Protein–RNA interactions for Protein: Q5T2N8

ATAD3C, ATPase family AAA domain-containing protein 3C, humanhuman

Predictions only

Length 411 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATAD3CQ5T2N8 LBX2-203ENST00000460508 1452 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
ATAD3CQ5T2N8 RNF144A-201ENST00000320892 5743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
ATAD3CQ5T2N8 SLC38A7-205ENST00000564010 1437 ntTSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
ATAD3CQ5T2N8 ZNF346-201ENST00000358149 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
ATAD3CQ5T2N8 SYNM-202ENST00000336292 7394 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
ATAD3CQ5T2N8 HCK-203ENST00000375862 1806 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
ATAD3CQ5T2N8 ZNF282-203ENST00000479907 1815 ntTSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
ATAD3CQ5T2N8 OTUB1-209ENST00000538426 1729 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
ATAD3CQ5T2N8 DOK7-201ENST00000340083 2562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
ATAD3CQ5T2N8 DOK7-203ENST00000507039 2551 ntTSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
ATAD3CQ5T2N8 NDUFS3-201ENST00000263774 958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
ATAD3CQ5T2N8 CLPSL2-201ENST00000360454 488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
ATAD3CQ5T2N8 BCAP29-209ENST00000465919 942 ntTSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
ATAD3CQ5T2N8 YJEFN3-203ENST00000514277 995 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
ATAD3CQ5T2N8 CDKN2A-210ENST00000530628 748 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
ATAD3CQ5T2N8 AC011511.3-201ENST00000587088 355 ntTSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
ATAD3CQ5T2N8 TBC1D4-204ENST00000431480 6347 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
ATAD3CQ5T2N8 AC092720.2-201ENST00000602388 1665 ntBASIC17.31■□□□□ 0.36
ATAD3CQ5T2N8 HAUS4-205ENST00000541587 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
ATAD3CQ5T2N8 PNKP-214ENST00000600573 1602 ntTSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
ATAD3CQ5T2N8 SLC16A3-222ENST00000619321 2015 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
ATAD3CQ5T2N8 SLCO6A1-201ENST00000379807 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
ATAD3CQ5T2N8 RNF166-203ENST00000541206 2419 ntTSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
ATAD3CQ5T2N8 PTPA-201ENST00000337738 2845 ntTSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
ATAD3CQ5T2N8 CRHR1-214ENST00000619154 2370 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
ATAD3CQ5T2N8 LINC00605-201ENST00000514902 1558 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
ATAD3CQ5T2N8 MCUR1-201ENST00000379170 5471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
ATAD3CQ5T2N8 ECE1-205ENST00000436918 2328 ntTSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
ATAD3CQ5T2N8 ZNF133-210ENST00000535822 2341 ntTSL 3 BASIC17.31■□□□□ 0.36
ATAD3CQ5T2N8 OGG1-217ENST00000449570 1948 ntTSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
ATAD3CQ5T2N8 SEPT2-245ENST00000616972 3446 ntTSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
ATAD3CQ5T2N8 PALM3-201ENST00000340790 2262 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
ATAD3CQ5T2N8 PRKAR1B-204ENST00000406797 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
ATAD3CQ5T2N8 PKMYT1-216ENST00000574730 1806 ntTSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
ATAD3CQ5T2N8 NRBP1-203ENST00000379852 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
ATAD3CQ5T2N8 SCOC-208ENST00000510586 2193 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
ATAD3CQ5T2N8 SMARCC2-203ENST00000394023 4271 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
ATAD3CQ5T2N8 BRAF-201ENST00000288602 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
ATAD3CQ5T2N8 AC099398.1-201ENST00000567919 2776 ntBASIC17.3■□□□□ 0.36
ATAD3CQ5T2N8 CERKL-204ENST00000374970 1392 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
ATAD3CQ5T2N8 WASF1-202ENST00000359451 3075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
ATAD3CQ5T2N8 GOLGA6L2-204ENST00000567107 3030 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
ATAD3CQ5T2N8 SEC11A-201ENST00000268220 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
ATAD3CQ5T2N8 KCTD20-210ENST00000536244 5345 ntTSL 2 BASIC17.3■□□□□ 0.36
ATAD3CQ5T2N8 HNF1A-202ENST00000400024 2337 ntTSL 2 BASIC17.3■□□□□ 0.36
ATAD3CQ5T2N8 SHISA4-201ENST00000362011 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
ATAD3CQ5T2N8 JAKMIP1-202ENST00000409021 2975 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
ATAD3CQ5T2N8 CHD1L-204ENST00000431239 2907 ntTSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
ATAD3CQ5T2N8 PRKAR2A-201ENST00000265563 6471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
ATAD3CQ5T2N8 ZNF302-201ENST00000423823 2590 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
ATAD3CQ5T2N8 AC093627.4-202ENST00000479592 591 ntTSL 4 BASIC17.3■□□□□ 0.36
ATAD3CQ5T2N8 CDKN2A-205ENST00000479692 544 ntTSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
ATAD3CQ5T2N8 LRRC37A17P-202ENST00000570478 572 ntTSL 4 BASIC17.3■□□□□ 0.36
ATAD3CQ5T2N8 TNFRSF1A-201ENST00000162749 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
ATAD3CQ5T2N8 SDC2-202ENST00000518385 1583 ntTSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
ATAD3CQ5T2N8 AVPR1A-201ENST00000299178 5963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
ATAD3CQ5T2N8 ENOSF1-201ENST00000251101 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
ATAD3CQ5T2N8 PCSK7-201ENST00000320934 4649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
ATAD3CQ5T2N8 ZNF74-201ENST00000357502 2788 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
ATAD3CQ5T2N8 SMAGP-205ENST00000603864 1518 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.3■□□□□ 0.36
ATAD3CQ5T2N8 TPD52L1-201ENST00000304877 1468 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.3■□□□□ 0.36
ATAD3CQ5T2N8 GATA1-202ENST00000376670 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
ATAD3CQ5T2N8 CASTOR1-201ENST00000404953 1460 ntTSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
ATAD3CQ5T2N8 SETD3-202ENST00000331768 2878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
ATAD3CQ5T2N8 MPZ-206ENST00000533357 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
ATAD3CQ5T2N8 GRM5-201ENST00000305432 4475 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
ATAD3CQ5T2N8 CDH5-202ENST00000539168 1672 ntTSL 2 BASIC17.29■□□□□ 0.36
ATAD3CQ5T2N8 KDM1A-201ENST00000356634 3033 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
ATAD3CQ5T2N8 NOC2LP2-201ENST00000407594 1944 ntBASIC17.29■□□□□ 0.36
ATAD3CQ5T2N8 TRAF4-201ENST00000262395 2923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
ATAD3CQ5T2N8 MARK4-210ENST00000620044 2105 ntTSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
ATAD3CQ5T2N8 KLF1-201ENST00000264834 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
ATAD3CQ5T2N8 GRM2-204ENST00000442933 2064 ntTSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
ATAD3CQ5T2N8 RARRES2-201ENST00000223271 740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
ATAD3CQ5T2N8 RNF208-202ENST00000392827 1135 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
ATAD3CQ5T2N8 LINC01816-201ENST00000414141 662 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
ATAD3CQ5T2N8 HTATIP2-208ENST00000532505 595 ntTSL 2 BASIC17.29■□□□□ 0.36
ATAD3CQ5T2N8 TESC-206ENST00000541210 936 ntTSL 3 BASIC17.29■□□□□ 0.36
ATAD3CQ5T2N8 SLC7A5P2-201ENST00000553010 536 ntBASIC17.29■□□□□ 0.36
ATAD3CQ5T2N8 AP001160.3-201ENST00000601484 763 ntBASIC17.29■□□□□ 0.36
ATAD3CQ5T2N8 ANKRD6-202ENST00000369408 5258 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
ATAD3CQ5T2N8 GTF2H4-201ENST00000259895 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
ATAD3CQ5T2N8 ABHD12B-202ENST00000353130 1477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
ATAD3CQ5T2N8 THOP1-201ENST00000307741 4804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
ATAD3CQ5T2N8 COX20-203ENST00000411948 2631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
ATAD3CQ5T2N8 GALK1-201ENST00000225614 1445 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.29■□□□□ 0.36
ATAD3CQ5T2N8 HDAC1-201ENST00000373548 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
ATAD3CQ5T2N8 SEMA6B-201ENST00000586582 3986 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
ATAD3CQ5T2N8 MAEA-201ENST00000264750 2058 ntTSL 2 BASIC17.28■□□□□ 0.36
ATAD3CQ5T2N8 UBXN11-201ENST00000314675 2254 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.28■□□□□ 0.36
ATAD3CQ5T2N8 RTEL1-204ENST00000370003 2273 ntTSL 2 BASIC17.28■□□□□ 0.36
ATAD3CQ5T2N8 FAM57A-201ENST00000301324 2013 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
ATAD3CQ5T2N8 DAG1-219ENST00000538711 5582 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
ATAD3CQ5T2N8 COQ10B-201ENST00000263960 2239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
ATAD3CQ5T2N8 AC116050.2-201ENST00000612102 1779 ntBASIC17.28■□□□□ 0.36
ATAD3CQ5T2N8 PCDHB12-203ENST00000624949 1963 ntTSL 2 BASIC17.28■□□□□ 0.36
ATAD3CQ5T2N8 WNT5B-201ENST00000310594 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
ATAD3CQ5T2N8 ZNF394-201ENST00000337673 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
ATAD3CQ5T2N8 DCLK2-207ENST00000635524 2153 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
ATAD3CQ5T2N8 CDK5R1-201ENST00000313401 4325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23 ms