Protein–RNA interactions for Protein: Q14011

CIRBP, Cold-inducible RNA-binding protein, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 172 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CIRBPQ14011 TMEM182-210ENST00000639249 1025 ntTSL 5 BASIC13.67□□□□□ -0.22
CIRBPQ14011 SGO1-209ENST00000442720 2266 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
CIRBPQ14011 GCGR-202ENST00000570996 1872 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.67□□□□□ -0.22
CIRBPQ14011 PNKP-214ENST00000600573 1602 ntTSL 5 BASIC13.67□□□□□ -0.22
CIRBPQ14011 ZNF213-202ENST00000416391 2996 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.67□□□□□ -0.22
CIRBPQ14011 CPEB1-214ENST00000617522 2220 ntTSL 5 BASIC13.67□□□□□ -0.22
CIRBPQ14011 FOXD4-201ENST00000382500 1974 ntAPPRIS P1 BASIC13.67□□□□□ -0.22
CIRBPQ14011 NOXA1-202ENST00000392815 1464 ntTSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
CIRBPQ14011 HMCES-203ENST00000417226 1490 ntTSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
CIRBPQ14011 HOXB9-201ENST00000311177 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
CIRBPQ14011 ASB6-203ENST00000450050 4535 ntTSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
CIRBPQ14011 ADGRB2-206ENST00000398556 4879 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.67□□□□□ -0.22
CIRBPQ14011 PLXNC1-201ENST00000258526 7346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
CIRBPQ14011 CYB5R2-212ENST00000533558 1658 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.66□□□□□ -0.22
CIRBPQ14011 WRNIP1-202ENST00000380769 3239 ntTSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
CIRBPQ14011 TTBK1-201ENST00000259750 6932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
CIRBPQ14011 CTIF-201ENST00000256413 5750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
CIRBPQ14011 TPCN2-201ENST00000294309 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
CIRBPQ14011 GABRD-201ENST00000378585 1961 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
CIRBPQ14011 SCO1-203ENST00000577427 1601 ntTSL 3 BASIC13.66□□□□□ -0.22
CIRBPQ14011 ADAMTS13-204ENST00000371911 1155 ntTSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
CIRBPQ14011 RASGRP2-203ENST00000377486 667 ntTSL 3 BASIC13.66□□□□□ -0.22
CIRBPQ14011 LRRC3C-201ENST00000377924 891 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.66□□□□□ -0.22
CIRBPQ14011 FNDC3B-204ENST00000421757 946 ntTSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
CIRBPQ14011 CHTF8-210ENST00000523421 766 ntTSL 3 BASIC13.66□□□□□ -0.22
CIRBPQ14011 RPLP2-207ENST00000530797 637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
CIRBPQ14011 SLC35A2-212ENST00000634665 486 ntTSL 4 BASIC13.66□□□□□ -0.22
CIRBPQ14011 ETV4-201ENST00000319349 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
CIRBPQ14011 ABHD12B-201ENST00000337334 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
CIRBPQ14011 LPAR2-202ENST00000542587 2546 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.66□□□□□ -0.22
CIRBPQ14011 MAP3K6-201ENST00000357582 4136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
CIRBPQ14011 UCK2-201ENST00000367879 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
CIRBPQ14011 CERKL-204ENST00000374970 1392 ntTSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
CIRBPQ14011 STAC-204ENST00000457375 1366 ntTSL 2 BASIC13.66□□□□□ -0.22
CIRBPQ14011 AC055733.4-201ENST00000638462 1354 ntBASIC13.66□□□□□ -0.22
CIRBPQ14011 IQCJ-SCHIP1-207ENST00000638749 2633 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
CIRBPQ14011 ST3GAL3-204ENST00000335430 1805 ntTSL 5 BASIC13.66□□□□□ -0.22
CIRBPQ14011 TMEM218-213ENST00000531909 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
CIRBPQ14011 TMPRSS5-202ENST00000536856 1811 ntTSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
CIRBPQ14011 FBXL3-201ENST00000355619 3503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
CIRBPQ14011 UBXN6-201ENST00000301281 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
CIRBPQ14011 DCAF4-201ENST00000353777 1940 ntTSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
CIRBPQ14011 MB21D1-202ENST00000370318 1917 ntTSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
CIRBPQ14011 NGLY1-204ENST00000396649 2024 ntTSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
CIRBPQ14011 AKIRIN2-201ENST00000257787 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
CIRBPQ14011 CCNJ-203ENST00000465148 2677 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.66□□□□□ -0.22
CIRBPQ14011 MBD3-207ENST00000590550 2782 ntTSL 2 BASIC13.66□□□□□ -0.22
CIRBPQ14011 CBWD6-201ENST00000377391 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
CIRBPQ14011 CPNE9-202ENST00000383831 1751 ntTSL 5 BASIC13.66□□□□□ -0.22
CIRBPQ14011 PGM1-205ENST00000540265 2345 ntTSL 2 BASIC13.65□□□□□ -0.22
CIRBPQ14011 ENOSF1-201ENST00000251101 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
CIRBPQ14011 INPP1-202ENST00000392329 2162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.65□□□□□ -0.22
CIRBPQ14011 ELOA3B-201ENST00000611323 1641 ntAPPRIS P1 BASIC13.65□□□□□ -0.22
CIRBPQ14011 ELOA3D-201ENST00000620881 1641 ntAPPRIS P1 BASIC13.65□□□□□ -0.22
CIRBPQ14011 ST3GAL3-206ENST00000351035 2377 ntTSL 5 BASIC13.65□□□□□ -0.22
CIRBPQ14011 IL17RC-202ENST00000383812 2384 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
CIRBPQ14011 IL17RC-203ENST00000403601 2388 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
CIRBPQ14011 EEF1A2-202ENST00000298049 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
CIRBPQ14011 RTN1-202ENST00000342503 1703 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
CIRBPQ14011 TLK2-202ENST00000343388 3227 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
CIRBPQ14011 SPIRE2-201ENST00000378247 3235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
CIRBPQ14011 FAHD1-202ENST00000382668 1845 ntTSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
CIRBPQ14011 NKX2-1-203ENST00000518149 2583 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.65□□□□□ -0.22
CIRBPQ14011 PCBP3-203ENST00000400308 1911 ntTSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
CIRBPQ14011 ANTXR1-201ENST00000303714 5859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
CIRBPQ14011 MIR31HG-201ENST00000304425 745 ntTSL 2 BASIC13.65□□□□□ -0.22
CIRBPQ14011 GADD45A-201ENST00000370985 803 ntTSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
CIRBPQ14011 CENPVL3-201ENST00000417339 864 ntAPPRIS P1 BASIC13.65□□□□□ -0.22
CIRBPQ14011 ANKRD63-201ENST00000434396 1143 ntAPPRIS P1 BASIC13.65□□□□□ -0.22
CIRBPQ14011 YJEFN3-203ENST00000514277 995 ntTSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
CIRBPQ14011 NTF6G-201ENST00000591094 616 ntBASIC13.65□□□□□ -0.22
CIRBPQ14011 TNFRSF11A-207ENST00000639222 855 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.65□□□□□ -0.22
CIRBPQ14011 NOMO3-201ENST00000263012 3911 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
CIRBPQ14011 FLJ16779-201ENST00000612722 7638 ntBASIC13.65□□□□□ -0.22
CIRBPQ14011 LIPG-203ENST00000577628 2323 ntTSL 2 BASIC13.65□□□□□ -0.22
CIRBPQ14011 P2RX2-201ENST00000343948 1494 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
CIRBPQ14011 ZDHHC7-203ENST00000564466 1488 ntTSL 5 BASIC13.65□□□□□ -0.22
CIRBPQ14011 SUMF2-204ENST00000395436 1683 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
CIRBPQ14011 SIKE1-203ENST00000369528 5506 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
CIRBPQ14011 VDAC1-203ENST00000395047 1873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
CIRBPQ14011 IQSEC3-203ENST00000538872 7094 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.65□□□□□ -0.22
CIRBPQ14011 SEPT2-203ENST00000391971 3315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
CIRBPQ14011 PCDHA13-202ENST00000409494 4884 ntTSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
CIRBPQ14011 ALDH1A3-201ENST00000329841 3924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
CIRBPQ14011 DIP2A-203ENST00000435722 2760 ntTSL 2 BASIC13.65□□□□□ -0.22
CIRBPQ14011 UBE3A-227ENST00000638011 8742 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.65□□□□□ -0.22
CIRBPQ14011 OTUD7A-201ENST00000307050 10770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
CIRBPQ14011 OR4D1-202ENST00000641449 4925 ntAPPRIS P1 BASIC13.65□□□□□ -0.22
CIRBPQ14011 CDCA7L-203ENST00000406877 3066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.23
CIRBPQ14011 SEMA6B-201ENST00000586582 3986 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
CIRBPQ14011 VPS13B-204ENST00000441350 1626 ntTSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
CIRBPQ14011 TMEM179-206ENST00000616017 1645 ntBASIC13.64□□□□□ -0.23
CIRBPQ14011 TRMU-201ENST00000290846 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
CIRBPQ14011 AC107959.1-202ENST00000502083 1945 ntTSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
CIRBPQ14011 ISYNA1-201ENST00000338128 2420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
CIRBPQ14011 FST-201ENST00000256759 2519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
CIRBPQ14011 TMEM184A-201ENST00000297477 6276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
CIRBPQ14011 IKBKG-214ENST00000618670 2069 ntTSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
CIRBPQ14011 LY6E-201ENST00000292494 1181 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
CIRBPQ14011 NRL-201ENST00000396995 810 ntTSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
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