Protein–RNA interactions for Protein: Q15029

EFTUD2, 116 kDa U5 small nuclear ribonucleoprotein component, humanhuman

Known RBP eCLIP

Length 972 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EFTUD2Q15029 FADS2-213ENST00000523235 5073 ntTSL 215.2■□□□□ 0.022e-10■■■■■ 37.3
EFTUD2Q15029 FADS2-203ENST00000355484 2107 ntTSL 212.85□□□□□ -0.352e-10■■■■■ 37.3
EFTUD2Q15029 ZNF160-212ENST00000599980 750 ntTSL 213.03□□□□□ -0.323e-9■■■■■ 37.3
EFTUD2Q15029 POMT2-201ENST00000261534 4876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.687e-7■■■■■ 37.3
EFTUD2Q15029 POMT2-202ENST00000452340 5647 ntTSL 218.83■□□□□ 0.617e-7■■■■■ 37.3
EFTUD2Q15029 POMT2-206ENST00000554767 5457 ntTSL 212.16□□□□□ -0.467e-7■■■■■ 37.3
EFTUD2Q15029 AP3D1-203ENST00000585652 4433 ntTSL 213.47□□□□□ -0.258e-8■■■■■ 37.3
EFTUD2Q15029 AP3D1-206ENST00000589223 3357 ntTSL 212.73□□□□□ -0.378e-8■■■■■ 37.3
EFTUD2Q15029 MBD1-216ENST00000587605 1945 ntTSL 2 BASIC20.68■□□□□ 0.92e-6■■■■■ 37.3
EFTUD2Q15029 MBD1-206ENST00000382948 2434 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.08■□□□□ 0.642e-6■■■■■ 37.3
EFTUD2Q15029 MBD1-208ENST00000398493 1845 ntTSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.592e-6■■■■■ 37.3
EFTUD2Q15029 MBD1-204ENST00000347968 3091 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.332e-6■■■■■ 37.3
EFTUD2Q15029 MBD1-210ENST00000457839 2473 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.86■□□□□ 0.292e-6■■■■■ 37.3
EFTUD2Q15029 MBD1-222ENST00000590208 2913 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.262e-6■■■■■ 37.3
EFTUD2Q15029 MBD1-202ENST00000269471 2980 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.252e-6■■■■■ 37.3
EFTUD2Q15029 MBD1-205ENST00000353909 2820 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.192e-6■■■■■ 37.3
EFTUD2Q15029 MBD1-203ENST00000339998 2956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.172e-6■■■■■ 37.3
EFTUD2Q15029 MBD1-224ENST00000591416 4905 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.152e-6■■■■■ 37.3
EFTUD2Q15029 MBD1-212ENST00000585672 2532 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.092e-6■■■■■ 37.3
EFTUD2Q15029 MBD1-201ENST00000269468 3259 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.032e-6■■■■■ 37.3
EFTUD2Q15029 POLR2H-209ENST00000460083 439 ntTSL 315.59■□□□□ 0.093e-8■■■■■ 37.3
EFTUD2Q15029 ZNF775-201ENST00000329630 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.873e-7■■■■■ 37.3
EFTUD2Q15029 RPS6KB2-207ENST00000525996 957 ntTSL 516.42■□□□□ 0.223e-6■■■■■ 37.3
EFTUD2Q15029 AC073111.4-201ENST00000483664 582 ntTSL 411.71□□□□□ -0.533e-7■■■■■ 37.3
EFTUD2Q15029 TRIM11-202ENST00000366699 2511 ntTSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.58e-7■■■■■ 37.3
EFTUD2Q15029 TRIM11-201ENST00000284551 2715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.48e-7■■■■■ 37.3
EFTUD2Q15029 TRIM28-204ENST00000594806 861 ntTSL 524.85■■□□□ 1.576e-15■■■■■ 37.3
EFTUD2Q15029 E2F4-201ENST00000379378 2096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.48■■■□□ 2.157e-7■■■■■ 37.3
EFTUD2Q15029 E2F4-208ENST00000567007 2615 ntTSL 218.95■□□□□ 0.627e-7■■■■■ 37.3
EFTUD2Q15029 SSBP4-205ENST00000598159 747 ntTSL 321.54■■□□□ 1.042e-6■■■■■ 37.2
EFTUD2Q15029 SSBP4-209ENST00000601357 606 ntTSL 521.22■□□□□ 0.992e-6■■■■■ 37.2
EFTUD2Q15029 SSBP4-204ENST00000597724 865 ntTSL 516.01■□□□□ 0.152e-6■■■■■ 37.2
EFTUD2Q15029 SSBP4-211ENST00000601614 628 ntTSL 214.65□□□□□ -0.062e-6■■■■■ 37.2
EFTUD2Q15029 SSBP4-214ENST00000607020 504 ntTSL 313.8□□□□□ -0.22e-6■■■■■ 37.2
EFTUD2Q15029 FBRS-201ENST00000287468 2811 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.037e-8■■■■■ 37.2
EFTUD2Q15029 FUS-212ENST00000569760 639 ntTSL 222.13■■□□□ 1.132e-14■■■■■ 37.2
EFTUD2Q15029 LAS1L-202ENST00000374807 2386 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.17□□□□□ -0.141e-9■■■■■ 37.2
EFTUD2Q15029 LAS1L-201ENST00000374804 2261 ntTSL 2 BASIC13.98□□□□□ -0.171e-9■■■■■ 37.2
EFTUD2Q15029 LAS1L-205ENST00000484069 5205 ntTSL 213.63□□□□□ -0.231e-9■■■■■ 37.2
EFTUD2Q15029 LAS1L-203ENST00000374811 2439 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.52□□□□□ -0.411e-9■■■■■ 37.2
EFTUD2Q15029 RCE1-201ENST00000309657 1485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.684e-7■■■■■ 37.2
EFTUD2Q15029 RCE1-203ENST00000524849 1428 ntTSL 1 (best)21.92■■□□□ 1.14e-7■■■■■ 37.2
EFTUD2Q15029 RCE1-207ENST00000533277 2719 ntTSL 221.6■■□□□ 1.054e-7■■■■■ 37.2
EFTUD2Q15029 RCE1-202ENST00000524506 1379 ntTSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.054e-7■■■■■ 37.2
EFTUD2Q15029 RCE1-204ENST00000525356 1270 ntTSL 5 BASIC14.54□□□□□ -0.084e-7■■■■■ 37.2
EFTUD2Q15029 CENPJ-201ENST00000381884 4347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.83□□□□□ -1.167e-9■■■■■ 37.2
EFTUD2Q15029 CENPJ-206ENST00000616936 5020 ntTSL 1 (best) BASIC6.96□□□□□ -1.297e-9■■■■■ 37.2
EFTUD2Q15029 CENPJ-202ENST00000418179 691 ntTSL 1 (best)4.14□□□□□ -1.757e-9■■■■■ 37.2
EFTUD2Q15029 CENPJ-205ENST00000545981 4299 ntTSL 2 BASIC3.81□□□□□ -1.87e-9■■■■■ 37.2
EFTUD2Q15029 RPL37A-207ENST00000478153 2082 ntTSL 1 (best)22.03■■□□□ 1.122e-11■■■■■ 37.2
EFTUD2Q15029 RPL37A-201ENST00000359681 742 ntTSL 1 (best)16.99■□□□□ 0.312e-11■■■■■ 37.2
EFTUD2Q15029 RPL37A-212ENST00000600880 425 ntTSL 2 BASIC11.16□□□□□ -0.622e-11■■■■■ 37.2
EFTUD2Q15029 RPL37A-205ENST00000446558 495 ntTSL 5 BASIC11.08□□□□□ -0.642e-11■■■■■ 37.2
EFTUD2Q15029 RPL37A-202ENST00000420712 385 ntTSL 59.44□□□□□ -0.92e-11■■■■■ 37.2
EFTUD2Q15029 RPL37A-208ENST00000487233 2225 ntTSL 29.13□□□□□ -0.952e-11■■■■■ 37.2
EFTUD2Q15029 RPL37A-209ENST00000490649 1701 ntTSL 1 (best)8.16□□□□□ -1.12e-11■■■■■ 37.2
EFTUD2Q15029 RPL37A-210ENST00000491306 3647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.8□□□□□ -1.162e-11■■■■■ 37.2
EFTUD2Q15029 DGCR8-201ENST00000351989 4514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.113e-7■■■■■ 37.2
EFTUD2Q15029 DGCR8-202ENST00000383024 4419 ntTSL 5 BASIC11.78□□□□□ -0.523e-7■■■■■ 37.2
EFTUD2Q15029 KRT8-208ENST00000547031 883 ntTSL 215.24■□□□□ 0.031e-7■■■■■ 37.2
EFTUD2Q15029 POLE2-201ENST00000216367 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.321e-7■■■■■ 37.1
EFTUD2Q15029 POLE2-202ENST00000539565 1792 ntTSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.861e-7■■■■■ 37.1
EFTUD2Q15029 POLE2-210ENST00000556584 1568 ntTSL 514.9□□□□□ -0.021e-7■■■■■ 37.1
EFTUD2Q15029 POLE2-206ENST00000554396 1581 ntTSL 1 (best) BASIC5.41□□□□□ -1.541e-7■■■■■ 37.1
EFTUD2Q15029 PBX2-202ENST00000478678 1320 ntTSL 1 (best)20.98■□□□□ 0.951e-7■■■■■ 37.1
EFTUD2Q15029 PBX2-201ENST00000375050 3205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.531e-7■■■■■ 37.1
EFTUD2Q15029 PBX2-205ENST00000496171 1050 ntTSL 216.8■□□□□ 0.281e-7■■■■■ 37.1
EFTUD2Q15029 AMDHD2-204ENST00000561487 701 ntTSL 213.4□□□□□ -0.262e-8■■■■■ 37.1
EFTUD2Q15029 ZC3H4-205ENST00000601973 4895 ntAPPRIS ALT2 TSL 516.03■□□□□ 0.161e-6■■■■■ 37.1
EFTUD2Q15029 ZC3H4-201ENST00000253048 6119 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.011e-6■■■■■ 37.1
EFTUD2Q15029 ZC3H4-202ENST00000594019 3259 ntTSL 211.84□□□□□ -0.511e-6■■■■■ 37.1
EFTUD2Q15029 RPS12-201ENST00000230050 631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.356e-26■■■■■ 37.1
EFTUD2Q15029 RPS12-202ENST00000484616 639 ntTSL 23.28□□□□□ -1.886e-26■■■■■ 37.1
EFTUD2Q15029 FOSL1-202ENST00000448083 1427 ntTSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.131e-6■■■■■ 37.1
EFTUD2Q15029 FOSL1-201ENST00000312562 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.981e-6■■■■■ 37.1
EFTUD2Q15029 FOSL1-204ENST00000532401 1132 ntTSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.541e-6■■■■■ 37.1
EFTUD2Q15029 FOSL1-203ENST00000531493 1200 ntTSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.461e-6■■■■■ 37.1
EFTUD2Q15029 FOSL1-205ENST00000534222 584 ntTSL 312.53□□□□□ -0.41e-6■■■■■ 37.1
EFTUD2Q15029 ADAM9-201ENST00000379917 3836 ntTSL 1 (best)10.59□□□□□ -0.711e-6■■■■■ 37.1
EFTUD2Q15029 ADAM9-209ENST00000487273 3839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.741e-6■■■■■ 37.1
EFTUD2Q15029 SLMAP-203ENST00000383718 6749 ntTSL 2 BASIC9.88□□□□□ -0.831e-6■■■■■ 37.1
EFTUD2Q15029 ADAM9-204ENST00000468065 3755 ntTSL 1 (best)9.81□□□□□ -0.841e-6■■■■■ 37.1
EFTUD2Q15029 ADAM9-207ENST00000481873 3793 ntTSL 1 (best)9.81□□□□□ -0.841e-6■■■■■ 37.1
EFTUD2Q15029 SLMAP-214ENST00000467901 2698 ntTSL 27.6□□□□□ -1.191e-6■■■■■ 37.1
EFTUD2Q15029 SLMAP-212ENST00000465203 511 ntTSL 53.06□□□□□ -1.921e-6■■■■■ 37.1
EFTUD2Q15029 SLMAP-216ENST00000475055 351 ntTSL 33□□□□□ -1.931e-6■■■■■ 37.1
EFTUD2Q15029 AL109827.1-203ENST00000541176 872 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC14.92□□□□□ -0.024e-7■■■■■ 37.1
EFTUD2Q15029 AL109827.1-201ENST00000454607 679 ntAPPRIS ALT2 TSL 29.7□□□□□ -0.864e-7■■■■■ 37.1
EFTUD2Q15029 AL109827.1-202ENST00000441563 611 ntAPPRIS ALT2 TSL 29.7□□□□□ -0.864e-7■■■■■ 37.1
EFTUD2Q15029 SETD6-202ENST00000310682 2042 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.79■■□□□ 1.081e-6■■■■■ 37.1
EFTUD2Q15029 SETD6-206ENST00000427443 1909 ntTSL 1 (best)20.61■□□□□ 0.891e-6■■■■■ 37.1
EFTUD2Q15029 SETD6-201ENST00000219315 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.821e-6■■■■■ 37.1
EFTUD2Q15029 SETD6-204ENST00000418480 829 ntTSL 519.52■□□□□ 0.721e-6■■■■■ 37.1
EFTUD2Q15029 SETD6-213ENST00000492050 706 ntTSL 319.44■□□□□ 0.71e-6■■■■■ 37.1
EFTUD2Q15029 SETD6-211ENST00000470003 593 ntTSL 218.17■□□□□ 0.51e-6■■■■■ 37.1
EFTUD2Q15029 SETD6-207ENST00000447443 576 ntTSL 517.28■□□□□ 0.361e-6■■■■■ 37.1
EFTUD2Q15029 SETD6-203ENST00000394266 3423 ntTSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.041e-6■■■■■ 37.1
EFTUD2Q15029 SLC39A4-204ENST00000527148 684 ntTSL 220.04■□□□□ 0.81e-7■■■■■ 37.1
EFTUD2Q15029 SLC39A4-207ENST00000531013 795 ntTSL 218.31■□□□□ 0.521e-7■■■■■ 37.1
EFTUD2Q15029 SLC39A4-205ENST00000529462 2778 ntTSL 215.73■□□□□ 0.111e-7■■■■■ 37.1
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