNAJA4Q8WW22 RBM42-204ENST00000589559 1328 ntTSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
DNAJA4Q8WW22 LRRC42-203ENST00000371370 2037 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
DNAJA4Q8WW22 TINAGL1-201ENST00000271064 2187 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
DNAJA4Q8WW22 GOLGA4-208ENST00000444882 1451 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
DNAJA4Q8WW22 PFKFB3-217ENST00000626882 1965 ntTSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
DNAJA4Q8WW22 TMEM8A-204ENST00000431232 3691 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
DNAJA4Q8WW22 GAS6-201ENST00000327773 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
DNAJA4Q8WW22 NUDT22-201ENST00000279206 1094 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
DNAJA4Q8WW22 DUT-201ENST00000331200 2147 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
DNAJA4Q8WW22 NUDT22-204ENST00000441250 986 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
DNAJA4Q8WW22 NME6-213ENST00000451657 871 ntTSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 68.4 ms