Protein–RNA interactions for Protein: Q86V59

PNMA8A, Paraneoplastic antigen-like protein 8A, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 439 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PNMA8AQ86V59 C22orf39-205ENST00000542103 1523 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
PNMA8AQ86V59 CXCR3-202ENST00000373693 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
PNMA8AQ86V59 C14orf79-207ENST00000550614 1912 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
PNMA8AQ86V59 NR0B1-202ENST00000378970 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
PNMA8AQ86V59 HTRA2-201ENST00000258080 2370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
PNMA8AQ86V59 PDE5A-201ENST00000264805 3020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
PNMA8AQ86V59 SNAPC2-201ENST00000221573 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
PNMA8AQ86V59 IGLL1-201ENST00000249053 716 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
PNMA8AQ86V59 C17orf58-201ENST00000334461 1535 ntTSL 2 BASIC23.46■■□□□ 1.35
PNMA8AQ86V59 ZCCHC24-201ENST00000372333 906 ntTSL 2 BASIC23.46■■□□□ 1.35
PNMA8AQ86V59 TNNT3-206ENST00000381579 1042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
PNMA8AQ86V59 AL445685.1-201ENST00000425802 762 ntTSL 3 BASIC23.46■■□□□ 1.35
PNMA8AQ86V59 TSPY21P-201ENST00000433481 731 ntBASIC23.46■■□□□ 1.35
PNMA8AQ86V59 PVRIG2P-201ENST00000435460 978 ntBASIC23.46■■□□□ 1.35
PNMA8AQ86V59 CR769775.1-204ENST00000439760 747 ntTSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
PNMA8AQ86V59 TSPY23P-201ENST00000440136 739 ntBASIC23.46■■□□□ 1.35
PNMA8AQ86V59 LY6E-203ENST00000517503 1335 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.46■■□□□ 1.35
PNMA8AQ86V59 AC008738.3-201ENST00000589932 659 ntTSL 2 BASIC23.46■■□□□ 1.35
PNMA8AQ86V59 SMN2-213ENST00000614240 804 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
PNMA8AQ86V59 DONSON-210ENST00000453626 2332 ntTSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.35
PNMA8AQ86V59 TLX2-201ENST00000233638 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.35
PNMA8AQ86V59 ENPP7-201ENST00000328313 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.35
PNMA8AQ86V59 HOXB6-201ENST00000225648 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
PNMA8AQ86V59 TGFBR1-202ENST00000374994 6516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
PNMA8AQ86V59 ALDH3B1-206ENST00000615463 1300 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
PNMA8AQ86V59 AC019068.1-202ENST00000483218 768 ntTSL 3 BASIC23.45■■□□□ 1.34
PNMA8AQ86V59 AC008771.1-201ENST00000508000 1151 ntTSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
PNMA8AQ86V59 CMTM3-210ENST00000565666 769 ntTSL 3 BASIC23.45■■□□□ 1.34
PNMA8AQ86V59 PRR29-207ENST00000580752 458 ntTSL 3 BASIC23.45■■□□□ 1.34
PNMA8AQ86V59 AC006504.5-207ENST00000586220 487 ntTSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
PNMA8AQ86V59 SLF2-205ENST00000609386 891 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
PNMA8AQ86V59 AC083849.1-201ENST00000615227 514 ntBASIC23.45■■□□□ 1.34
PNMA8AQ86V59 CR769767.2-201ENST00000622735 460 ntBASIC23.45■■□□□ 1.34
PNMA8AQ86V59 STEAP2-204ENST00000394626 2456 ntTSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
PNMA8AQ86V59 SLC35D3-201ENST00000331858 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
PNMA8AQ86V59 ARHGEF9-204ENST00000374878 2217 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
PNMA8AQ86V59 WDSUB1-203ENST00000392796 1812 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
PNMA8AQ86V59 ZNF282-203ENST00000479907 1815 ntTSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
PNMA8AQ86V59 PTGER3-212ENST00000628037 1815 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
PNMA8AQ86V59 GRM6-202ENST00000517717 2673 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
PNMA8AQ86V59 FAM228A-201ENST00000295150 1774 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
PNMA8AQ86V59 ERLEC1-203ENST00000405123 1756 ntTSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
PNMA8AQ86V59 ZNF821-211ENST00000564134 1748 ntTSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
PNMA8AQ86V59 WHAMM-201ENST00000286760 5101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
PNMA8AQ86V59 KCNIP4-206ENST00000447367 1641 ntTSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
PNMA8AQ86V59 FAM171A2-201ENST00000293443 3160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
PNMA8AQ86V59 TERF2IP-201ENST00000300086 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
PNMA8AQ86V59 KCNQ5-213ENST00000629977 2830 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
PNMA8AQ86V59 EDEM1-204ENST00000445686 1363 ntTSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
PNMA8AQ86V59 IER5L-201ENST00000372491 2711 ntAPPRIS P1 BASIC23.44■■□□□ 1.34
PNMA8AQ86V59 NTMT1-211ENST00000617943 1346 ntTSL 3 BASIC23.44■■□□□ 1.34
PNMA8AQ86V59 DGKQ-201ENST00000273814 4636 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
PNMA8AQ86V59 ITGB1BP1-202ENST00000355346 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
PNMA8AQ86V59 RABAC1-201ENST00000222008 821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
PNMA8AQ86V59 NDUFS7-201ENST00000233627 1039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
PNMA8AQ86V59 FAM187B-201ENST00000324675 1184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
PNMA8AQ86V59 KRTCAP3-202ENST00000407293 942 ntTSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
PNMA8AQ86V59 DERL1-203ENST00000419562 918 ntTSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
PNMA8AQ86V59 ST6GALNAC4P1-201ENST00000435385 499 ntBASIC23.44■■□□□ 1.34
PNMA8AQ86V59 ZNF554-204ENST00000591265 1148 ntTSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
PNMA8AQ86V59 DFFB-212ENST00000625756 649 ntTSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
PNMA8AQ86V59 FAM3A-202ENST00000359889 1712 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
PNMA8AQ86V59 ST8SIA6-201ENST00000377602 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
PNMA8AQ86V59 PSMD7-201ENST00000219313 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
PNMA8AQ86V59 TPRN-202ENST00000409012 2718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
PNMA8AQ86V59 ZSCAN18-217ENST00000601144 2190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
PNMA8AQ86V59 ODC1-201ENST00000234111 2653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
PNMA8AQ86V59 TMEM11-201ENST00000317635 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
PNMA8AQ86V59 ACTR8-202ENST00000482349 2091 ntTSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
PNMA8AQ86V59 C1QL3-201ENST00000298943 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
PNMA8AQ86V59 ME2-208ENST00000638937 2471 ntTSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
PNMA8AQ86V59 ASB6-201ENST00000277458 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
PNMA8AQ86V59 LGALS9C-209ENST00000581545 1378 ntTSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
PNMA8AQ86V59 RAB28-202ENST00000330852 1715 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
PNMA8AQ86V59 AC004870.1-201ENST00000315132 882 ntBASIC23.43■■□□□ 1.34
PNMA8AQ86V59 MRPS15-201ENST00000373116 1006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
PNMA8AQ86V59 C21orf91-202ENST00000400558 1090 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
PNMA8AQ86V59 PRELID1P1-202ENST00000567272 903 ntBASIC23.43■■□□□ 1.34
PNMA8AQ86V59 C1QTNF1-205ENST00000578229 1294 ntTSL 4 BASIC23.43■■□□□ 1.34
PNMA8AQ86V59 MIR3652-201ENST00000579335 131 ntBASIC23.43■■□□□ 1.34
PNMA8AQ86V59 CDK2AP1-207ENST00000618072 1144 ntTSL 3 BASIC23.43■■□□□ 1.34
PNMA8AQ86V59 HAS1-201ENST00000222115 2087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
PNMA8AQ86V59 SHMT1-201ENST00000316694 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
PNMA8AQ86V59 TRIM3-201ENST00000345851 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
PNMA8AQ86V59 APBB1-210ENST00000530885 1626 ntTSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
PNMA8AQ86V59 MAGI2-202ENST00000419488 6800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
PNMA8AQ86V59 PNKP-224ENST00000631020 1545 ntTSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
PNMA8AQ86V59 PNMA6A-201ENST00000421798 2209 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
PNMA8AQ86V59 AC018553.1-201ENST00000616682 1458 ntBASIC23.43■■□□□ 1.34
PNMA8AQ86V59 GRTP1-202ENST00000375430 1834 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
PNMA8AQ86V59 MAGED2-206ENST00000375068 2189 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
PNMA8AQ86V59 GMDS-208ENST00000530927 1440 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
PNMA8AQ86V59 H19-201ENST00000411754 1788 ntTSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
PNMA8AQ86V59 METTL5-207ENST00000410097 1370 ntTSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
PNMA8AQ86V59 DOHH-201ENST00000427575 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
PNMA8AQ86V59 SMN1-209ENST00000514951 1308 ntTSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
PNMA8AQ86V59 PSIP1-201ENST00000380715 1966 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
PNMA8AQ86V59 BIRC2-206ENST00000530675 1927 ntTSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
PNMA8AQ86V59 PSMA7-203ENST00000370873 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
PNMA8AQ86V59 AP000347.1-202ENST00000435868 847 ntBASIC23.42■■□□□ 1.34
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.5 ms