Protein–RNA interactions for Protein: Q8NFJ8

BHLHE22, Class E basic helix-loop-helix protein 22, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 381 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BHLHE22Q8NFJ8 GTF2IP4-202ENST00000544802 3609 ntTSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
BHLHE22Q8NFJ8 TMEM121-201ENST00000392519 1532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
BHLHE22Q8NFJ8 GOLGA4-212ENST00000617480 1545 ntTSL 5 BASIC18.79■□□□□ 0.6
BHLHE22Q8NFJ8 PKD2-201ENST00000237596 5056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
BHLHE22Q8NFJ8 ADAMTS9-202ENST00000459780 2871 ntTSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
BHLHE22Q8NFJ8 NLGN2-204ENST00000575301 4374 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.79■□□□□ 0.6
BHLHE22Q8NFJ8 KRT18-207ENST00000550600 1696 ntTSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
BHLHE22Q8NFJ8 LINC01819-201ENST00000422351 2156 ntTSL 5 BASIC18.79■□□□□ 0.6
BHLHE22Q8NFJ8 MLF2-201ENST00000203630 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
BHLHE22Q8NFJ8 DCPS-201ENST00000263579 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
BHLHE22Q8NFJ8 RIOX2-201ENST00000333396 5347 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
BHLHE22Q8NFJ8 NUDT4-202ENST00000415493 4839 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
BHLHE22Q8NFJ8 GTF2IRD2B-210ENST00000629105 1910 ntTSL 5 BASIC18.79■□□□□ 0.6
BHLHE22Q8NFJ8 SOCS3-201ENST00000330871 2734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
BHLHE22Q8NFJ8 TCTEX1D4-201ENST00000339355 763 ntAPPRIS P1 BASIC18.79■□□□□ 0.6
BHLHE22Q8NFJ8 MAP1LC3A-202ENST00000374837 961 ntTSL 3 BASIC18.79■□□□□ 0.6
BHLHE22Q8NFJ8 SLC35A2-205ENST00000376529 865 ntTSL 3 BASIC18.79■□□□□ 0.6
BHLHE22Q8NFJ8 PGM5P4-201ENST00000421970 445 ntBASIC18.79■□□□□ 0.6
BHLHE22Q8NFJ8 AC012414.4-201ENST00000560839 1074 ntTSL 5 BASIC18.79■□□□□ 0.6
BHLHE22Q8NFJ8 ORAI3-202ENST00000562699 628 ntTSL 2 BASIC18.79■□□□□ 0.6
BHLHE22Q8NFJ8 AP005205.2-201ENST00000577327 491 ntTSL 2 BASIC18.79■□□□□ 0.6
BHLHE22Q8NFJ8 TFG-210ENST00000620299 1289 ntTSL 5 BASIC18.79■□□□□ 0.6
BHLHE22Q8NFJ8 AC060814.5-201ENST00000630916 1074 ntTSL 2 BASIC18.79■□□□□ 0.6
BHLHE22Q8NFJ8 SHISA5-220ENST00000619810 2385 ntTSL 2 BASIC18.79■□□□□ 0.6
BHLHE22Q8NFJ8 SCARB1-211ENST00000546215 1597 ntTSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
BHLHE22Q8NFJ8 SEMA6D-205ENST00000389425 2318 ntTSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
BHLHE22Q8NFJ8 MAP3K6-207ENST00000493901 4309 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.79■□□□□ 0.6
BHLHE22Q8NFJ8 EDEM1-201ENST00000256497 6146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
BHLHE22Q8NFJ8 SMYD2-201ENST00000366957 1671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
BHLHE22Q8NFJ8 MUTYH-203ENST00000372098 1839 ntTSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
BHLHE22Q8NFJ8 MUTYH-204ENST00000372104 1823 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
BHLHE22Q8NFJ8 MUTYH-205ENST00000372110 1809 ntTSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
BHLHE22Q8NFJ8 KCTD12-201ENST00000377474 6225 ntAPPRIS P1 BASIC18.79■□□□□ 0.6
BHLHE22Q8NFJ8 ZBTB7B-201ENST00000292176 2129 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
BHLHE22Q8NFJ8 TCAP-201ENST00000309889 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
BHLHE22Q8NFJ8 MZT1-201ENST00000377818 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
BHLHE22Q8NFJ8 TM9SF1-203ENST00000524835 1938 ntTSL 2 BASIC18.78■□□□□ 0.6
BHLHE22Q8NFJ8 MME-202ENST00000382989 1319 ntTSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
BHLHE22Q8NFJ8 ACY1-207ENST00000476854 1319 ntTSL 3 BASIC18.78■□□□□ 0.6
BHLHE22Q8NFJ8 MCU-202ENST00000373053 2949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
BHLHE22Q8NFJ8 UBTF-202ENST00000343638 4684 ntTSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
BHLHE22Q8NFJ8 EIF2B1-201ENST00000424014 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
BHLHE22Q8NFJ8 PRR5-ARHGAP8-201ENST00000352766 2043 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.78■□□□□ 0.6
BHLHE22Q8NFJ8 LRCH3-207ENST00000441090 2034 ntTSL 2 BASIC18.78■□□□□ 0.6
BHLHE22Q8NFJ8 SMARCB1-202ENST00000344921 1728 ntTSL 2 BASIC18.78■□□□□ 0.6
BHLHE22Q8NFJ8 PDP1-208ENST00000520728 2554 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
BHLHE22Q8NFJ8 MEF2B-203ENST00000410050 1429 ntTSL 5 BASIC18.78■□□□□ 0.6
BHLHE22Q8NFJ8 EMC7-201ENST00000256545 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
BHLHE22Q8NFJ8 INTS11-205ENST00000429572 1104 ntTSL 2 BASIC18.78■□□□□ 0.6
BHLHE22Q8NFJ8 KRT8-216ENST00000552551 2126 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.78■□□□□ 0.6
BHLHE22Q8NFJ8 PFKFB3-217ENST00000626882 1965 ntTSL 5 BASIC18.78■□□□□ 0.6
BHLHE22Q8NFJ8 HENMT1-203ENST00000402983 1696 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
BHLHE22Q8NFJ8 PAQR4-202ENST00000318782 2793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
BHLHE22Q8NFJ8 CCDC74A-201ENST00000295171 1543 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
BHLHE22Q8NFJ8 CCDC74B-201ENST00000310463 1549 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.78■□□□□ 0.6
BHLHE22Q8NFJ8 NR1H2-210ENST00000598168 1915 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.78■□□□□ 0.6
BHLHE22Q8NFJ8 NRN1-204ENST00000622188 1795 ntTSL 2 BASIC18.78■□□□□ 0.6
BHLHE22Q8NFJ8 FIP1L1-203ENST00000358575 2180 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC18.78■□□□□ 0.6
BHLHE22Q8NFJ8 FOXI3-201ENST00000428390 2804 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.78■□□□□ 0.6
BHLHE22Q8NFJ8 AKT1S1-207ENST00000391835 3075 ntTSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
BHLHE22Q8NFJ8 FENDRR-203ENST00000595886 3095 ntTSL 2 BASIC18.77■□□□□ 0.6
BHLHE22Q8NFJ8 DUT-201ENST00000331200 2147 ntTSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
BHLHE22Q8NFJ8 PRMT2-206ENST00000397638 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
BHLHE22Q8NFJ8 CXXC4-201ENST00000394767 5565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.77■□□□□ 0.6
BHLHE22Q8NFJ8 SLC16A13-201ENST00000308027 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
BHLHE22Q8NFJ8 BANP-223ENST00000538234 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
BHLHE22Q8NFJ8 USP48-204ENST00000400301 4309 ntTSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
BHLHE22Q8NFJ8 KRT86-202ENST00000423955 2217 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.77■□□□□ 0.6
BHLHE22Q8NFJ8 UXS1-203ENST00000409501 1839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
BHLHE22Q8NFJ8 SMPD3-203ENST00000563226 2093 ntTSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
BHLHE22Q8NFJ8 SORCS3-201ENST00000369699 5530 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.77■□□□□ 0.6
BHLHE22Q8NFJ8 FAM83E-201ENST00000263266 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
BHLHE22Q8NFJ8 FIP1L1-202ENST00000337488 2198 ntTSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
BHLHE22Q8NFJ8 DCLK2-207ENST00000635524 2153 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.77■□□□□ 0.6
BHLHE22Q8NFJ8 CCDC160-201ENST00000370809 1299 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.77■□□□□ 0.6
BHLHE22Q8NFJ8 GDNF-203ENST00000381826 778 ntTSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
BHLHE22Q8NFJ8 GDNF-204ENST00000427982 856 ntTSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
BHLHE22Q8NFJ8 ALG5-202ENST00000443765 1119 ntTSL 2 BASIC18.77■□□□□ 0.6
BHLHE22Q8NFJ8 EXD3-208ENST00000479452 962 ntTSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
BHLHE22Q8NFJ8 LGR4-203ENST00000480977 492 ntTSL 2 BASIC18.77■□□□□ 0.6
BHLHE22Q8NFJ8 AC008750.8-201ENST00000600067 551 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.77■□□□□ 0.6
BHLHE22Q8NFJ8 ANKS3-201ENST00000304283 2662 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.77■□□□□ 0.6
BHLHE22Q8NFJ8 IMP3-201ENST00000314852 2028 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.77■□□□□ 0.6
BHLHE22Q8NFJ8 PALM3-201ENST00000340790 2262 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.77■□□□□ 0.6
BHLHE22Q8NFJ8 CCT4-204ENST00000544079 2261 ntTSL 2 BASIC18.77■□□□□ 0.6
BHLHE22Q8NFJ8 FAM91A1-201ENST00000334705 5511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
BHLHE22Q8NFJ8 CPEB2-207ENST00000507071 2103 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
BHLHE22Q8NFJ8 PLSCR3-213ENST00000576362 1605 ntTSL 3 BASIC18.77■□□□□ 0.6
BHLHE22Q8NFJ8 RUVBL2-211ENST00000601968 1641 ntTSL 5 BASIC18.77■□□□□ 0.6
BHLHE22Q8NFJ8 NR1H2-201ENST00000253727 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.59
BHLHE22Q8NFJ8 PML-204ENST00000359928 1726 ntTSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.59
BHLHE22Q8NFJ8 RNH1-203ENST00000397604 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.59
BHLHE22Q8NFJ8 EARS2-206ENST00000563232 1709 ntTSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.59
BHLHE22Q8NFJ8 SLC12A4-201ENST00000316341 4765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.59
BHLHE22Q8NFJ8 NAP1L5-201ENST00000323061 2321 ntAPPRIS P1 BASIC18.77■□□□□ 0.59
BHLHE22Q8NFJ8 MMP9-201ENST00000372330 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.59
BHLHE22Q8NFJ8 BAIAP2-204ENST00000428708 2095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.59
BHLHE22Q8NFJ8 BCL7A-203ENST00000538010 6247 ntTSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.59
BHLHE22Q8NFJ8 CA11-201ENST00000084798 1844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.59
BHLHE22Q8NFJ8 UBE2L6-202ENST00000340573 1573 ntTSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 44.1 ms