Protein–RNA interactions for Protein: Q15431

SYCP1, Synaptonemal complex protein 1, humanhuman

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Length 976 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SYCP1Q15431 ZDHHC2-201ENST00000262096 6377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
SYCP1Q15431 TNFRSF18-201ENST00000328596 851 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
SYCP1Q15431 HSCB-202ENST00000398941 955 ntTSL 2 BASIC21.77■■□□□ 1.08
SYCP1Q15431 GXYLT1P2-201ENST00000433312 1230 ntBASIC21.77■■□□□ 1.08
SYCP1Q15431 KRT18P5-201ENST00000436075 1291 ntBASIC21.77■■□□□ 1.08
SYCP1Q15431 AL845552.2-201ENST00000553301 553 ntTSL 4 BASIC21.77■■□□□ 1.08
SYCP1Q15431 SLC25A29-212ENST00000555927 960 ntTSL 2 BASIC21.77■■□□□ 1.08
SYCP1Q15431 AC007773.1-201ENST00000592680 972 ntTSL 2 BASIC21.77■■□□□ 1.08
SYCP1Q15431 GDF6-203ENST00000621429 1179 ntTSL 5 BASIC21.77■■□□□ 1.08
SYCP1Q15431 WWOX-218ENST00000627394 894 ntTSL 5 BASIC21.77■■□□□ 1.08
SYCP1Q15431 STMN3-202ENST00000540534 2351 ntTSL 2 BASIC21.77■■□□□ 1.08
SYCP1Q15431 KIAA1456-201ENST00000400069 1982 ntTSL 2 BASIC21.77■■□□□ 1.08
SYCP1Q15431 SLC5A10-205ENST00000417251 1984 ntTSL 2 BASIC21.77■■□□□ 1.08
SYCP1Q15431 PEX5L-206ENST00000465751 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.77■■□□□ 1.08
SYCP1Q15431 UAP1-204ENST00000367926 2294 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
SYCP1Q15431 TEAD2-202ENST00000377214 2440 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.77■■□□□ 1.08
SYCP1Q15431 TM9SF1-206ENST00000528669 2425 ntTSL 5 BASIC21.77■■□□□ 1.08
SYCP1Q15431 B3GALNT2-201ENST00000313984 1874 ntTSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
SYCP1Q15431 FHL1-219ENST00000618438 2178 ntTSL 3 BASIC21.77■■□□□ 1.07
SYCP1Q15431 BLOC1S3-201ENST00000433642 2601 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.76■■□□□ 1.07
SYCP1Q15431 RAB28-203ENST00000338176 1787 ntTSL 3 BASIC21.76■■□□□ 1.07
SYCP1Q15431 TREX1-205ENST00000625293 1783 ntBASIC21.76■■□□□ 1.07
SYCP1Q15431 RAB4A-205ENST00000618010 2799 ntTSL 3 BASIC21.76■■□□□ 1.07
SYCP1Q15431 KRT81-201ENST00000327741 1929 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
SYCP1Q15431 SSR1-204ENST00000474597 1808 ntTSL 5 BASIC21.76■■□□□ 1.07
SYCP1Q15431 WDR25-201ENST00000335290 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
SYCP1Q15431 CMIP-209ENST00000566513 2288 ntTSL 5 BASIC21.76■■□□□ 1.07
SYCP1Q15431 SPI1-201ENST00000227163 1168 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.76■■□□□ 1.07
SYCP1Q15431 NAP1L5-201ENST00000323061 2321 ntAPPRIS P1 BASIC21.76■■□□□ 1.07
SYCP1Q15431 MSANTD2-202ENST00000374979 2349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
SYCP1Q15431 FAM216A-201ENST00000377673 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
SYCP1Q15431 DNAJC27-AS1-204ENST00000428614 780 ntTSL 3 BASIC21.76■■□□□ 1.07
SYCP1Q15431 CNN2P6-201ENST00000439038 900 ntBASIC21.76■■□□□ 1.07
SYCP1Q15431 IDNK-204ENST00000454393 1210 ntTSL 3 BASIC21.76■■□□□ 1.07
SYCP1Q15431 CMTM8-202ENST00000458535 996 ntTSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
SYCP1Q15431 RARRES2P4-201ENST00000514074 484 ntBASIC21.76■■□□□ 1.07
SYCP1Q15431 DHRS4L2-204ENST00000537912 918 ntTSL 2 BASIC21.76■■□□□ 1.07
SYCP1Q15431 RAD23A-203ENST00000586534 1746 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
SYCP1Q15431 CLN3-240ENST00000631023 1586 ntTSL 5 BASIC21.76■■□□□ 1.07
SYCP1Q15431 KAZN-203ENST00000376030 6030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.76■■□□□ 1.07
SYCP1Q15431 ANTXR1-203ENST00000409829 2221 ntTSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
SYCP1Q15431 ICA1-206ENST00000402384 2458 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.75■■□□□ 1.07
SYCP1Q15431 FUZ-216ENST00000533418 1524 ntTSL 5 BASIC21.75■■□□□ 1.07
SYCP1Q15431 ZNF419-204ENST00000415379 2186 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.75■■□□□ 1.07
SYCP1Q15431 RELL2-202ENST00000444782 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
SYCP1Q15431 NECAB1-201ENST00000417640 5289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
SYCP1Q15431 MAFG-AS1-201ENST00000582106 1895 ntTSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
SYCP1Q15431 FOXN3-209ENST00000555353 1595 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
SYCP1Q15431 LDHD-201ENST00000300051 2067 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
SYCP1Q15431 EIF3J-201ENST00000261868 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
SYCP1Q15431 AC007613.1-201ENST00000572811 2597 ntBASIC21.75■■□□□ 1.07
SYCP1Q15431 CHTOP-201ENST00000368686 2250 ntTSL 2 BASIC21.75■■□□□ 1.07
SYCP1Q15431 MAPK8IP3-202ENST00000356010 4456 ntTSL 5 BASIC21.75■■□□□ 1.07
SYCP1Q15431 ZBTB46-203ENST00000395104 5198 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.75■■□□□ 1.07
SYCP1Q15431 RPLP0-201ENST00000228306 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
SYCP1Q15431 IL15RA-201ENST00000379971 588 ntTSL 3 BASIC21.75■■□□□ 1.07
SYCP1Q15431 UBXN2B-206ENST00000638450 591 ntTSL 5 BASIC21.75■■□□□ 1.07
SYCP1Q15431 AC093762.2-201ENST00000641700 291 ntAPPRIS P1 BASIC21.75■■□□□ 1.07
SYCP1Q15431 ACOT2-205ENST00000622407 1604 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
SYCP1Q15431 SLC2A11-204ENST00000398356 2388 ntTSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
SYCP1Q15431 CD55-203ENST00000367063 1691 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
SYCP1Q15431 FBXO41-205ENST00000521871 7336 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.75■■□□□ 1.07
SYCP1Q15431 SLC37A2-203ENST00000403796 2910 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.75■■□□□ 1.07
SYCP1Q15431 SEPHS1-206ENST00000545675 2988 ntTSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
SYCP1Q15431 FGF17-202ENST00000518533 1706 ntTSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
SYCP1Q15431 GAS2L1P2-201ENST00000436355 1356 ntBASIC21.74■■□□□ 1.07
SYCP1Q15431 EGLN2-201ENST00000303961 2102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
SYCP1Q15431 JAK2-201ENST00000381652 5285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
SYCP1Q15431 ZNF419-201ENST00000221735 2309 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
SYCP1Q15431 MIB2-231ENST00000518681 3116 ntTSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
SYCP1Q15431 ADAMTS19-201ENST00000274487 5234 ntTSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
SYCP1Q15431 C19orf67-203ENST00000548523 1427 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.74■■□□□ 1.07
SYCP1Q15431 SSH1-209ENST00000551165 2354 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
SYCP1Q15431 AC068338.2-201ENST00000563278 1430 ntBASIC21.74■■□□□ 1.07
SYCP1Q15431 AC008764.1-201ENST00000409035 2567 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.74■■□□□ 1.07
SYCP1Q15431 MZF1-206ENST00000599369 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
SYCP1Q15431 SLC35F3-201ENST00000366617 2762 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
SYCP1Q15431 MCRIP2P1-201ENST00000394346 511 ntBASIC21.74■■□□□ 1.07
SYCP1Q15431 LTB-211ENST00000446745 853 ntTSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
SYCP1Q15431 RPLP2-207ENST00000530797 637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
SYCP1Q15431 MMP25-AS1-204ENST00000572574 794 ntTSL 5 BASIC21.74■■□□□ 1.07
SYCP1Q15431 ZNF561-AS1-205ENST00000588765 579 ntTSL 4 BASIC21.74■■□□□ 1.07
SYCP1Q15431 CDK6-202ENST00000424848 1465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
SYCP1Q15431 LMAN1L-202ENST00000379709 1699 ntTSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
SYCP1Q15431 ZBTB48-202ENST00000377674 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
SYCP1Q15431 MAFF-206ENST00000538320 2458 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC21.74■■□□□ 1.07
SYCP1Q15431 PTPA-206ENST00000358994 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
SYCP1Q15431 MYO9A-214ENST00000566885 5111 ntTSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
SYCP1Q15431 RAB11FIP5-201ENST00000258098 4342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
SYCP1Q15431 FGFBP3-201ENST00000311575 2545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
SYCP1Q15431 CPSF3-201ENST00000238112 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
SYCP1Q15431 NECAB3-202ENST00000375238 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
SYCP1Q15431 PRKCI-201ENST00000295797 4950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
SYCP1Q15431 STEAP1-201ENST00000297205 1313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
SYCP1Q15431 AMIGO1-202ENST00000369864 5088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
SYCP1Q15431 KCNMA1-278ENST00000640141 5705 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.74■■□□□ 1.07
SYCP1Q15431 CHPF-203ENST00000535926 2634 ntTSL 2 BASIC21.74■■□□□ 1.07
SYCP1Q15431 SPHK2-213ENST00000601712 1394 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.74■■□□□ 1.07
SYCP1Q15431 PIGQ-206ENST00000422307 2052 ntTSL 3 BASIC21.73■■□□□ 1.07
SYCP1Q15431 TMC5-203ENST00000396229 4917 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.73■■□□□ 1.07
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