Protein–RNA interactions for Protein: Q15034

HERC3, Probable E3 ubiquitin-protein ligase HERC3, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HERC3Q15034 CECR2-202ENST00000342247 6178 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.24■□□□□ 0.67
HERC3Q15034 CD55-203ENST00000367063 1691 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
HERC3Q15034 BACE1-209ENST00000513780 1465 ntTSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
HERC3Q15034 ITPKB-203ENST00000429204 6162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.24■□□□□ 0.67
HERC3Q15034 CMTM7-201ENST00000334983 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
HERC3Q15034 NRXN2-201ENST00000265459 6621 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.24■□□□□ 0.67
HERC3Q15034 FAM20B-201ENST00000263733 5984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
HERC3Q15034 CRB2-202ENST00000373631 5550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
HERC3Q15034 FAM110A-204ENST00000381941 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
HERC3Q15034 ODF3B-201ENST00000329363 970 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.24■□□□□ 0.67
HERC3Q15034 C2orf82-203ENST00000409533 561 ntAPPRIS P2 TSL 4 BASIC19.24■□□□□ 0.67
HERC3Q15034 OTUB1-203ENST00000428192 1296 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC19.24■□□□□ 0.67
HERC3Q15034 AKAIN1-201ENST00000434239 575 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.24■□□□□ 0.67
HERC3Q15034 APTR-205ENST00000447009 902 ntTSL 2 BASIC19.24■□□□□ 0.67
HERC3Q15034 NME6-213ENST00000451657 871 ntTSL 2 BASIC19.24■□□□□ 0.67
HERC3Q15034 AL049874.3-201ENST00000557618 868 ntTSL 3 BASIC19.24■□□□□ 0.67
HERC3Q15034 FGF17-202ENST00000518533 1706 ntTSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
HERC3Q15034 FBXL17-205ENST00000542267 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
HERC3Q15034 IQCJ-SCHIP1-207ENST00000638749 2633 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
HERC3Q15034 MFSD10-206ENST00000508221 1639 ntTSL 5 BASIC19.24■□□□□ 0.67
HERC3Q15034 TMEM179-201ENST00000341595 2513 ntTSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
HERC3Q15034 CERS5-203ENST00000422340 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.24■□□□□ 0.67
HERC3Q15034 MCC-208ENST00000514701 2855 ntTSL 2 BASIC19.24■□□□□ 0.67
HERC3Q15034 RIIAD1-201ENST00000326413 1772 ntTSL 2 BASIC19.24■□□□□ 0.67
HERC3Q15034 PLCB2-204ENST00000557821 4517 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
HERC3Q15034 KCNH2-202ENST00000330883 3267 ntTSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
HERC3Q15034 TSPAN3-207ENST00000559494 1326 ntTSL 5 BASIC19.24■□□□□ 0.67
HERC3Q15034 LEMD2-201ENST00000293760 2958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
HERC3Q15034 ADAD1-202ENST00000388724 1912 ntTSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
HERC3Q15034 STK25-205ENST00000405883 1904 ntTSL 2 BASIC19.23■□□□□ 0.67
HERC3Q15034 RNF146-213ENST00000610153 2070 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC19.23■□□□□ 0.67
HERC3Q15034 COBL-202ENST00000395540 2332 ntTSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
HERC3Q15034 INTS12-206ENST00000451321 1975 ntTSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
HERC3Q15034 PLPBP-201ENST00000328195 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
HERC3Q15034 RASSF1-202ENST00000357043 1864 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
HERC3Q15034 CCDC103-202ENST00000410006 921 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.23■□□□□ 0.67
HERC3Q15034 ELAVL3-202ENST00000438662 1223 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.23■□□□□ 0.67
HERC3Q15034 AL359182.2-201ENST00000457720 606 ntTSL 3 BASIC19.23■□□□□ 0.67
HERC3Q15034 AC011611.3-201ENST00000552367 569 ntTSL 4 BASIC19.23■□□□□ 0.67
HERC3Q15034 AL160396.2-202ENST00000636692 566 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.23■□□□□ 0.67
HERC3Q15034 EDN3-204ENST00000371028 2397 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC19.23■□□□□ 0.67
HERC3Q15034 TCERG1L-201ENST00000368642 2618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
HERC3Q15034 RHBDD3-201ENST00000216085 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
HERC3Q15034 PPFIA1-201ENST00000253925 5234 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
HERC3Q15034 KIF22-203ENST00000561482 2505 ntTSL 2 BASIC19.23■□□□□ 0.67
HERC3Q15034 MEF2B-201ENST00000409224 1683 ntTSL 2 BASIC19.23■□□□□ 0.67
HERC3Q15034 LIMS2-204ENST00000409286 1678 ntTSL 2 BASIC19.23■□□□□ 0.67
HERC3Q15034 ST3GAL4-205ENST00000449406 1669 ntTSL 5 BASIC19.23■□□□□ 0.67
HERC3Q15034 NECAB3-202ENST00000375238 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
HERC3Q15034 TPCN2-201ENST00000294309 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
HERC3Q15034 CHRNB1-201ENST00000306071 2557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
HERC3Q15034 PRR14-203ENST00000542965 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
HERC3Q15034 PHF20L1-214ENST00000485595 1810 ntTSL 2 BASIC19.23■□□□□ 0.67
HERC3Q15034 ARMC6-220ENST00000546344 1814 ntTSL 2 BASIC19.23■□□□□ 0.67
HERC3Q15034 SLC22A17-211ENST00000637426 1563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
HERC3Q15034 EVL-202ENST00000402714 2353 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
HERC3Q15034 DIP2A-203ENST00000435722 2760 ntTSL 2 BASIC19.22■□□□□ 0.67
HERC3Q15034 MAPK9-208ENST00000455781 4336 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC19.22■□□□□ 0.67
HERC3Q15034 FDXR-217ENST00000582944 1766 ntTSL 2 BASIC19.22■□□□□ 0.67
HERC3Q15034 MORN1-202ENST00000378529 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
HERC3Q15034 KLHL21-206ENST00000610898 1945 ntTSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
HERC3Q15034 FAM129C-208ENST00000599164 2073 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.22■□□□□ 0.67
HERC3Q15034 CNIH4-203ENST00000366858 702 ntTSL 3 BASIC19.22■□□□□ 0.67
HERC3Q15034 MDK-204ENST00000395569 686 ntTSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
HERC3Q15034 CYYR1-202ENST00000400043 735 ntTSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
HERC3Q15034 AC092143.2-201ENST00000554623 985 ntTSL 3 BASIC19.22■□□□□ 0.67
HERC3Q15034 MAPK14-210ENST00000622903 1003 ntTSL 5 BASIC19.22■□□□□ 0.67
HERC3Q15034 NECAB3-201ENST00000246190 1989 ntTSL 5 BASIC19.22■□□□□ 0.67
HERC3Q15034 SMARCD1-201ENST00000381513 3237 ntTSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
HERC3Q15034 MOB3C-202ENST00000319928 2822 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.22■□□□□ 0.67
HERC3Q15034 CELF6-202ENST00000395258 1741 ntTSL 5 BASIC19.22■□□□□ 0.67
HERC3Q15034 CIDEB-202ENST00000336557 2409 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.22■□□□□ 0.67
HERC3Q15034 SLC27A3-214ENST00000624995 2413 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
HERC3Q15034 KRT83-201ENST00000293670 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
HERC3Q15034 PADI2-201ENST00000375481 1607 ntTSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
HERC3Q15034 HOXC6-202ENST00000394331 2943 ntTSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
HERC3Q15034 GPR31-201ENST00000366834 2059 ntAPPRIS P1 BASIC19.21■□□□□ 0.67
HERC3Q15034 ROCK2-202ENST00000315872 8292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
HERC3Q15034 RNF146-203ENST00000368314 2369 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC19.21■□□□□ 0.67
HERC3Q15034 KCNC3-203ENST00000477616 3176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
HERC3Q15034 STRN4-202ENST00000391910 3628 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.21■□□□□ 0.67
HERC3Q15034 PSPN-201ENST00000245810 471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
HERC3Q15034 TRAPPC5-201ENST00000317378 790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
HERC3Q15034 UBE2L6-202ENST00000340573 1573 ntTSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
HERC3Q15034 UBE2C-203ENST00000352551 665 ntTSL 2 BASIC19.21■□□□□ 0.67
HERC3Q15034 NENF-201ENST00000366988 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
HERC3Q15034 CT47A12-201ENST00000419982 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
HERC3Q15034 DIMT1-202ENST00000506390 1208 ntTSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
HERC3Q15034 CKLF-CMTM1-204ENST00000532838 587 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC19.21■□□□□ 0.67
HERC3Q15034 SEMA7A-203ENST00000543145 2304 ntTSL 2 BASIC19.21■□□□□ 0.67
HERC3Q15034 RPL17-204ENST00000579248 790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.21■□□□□ 0.67
HERC3Q15034 AC003102.1-201ENST00000588279 569 ntTSL 4 BASIC19.21■□□□□ 0.67
HERC3Q15034 IRF7-203ENST00000397566 2051 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
HERC3Q15034 ISOC1-201ENST00000173527 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
HERC3Q15034 MAZ-214ENST00000568544 1464 ntTSL 2 BASIC19.21■□□□□ 0.67
HERC3Q15034 QTRT1-201ENST00000250237 1317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
HERC3Q15034 ECE1-205ENST00000436918 2328 ntTSL 2 BASIC19.2■□□□□ 0.66
HERC3Q15034 HOOK1-201ENST00000371208 5857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
HERC3Q15034 BID-205ENST00000399774 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
HERC3Q15034 ST6GALNAC6-215ENST00000542456 2018 ntTSL 2 BASIC19.2■□□□□ 0.66
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