Protein–RNA interactions for Protein: Q13936

CACNA1C, Voltage-dependent L-type calcium channel subunit alpha-1C, humanhuman

Predictions only

Length 2,221 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CACNA1CQ13936 GATA5-201ENST00000252997 2595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
CACNA1CQ13936 TCF7-201ENST00000342854 3045 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
CACNA1CQ13936 PPP1R36-201ENST00000298705 1405 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
CACNA1CQ13936 PLEKHH3-204ENST00000591022 2983 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
CACNA1CQ13936 FAM20B-201ENST00000263733 5984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
CACNA1CQ13936 TSTA3-201ENST00000425753 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
CACNA1CQ13936 RBM6-204ENST00000422955 2324 ntTSL 2 BASIC17.94■□□□□ 0.46
CACNA1CQ13936 FAM129C-205ENST00000595684 2265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
CACNA1CQ13936 ASPHD2-201ENST00000215906 3357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
CACNA1CQ13936 GDF15-201ENST00000252809 1200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
CACNA1CQ13936 TREX2-204ENST00000370212 861 ntTSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
CACNA1CQ13936 TREX2-205ENST00000370231 1255 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
CACNA1CQ13936 TREX2-207ENST00000393862 907 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.94■□□□□ 0.46
CACNA1CQ13936 HDAC11-203ENST00000402271 1018 ntTSL 3 BASIC17.94■□□□□ 0.46
CACNA1CQ13936 AC080023.1-201ENST00000526906 803 ntTSL 2 BASIC17.94■□□□□ 0.46
CACNA1CQ13936 C12orf76-208ENST00000551185 496 ntTSL 2 BASIC17.94■□□□□ 0.46
CACNA1CQ13936 MAP3K14-AS1-202ENST00000585351 893 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
CACNA1CQ13936 AC007786.1-201ENST00000587859 709 ntTSL 2 BASIC17.94■□□□□ 0.46
CACNA1CQ13936 ZNF302-215ENST00000627982 1723 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
CACNA1CQ13936 ILKAP-201ENST00000254654 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
CACNA1CQ13936 FBLN1-204ENST00000402984 2355 ntTSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
CACNA1CQ13936 CHST8-203ENST00000438847 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
CACNA1CQ13936 CDH22-201ENST00000372262 3661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
CACNA1CQ13936 UBAP1-204ENST00000625521 2029 ntTSL 2 BASIC17.94■□□□□ 0.46
CACNA1CQ13936 VCPKMT-202ENST00000395860 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
CACNA1CQ13936 RGS11-204ENST00000397770 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
CACNA1CQ13936 TOR2A-203ENST00000373284 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
CACNA1CQ13936 AGFG2-201ENST00000300176 4796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
CACNA1CQ13936 MSLN-201ENST00000382862 2116 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
CACNA1CQ13936 NRXN2-205ENST00000409571 6381 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
CACNA1CQ13936 RHOC-204ENST00000369633 1295 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.94■□□□□ 0.46
CACNA1CQ13936 AL353593.2-202ENST00000602947 550 ntTSL 4 BASIC17.94■□□□□ 0.46
CACNA1CQ13936 AC113410.3-201ENST00000623366 203 ntBASIC17.94■□□□□ 0.46
CACNA1CQ13936 MFSD7-204ENST00000503156 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
CACNA1CQ13936 BAZ1B-202ENST00000404251 5428 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.93■□□□□ 0.46
CACNA1CQ13936 MTFP1-201ENST00000266263 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
CACNA1CQ13936 CIRBP-215ENST00000588030 1509 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
CACNA1CQ13936 PTPN11-202ENST00000392597 1876 ntTSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
CACNA1CQ13936 C20orf27-201ENST00000217195 1302 ntTSL 2 BASIC17.93■□□□□ 0.46
CACNA1CQ13936 DBNDD2-206ENST00000372720 1481 ntTSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
CACNA1CQ13936 LCE2A-201ENST00000368779 592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
CACNA1CQ13936 RABL2A-202ENST00000393165 1118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
CACNA1CQ13936 PHF11-218ENST00000496623 1173 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.93■□□□□ 0.46
CACNA1CQ13936 AC015712.2-203ENST00000560461 688 ntTSL 3 BASIC17.93■□□□□ 0.46
CACNA1CQ13936 NOXO1-205ENST00000566005 1144 ntTSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
CACNA1CQ13936 NCBP2-AS2-201ENST00000602845 918 ntAPPRIS P1 BASIC17.93■□□□□ 0.46
CACNA1CQ13936 OSTM1-201ENST00000193322 4467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
CACNA1CQ13936 LRRC25-202ENST00000595840 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
CACNA1CQ13936 USP21-203ENST00000368002 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
CACNA1CQ13936 DLGAP4-206ENST00000475894 3110 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.93■□□□□ 0.46
CACNA1CQ13936 CERKL-201ENST00000339098 1677 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
CACNA1CQ13936 MPZL1-201ENST00000359523 5010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
CACNA1CQ13936 RNF8-204ENST00000469731 1800 ntTSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
CACNA1CQ13936 ST3GAL4-209ENST00000526727 1967 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
CACNA1CQ13936 RARA-201ENST00000254066 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
CACNA1CQ13936 FAM91A1-207ENST00000521166 2706 ntTSL 2 BASIC17.93■□□□□ 0.46
CACNA1CQ13936 SUMO3-204ENST00000411651 1921 ntTSL 2 BASIC17.93■□□□□ 0.46
CACNA1CQ13936 NPNT-214ENST00000514622 2362 ntTSL 2 BASIC17.93■□□□□ 0.46
CACNA1CQ13936 NDUFB1-201ENST00000329559 528 ntTSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
CACNA1CQ13936 TBL1Y-201ENST00000346432 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
CACNA1CQ13936 C20orf166-AS1-202ENST00000436101 761 ntTSL 5 BASIC17.92■□□□□ 0.46
CACNA1CQ13936 AL590666.2-201ENST00000448869 758 ntTSL 2 BASIC17.92■□□□□ 0.46
CACNA1CQ13936 OAF-202ENST00000531220 815 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.92■□□□□ 0.46
CACNA1CQ13936 FAM181A-203ENST00000556222 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
CACNA1CQ13936 AC010531.1-201ENST00000568879 953 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC17.92■□□□□ 0.46
CACNA1CQ13936 AC105020.4-201ENST00000569467 563 ntTSL 4 BASIC17.92■□□□□ 0.46
CACNA1CQ13936 C17orf62-238ENST00000585064 1074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.92■□□□□ 0.46
CACNA1CQ13936 AC110285.5-201ENST00000611501 352 ntBASIC17.92■□□□□ 0.46
CACNA1CQ13936 SPTBN4-204ENST00000392025 8671 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.92■□□□□ 0.46
CACNA1CQ13936 ODC1-202ENST00000405333 1943 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.92■□□□□ 0.46
CACNA1CQ13936 RAB11B-201ENST00000328024 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
CACNA1CQ13936 C16orf70-201ENST00000219139 2865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
CACNA1CQ13936 KCNK12-201ENST00000327876 6227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
CACNA1CQ13936 BYSL-201ENST00000230340 2029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
CACNA1CQ13936 SUDS3-204ENST00000543473 4897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
CACNA1CQ13936 BID-204ENST00000399767 2129 ntTSL 2 BASIC17.92■□□□□ 0.46
CACNA1CQ13936 MEF2B-203ENST00000410050 1429 ntTSL 5 BASIC17.92■□□□□ 0.46
CACNA1CQ13936 OTUB1-210ENST00000541478 1803 ntTSL 5 BASIC17.92■□□□□ 0.46
CACNA1CQ13936 DYNLT3-201ENST00000378578 2217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
CACNA1CQ13936 KIAA0895L-206ENST00000563902 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
CACNA1CQ13936 AC008105.2-201ENST00000420431 579 ntTSL 4 BASIC17.92■□□□□ 0.46
CACNA1CQ13936 KCNIP3-205ENST00000468529 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
CACNA1CQ13936 WDR86-AS1-203ENST00000480632 704 ntTSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
CACNA1CQ13936 GOSR2-208ENST00000573224 1115 ntTSL 5 BASIC17.92■□□□□ 0.46
CACNA1CQ13936 ACTR5-201ENST00000243903 2565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
CACNA1CQ13936 HIGD1A-201ENST00000321331 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
CACNA1CQ13936 MAST1-208ENST00000591495 1496 ntTSL 5 BASIC17.92■□□□□ 0.46
CACNA1CQ13936 PMPCB-202ENST00000428154 1714 ntTSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
CACNA1CQ13936 RBP4-202ENST00000371467 1314 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.92■□□□□ 0.46
CACNA1CQ13936 TMEM79-201ENST00000295694 2191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
CACNA1CQ13936 SPIRE2-201ENST00000378247 3235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
CACNA1CQ13936 TSPY15P-201ENST00000457163 923 ntBASIC17.91■□□□□ 0.46
CACNA1CQ13936 AL353708.3-201ENST00000610272 989 ntBASIC17.91■□□□□ 0.46
CACNA1CQ13936 CROCCP2-205ENST00000639481 1296 ntTSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
CACNA1CQ13936 SUMF2-201ENST00000275607 1894 ntTSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
CACNA1CQ13936 APLP2-204ENST00000345598 1862 ntTSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
CACNA1CQ13936 SMAD7-201ENST00000262158 3087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
CACNA1CQ13936 PCDHB12-202ENST00000622978 2093 ntTSL 2 BASIC17.91■□□□□ 0.46
CACNA1CQ13936 FAM19A4-201ENST00000295569 2292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
CACNA1CQ13936 NYX-202ENST00000378220 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
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