Protein–RNA interactions for Protein: Q6IBW4

NCAPH2, Condensin-2 complex subunit H2, humanhuman

Predictions only

Length 605 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NCAPH2Q6IBW4 TUBA4A-202ENST00000392088 2499 ntTSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
NCAPH2Q6IBW4 TRIM58-201ENST00000366481 3225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
NCAPH2Q6IBW4 RAC1-202ENST00000356142 907 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
NCAPH2Q6IBW4 IFI6-203ENST00000362020 828 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
NCAPH2Q6IBW4 SEC61A2-206ENST00000379051 707 ntTSL 3 BASIC22.19■■□□□ 1.14
NCAPH2Q6IBW4 ISG20-202ENST00000379224 540 ntTSL 3 BASIC22.19■■□□□ 1.14
NCAPH2Q6IBW4 NPY-202ENST00000405982 565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
NCAPH2Q6IBW4 GCSHP5-201ENST00000443090 522 ntBASIC22.19■■□□□ 1.14
NCAPH2Q6IBW4 LIME1-205ENST00000480139 819 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.19■■□□□ 1.14
NCAPH2Q6IBW4 SPINK2-202ENST00000504762 659 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
NCAPH2Q6IBW4 AC100835.1-201ENST00000565737 498 ntTSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
NCAPH2Q6IBW4 FXYD1-204ENST00000588081 645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
NCAPH2Q6IBW4 AC124016.1-201ENST00000609552 612 ntBASIC22.19■■□□□ 1.14
NCAPH2Q6IBW4 TMEM191B-203ENST00000613597 366 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
NCAPH2Q6IBW4 FAM197Y4-202ENST00000622692 608 ntBASIC22.19■■□□□ 1.14
NCAPH2Q6IBW4 SYT7-209ENST00000542836 1362 ntTSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
NCAPH2Q6IBW4 ALKBH6-213ENST00000486389 1525 ntTSL 3 BASIC22.19■■□□□ 1.14
NCAPH2Q6IBW4 PPM1D-204ENST00000629650 1525 ntTSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
NCAPH2Q6IBW4 SLC36A1-209ENST00000521925 1621 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
NCAPH2Q6IBW4 GALNT16-204ENST00000553669 1629 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
NCAPH2Q6IBW4 FUZ-201ENST00000313777 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
NCAPH2Q6IBW4 CLN8-208ENST00000635751 1807 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
NCAPH2Q6IBW4 ZSCAN1-201ENST00000282326 2054 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
NCAPH2Q6IBW4 ASB16-201ENST00000293414 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
NCAPH2Q6IBW4 LINC00304-201ENST00000321214 2243 ntTSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
NCAPH2Q6IBW4 AP003356.1-202ENST00000517910 2770 ntTSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
NCAPH2Q6IBW4 TRMT2A-201ENST00000252136 2964 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
NCAPH2Q6IBW4 UBE2K-201ENST00000261427 5245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
NCAPH2Q6IBW4 LONRF3-202ENST00000371628 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
NCAPH2Q6IBW4 JMJD4-202ENST00000438896 2502 ntTSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
NCAPH2Q6IBW4 GALNS-201ENST00000268695 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
NCAPH2Q6IBW4 GPR35-201ENST00000319838 2249 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
NCAPH2Q6IBW4 TOR1A-201ENST00000351698 2076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
NCAPH2Q6IBW4 LBX2-AS1-202ENST00000603175 2083 ntBASIC22.18■■□□□ 1.14
NCAPH2Q6IBW4 DTWD1-202ENST00000403028 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
NCAPH2Q6IBW4 C19orf84-202ENST00000574814 1318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
NCAPH2Q6IBW4 PEX7-202ENST00000367756 680 ntTSL 3 BASIC22.18■■□□□ 1.14
NCAPH2Q6IBW4 AC007161.3-201ENST00000469183 637 ntTSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
NCAPH2Q6IBW4 AC069185.1-201ENST00000531395 811 ntTSL 3 BASIC22.18■■□□□ 1.14
NCAPH2Q6IBW4 RNF121-214ENST00000533380 870 ntTSL 3 BASIC22.18■■□□□ 1.14
NCAPH2Q6IBW4 NOXO1-205ENST00000566005 1144 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
NCAPH2Q6IBW4 AC007493.2-201ENST00000568427 478 ntTSL 3 BASIC22.18■■□□□ 1.14
NCAPH2Q6IBW4 AC007786.1-201ENST00000587859 709 ntTSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
NCAPH2Q6IBW4 FBXO17-202ENST00000595329 1299 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
NCAPH2Q6IBW4 ZNF510-203ENST00000375231 5616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
NCAPH2Q6IBW4 ZBTB7A-201ENST00000322357 5422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
NCAPH2Q6IBW4 NGEF-202ENST00000373552 2286 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
NCAPH2Q6IBW4 C17orf62-204ENST00000437807 2242 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
NCAPH2Q6IBW4 TMEM79-201ENST00000295694 2191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
NCAPH2Q6IBW4 CRMP1-201ENST00000324989 3146 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
NCAPH2Q6IBW4 TBX6-201ENST00000279386 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
NCAPH2Q6IBW4 RBM45-207ENST00000616198 1788 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
NCAPH2Q6IBW4 TBX6-205ENST00000627355 1796 ntTSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
NCAPH2Q6IBW4 DISC1-204ENST00000366633 2676 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
NCAPH2Q6IBW4 DISC1-214ENST00000539444 2658 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
NCAPH2Q6IBW4 ILDR2-207ENST00000529071 2566 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
NCAPH2Q6IBW4 SOX2-201ENST00000325404 2513 ntAPPRIS P1 BASIC22.17■■□□□ 1.14
NCAPH2Q6IBW4 AGER-207ENST00000375076 1492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
NCAPH2Q6IBW4 WNT7B-204ENST00000410089 2202 ntTSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
NCAPH2Q6IBW4 HIST1H2AM-201ENST00000359611 393 ntAPPRIS P1 BASIC22.17■■□□□ 1.14
NCAPH2Q6IBW4 TREX2-204ENST00000370212 861 ntTSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
NCAPH2Q6IBW4 TREX2-205ENST00000370231 1255 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
NCAPH2Q6IBW4 TREX2-207ENST00000393862 907 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
NCAPH2Q6IBW4 CORO1B-210ENST00000627576 960 ntTSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
NCAPH2Q6IBW4 KLF16-201ENST00000250916 2890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
NCAPH2Q6IBW4 KLF2-201ENST00000248071 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
NCAPH2Q6IBW4 PLBD1-201ENST00000240617 2426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
NCAPH2Q6IBW4 SMTN-204ENST00000404574 1735 ntTSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
NCAPH2Q6IBW4 GRB14-201ENST00000263915 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
NCAPH2Q6IBW4 CNEP1R1-203ENST00000458059 2965 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
NCAPH2Q6IBW4 CXCL16-201ENST00000293778 2222 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
NCAPH2Q6IBW4 CSPG5-201ENST00000264723 4080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
NCAPH2Q6IBW4 AP006587.1-201ENST00000534129 1502 ntBASIC22.16■■□□□ 1.14
NCAPH2Q6IBW4 RABEPK-204ENST00000394125 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
NCAPH2Q6IBW4 NBPF21P-201ENST00000425093 1451 ntBASIC22.16■■□□□ 1.14
NCAPH2Q6IBW4 EYA2-210ENST00000611592 2612 ntTSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
NCAPH2Q6IBW4 BYSL-201ENST00000230340 2029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
NCAPH2Q6IBW4 RAB11FIP4-201ENST00000394744 1968 ntTSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
NCAPH2Q6IBW4 TMEM109-202ENST00000536171 1959 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
NCAPH2Q6IBW4 MTFP1-202ENST00000355143 891 ntTSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
NCAPH2Q6IBW4 ZNF436-AS1-202ENST00000437367 606 ntTSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
NCAPH2Q6IBW4 LINC00894-209ENST00000458274 547 ntTSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
NCAPH2Q6IBW4 F2R-202ENST00000505600 442 ntTSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
NCAPH2Q6IBW4 OPA3-203ENST00000544371 1146 ntTSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
NCAPH2Q6IBW4 OVCH1-AS1-203ENST00000551108 963 ntTSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
NCAPH2Q6IBW4 CDK13-207ENST00000613626 3099 ntTSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
NCAPH2Q6IBW4 SAXO1-202ENST00000380534 2099 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
NCAPH2Q6IBW4 SLC25A15-201ENST00000338625 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
NCAPH2Q6IBW4 DALRD3-205ENST00000440857 2014 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
NCAPH2Q6IBW4 YTHDF3-213ENST00000621820 2363 ntTSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
NCAPH2Q6IBW4 EMC8-202ENST00000435200 1935 ntTSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
NCAPH2Q6IBW4 Z83844.2-201ENST00000456099 1945 ntTSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
NCAPH2Q6IBW4 HMOX2-218ENST00000619913 1908 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
NCAPH2Q6IBW4 HOXC13-AS-201ENST00000512916 1408 ntTSL 3 BASIC22.15■■□□□ 1.14
NCAPH2Q6IBW4 MAP3K21-203ENST00000366624 5809 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
NCAPH2Q6IBW4 DNAJC1-202ENST00000376980 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
NCAPH2Q6IBW4 WIPI2-203ENST00000401525 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
NCAPH2Q6IBW4 GTPBP3-222ENST00000600625 2493 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
NCAPH2Q6IBW4 PIGQ-206ENST00000422307 2052 ntTSL 3 BASIC22.15■■□□□ 1.14
NCAPH2Q6IBW4 LRRC42-203ENST00000371370 2037 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.8 ms