Protein–RNA interactions for Protein: Q8WV19

SFT2D1, Vesicle transport protein SFT2A, humanhuman

Predictions only

Length 159 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SFT2D1Q8WV19 RCE1-202ENST00000524506 1379 ntTSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
SFT2D1Q8WV19 MXRA8-209ENST00000477278 2728 ntTSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
SFT2D1Q8WV19 KDSR-202ENST00000406396 5447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
SFT2D1Q8WV19 PCDHA5-202ENST00000529859 5218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
SFT2D1Q8WV19 FXN-202ENST00000396364 980 ntTSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
SFT2D1Q8WV19 AL122058.1-201ENST00000412321 1166 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
SFT2D1Q8WV19 TSPY9P-201ENST00000440215 945 ntBASIC15.8■□□□□ 0.12
SFT2D1Q8WV19 TSPY11P-201ENST00000442607 1045 ntBASIC15.8■□□□□ 0.12
SFT2D1Q8WV19 SMUG1P1-201ENST00000590640 811 ntBASIC15.8■□□□□ 0.12
SFT2D1Q8WV19 MIR4787-201ENST00000607364 84 ntBASIC15.8■□□□□ 0.12
SFT2D1Q8WV19 MIR2861-201ENST00000636310 90 ntBASIC15.8■□□□□ 0.12
SFT2D1Q8WV19 CRHR2-207ENST00000471646 2530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
SFT2D1Q8WV19 LTF-203ENST00000426532 2494 ntTSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
SFT2D1Q8WV19 SKOR1-202ENST00000380035 3675 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
SFT2D1Q8WV19 HBEGF-201ENST00000230990 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
SFT2D1Q8WV19 AC068880.1-201ENST00000507289 2297 ntBASIC15.8■□□□□ 0.12
SFT2D1Q8WV19 DYNLT3-201ENST00000378578 2217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
SFT2D1Q8WV19 RBCK1-203ENST00000382181 2208 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
SFT2D1Q8WV19 TWF1-201ENST00000395510 3045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
SFT2D1Q8WV19 MGLL-204ENST00000434178 4941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
SFT2D1Q8WV19 WBP2-204ENST00000585462 1895 ntTSL 3 BASIC15.8■□□□□ 0.12
SFT2D1Q8WV19 BEGAIN-202ENST00000443071 2744 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
SFT2D1Q8WV19 PAQR6-205ENST00000368270 1765 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
SFT2D1Q8WV19 AC046158.3-201ENST00000624947 2558 ntBASIC15.8■□□□□ 0.12
SFT2D1Q8WV19 DPP3P2-201ENST00000416030 1696 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
SFT2D1Q8WV19 VPS37A-201ENST00000324849 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
SFT2D1Q8WV19 WISP2-203ENST00000372868 1600 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.79■□□□□ 0.12
SFT2D1Q8WV19 ARHGAP35-201ENST00000404338 8889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
SFT2D1Q8WV19 BX119927.1-201ENST00000636596 1552 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
SFT2D1Q8WV19 VSTM2A-204ENST00000407838 3112 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.79■□□□□ 0.12
SFT2D1Q8WV19 ZNF354C-201ENST00000315475 5411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
SFT2D1Q8WV19 RMI2-201ENST00000312499 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
SFT2D1Q8WV19 WNT5B-201ENST00000310594 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
SFT2D1Q8WV19 CHTOP-203ENST00000368690 2165 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
SFT2D1Q8WV19 SNCB-206ENST00000614675 1407 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
SFT2D1Q8WV19 DHX33-201ENST00000225296 5618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
SFT2D1Q8WV19 PDCD10-201ENST00000392750 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
SFT2D1Q8WV19 CA9-204ENST00000617161 1374 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
SFT2D1Q8WV19 SLC9A6-208ENST00000636206 4711 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
SFT2D1Q8WV19 KDM5C-204ENST00000375401 6031 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
SFT2D1Q8WV19 C12orf75-208ENST00000612117 1329 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
SFT2D1Q8WV19 PSAP-205ENST00000610929 1969 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
SFT2D1Q8WV19 SYT15-202ENST00000374323 6428 ntTSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
SFT2D1Q8WV19 NR1H2-210ENST00000598168 1915 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
SFT2D1Q8WV19 ACYP2-202ENST00000394666 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
SFT2D1Q8WV19 GATA2-AS1-201ENST00000464242 1163 ntTSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
SFT2D1Q8WV19 TUSC3-209ENST00000509380 1266 ntTSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
SFT2D1Q8WV19 RAB6A-204ENST00000536566 1267 ntTSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
SFT2D1Q8WV19 GPX4-213ENST00000622390 1002 ntTSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
SFT2D1Q8WV19 VASH1-201ENST00000167106 5728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
SFT2D1Q8WV19 AC008894.3-201ENST00000624324 3103 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
SFT2D1Q8WV19 SSR1-204ENST00000474597 1808 ntTSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
SFT2D1Q8WV19 KCNQ2-207ENST00000370224 3004 ntTSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
SFT2D1Q8WV19 BRPF1-203ENST00000424362 4712 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
SFT2D1Q8WV19 MMD2-201ENST00000401401 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
SFT2D1Q8WV19 KIFC3-201ENST00000379655 3427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
SFT2D1Q8WV19 GAS8-202ENST00000536122 1687 ntTSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
SFT2D1Q8WV19 NPTX2-201ENST00000265634 2700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
SFT2D1Q8WV19 SERBP1-202ENST00000370990 1621 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
SFT2D1Q8WV19 MFSD7-204ENST00000503156 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
SFT2D1Q8WV19 ZNF517-207ENST00000531720 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
SFT2D1Q8WV19 SPNS3-201ENST00000355530 2133 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
SFT2D1Q8WV19 RWDD4-202ENST00000327570 2590 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC15.79■□□□□ 0.12
SFT2D1Q8WV19 P2RX5-202ENST00000345901 2031 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
SFT2D1Q8WV19 GAL3ST4-201ENST00000360039 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
SFT2D1Q8WV19 RARRES1-201ENST00000237696 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
SFT2D1Q8WV19 PEX7-201ENST00000318471 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
SFT2D1Q8WV19 PNLIPRP2-204ENST00000591655 1456 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
SFT2D1Q8WV19 GCH1-207ENST00000622544 2923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
SFT2D1Q8WV19 DUT-202ENST00000455976 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
SFT2D1Q8WV19 AC009237.3-201ENST00000393279 1427 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
SFT2D1Q8WV19 GATAD2A-202ENST00000360315 5671 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
SFT2D1Q8WV19 LINC01356-201ENST00000401018 1819 ntTSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
SFT2D1Q8WV19 SEMA3B-209ENST00000456560 2221 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
SFT2D1Q8WV19 OGFOD2-201ENST00000228922 1780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
SFT2D1Q8WV19 LEF1-201ENST00000265165 3068 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
SFT2D1Q8WV19 ZNRF2-201ENST00000323037 3460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
SFT2D1Q8WV19 DSG2-202ENST00000585206 1081 ntTSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
SFT2D1Q8WV19 PICSAR-201ENST00000615826 733 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
SFT2D1Q8WV19 CHMP6-201ENST00000325167 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
SFT2D1Q8WV19 DCP1B-201ENST00000280665 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
SFT2D1Q8WV19 PIGQ-206ENST00000422307 2052 ntTSL 3 BASIC15.78■□□□□ 0.12
SFT2D1Q8WV19 ELF3-201ENST00000359651 4994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
SFT2D1Q8WV19 DTX2-201ENST00000324432 2769 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
SFT2D1Q8WV19 TMEM198-201ENST00000344458 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
SFT2D1Q8WV19 CCT5-214ENST00000515676 1997 ntTSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
SFT2D1Q8WV19 BIRC2-206ENST00000530675 1927 ntTSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
SFT2D1Q8WV19 BBC3-202ENST00000341983 1538 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
SFT2D1Q8WV19 PALM3-201ENST00000340790 2262 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
SFT2D1Q8WV19 GLCCI1-201ENST00000223145 4743 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
SFT2D1Q8WV19 HR-201ENST00000312841 5351 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
SFT2D1Q8WV19 EPS8L1-209ENST00000588359 1407 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
SFT2D1Q8WV19 NRN1-204ENST00000622188 1795 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
SFT2D1Q8WV19 ITPK1-202ENST00000354313 2803 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
SFT2D1Q8WV19 ZNF281-203ENST00000367353 3080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
SFT2D1Q8WV19 STK25-201ENST00000316586 4619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
SFT2D1Q8WV19 COX20-203ENST00000411948 2631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
SFT2D1Q8WV19 UBFD1-201ENST00000395878 5110 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
SFT2D1Q8WV19 PRTG-204ENST00000561292 833 ntTSL 3 BASIC15.77■□□□□ 0.12
SFT2D1Q8WV19 SNAI3-AS1-201ENST00000563261 998 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 10.5 ms