Protein–RNA interactions for Protein: Q8WUW1

BRK1, Protein BRICK1, humanhuman

Predictions only

Length 75 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BRK1Q8WUW1 PCM1-202ENST00000327578 8287 ntTSL 5 BASIC11.06□□□□□ -0.64
BRK1Q8WUW1 UBR2-201ENST00000372899 7857 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
BRK1Q8WUW1 UBR2-202ENST00000372901 7857 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.06□□□□□ -0.64
BRK1Q8WUW1 FBXL17-201ENST00000359660 4510 ntTSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
BRK1Q8WUW1 CHRD-202ENST00000348986 3155 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.06□□□□□ -0.64
BRK1Q8WUW1 TBC1D28-201ENST00000345096 2789 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.06□□□□□ -0.64
BRK1Q8WUW1 PTK7-202ENST00000230419 4272 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
BRK1Q8WUW1 RNASEH2B-202ENST00000422660 4830 ntTSL 5 BASIC11.06□□□□□ -0.64
BRK1Q8WUW1 NCOA1-205ENST00000406961 7289 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC11.06□□□□□ -0.64
BRK1Q8WUW1 TMUB2-209ENST00000587989 1969 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC11.06□□□□□ -0.64
BRK1Q8WUW1 GUCY1A2-202ENST00000347596 2532 ntTSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
BRK1Q8WUW1 IRAK3-201ENST00000261233 8663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
BRK1Q8WUW1 ELK4-202ENST00000357992 10239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
BRK1Q8WUW1 NOMO1-207ENST00000610363 3765 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
BRK1Q8WUW1 ITGB1BP1-204ENST00000360635 4859 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.06□□□□□ -0.64
BRK1Q8WUW1 NFATC4-222ENST00000555590 2830 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
BRK1Q8WUW1 ATIC-205ENST00000435675 2275 ntTSL 2 BASIC11.06□□□□□ -0.64
BRK1Q8WUW1 GTF2I-212ENST00000573035 4548 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
BRK1Q8WUW1 C2orf54-201ENST00000307486 2017 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
BRK1Q8WUW1 LONRF1-201ENST00000398246 3594 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.06□□□□□ -0.64
BRK1Q8WUW1 ANXA8L1-201ENST00000584982 2174 ntTSL 2 BASIC11.06□□□□□ -0.64
BRK1Q8WUW1 TMPO-203ENST00000343315 2465 ntTSL 5 BASIC11.06□□□□□ -0.64
BRK1Q8WUW1 PABPC4-204ENST00000372862 2470 ntTSL 5 BASIC11.06□□□□□ -0.64
BRK1Q8WUW1 NOTCH4-201ENST00000375023 6745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
BRK1Q8WUW1 KIAA2026-201ENST00000381461 6884 ntTSL 5 BASIC11.05□□□□□ -0.64
BRK1Q8WUW1 YPEL1-201ENST00000339468 4329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
BRK1Q8WUW1 GATA4-206ENST00000528712 2614 ntTSL 2 BASIC11.05□□□□□ -0.64
BRK1Q8WUW1 ITGB2-206ENST00000397852 2769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
BRK1Q8WUW1 GJB3-202ENST00000373366 2217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
BRK1Q8WUW1 PHF1-201ENST00000374512 2224 ntTSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
BRK1Q8WUW1 HEYL-201ENST00000372852 3661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
BRK1Q8WUW1 YIPF6-204ENST00000462683 6741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
BRK1Q8WUW1 DACH1-203ENST00000619232 2986 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.05□□□□□ -0.64
BRK1Q8WUW1 GPRIN2-202ENST00000374317 1966 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.05□□□□□ -0.64
BRK1Q8WUW1 PKIA-202ENST00000396418 4163 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.05□□□□□ -0.64
BRK1Q8WUW1 KCNMA1-251ENST00000639090 4319 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.05□□□□□ -0.64
BRK1Q8WUW1 CBS-201ENST00000352178 2583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
BRK1Q8WUW1 FAM219B-204ENST00000563119 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
BRK1Q8WUW1 ABCG5-202ENST00000405322 2896 ntTSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
BRK1Q8WUW1 SCARF1-205ENST00000571272 2871 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
BRK1Q8WUW1 OSBPL8-201ENST00000261183 7239 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
BRK1Q8WUW1 OSBPL8-218ENST00000611266 7239 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
BRK1Q8WUW1 SLC25A11-201ENST00000225665 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
BRK1Q8WUW1 GGT5-201ENST00000263112 2334 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
BRK1Q8WUW1 TINAGL1-201ENST00000271064 2187 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
BRK1Q8WUW1 MYB-203ENST00000341911 3672 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
BRK1Q8WUW1 C12orf56-207ENST00000543942 3242 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.05□□□□□ -0.64
BRK1Q8WUW1 USP27X-201ENST00000621775 2618 ntAPPRIS P1 BASIC11.05□□□□□ -0.64
BRK1Q8WUW1 OPA1-205ENST00000361908 6439 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
BRK1Q8WUW1 MAPK4-201ENST00000400384 4770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
BRK1Q8WUW1 CCDC120-206ENST00000603986 2379 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.05□□□□□ -0.64
BRK1Q8WUW1 SAMD11-210ENST00000616016 2391 ntTSL 5 BASIC11.05□□□□□ -0.64
BRK1Q8WUW1 SYTL1-208ENST00000543823 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
BRK1Q8WUW1 CERS5-201ENST00000317551 2051 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC11.05□□□□□ -0.64
BRK1Q8WUW1 HEXB-201ENST00000261416 1901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
BRK1Q8WUW1 SLC16A5-201ENST00000329783 1934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
BRK1Q8WUW1 WDSUB1-202ENST00000359774 1912 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.05□□□□□ -0.64
BRK1Q8WUW1 SPN-202ENST00000395389 1935 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
BRK1Q8WUW1 PTGES2-AS1-201ENST00000443493 2100 ntBASIC11.05□□□□□ -0.64
BRK1Q8WUW1 RRN3-205ENST00000563559 2128 ntTSL 5 BASIC11.05□□□□□ -0.64
BRK1Q8WUW1 HNF1B-207ENST00000621123 1971 ntTSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
BRK1Q8WUW1 TRMT2B-201ENST00000372935 2921 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
BRK1Q8WUW1 SUSD1-203ENST00000374264 2754 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
BRK1Q8WUW1 MGRN1-203ENST00000415496 6405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
BRK1Q8WUW1 ZMYM3-203ENST00000373981 1841 ntTSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
BRK1Q8WUW1 C2CD4C-201ENST00000332235 3129 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.04□□□□□ -0.64
BRK1Q8WUW1 TYSND1-201ENST00000287078 3644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
BRK1Q8WUW1 TBC1D1-201ENST00000261439 5700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
BRK1Q8WUW1 PPFIA4-202ENST00000295706 6395 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.04□□□□□ -0.64
BRK1Q8WUW1 LENG8-209ENST00000616932 2825 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.04□□□□□ -0.64
BRK1Q8WUW1 VIPR1-217ENST00000543411 2681 ntTSL 2 BASIC11.04□□□□□ -0.64
BRK1Q8WUW1 SPAG9-205ENST00000505279 4659 ntTSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
BRK1Q8WUW1 AFTPH-202ENST00000238856 4040 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
BRK1Q8WUW1 FAR2P4-203ENST00000560285 1739 ntTSL 2 BASIC11.04□□□□□ -0.64
BRK1Q8WUW1 FDX1-201ENST00000260270 3206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
BRK1Q8WUW1 ADGRA1-AS1-201ENST00000366099 3236 ntBASIC11.04□□□□□ -0.64
BRK1Q8WUW1 C1orf56-201ENST00000368926 2096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
BRK1Q8WUW1 RCC2-202ENST00000375436 4087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
BRK1Q8WUW1 AL731571.1-201ENST00000617058 5428 ntBASIC11.04□□□□□ -0.64
BRK1Q8WUW1 FLOT1-201ENST00000376389 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
BRK1Q8WUW1 PIGQ-204ENST00000409527 1915 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.04□□□□□ -0.64
BRK1Q8WUW1 DIXDC1-205ENST00000529225 1945 ntTSL 5 BASIC11.04□□□□□ -0.64
BRK1Q8WUW1 ANKRD9-205ENST00000560748 1413 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.04□□□□□ -0.64
BRK1Q8WUW1 ZNF133-205ENST00000401790 2642 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.04□□□□□ -0.64
BRK1Q8WUW1 CASK-202ENST00000378158 3848 ntTSL 5 BASIC11.04□□□□□ -0.64
BRK1Q8WUW1 AC023824.1-201ENST00000562945 2975 ntBASIC11.04□□□□□ -0.64
BRK1Q8WUW1 DIO3OS-208ENST00000556120 2473 ntTSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
BRK1Q8WUW1 SH2D3C-213ENST00000629203 2478 ntTSL 2 BASIC11.04□□□□□ -0.64
BRK1Q8WUW1 C9orf50-201ENST00000372478 1620 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC11.04□□□□□ -0.64
BRK1Q8WUW1 STT3B-201ENST00000295770 4248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
BRK1Q8WUW1 SUPT20H-202ENST00000356185 2681 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
BRK1Q8WUW1 HRASLS5-206ENST00000540857 3032 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
BRK1Q8WUW1 USP21-201ENST00000289865 2195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
BRK1Q8WUW1 TMEM44-203ENST00000381975 2197 ntTSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
BRK1Q8WUW1 SYBU-235ENST00000533895 3244 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
BRK1Q8WUW1 NR3C1-203ENST00000394464 6795 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
BRK1Q8WUW1 EMC10-201ENST00000334976 9446 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
BRK1Q8WUW1 GRK6-206ENST00000507633 1660 ntTSL 5 BASIC11.04□□□□□ -0.64
BRK1Q8WUW1 ALDH1A3-203ENST00000557963 1670 ntBASIC11.04□□□□□ -0.64
BRK1Q8WUW1 AC011511.4-201ENST00000586529 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.04□□□□□ -0.64
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.1 ms