Protein–RNA interactions for Protein: Q52LD8

RFTN2, Raftlin-2, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 501 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RFTN2Q52LD8 ZNF554-201ENST00000317243 2736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
RFTN2Q52LD8 EIF3B-202ENST00000397011 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
RFTN2Q52LD8 FAM83E-201ENST00000263266 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
RFTN2Q52LD8 C11orf49-201ENST00000278460 1645 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
RFTN2Q52LD8 RAB28-201ENST00000288723 1810 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
RFTN2Q52LD8 LRCH4-201ENST00000310300 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
RFTN2Q52LD8 IL15RA-207ENST00000397250 584 ntTSL 2 BASIC18.87■□□□□ 0.61
RFTN2Q52LD8 ARHGDIA-202ENST00000400721 1568 ntTSL 2 BASIC18.87■□□□□ 0.61
RFTN2Q52LD8 CCDC103-202ENST00000410006 921 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.87■□□□□ 0.61
RFTN2Q52LD8 MELTF-AS1-202ENST00000415244 951 ntTSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
RFTN2Q52LD8 ATP6V0E2-203ENST00000456496 2722 ntTSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
RFTN2Q52LD8 ABHD14A-202ENST00000458031 1113 ntTSL 5 BASIC18.87■□□□□ 0.61
RFTN2Q52LD8 IL15RA-215ENST00000528354 1037 ntTSL 2 BASIC18.87■□□□□ 0.61
RFTN2Q52LD8 MCRIP1-203ENST00000538396 925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
RFTN2Q52LD8 KIF22-203ENST00000561482 2505 ntTSL 2 BASIC18.87■□□□□ 0.61
RFTN2Q52LD8 ATP6V0E2-213ENST00000615196 2727 ntTSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
RFTN2Q52LD8 CLDN5-204ENST00000618236 1374 ntAPPRIS P1 BASIC18.87■□□□□ 0.61
RFTN2Q52LD8 AL161421.1-201ENST00000619666 1101 ntTSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
RFTN2Q52LD8 AL050303.2-201ENST00000619798 666 ntBASIC18.87■□□□□ 0.61
RFTN2Q52LD8 IL15RA-220ENST00000620345 1115 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
RFTN2Q52LD8 MARS-234ENST00000630571 216 ntTSL 5 BASIC18.87■□□□□ 0.61
RFTN2Q52LD8 MARS-235ENST00000630803 183 ntTSL 3 BASIC18.87■□□□□ 0.61
RFTN2Q52LD8 SH2B1-202ENST00000337120 6043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
RFTN2Q52LD8 PIK3R1-201ENST00000320694 2625 ntTSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
RFTN2Q52LD8 PLPBP-201ENST00000328195 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
RFTN2Q52LD8 PTBP1-220ENST00000627714 2201 ntTSL 5 BASIC18.86■□□□□ 0.61
RFTN2Q52LD8 ANXA8L1-201ENST00000584982 2174 ntTSL 2 BASIC18.86■□□□□ 0.61
RFTN2Q52LD8 ALDOA-212ENST00000564546 2104 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
RFTN2Q52LD8 CAPZB-202ENST00000264203 2068 ntTSL 2 BASIC18.86■□□□□ 0.61
RFTN2Q52LD8 ARHGAP22-210ENST00000477708 1951 ntTSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
RFTN2Q52LD8 YAP1-201ENST00000282441 5386 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
RFTN2Q52LD8 SLC52A2-209ENST00000530047 1757 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.86■□□□□ 0.61
RFTN2Q52LD8 PPM1D-204ENST00000629650 1525 ntTSL 5 BASIC18.86■□□□□ 0.61
RFTN2Q52LD8 BZW1-209ENST00000452790 1473 ntTSL 2 BASIC18.86■□□□□ 0.61
RFTN2Q52LD8 RREB1-203ENST00000379933 5826 ntTSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
RFTN2Q52LD8 RAPSN-205ENST00000529341 1408 ntTSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
RFTN2Q52LD8 AC004408.2-201ENST00000623613 2777 ntBASIC18.86■□□□□ 0.61
RFTN2Q52LD8 ANKRD2-201ENST00000298808 1350 ntTSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
RFTN2Q52LD8 KSR1-205ENST00000509603 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.86■□□□□ 0.61
RFTN2Q52LD8 UCHL5-204ENST00000367451 1346 ntTSL 5 BASIC18.86■□□□□ 0.61
RFTN2Q52LD8 GAR1-201ENST00000226796 1224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
RFTN2Q52LD8 CDCA4P2-201ENST00000441182 718 ntBASIC18.86■□□□□ 0.61
RFTN2Q52LD8 ATP6V0E2-211ENST00000606024 893 ntTSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
RFTN2Q52LD8 METRN-204ENST00000568223 3325 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
RFTN2Q52LD8 PFKFB3-204ENST00000379785 2181 ntTSL 5 BASIC18.86■□□□□ 0.61
RFTN2Q52LD8 SLC34A3-202ENST00000538474 2162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.86■□□□□ 0.61
RFTN2Q52LD8 MAGED2-203ENST00000375053 2066 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
RFTN2Q52LD8 ARMC6-220ENST00000546344 1814 ntTSL 2 BASIC18.86■□□□□ 0.61
RFTN2Q52LD8 ENTPD6-201ENST00000354989 2708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
RFTN2Q52LD8 ZDHHC3-205ENST00000424952 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
RFTN2Q52LD8 SEPT7-206ENST00000435235 1584 ntTSL 2 BASIC18.85■□□□□ 0.61
RFTN2Q52LD8 TMEM53-202ENST00000372237 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
RFTN2Q52LD8 CASP6-201ENST00000265164 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
RFTN2Q52LD8 MKRN4P-201ENST00000444706 1521 ntBASIC18.85■□□□□ 0.61
RFTN2Q52LD8 SAMD11-211ENST00000616125 2230 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.85■□□□□ 0.61
RFTN2Q52LD8 AC018553.1-201ENST00000616682 1458 ntBASIC18.85■□□□□ 0.61
RFTN2Q52LD8 ZDHHC24-203ENST00000526986 1424 ntTSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
RFTN2Q52LD8 PLD4-204ENST00000540372 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.85■□□□□ 0.61
RFTN2Q52LD8 UBE2E3-201ENST00000392415 1347 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.85■□□□□ 0.61
RFTN2Q52LD8 TOM1L2-210ENST00000542206 1320 ntTSL 2 BASIC18.85■□□□□ 0.61
RFTN2Q52LD8 C3orf70-201ENST00000335012 5901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
RFTN2Q52LD8 BCL2L12-201ENST00000246784 990 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
RFTN2Q52LD8 STYXL1-204ENST00000360591 1127 ntTSL 5 BASIC18.85■□□□□ 0.61
RFTN2Q52LD8 SMNDC1-201ENST00000369592 1110 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.85■□□□□ 0.61
RFTN2Q52LD8 ZNF451-202ENST00000370702 458 ntTSL 2 BASIC18.85■□□□□ 0.61
RFTN2Q52LD8 ZNF467-202ENST00000484747 913 ntTSL 2 BASIC18.85■□□□□ 0.61
RFTN2Q52LD8 TPT1-AS1-210ENST00000520590 873 ntTSL 5 BASIC18.85■□□□□ 0.61
RFTN2Q52LD8 PHB2-213ENST00000546111 858 ntTSL 2 BASIC18.85■□□□□ 0.61
RFTN2Q52LD8 CAPNS1-205ENST00000588780 1035 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.85■□□□□ 0.61
RFTN2Q52LD8 AC012313.6-201ENST00000599889 790 ntTSL 3 BASIC18.85■□□□□ 0.61
RFTN2Q52LD8 FAM198A-202ENST00000430121 3121 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.85■□□□□ 0.61
RFTN2Q52LD8 EIF2B1-201ENST00000424014 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
RFTN2Q52LD8 MYH14-208ENST00000598205 6137 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.85■□□□□ 0.61
RFTN2Q52LD8 MUTYH-203ENST00000372098 1839 ntTSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
RFTN2Q52LD8 MUTYH-204ENST00000372104 1823 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
RFTN2Q52LD8 MUTYH-205ENST00000372110 1809 ntTSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
RFTN2Q52LD8 EVL-202ENST00000402714 2353 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
RFTN2Q52LD8 CERS5-203ENST00000422340 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.85■□□□□ 0.61
RFTN2Q52LD8 FAM131C-201ENST00000375662 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
RFTN2Q52LD8 AC013269.1-201ENST00000409259 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
RFTN2Q52LD8 TISP43-206ENST00000623376 1653 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
RFTN2Q52LD8 BSCL2-207ENST00000407022 1516 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
RFTN2Q52LD8 TM9SF1-203ENST00000524835 1938 ntTSL 2 BASIC18.84■□□□□ 0.61
RFTN2Q52LD8 ISLR2-202ENST00000419208 2306 ntTSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
RFTN2Q52LD8 NAGPA-AS1-202ENST00000632058 2265 ntTSL 2 BASIC18.84■□□□□ 0.61
RFTN2Q52LD8 SMIM4-203ENST00000477703 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
RFTN2Q52LD8 EEF1D-225ENST00000529272 1311 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.84■□□□□ 0.61
RFTN2Q52LD8 C20orf196-202ENST00000378979 585 ntTSL 2 BASIC18.84■□□□□ 0.61
RFTN2Q52LD8 WWTR1-AS1-203ENST00000495094 975 ntTSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
RFTN2Q52LD8 AF201337.1-201ENST00000520239 748 ntBASIC18.84■□□□□ 0.61
RFTN2Q52LD8 RPH3AL-203ENST00000536489 1235 ntTSL 2 BASIC18.84■□□□□ 0.61
RFTN2Q52LD8 C17orf49-202ENST00000546495 996 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.84■□□□□ 0.61
RFTN2Q52LD8 AC105036.2-201ENST00000569468 176 ntBASIC18.84■□□□□ 0.61
RFTN2Q52LD8 C2CD2-202ENST00000380486 6345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
RFTN2Q52LD8 MIXL1-201ENST00000366810 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
RFTN2Q52LD8 TMEM235-201ENST00000374946 2409 ntTSL 5 BASIC18.84■□□□□ 0.61
RFTN2Q52LD8 ZKSCAN7-205ENST00000426540 2791 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.84■□□□□ 0.61
RFTN2Q52LD8 MBD3-207ENST00000590550 2782 ntTSL 2 BASIC18.84■□□□□ 0.61
RFTN2Q52LD8 ACTL6A-201ENST00000392662 1899 ntTSL 2 BASIC18.84■□□□□ 0.61
RFTN2Q52LD8 PRDM11-201ENST00000424263 1858 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.84■□□□□ 0.61
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 52.6 ms