Protein–RNA interactions for Protein: Q8IZU3

SYCP3, Synaptonemal complex protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 236 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SYCP3Q8IZU3 SERF1A-201ENST00000317633 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
SYCP3Q8IZU3 AC079145.1-201ENST00000416575 541 ntTSL 2 BASIC21.65■■□□□ 1.06
SYCP3Q8IZU3 POU5F1P3-201ENST00000428824 1078 ntBASIC21.65■■□□□ 1.06
SYCP3Q8IZU3 TTTY14-205ENST00000454875 544 ntTSL 2 BASIC21.65■■□□□ 1.06
SYCP3Q8IZU3 ZNF529-AS1-202ENST00000475219 1033 ntTSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
SYCP3Q8IZU3 MAZ-215ENST00000569978 567 ntTSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
SYCP3Q8IZU3 AC006058.3-201ENST00000606217 1069 ntBASIC21.65■■□□□ 1.06
SYCP3Q8IZU3 ADD3-AS1-204ENST00000627565 388 ntTSL 3 BASIC21.65■■□□□ 1.06
SYCP3Q8IZU3 CCDC71-201ENST00000321895 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
SYCP3Q8IZU3 GALNT16-204ENST00000553669 1629 ntTSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
SYCP3Q8IZU3 NKX1-2-201ENST00000451024 3364 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.65■■□□□ 1.06
SYCP3Q8IZU3 RARA-201ENST00000254066 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
SYCP3Q8IZU3 DALRD3-201ENST00000313778 1968 ntTSL 2 BASIC21.65■■□□□ 1.06
SYCP3Q8IZU3 GABRD-201ENST00000378585 1961 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
SYCP3Q8IZU3 BSCL2-207ENST00000407022 1516 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
SYCP3Q8IZU3 TH-206ENST00000381178 1910 ntTSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
SYCP3Q8IZU3 ZNRF3-203ENST00000544604 6851 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
SYCP3Q8IZU3 CACTIN-202ENST00000248420 2671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.64■■□□□ 1.06
SYCP3Q8IZU3 KCNC2-204ENST00000540018 2168 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.64■■□□□ 1.06
SYCP3Q8IZU3 TBX6-201ENST00000279386 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
SYCP3Q8IZU3 TBX6-205ENST00000627355 1796 ntTSL 5 BASIC21.64■■□□□ 1.06
SYCP3Q8IZU3 HNRNPA3-204ENST00000435711 1731 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
SYCP3Q8IZU3 PAIP1-203ENST00000436644 1734 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
SYCP3Q8IZU3 STK16-201ENST00000396738 1673 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.64■■□□□ 1.05
SYCP3Q8IZU3 CHP2-201ENST00000300113 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
SYCP3Q8IZU3 AGTR1-209ENST00000497524 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
SYCP3Q8IZU3 MAL-201ENST00000309988 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
SYCP3Q8IZU3 NUDT8-202ENST00000376693 728 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.64■■□□□ 1.05
SYCP3Q8IZU3 TSPY20P-201ENST00000450910 630 ntBASIC21.64■■□□□ 1.05
SYCP3Q8IZU3 FAM201B-201ENST00000458407 597 ntBASIC21.64■■□□□ 1.05
SYCP3Q8IZU3 AC026427.1-201ENST00000508993 555 ntTSL 3 BASIC21.64■■□□□ 1.05
SYCP3Q8IZU3 ADM-205ENST00000528544 586 ntTSL 2 BASIC21.64■■□□□ 1.05
SYCP3Q8IZU3 PRKY-204ENST00000533551 1019 ntBASIC21.64■■□□□ 1.05
SYCP3Q8IZU3 NDOR1-204ENST00000458322 1829 ntTSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
SYCP3Q8IZU3 ZNF771-202ENST00000434417 1454 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.64■■□□□ 1.05
SYCP3Q8IZU3 DUT-201ENST00000331200 2147 ntTSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
SYCP3Q8IZU3 PPFIA1-201ENST00000253925 5234 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
SYCP3Q8IZU3 ANXA2-201ENST00000332680 1444 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
SYCP3Q8IZU3 SSH1-209ENST00000551165 2354 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
SYCP3Q8IZU3 TPPP3-204ENST00000562206 1410 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.63■■□□□ 1.05
SYCP3Q8IZU3 GPS2-201ENST00000380728 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
SYCP3Q8IZU3 PFKFB3-217ENST00000626882 1965 ntTSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
SYCP3Q8IZU3 LAYN-203ENST00000436913 2590 ntTSL 2 BASIC21.63■■□□□ 1.05
SYCP3Q8IZU3 RAB5C-202ENST00000393860 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
SYCP3Q8IZU3 CCDC91-207ENST00000539107 2440 ntTSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
SYCP3Q8IZU3 ROR1-201ENST00000371079 5832 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
SYCP3Q8IZU3 MBD3-201ENST00000156825 5518 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
SYCP3Q8IZU3 POMC-201ENST00000264708 1074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.63■■□□□ 1.05
SYCP3Q8IZU3 PARL-201ENST00000311101 1240 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
SYCP3Q8IZU3 CCDC107-206ENST00000426546 1242 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
SYCP3Q8IZU3 LINC00708-201ENST00000428165 916 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
SYCP3Q8IZU3 LINC00969-218ENST00000452844 583 ntTSL 3 BASIC21.63■■□□□ 1.05
SYCP3Q8IZU3 LINC00969-221ENST00000457233 1279 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
SYCP3Q8IZU3 LEF1-AS1-203ENST00000507799 459 ntTSL 3 BASIC21.63■■□□□ 1.05
SYCP3Q8IZU3 MIR381HG-201ENST00000553692 425 ntTSL 3 BASIC21.63■■□□□ 1.05
SYCP3Q8IZU3 AC022167.3-201ENST00000564485 427 ntTSL 2 BASIC21.63■■□□□ 1.05
SYCP3Q8IZU3 DCTPP1-205ENST00000568973 878 ntTSL 2 BASIC21.63■■□□□ 1.05
SYCP3Q8IZU3 LINC00654-202ENST00000589201 579 ntTSL 3 BASIC21.63■■□□□ 1.05
SYCP3Q8IZU3 AC069544.1-201ENST00000609399 999 ntBASIC21.63■■□□□ 1.05
SYCP3Q8IZU3 IL15RA-222ENST00000622442 1160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
SYCP3Q8IZU3 WIPF2-202ENST00000394103 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
SYCP3Q8IZU3 SLC16A5-202ENST00000450736 2051 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
SYCP3Q8IZU3 DLG3-202ENST00000374355 5074 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
SYCP3Q8IZU3 MOGS-201ENST00000233616 2895 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
SYCP3Q8IZU3 ARHGAP22-204ENST00000417247 2340 ntTSL 2 BASIC21.63■■□□□ 1.05
SYCP3Q8IZU3 SSBP2-218ENST00000514493 1790 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
SYCP3Q8IZU3 APTR-204ENST00000440088 2029 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
SYCP3Q8IZU3 PML-204ENST00000359928 1726 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
SYCP3Q8IZU3 ZNF692-202ENST00000366471 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
SYCP3Q8IZU3 FAM57B-204ENST00000564806 1710 ntTSL 2 BASIC21.63■■□□□ 1.05
SYCP3Q8IZU3 AC107959.1-202ENST00000502083 1945 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
SYCP3Q8IZU3 RIMBP3C-201ENST00000331505 5475 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.62■■□□□ 1.05
SYCP3Q8IZU3 PSMD8-201ENST00000215071 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
SYCP3Q8IZU3 CDKN2B-AS1-217ENST00000585267 1337 ntTSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
SYCP3Q8IZU3 PLSCR3-212ENST00000576201 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
SYCP3Q8IZU3 TRA2B-203ENST00000382191 976 ntTSL 2 BASIC21.62■■□□□ 1.05
SYCP3Q8IZU3 CENPS-CORT-202ENST00000465026 494 ntTSL 3 BASIC21.62■■□□□ 1.05
SYCP3Q8IZU3 CENPS-CORT-203ENST00000470413 626 ntTSL 2 BASIC21.62■■□□□ 1.05
SYCP3Q8IZU3 CRIP2-202ENST00000483017 1176 ntTSL 2 BASIC21.62■■□□□ 1.05
SYCP3Q8IZU3 CMTM3-207ENST00000564060 824 ntTSL 2 BASIC21.62■■□□□ 1.05
SYCP3Q8IZU3 CMTM3-211ENST00000565922 615 ntTSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
SYCP3Q8IZU3 AC233263.1-201ENST00000578059 224 ntBASIC21.62■■□□□ 1.05
SYCP3Q8IZU3 TMEM230-207ENST00000379286 1735 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.62■■□□□ 1.05
SYCP3Q8IZU3 EPS8L1-203ENST00000540810 2360 ntTSL 2 BASIC21.62■■□□□ 1.05
SYCP3Q8IZU3 TINCR-201ENST00000448587 3733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
SYCP3Q8IZU3 RUNX3-202ENST00000338888 2629 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
SYCP3Q8IZU3 SUSD1-202ENST00000374263 2973 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.61■■□□□ 1.05
SYCP3Q8IZU3 LRRC4B-201ENST00000389201 2958 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.61■■□□□ 1.05
SYCP3Q8IZU3 ALKBH6-213ENST00000486389 1525 ntTSL 3 BASIC21.61■■□□□ 1.05
SYCP3Q8IZU3 AP006587.1-201ENST00000534129 1502 ntBASIC21.61■■□□□ 1.05
SYCP3Q8IZU3 NTMT1-210ENST00000613644 1501 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.61■■□□□ 1.05
SYCP3Q8IZU3 NRXN1-226ENST00000626899 2543 ntTSL 2 BASIC21.61■■□□□ 1.05
SYCP3Q8IZU3 DVL3-203ENST00000431765 2294 ntTSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
SYCP3Q8IZU3 KLHDC4-201ENST00000270583 1886 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
SYCP3Q8IZU3 P2RY6-210ENST00000542092 1674 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.61■■□□□ 1.05
SYCP3Q8IZU3 OLFM1-202ENST00000277415 1014 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
SYCP3Q8IZU3 C15orf48-201ENST00000344300 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
SYCP3Q8IZU3 FKBP2-202ENST00000394540 1002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
SYCP3Q8IZU3 AC096537.1-201ENST00000437416 684 ntTSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
SYCP3Q8IZU3 AC007161.3-201ENST00000469183 637 ntTSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16.7 ms