Protein–RNA interactions for Protein: Q15118

PDK1, [Pyruvate dehydrogenase (acetyl-transferring)] kinase isozyme 1, mitochondrial, humanhuman

Predictions only

Length 436 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PDK1Q15118 PQLC2-202ENST00000375155 1805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.18■□□□□ 0.82
PDK1Q15118 CA11-201ENST00000084798 1844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
PDK1Q15118 TNFSF11-203ENST00000398795 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
PDK1Q15118 KLHDC4-201ENST00000270583 1886 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
PDK1Q15118 SPNS1-201ENST00000311008 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
PDK1Q15118 HOXB2-201ENST00000330070 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
PDK1Q15118 GNAI1-201ENST00000351004 3347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
PDK1Q15118 NEU4-205ENST00000407683 2273 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.18■□□□□ 0.82
PDK1Q15118 TMEM8A-204ENST00000431232 3691 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
PDK1Q15118 TDRP-203ENST00000523656 2622 ntTSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
PDK1Q15118 ATP6V0A2-201ENST00000330342 6542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
PDK1Q15118 MRAP-201ENST00000303645 935 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
PDK1Q15118 MRPS26-201ENST00000380325 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
PDK1Q15118 DGCR6L-202ENST00000405465 962 ntTSL 3 BASIC20.18■□□□□ 0.82
PDK1Q15118 CFL1-211ENST00000531407 1062 ntTSL 2 BASIC20.18■□□□□ 0.82
PDK1Q15118 SOX15-202ENST00000538513 1050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
PDK1Q15118 AC113189.1-201ENST00000570444 327 ntTSL 3 BASIC20.18■□□□□ 0.82
PDK1Q15118 SOX15-203ENST00000570788 1093 ntBASIC20.18■□□□□ 0.82
PDK1Q15118 LIMD2-206ENST00000578993 602 ntTSL 3 BASIC20.18■□□□□ 0.82
PDK1Q15118 DCAKD-205ENST00000588499 990 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.18■□□□□ 0.82
PDK1Q15118 AC120498.8-201ENST00000614275 531 ntBASIC20.18■□□□□ 0.82
PDK1Q15118 HSD17B12-213ENST00000637401 866 ntTSL 4 BASIC20.18■□□□□ 0.82
PDK1Q15118 DPP10-203ENST00000393147 2758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
PDK1Q15118 PTAR1-205ENST00000472967 1689 ntTSL 2 BASIC20.18■□□□□ 0.82
PDK1Q15118 KDM2A-202ENST00000398645 6511 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
PDK1Q15118 PRAF2-202ENST00000553851 1334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
PDK1Q15118 KRT1-201ENST00000252244 2451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
PDK1Q15118 FGF14-IT1-202ENST00000607251 2123 ntTSL 2 BASIC20.18■□□□□ 0.82
PDK1Q15118 ADAP1-216ENST00000539900 2178 ntTSL 2 BASIC20.18■□□□□ 0.82
PDK1Q15118 FAM3A-215ENST00000447601 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
PDK1Q15118 NAT16-204ENST00000455377 1492 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
PDK1Q15118 CYP21A2-222ENST00000435122 1914 ntTSL 2 BASIC20.17■□□□□ 0.82
PDK1Q15118 NT5C-201ENST00000245552 954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
PDK1Q15118 TRAPPC5-201ENST00000317378 790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
PDK1Q15118 MAGI2-AS3-209ENST00000448195 774 ntTSL 3 BASIC20.17■□□□□ 0.82
PDK1Q15118 HIGD1A-204ENST00000452906 585 ntTSL 2 BASIC20.17■□□□□ 0.82
PDK1Q15118 GNB5-211ENST00000560116 918 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
PDK1Q15118 ANAPC11-223ENST00000612413 964 ntTSL 3 BASIC20.17■□□□□ 0.82
PDK1Q15118 AL121906.2-201ENST00000621597 723 ntBASIC20.17■□□□□ 0.82
PDK1Q15118 NETO1-207ENST00000583169 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
PDK1Q15118 CENPH-206ENST00000515001 1305 ntTSL 2 BASIC20.17■□□□□ 0.82
PDK1Q15118 KATNAL2-208ENST00000592005 1348 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
PDK1Q15118 FOXC2-201ENST00000320354 2478 ntAPPRIS P1 BASIC20.17■□□□□ 0.82
PDK1Q15118 TRMU-202ENST00000381019 1381 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
PDK1Q15118 TBC1D10A-204ENST00000403477 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.17■□□□□ 0.82
PDK1Q15118 AC007383.3-201ENST00000453039 1411 ntTSL 3 BASIC20.17■□□□□ 0.82
PDK1Q15118 ALKBH6-213ENST00000486389 1525 ntTSL 3 BASIC20.17■□□□□ 0.82
PDK1Q15118 AMDHD1-201ENST00000266736 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
PDK1Q15118 S1PR5-201ENST00000333430 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
PDK1Q15118 MAF1-201ENST00000322428 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
PDK1Q15118 CACNA1I-204ENST00000407673 5952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
PDK1Q15118 INTS11-250ENST00000620829 1862 ntTSL 2 BASIC20.16■□□□□ 0.82
PDK1Q15118 RBM26-202ENST00000438724 5152 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
PDK1Q15118 BAALC-203ENST00000309982 2831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
PDK1Q15118 ZBTB7B-201ENST00000292176 2129 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
PDK1Q15118 AC068473.1-201ENST00000317008 1111 ntTSL 2 BASIC20.16■□□□□ 0.82
PDK1Q15118 SDHC-201ENST00000342751 1127 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
PDK1Q15118 STPG4-207ENST00000445927 891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
PDK1Q15118 TNIK-208ENST00000465393 750 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
PDK1Q15118 NAT14-204ENST00000591590 1011 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
PDK1Q15118 TIMM50-213ENST00000599794 786 ntTSL 2 BASIC20.16■□□□□ 0.82
PDK1Q15118 RBFOX1-215ENST00000553186 2196 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
PDK1Q15118 NAAA-206ENST00000507956 1300 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.16■□□□□ 0.82
PDK1Q15118 NKX2-1-202ENST00000498187 2338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
PDK1Q15118 SNCA-203ENST00000394986 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
PDK1Q15118 R3HCC1-210ENST00000625275 1489 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
PDK1Q15118 FDFT1-209ENST00000525900 1596 ntTSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
PDK1Q15118 TMEM230-207ENST00000379286 1735 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.16■□□□□ 0.82
PDK1Q15118 RDH13-203ENST00000415061 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
PDK1Q15118 ST3GAL4-217ENST00000534083 1919 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
PDK1Q15118 ZDHHC18-202ENST00000374142 5020 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
PDK1Q15118 DHRS7-201ENST00000216500 2322 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
PDK1Q15118 LIMS2-207ENST00000409808 2315 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
PDK1Q15118 IL17RE-206ENST00000454190 2757 ntTSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
PDK1Q15118 C10orf76-201ENST00000311122 724 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
PDK1Q15118 FAM160B1-201ENST00000369246 666 ntTSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
PDK1Q15118 ZNF295-AS1-201ENST00000412906 952 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
PDK1Q15118 CT47A12-201ENST00000419982 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
PDK1Q15118 AC008443.1-203ENST00000505151 886 ntTSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
PDK1Q15118 COX4I1-202ENST00000561569 716 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
PDK1Q15118 EML2-AS1-202ENST00000591087 838 ntTSL 3 BASIC20.15■□□□□ 0.82
PDK1Q15118 AC008687.6-201ENST00000596318 630 ntBASIC20.15■□□□□ 0.82
PDK1Q15118 TMEM191B-201ENST00000612978 1220 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
PDK1Q15118 PYURF-201ENST00000273968 1361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
PDK1Q15118 GPR139-202ENST00000570682 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
PDK1Q15118 KCNK4-201ENST00000394525 1673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
PDK1Q15118 AC233280.1-201ENST00000423600 1684 ntTSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
PDK1Q15118 MARCH8-201ENST00000319836 5272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
PDK1Q15118 SLC52A2-209ENST00000530047 1757 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
PDK1Q15118 ACD-214ENST00000620338 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
PDK1Q15118 ANXA8-208ENST00000611843 2174 ntTSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
PDK1Q15118 ZNF324B-202ENST00000545523 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
PDK1Q15118 OLFM1-205ENST00000371796 2492 ntTSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
PDK1Q15118 ZNF12-201ENST00000342651 2921 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
PDK1Q15118 FENDRR-203ENST00000595886 3095 ntTSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
PDK1Q15118 LSM11-201ENST00000286307 6584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
PDK1Q15118 ROCK2-202ENST00000315872 8292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
PDK1Q15118 HOXA11-201ENST00000006015 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
PDK1Q15118 AC116562.4-201ENST00000641316 2276 ntBASIC20.14■□□□□ 0.81
PDK1Q15118 AKIRIN2-201ENST00000257787 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.5 ms