Protein–RNA interactions for Protein: Q8NEK5

ZNF548, Zinc finger protein 548, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 533 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZNF548Q8NEK5 AC004264.1-201ENST00000608354 794 ntBASIC19.54■□□□□ 0.72
ZNF548Q8NEK5 RASGRP2-211ENST00000394432 2304 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
ZNF548Q8NEK5 TSNAXIP1-202ENST00000415766 2338 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.54■□□□□ 0.72
ZNF548Q8NEK5 AL162377.1-201ENST00000618844 1793 ntBASIC19.54■□□□□ 0.72
ZNF548Q8NEK5 MRFAP1-201ENST00000320912 2049 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.54■□□□□ 0.72
ZNF548Q8NEK5 PACSIN3-211ENST00000539589 2009 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.54■□□□□ 0.72
ZNF548Q8NEK5 NARS2-201ENST00000281038 2519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
ZNF548Q8NEK5 AC005224.2-201ENST00000571192 1885 ntTSL 2 BASIC19.54■□□□□ 0.72
ZNF548Q8NEK5 TPST2-202ENST00000398110 1968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.53■□□□□ 0.72
ZNF548Q8NEK5 PTPRJ-208ENST00000615445 4773 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.53■□□□□ 0.72
ZNF548Q8NEK5 MYL5-206ENST00000506838 2956 ntTSL 2 BASIC19.53■□□□□ 0.72
ZNF548Q8NEK5 ACBD4-201ENST00000321854 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
ZNF548Q8NEK5 TANGO2-217ENST00000456048 2439 ntTSL 2 BASIC19.53■□□□□ 0.72
ZNF548Q8NEK5 SHISA7-201ENST00000376325 6033 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC19.53■□□□□ 0.72
ZNF548Q8NEK5 FAM129C-207ENST00000599124 1918 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
ZNF548Q8NEK5 MAMSTR-203ENST00000594582 1693 ntTSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
ZNF548Q8NEK5 RBM45-207ENST00000616198 1788 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
ZNF548Q8NEK5 FAM26F-202ENST00000368605 1117 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.53■□□□□ 0.72
ZNF548Q8NEK5 RAP1B-203ENST00000378985 1017 ntTSL 2 BASIC19.53■□□□□ 0.72
ZNF548Q8NEK5 ELAVL3-202ENST00000438662 1223 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.53■□□□□ 0.72
ZNF548Q8NEK5 FAM210CP-201ENST00000445714 574 ntBASIC19.53■□□□□ 0.72
ZNF548Q8NEK5 PHF11-218ENST00000496623 1173 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.53■□□□□ 0.72
ZNF548Q8NEK5 RAP1B-221ENST00000540209 1264 ntTSL 2 BASIC19.53■□□□□ 0.72
ZNF548Q8NEK5 AP003071.4-201ENST00000562276 1284 ntBASIC19.53■□□□□ 0.72
ZNF548Q8NEK5 SUMO2-203ENST00000578238 490 ntTSL 2 BASIC19.53■□□□□ 0.72
ZNF548Q8NEK5 CD177P1-201ENST00000606252 935 ntBASIC19.53■□□□□ 0.72
ZNF548Q8NEK5 CHD1L-201ENST00000361293 2484 ntTSL 2 BASIC19.53■□□□□ 0.72
ZNF548Q8NEK5 PNMA2-204ENST00000522362 4965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
ZNF548Q8NEK5 CCSAP-203ENST00000366687 5089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
ZNF548Q8NEK5 FAM53A-202ENST00000461064 2159 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.53■□□□□ 0.72
ZNF548Q8NEK5 CDCA4-201ENST00000336219 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
ZNF548Q8NEK5 SCUBE1-201ENST00000290460 2258 ntTSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
ZNF548Q8NEK5 SLC25A46-202ENST00000447245 1575 ntTSL 2 BASIC19.53■□□□□ 0.72
ZNF548Q8NEK5 AC027031.2-201ENST00000521369 1318 ntTSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
ZNF548Q8NEK5 MAP3K14-AS1-203ENST00000585780 2475 ntTSL 2 BASIC19.52■□□□□ 0.72
ZNF548Q8NEK5 NXN-201ENST00000336868 3036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
ZNF548Q8NEK5 KRT18-202ENST00000388837 1420 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.52■□□□□ 0.72
ZNF548Q8NEK5 DMWD-202ENST00000377735 3292 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.52■□□□□ 0.72
ZNF548Q8NEK5 AL355355.2-201ENST00000442321 338 ntBASIC19.52■□□□□ 0.72
ZNF548Q8NEK5 FDX2-207ENST00000494368 584 ntTSL 4 BASIC19.52■□□□□ 0.72
ZNF548Q8NEK5 AF131216.3-201ENST00000525867 1099 ntTSL 2 BASIC19.52■□□□□ 0.72
ZNF548Q8NEK5 ANAPC11-207ENST00000572639 578 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.52■□□□□ 0.72
ZNF548Q8NEK5 RPL23AP53-202ENST00000606507 370 ntTSL 3 BASIC19.52■□□□□ 0.72
ZNF548Q8NEK5 AC133561.5-201ENST00000635547 218 ntBASIC19.52■□□□□ 0.72
ZNF548Q8NEK5 MAP7D2-203ENST00000443379 2476 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.52■□□□□ 0.72
ZNF548Q8NEK5 TSPAN17-202ENST00000310032 2550 ntTSL 5 BASIC19.52■□□□□ 0.72
ZNF548Q8NEK5 SSH3-202ENST00000308298 2046 ntTSL 2 BASIC19.52■□□□□ 0.72
ZNF548Q8NEK5 AL512408.1-201ENST00000569378 2000 ntBASIC19.52■□□□□ 0.72
ZNF548Q8NEK5 COPS7A-222ENST00000626119 1768 ntTSL 3 BASIC19.52■□□□□ 0.71
ZNF548Q8NEK5 SOX2-201ENST00000325404 2513 ntAPPRIS P1 BASIC19.52■□□□□ 0.71
ZNF548Q8NEK5 BPTF-201ENST00000306378 9688 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.71
ZNF548Q8NEK5 AFDN-202ENST00000351017 5823 ntTSL 5 BASIC19.52■□□□□ 0.71
ZNF548Q8NEK5 FGF2-202ENST00000608478 3880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
ZNF548Q8NEK5 FAM189B-201ENST00000350210 2379 ntTSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
ZNF548Q8NEK5 GPRC5C-204ENST00000392629 1419 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
ZNF548Q8NEK5 FAM66B-201ENST00000529456 1432 ntTSL 2 BASIC19.51■□□□□ 0.71
ZNF548Q8NEK5 MCEMP1-201ENST00000333598 1730 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
ZNF548Q8NEK5 GAMT-201ENST00000252288 1121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
ZNF548Q8NEK5 DNTTIP1-201ENST00000372622 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
ZNF548Q8NEK5 TRAPPC3-204ENST00000373166 1265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
ZNF548Q8NEK5 NPY-202ENST00000405982 565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
ZNF548Q8NEK5 FAM197Y1-201ENST00000421178 764 ntBASIC19.51■□□□□ 0.71
ZNF548Q8NEK5 MUC1-211ENST00000438413 927 ntTSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
ZNF548Q8NEK5 HPS6-201ENST00000299238 2649 ntAPPRIS P1 BASIC19.51■□□□□ 0.71
ZNF548Q8NEK5 P4HB-201ENST00000331483 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
ZNF548Q8NEK5 DBNL-220ENST00000494774 2117 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
ZNF548Q8NEK5 USP39-204ENST00000409766 2033 ntTSL 2 BASIC19.51■□□□□ 0.71
ZNF548Q8NEK5 CACNB2-203ENST00000352115 1911 ntTSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
ZNF548Q8NEK5 HMOX2-218ENST00000619913 1908 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.51■□□□□ 0.71
ZNF548Q8NEK5 SAAL1-204ENST00000529318 1503 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.51■□□□□ 0.71
ZNF548Q8NEK5 NGEF-202ENST00000373552 2286 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.5■□□□□ 0.71
ZNF548Q8NEK5 SLC39A5-209ENST00000454355 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
ZNF548Q8NEK5 HDDC3-202ENST00000394272 1880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.5■□□□□ 0.71
ZNF548Q8NEK5 OXER1-201ENST00000378661 1781 ntAPPRIS P1 BASIC19.5■□□□□ 0.71
ZNF548Q8NEK5 H19-201ENST00000411754 1788 ntTSL 5 BASIC19.5■□□□□ 0.71
ZNF548Q8NEK5 BRSK2-201ENST00000308219 4089 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
ZNF548Q8NEK5 PGAM5-203ENST00000498926 2834 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.5■□□□□ 0.71
ZNF548Q8NEK5 TEX45-201ENST00000361664 1679 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
ZNF548Q8NEK5 RALGPS1-204ENST00000373436 1667 ntTSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
ZNF548Q8NEK5 TACC3-213ENST00000617535 1693 ntTSL 5 BASIC19.5■□□□□ 0.71
ZNF548Q8NEK5 FBXW7-202ENST00000281708 4976 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
ZNF548Q8NEK5 AC110769.1-201ENST00000420161 815 ntTSL 3 BASIC19.5■□□□□ 0.71
ZNF548Q8NEK5 MRPL36-202ENST00000505059 610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
ZNF548Q8NEK5 CDC42EP2-202ENST00000533419 1279 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.5■□□□□ 0.71
ZNF548Q8NEK5 AC009093.4-201ENST00000567984 561 ntTSL 4 BASIC19.5■□□□□ 0.71
ZNF548Q8NEK5 AC073195.1-201ENST00000607241 877 ntBASIC19.5■□□□□ 0.71
ZNF548Q8NEK5 MZF1-203ENST00000594234 2385 ntTSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
ZNF548Q8NEK5 NTMT1-210ENST00000613644 1501 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.5■□□□□ 0.71
ZNF548Q8NEK5 CD8B-203ENST00000390655 1417 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
ZNF548Q8NEK5 FP700111.2-201ENST00000619190 1892 ntBASIC19.5■□□□□ 0.71
ZNF548Q8NEK5 ETFA-202ENST00000433983 1346 ntTSL 2 BASIC19.5■□□□□ 0.71
ZNF548Q8NEK5 DISC1-215ENST00000602281 2761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
ZNF548Q8NEK5 GRB14-201ENST00000263915 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
ZNF548Q8NEK5 ZNF771-201ENST00000319296 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
ZNF548Q8NEK5 NRP2-206ENST00000417189 2386 ntTSL 2 BASIC19.49■□□□□ 0.71
ZNF548Q8NEK5 REV1-201ENST00000258428 4751 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
ZNF548Q8NEK5 PHF20L1-214ENST00000485595 1810 ntTSL 2 BASIC19.49■□□□□ 0.71
ZNF548Q8NEK5 INPP1-202ENST00000392329 2162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.49■□□□□ 0.71
ZNF548Q8NEK5 ODF3L2-202ENST00000382696 1393 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
ZNF548Q8NEK5 TSEN15-203ENST00000423085 1743 ntTSL 2 BASIC19.49■□□□□ 0.71
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