Protein–RNA interactions for Protein: Q13886

KLF9, Krueppel-like factor 9, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 244 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KLF9Q13886 GAS7-205ENST00000542249 1799 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
KLF9Q13886 AMIGO1-202ENST00000369864 5088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
KLF9Q13886 SLC43A1-201ENST00000278426 2598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
KLF9Q13886 ACTL6B-201ENST00000160382 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
KLF9Q13886 MCTP1-218ENST00000515393 5396 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
KLF9Q13886 TSGA10IP-203ENST00000532620 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
KLF9Q13886 RNPEPL1-201ENST00000270357 5658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
KLF9Q13886 C1QL1-201ENST00000253407 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
KLF9Q13886 LKAAEAR1-201ENST00000302096 761 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
KLF9Q13886 LKAAEAR1-202ENST00000308906 868 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
KLF9Q13886 TMEM134-202ENST00000393877 823 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
KLF9Q13886 C4orf48-201ENST00000409248 433 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
KLF9Q13886 C4orf48-202ENST00000409860 477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
KLF9Q13886 SERP1-208ENST00000491660 830 ntTSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
KLF9Q13886 AC080023.1-201ENST00000526906 803 ntTSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
KLF9Q13886 TIE1-210ENST00000538015 1140 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
KLF9Q13886 PTGDR-202ENST00000553372 1216 ntTSL 3 BASIC16.67■□□□□ 0.26
KLF9Q13886 AC106738.1-201ENST00000560487 359 ntTSL 3 BASIC16.67■□□□□ 0.26
KLF9Q13886 AUTS2-201ENST00000342771 6173 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
KLF9Q13886 TCF7-204ENST00000395029 3330 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
KLF9Q13886 ANKS3-230ENST00000614075 2387 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
KLF9Q13886 DHRS12-201ENST00000218981 1970 ntTSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
KLF9Q13886 RABL6-201ENST00000311502 3091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
KLF9Q13886 ATPAF2-206ENST00000474627 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
KLF9Q13886 PDZD3-202ENST00000355547 2252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
KLF9Q13886 SLC25A47-201ENST00000361529 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
KLF9Q13886 MMP23B-201ENST00000356026 1326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
KLF9Q13886 POMZP3-202ENST00000310842 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
KLF9Q13886 TBR1-202ENST00000410035 1454 ntTSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
KLF9Q13886 TRAF4-205ENST00000444415 1456 ntTSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
KLF9Q13886 KRT87P-202ENST00000534226 1464 ntBASIC16.67■□□□□ 0.26
KLF9Q13886 MAPK8IP1P2-201ENST00000580257 1472 ntBASIC16.67■□□□□ 0.26
KLF9Q13886 SHANK3-203ENST00000445220 5175 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
KLF9Q13886 KDF1-201ENST00000320567 1793 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.66■□□□□ 0.26
KLF9Q13886 SIGLEC10-204ENST00000436984 1776 ntTSL 2 BASIC16.66■□□□□ 0.26
KLF9Q13886 SLC25A3-201ENST00000188376 1909 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
KLF9Q13886 SLC29A4-202ENST00000396872 5685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
KLF9Q13886 PRKCB-202ENST00000321728 2689 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
KLF9Q13886 TMEM175-212ENST00000508204 1399 ntTSL 3 BASIC16.66■□□□□ 0.26
KLF9Q13886 CD7-206ENST00000583376 1659 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
KLF9Q13886 TEX21P-204ENST00000641479 1693 ntBASIC16.66■□□□□ 0.26
KLF9Q13886 SLC3A2-202ENST00000377889 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
KLF9Q13886 FP475955.4-201ENST00000623131 1990 ntBASIC16.66■□□□□ 0.26
KLF9Q13886 ADRA1A-201ENST00000276393 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
KLF9Q13886 PRODH-215ENST00000610940 2405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
KLF9Q13886 SOGA3-203ENST00000525778 4077 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
KLF9Q13886 SLC25A48-201ENST00000274513 1880 ntTSL 2 BASIC16.66■□□□□ 0.26
KLF9Q13886 AC114490.1-202ENST00000311990 1887 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
KLF9Q13886 PODXL2-201ENST00000342480 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
KLF9Q13886 B4GALT2-202ENST00000356836 2629 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.66■□□□□ 0.26
KLF9Q13886 PEMT-202ENST00000395781 1050 ntTSL 2 BASIC16.66■□□□□ 0.26
KLF9Q13886 YBEY-204ENST00000397692 433 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
KLF9Q13886 CBS-203ENST00000398158 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
KLF9Q13886 HES6-202ENST00000409002 1286 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
KLF9Q13886 FAM187A-202ENST00000412523 1748 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
KLF9Q13886 KRT16P6-202ENST00000425692 1426 ntBASIC16.66■□□□□ 0.26
KLF9Q13886 ALG5-202ENST00000443765 1119 ntTSL 2 BASIC16.66■□□□□ 0.26
KLF9Q13886 CREB3L2-203ENST00000452463 1105 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
KLF9Q13886 ESPN-205ENST00000461727 1869 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
KLF9Q13886 SMIM29-205ENST00000468145 903 ntTSL 2 BASIC16.66■□□□□ 0.26
KLF9Q13886 SMIM29-207ENST00000481533 1053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
KLF9Q13886 SRR-208ENST00000576848 588 ntTSL 4 BASIC16.66■□□□□ 0.26
KLF9Q13886 MADCAM1-208ENST00000621286 1203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
KLF9Q13886 CBSL-206ENST00000624406 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
KLF9Q13886 USP48-204ENST00000400301 4309 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
KLF9Q13886 ANKRD13B-209ENST00000614878 2670 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
KLF9Q13886 HYAL1-204ENST00000395144 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
KLF9Q13886 CHRNA10-201ENST00000250699 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
KLF9Q13886 MYO15B-232ENST00000610510 9195 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
KLF9Q13886 PHC1-212ENST00000543824 4292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
KLF9Q13886 ACY1-207ENST00000476854 1319 ntTSL 3 BASIC16.66■□□□□ 0.26
KLF9Q13886 ILKAP-211ENST00000612675 1335 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
KLF9Q13886 AJUBA-202ENST00000361265 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
KLF9Q13886 TMEM191A-208ENST00000450925 1961 ntTSL 2 BASIC16.66■□□□□ 0.26
KLF9Q13886 EVC-201ENST00000264956 6431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
KLF9Q13886 HYOU1-212ENST00000532519 2162 ntTSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
KLF9Q13886 ZNRF2-201ENST00000323037 3460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
KLF9Q13886 MTX2-201ENST00000249442 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
KLF9Q13886 TXNRD2-202ENST00000400518 2025 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
KLF9Q13886 CTSD-212ENST00000637815 2003 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
KLF9Q13886 C2orf81-201ENST00000290390 2227 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
KLF9Q13886 TDP2-202ENST00000378198 2071 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
KLF9Q13886 GNE-201ENST00000377902 2565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
KLF9Q13886 FAM131A-202ENST00000340957 2421 ntTSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
KLF9Q13886 KRT8P17-201ENST00000453110 1448 ntBASIC16.65■□□□□ 0.26
KLF9Q13886 NINJ1-201ENST00000375446 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
KLF9Q13886 AC093833.1-201ENST00000442821 553 ntTSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
KLF9Q13886 ZFYVE28-207ENST00000509171 1135 ntTSL 2 BASIC16.65■□□□□ 0.26
KLF9Q13886 HRH3-203ENST00000611492 900 ntTSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
KLF9Q13886 PCGF6-201ENST00000337211 1950 ntTSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
KLF9Q13886 LRRC32-202ENST00000404995 2656 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
KLF9Q13886 CACNA1A-246ENST00000637736 8340 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
KLF9Q13886 DENND1A-203ENST00000373624 5010 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
KLF9Q13886 STK16-201ENST00000396738 1673 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.65■□□□□ 0.26
KLF9Q13886 TSPY26P-201ENST00000476365 1326 ntBASIC16.65■□□□□ 0.26
KLF9Q13886 CENPS-CORT-204ENST00000602296 1326 ntTSL 3 BASIC16.65■□□□□ 0.26
KLF9Q13886 STK25-203ENST00000403346 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
KLF9Q13886 NLGN2-204ENST00000575301 4374 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
KLF9Q13886 ECE1-203ENST00000374893 2484 ntTSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.26
KLF9Q13886 EIF2B5-201ENST00000273783 2655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.26
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